MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi B str. SPB7 chromosome

Total Repeats: 91933

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_010102	CGG	2	6	76220	76225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612397
1502	NC_010102	AGGC	2	8	76235	76242	25 %	0 %	50 %	25 %	161612397
1503	NC_010102	CGC	3	9	76249	76257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612397
1504	NC_010102	CCG	2	6	76327	76332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612397
1505	NC_010102	CCG	2	6	76350	76355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612397
1506	NC_010102	GCC	2	6	76427	76432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612397
1507	NC_010102	CAGC	2	8	76485	76492	25 %	0 %	25 %	50 %	161612397
1508	NC_010102	CGC	2	6	76510	76515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612397
1509	NC_010102	GGTC	2	8	76614	76621	0 %	25 %	50 %	25 %	161612397
1510	NC_010102	ACTC	2	8	76666	76673	25 %	25 %	0 %	50 %	161612397
1511	NC_010102	T	8	8	76739	76746	0 %	100 %	0 %	0 %	161612398
1512	NC_010102	ATT	2	6	76748	76753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161612398
1513	NC_010102	TCA	2	6	76901	76906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161612398
1514	NC_010102	ACC	2	6	76928	76933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161612398
1515	NC_010102	ATA	2	6	76964	76969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161612398
1516	NC_010102	CATCCT	2	12	77049	77060	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	161612398
1517	NC_010102	CGG	2	6	77193	77198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612398
1518	NC_010102	TCG	2	6	77216	77221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612398
1519	NC_010102	AAT	2	6	77296	77301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161612398
1520	NC_010102	CAG	2	6	77335	77340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612398
1521	NC_010102	GAT	2	6	77415	77420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612398
1522	NC_010102	GCG	2	6	77438	77443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612398
1523	NC_010102	ATC	3	9	77465	77473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161612398
1524	NC_010102	TGC	2	6	77559	77564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612398
1525	NC_010102	CGG	2	6	77565	77570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612398
1526	NC_010102	GCG	2	6	77585	77590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612398
1527	NC_010102	TCA	2	6	77639	77644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161612398
1528	NC_010102	CAC	2	6	77707	77712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161612398
1529	NC_010102	GGT	2	6	77728	77733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612398
1530	NC_010102	CCG	2	6	77754	77759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612398
1531	NC_010102	GTG	2	6	77795	77800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612398
1532	NC_010102	CGT	2	6	77838	77843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612398
1533	NC_010102	GCT	2	6	77853	77858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612398
1534	NC_010102	CAGA	2	8	77866	77873	50 %	0 %	25 %	25 %	161612398
1535	NC_010102	CAG	2	6	77944	77949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612398
1536	NC_010102	TTC	2	6	77983	77988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161612398
1537	NC_010102	A	6	6	78120	78125	100 %	0 %	0 %	0 %	161612398
1538	NC_010102	GTC	2	6	78238	78243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612398
1539	NC_010102	GGC	2	6	78423	78428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612399
1540	NC_010102	GTT	2	6	78474	78479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161612399
1541	NC_010102	ATG	2	6	78493	78498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612399
1542	NC_010102	TCAGC	2	10	78617	78626	20 %	20 %	20 %	40 %	161612399
1543	NC_010102	GC	3	6	78630	78635	0 %	0 %	50 %	50 %	161612399
1544	NC_010102	GT	4	8	78652	78659	0 %	50 %	50 %	0 %	161612399
1545	NC_010102	GCCA	2	8	78661	78668	25 %	0 %	25 %	50 %	161612399
1546	NC_010102	CGA	2	6	78686	78691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612399
1547	NC_010102	GATG	2	8	78716	78723	25 %	25 %	50 %	0 %	161612399
1548	NC_010102	GTA	2	6	78864	78869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612399
1549	NC_010102	CGC	2	6	78905	78910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612399
1550	NC_010102	AGT	2	6	78917	78922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612399
1551	NC_010102	CAT	2	6	78924	78929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161612399
1552	NC_010102	GCA	2	6	78947	78952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612399
1553	NC_010102	GTC	2	6	79030	79035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612399
1554	NC_010102	CGG	2	6	79058	79063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612399
1555	NC_010102	TTGG	2	8	79082	79089	0 %	50 %	50 %	0 %	161612399
1556	NC_010102	CTC	2	6	79164	79169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161612399
1557	NC_010102	TCA	2	6	79237	79242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161612399
1558	NC_010102	CGG	2	6	79252	79257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612399
1559	NC_010102	GGT	2	6	79296	79301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612399
1560	NC_010102	GCG	2	6	79371	79376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612399
1561	NC_010102	A	6	6	79505	79510	100 %	0 %	0 %	0 %	161612399
1562	NC_010102	TCA	2	6	79559	79564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161612399
1563	NC_010102	T	6	6	79579	79584	0 %	100 %	0 %	0 %	161612400
1564	NC_010102	TCA	2	6	79723	79728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161612401
1565	NC_010102	ACC	2	6	79731	79736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161612401
1566	NC_010102	GGT	2	6	79781	79786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612401
1567	NC_010102	CAG	2	6	79923	79928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612401
1568	NC_010102	CGA	2	6	80084	80089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612401
1569	NC_010102	CTT	2	6	80111	80116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161612401
1570	NC_010102	CCGA	2	8	80142	80149	25 %	0 %	25 %	50 %	161612401
1571	NC_010102	CGT	2	6	80174	80179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612401
1572	NC_010102	CAG	2	6	80194	80199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612401
1573	NC_010102	TTG	2	6	80230	80235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161612401
1574	NC_010102	TC	3	6	80305	80310	0 %	50 %	0 %	50 %	161612401
1575	NC_010102	CCT	2	6	80539	80544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161612401
1576	NC_010102	ACA	2	6	80555	80560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161612401
1577	NC_010102	GC	3	6	80570	80575	0 %	0 %	50 %	50 %	161612401
1578	NC_010102	TCCA	2	8	80590	80597	25 %	25 %	0 %	50 %	161612401
1579	NC_010102	CGG	2	6	80600	80605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612401
1580	NC_010102	CCG	2	6	80632	80637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612401
1581	NC_010102	TTC	2	6	80640	80645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161612401
1582	NC_010102	TAA	2	6	80883	80888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161612402
1583	NC_010102	GAA	2	6	80914	80919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161612402
1584	NC_010102	TCC	2	6	80929	80934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161612402
1585	NC_010102	ACCC	2	8	80964	80971	25 %	0 %	0 %	75 %	161612402
1586	NC_010102	CAG	2	6	80977	80982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612402
1587	NC_010102	GAT	2	6	80992	80997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612402
1588	NC_010102	GGC	2	6	81035	81040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612402
1589	NC_010102	GAA	2	6	81133	81138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161612402
1590	NC_010102	TGG	2	6	81147	81152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612402
1591	NC_010102	GGC	2	6	81169	81174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612402
1592	NC_010102	GC	4	8	81191	81198	0 %	0 %	50 %	50 %	161612402
1593	NC_010102	CAG	3	9	81250	81258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612402
1594	NC_010102	TGC	2	6	81264	81269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612402
1595	NC_010102	GTACG	2	10	81336	81345	20 %	20 %	40 %	20 %	161612402
1596	NC_010102	CAC	2	6	81398	81403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161612402
1597	NC_010102	GCC	2	6	81436	81441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612402
1598	NC_010102	AGT	2	6	81513	81518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612402
1599	NC_010102	ATG	2	6	81521	81526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612402
1600	NC_010102	CAG	2	6	81653	81658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612402
1601	NC_010102	ATG	3	9	81662	81670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612402
1602	NC_010102	CCA	2	6	81774	81779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161612402
1603	NC_010102	CGA	2	6	81792	81797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612402
1604	NC_010102	AAC	2	6	81806	81811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161612402
1605	NC_010102	CGA	2	6	81831	81836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612402
1606	NC_010102	CATC	2	8	81867	81874	25 %	25 %	0 %	50 %	161612402
1607	NC_010102	AGA	2	6	81885	81890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161612402
1608	NC_010102	CGG	2	6	82009	82014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612402
1609	NC_010102	TAG	3	9	82025	82033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612402
1610	NC_010102	CAGAA	2	10	82049	82058	60 %	0 %	20 %	20 %	161612402
1611	NC_010102	AGG	2	6	82074	82079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161612402
1612	NC_010102	CAT	2	6	82084	82089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161612402
1613	NC_010102	CCAG	2	8	82161	82168	25 %	0 %	25 %	50 %	161612402
1614	NC_010102	TAA	2	6	82248	82253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161612402
1615	NC_010102	ATT	2	6	82307	82312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161612402
1616	NC_010102	A	8	8	82321	82328	100 %	0 %	0 %	0 %	161612402
1617	NC_010102	T	6	6	82348	82353	0 %	100 %	0 %	0 %	161612402
1618	NC_010102	GTTT	2	8	82421	82428	0 %	75 %	25 %	0 %	161612404
1619	NC_010102	TAT	2	6	82432	82437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161612404
1620	NC_010102	TTG	2	6	82445	82450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161612404
1621	NC_010102	ATG	2	6	82490	82495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612404
1622	NC_010102	T	6	6	82534	82539	0 %	100 %	0 %	0 %	161612403
1623	NC_010102	ATT	2	6	82546	82551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161612403
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1625	NC_010102	ATTG	2	8	82587	82594	25 %	50 %	25 %	0 %	161612403
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1752	NC_010102	CAT	2	6	88712	88717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161612413
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1865	NC_010102	CGA	2	6	94272	94277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612421
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1872	NC_010102	GCTGGG	2	12	94683	94694	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	161612421
1873	NC_010102	GC	3	6	94713	94718	0 %	0 %	50 %	50 %	161612421
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1987	NC_010102	TACT	2	8	101441	101448	25 %	50 %	0 %	25 %	161612429
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1999	NC_010102	TCA	2	6	102140	102145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161612429
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