MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi B str. SPB7 chromosome

Total Repeats: 91933

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_010102	GCC	2	6	227051	227056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612556
4502	NC_010102	GCC	2	6	227061	227066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612556
4503	NC_010102	AGC	2	6	227113	227118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612556
4504	NC_010102	CAA	2	6	227152	227157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161612556
4505	NC_010102	GGAA	2	8	227169	227176	50 %	0 %	50 %	0 %	161612556
4506	NC_010102	TGG	2	6	227192	227197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612556
4507	NC_010102	GC	3	6	227222	227227	0 %	0 %	50 %	50 %	161612556
4508	NC_010102	CGG	2	6	227325	227330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612556
4509	NC_010102	GC	3	6	227340	227345	0 %	0 %	50 %	50 %	161612556
4510	NC_010102	CTG	3	9	227383	227391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612556
4511	NC_010102	CAG	2	6	227461	227466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612556
4512	NC_010102	GGT	2	6	227478	227483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612556
4513	NC_010102	TGC	2	6	227489	227494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612556
4514	NC_010102	GGC	2	6	227508	227513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612556
4515	NC_010102	ATT	2	6	227525	227530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161612556
4516	NC_010102	CGG	2	6	227544	227549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612556
4517	NC_010102	CGG	2	6	227642	227647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612556
4518	NC_010102	CGC	2	6	227700	227705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612557
4519	NC_010102	TTA	2	6	227709	227714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161612557
4520	NC_010102	CGC	2	6	227731	227736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612557
4521	NC_010102	CCG	2	6	227780	227785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612557
4522	NC_010102	GCT	3	9	227816	227824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612557
4523	NC_010102	TGGCG	2	10	227846	227855	0 %	20 %	60 %	20 %	161612557
4524	NC_010102	CCG	2	6	227889	227894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612557
4525	NC_010102	TGAT	2	8	227908	227915	25 %	50 %	25 %	0 %	161612557
4526	NC_010102	CTG	2	6	227946	227951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612557
4527	NC_010102	CGT	2	6	227965	227970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612557
4528	NC_010102	TGGTC	2	10	227974	227983	0 %	40 %	40 %	20 %	161612557
4529	NC_010102	CGCT	2	8	228081	228088	0 %	25 %	25 %	50 %	161612557
4530	NC_010102	GCCA	2	8	228162	228169	25 %	0 %	25 %	50 %	161612557
4531	NC_010102	CCG	2	6	228185	228190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612557
4532	NC_010102	G	6	6	228192	228197	0 %	0 %	100 %	0 %	161612557
4533	NC_010102	TGA	2	6	228208	228213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612557
4534	NC_010102	AGG	2	6	228268	228273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161612557
4535	NC_010102	CGG	2	6	228334	228339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612557
4536	NC_010102	ATCG	2	8	228345	228352	25 %	25 %	25 %	25 %	161612557
4537	NC_010102	AAG	2	6	228367	228372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161612557
4538	NC_010102	CGC	2	6	228430	228435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612557
4539	NC_010102	CCG	2	6	228484	228489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612557
4540	NC_010102	GGC	2	6	228590	228595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612558
4541	NC_010102	GCC	2	6	228654	228659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612558
4542	NC_010102	TGTT	2	8	228684	228691	0 %	75 %	25 %	0 %	161612558
4543	NC_010102	GCC	2	6	228692	228697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612558
4544	NC_010102	GCTG	2	8	228699	228706	0 %	25 %	50 %	25 %	161612558
4545	NC_010102	CAT	2	6	228778	228783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161612558
4546	NC_010102	GAT	2	6	228790	228795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612558
4547	NC_010102	CTG	2	6	228809	228814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612558
4548	NC_010102	TGG	2	6	228837	228842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612558
4549	NC_010102	GC	3	6	228930	228935	0 %	0 %	50 %	50 %	161612558
4550	NC_010102	GC	3	6	228975	228980	0 %	0 %	50 %	50 %	161612558
4551	NC_010102	GCC	2	6	228995	229000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612558
4552	NC_010102	GC	3	6	229023	229028	0 %	0 %	50 %	50 %	161612558
4553	NC_010102	GGCGT	2	10	229037	229046	0 %	20 %	60 %	20 %	161612558
4554	NC_010102	TGG	2	6	229089	229094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612558
4555	NC_010102	CCA	2	6	229138	229143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161612558
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4557	NC_010102	TTG	2	6	229256	229261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161612558
4558	NC_010102	GGC	2	6	229339	229344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612558
4559	NC_010102	CTG	2	6	229373	229378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612558
4560	NC_010102	GCT	2	6	229423	229428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612558
4561	NC_010102	CTG	2	6	229454	229459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612558
4562	NC_010102	GC	3	6	229460	229465	0 %	0 %	50 %	50 %	161612558
4563	NC_010102	ATGG	2	8	229540	229547	25 %	25 %	50 %	0 %	161612558
4564	NC_010102	GC	3	6	229581	229586	0 %	0 %	50 %	50 %	161612558
4565	NC_010102	GCT	2	6	229588	229593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612558
4566	NC_010102	GCT	2	6	229600	229605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612558
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4568	NC_010102	GGC	2	6	229657	229662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612558
4569	NC_010102	GC	3	6	229701	229706	0 %	0 %	50 %	50 %	161612558
4570	NC_010102	CTG	3	9	229709	229717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612558
4571	NC_010102	GC	3	6	229728	229733	0 %	0 %	50 %	50 %	161612558
4572	NC_010102	GCT	2	6	229780	229785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612558
4573	NC_010102	GAA	2	6	229787	229792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161612558
4574	NC_010102	GGC	2	6	229822	229827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612558
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4576	NC_010102	TGGCGG	2	12	229848	229859	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	161612558
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4579	NC_010102	CTGC	2	8	229988	229995	0 %	25 %	25 %	50 %	161612558
4580	NC_010102	GCG	3	9	230009	230017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612558
4581	NC_010102	CTG	2	6	230021	230026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612558
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4583	NC_010102	GCC	2	6	230039	230044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612558
4584	NC_010102	GCG	2	6	230049	230054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612558
4585	NC_010102	CGC	2	6	230061	230066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612558
4586	NC_010102	TGC	2	6	230112	230117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612558
4587	NC_010102	GCG	2	6	230136	230141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612558
4588	NC_010102	CGC	2	6	230261	230266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612558
4589	NC_010102	GCG	2	6	230289	230294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612558
4590	NC_010102	CG	5	10	230299	230308	0 %	0 %	50 %	50 %	161612558
4591	NC_010102	GCT	2	6	230341	230346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612558
4592	NC_010102	GGC	2	6	230353	230358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612558
4593	NC_010102	CGA	2	6	230376	230381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612558
4594	NC_010102	CGG	2	6	230550	230555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612558
4595	NC_010102	GC	3	6	230577	230582	0 %	0 %	50 %	50 %	161612558
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4601	NC_010102	ATT	2	6	231064	231069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161612560
4602	NC_010102	T	7	7	231068	231074	0 %	100 %	0 %	0 %	161612560
4603	NC_010102	TAA	2	6	231082	231087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161612560
4604	NC_010102	A	6	6	231086	231091	100 %	0 %	0 %	0 %	161612560
4605	NC_010102	AAAT	2	8	231103	231110	75 %	25 %	0 %	0 %	161612560
4606	NC_010102	A	8	8	231129	231136	100 %	0 %	0 %	0 %	161612560
4607	NC_010102	T	6	6	231149	231154	0 %	100 %	0 %	0 %	161612560
4608	NC_010102	TA	3	6	231204	231209	50 %	50 %	0 %	0 %	161612561
4609	NC_010102	T	7	7	231231	231237	0 %	100 %	0 %	0 %	161612561
4610	NC_010102	T	7	7	231260	231266	0 %	100 %	0 %	0 %	161612561
4611	NC_010102	CTTG	2	8	231278	231285	0 %	50 %	25 %	25 %	161612561
4612	NC_010102	TTTG	2	8	231287	231294	0 %	75 %	25 %	0 %	161612561
4613	NC_010102	T	6	6	231295	231300	0 %	100 %	0 %	0 %	161612561
4614	NC_010102	TAT	2	6	231317	231322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161612561
4615	NC_010102	TAAA	2	8	231341	231348	75 %	25 %	0 %	0 %	161612561
4616	NC_010102	CAG	2	6	231567	231572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612562
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4618	NC_010102	TGC	2	6	231625	231630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612562
4619	NC_010102	CGA	2	6	231700	231705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612562
4620	NC_010102	CAC	2	6	231808	231813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161612562
4621	NC_010102	AAG	2	6	231819	231824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161612562
4622	NC_010102	CGG	3	9	231895	231903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612562
4623	NC_010102	ACC	2	6	231936	231941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161612562
4624	NC_010102	GCG	3	9	232004	232012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612562
4625	NC_010102	CCA	2	6	232059	232064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161612562
4626	NC_010102	CAG	2	6	232084	232089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612562
4627	NC_010102	A	6	6	232218	232223	100 %	0 %	0 %	0 %	161612563
4628	NC_010102	GTG	2	6	232248	232253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612563
4629	NC_010102	GAT	2	6	232335	232340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612563
4630	NC_010102	TC	3	6	232352	232357	0 %	50 %	0 %	50 %	161612563
4631	NC_010102	ATC	2	6	232396	232401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161612563
4632	NC_010102	TTA	2	6	232444	232449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161612563
4633	NC_010102	ATA	2	6	232462	232467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161612563
4634	NC_010102	GCT	2	6	232514	232519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612563
4635	NC_010102	ATT	2	6	232641	232646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161612563
4636	NC_010102	TAT	2	6	232720	232725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161612563
4637	NC_010102	ATG	2	6	232765	232770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612563
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4639	NC_010102	GC	3	6	232835	232840	0 %	0 %	50 %	50 %	161612563
4640	NC_010102	GGCG	2	8	232942	232949	0 %	0 %	75 %	25 %	161612563
4641	NC_010102	GGC	2	6	233028	233033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612563
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4643	NC_010102	AT	3	6	233089	233094	50 %	50 %	0 %	0 %	161612563
4644	NC_010102	GC	3	6	233103	233108	0 %	0 %	50 %	50 %	161612563
4645	NC_010102	GCGG	2	8	233137	233144	0 %	0 %	75 %	25 %	161612563
4646	NC_010102	GAA	2	6	233232	233237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161612563
4647	NC_010102	GGC	2	6	233361	233366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612563
4648	NC_010102	CCT	2	6	233386	233391	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161612563
4649	NC_010102	CGG	2	6	233420	233425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612563
4650	NC_010102	GCT	2	6	233483	233488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612563
4651	NC_010102	TGA	2	6	233603	233608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612563
4652	NC_010102	GAA	2	6	233649	233654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161612563
4653	NC_010102	TGA	2	6	233930	233935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612563
4654	NC_010102	CAA	2	6	233969	233974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161612563
4655	NC_010102	ACA	3	9	234010	234018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161612563
4656	NC_010102	CG	3	6	234081	234086	0 %	0 %	50 %	50 %	161612563
4657	NC_010102	CTA	2	6	234110	234115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161612563
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4661	NC_010102	CGG	2	6	234254	234259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612563
4662	NC_010102	GCT	2	6	234266	234271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612563
4663	NC_010102	TA	3	6	234325	234330	50 %	50 %	0 %	0 %	161612563
4664	NC_010102	ACT	2	6	234370	234375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161612563
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4666	NC_010102	CGC	2	6	234477	234482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612563
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4668	NC_010102	GGC	2	6	234534	234539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612563
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4673	NC_010102	CTG	3	9	234723	234731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612563
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4685	NC_010102	CCGC	2	8	235297	235304	0 %	0 %	25 %	75 %	161612564
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4689	NC_010102	CAG	2	6	235423	235428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612564
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4696	NC_010102	GCG	2	6	236055	236060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612565
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4700	NC_010102	G	6	6	236190	236195	0 %	0 %	100 %	0 %	161612566
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4712	NC_010102	CGGGAT	2	12	236975	236986	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	161612567
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4714	NC_010102	ATG	2	6	237164	237169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612567
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4716	NC_010102	TGC	2	6	237192	237197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612568
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4719	NC_010102	GGAG	2	8	237331	237338	25 %	0 %	75 %	0 %	161612568
4720	NC_010102	GAT	2	6	237536	237541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612568
4721	NC_010102	CTGG	2	8	237553	237560	0 %	25 %	50 %	25 %	161612568
4722	NC_010102	CCG	2	6	237611	237616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612568
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4725	NC_010102	GCA	2	6	237783	237788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612568
4726	NC_010102	ATC	2	6	237888	237893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161612568
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4728	NC_010102	G	6	6	238006	238011	0 %	0 %	100 %	0 %	161612568
4729	NC_010102	CG	3	6	238136	238141	0 %	0 %	50 %	50 %	161612569
4730	NC_010102	TCT	2	6	238163	238168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161612569
4731	NC_010102	TCC	2	6	238229	238234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161612569
4732	NC_010102	GAA	2	6	238246	238251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161612569
4733	NC_010102	TAG	2	6	238292	238297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612569
4734	NC_010102	GAA	2	6	238318	238323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161612569
4735	NC_010102	GCC	2	6	238336	238341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612569
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4737	NC_010102	CTT	2	6	238371	238376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161612569
4738	NC_010102	GTG	2	6	238409	238414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161612569
4739	NC_010102	TTCA	2	8	238453	238460	25 %	50 %	0 %	25 %	161612569
4740	NC_010102	GCC	2	6	238475	238480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612569
4741	NC_010102	CGA	2	6	238556	238561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612569
4742	NC_010102	CGC	2	6	238587	238592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161612569
4743	NC_010102	GAT	2	6	238594	238599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612569
4744	NC_010102	CAGGT	2	10	238610	238619	20 %	20 %	40 %	20 %	161612569
4745	NC_010102	ACG	2	6	238625	238630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161612569
4746	NC_010102	GTA	2	6	238633	238638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612569
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4802	NC_010102	CGG	2	6	241180	241185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161612572
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4988	NC_010102	T	6	6	249625	249630	0 %	100 %	0 %	0 %	161612581
4989	NC_010102	CTG	2	6	249718	249723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612581
4990	NC_010102	CAT	2	6	249750	249755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161612581
4991	NC_010102	GC	3	6	249794	249799	0 %	0 %	50 %	50 %	161612581
4992	NC_010102	GCT	2	6	249834	249839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161612581
4993	NC_010102	TGA	2	6	249860	249865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161612581
4994	NC_010102	TTA	2	6	249884	249889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161612581
4995	NC_010102	CTT	2	6	249923	249928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161612581
4996	NC_010102	T	6	6	249927	249932	0 %	100 %	0 %	0 %	161612581
4997	NC_010102	TCA	2	6	249970	249975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161612581
4998	NC_010102	GTTG	2	8	250065	250072	0 %	50 %	50 %	0 %	161612581
4999	NC_010102	AAT	2	6	250208	250213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161612582
5000	NC_010102	T	6	6	250252	250257	0 %	100 %	0 %	0 %	161612582

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