MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus USA300_TCH1516 chromosome

Total Repeats: 6851

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010079	ATGC	2	8	1039	1046	25 %	25 %	25 %	25 %	161508267
2	NC_010079	TCAT	2	8	1808	1815	25 %	50 %	0 %	25 %	161508267
3	NC_010079	TAAT	2	8	2177	2184	50 %	50 %	0 %	0 %	161508268
4	NC_010079	ATTA	2	8	2497	2504	50 %	50 %	0 %	0 %	161508268
5	NC_010079	CAAA	2	8	2627	2634	75 %	0 %	0 %	25 %	161508268
6	NC_010079	GACT	2	8	2719	2726	25 %	25 %	25 %	25 %	161508268
7	NC_010079	TAAA	2	8	2814	2821	75 %	25 %	0 %	0 %	161508268
8	NC_010079	TTTA	2	8	2875	2882	25 %	75 %	0 %	0 %	161508268
9	NC_010079	TTCA	2	8	3163	3170	25 %	50 %	0 %	25 %	161508268
10	NC_010079	GATG	2	8	3184	3191	25 %	25 %	50 %	0 %	161508268
11	NC_010079	AATT	2	8	3288	3295	50 %	50 %	0 %	0 %	161508268
12	NC_010079	ATTA	2	8	3819	3826	50 %	50 %	0 %	0 %	161508269
13	NC_010079	TTCT	2	8	3909	3916	0 %	75 %	0 %	25 %	161508269
14	NC_010079	TCAT	2	8	3920	3927	25 %	50 %	0 %	25 %	161508269
15	NC_010079	GTAT	2	8	5158	5165	25 %	50 %	25 %	0 %	161508271
16	NC_010079	TATC	2	8	6061	6068	25 %	50 %	0 %	25 %	161508271
17	NC_010079	TAGA	2	8	6466	6473	50 %	25 %	25 %	0 %	161508271
18	NC_010079	TGGA	2	8	6592	6599	25 %	25 %	50 %	0 %	161508271
19	NC_010079	AATG	2	8	6815	6822	50 %	25 %	25 %	0 %	161508271
20	NC_010079	TCAA	2	8	7046	7053	50 %	25 %	0 %	25 %	161508272
21	NC_010079	ATGG	2	8	7368	7375	25 %	25 %	50 %	0 %	161508272
22	NC_010079	GGTA	2	8	7559	7566	25 %	25 %	50 %	0 %	161508272
23	NC_010079	TAAG	2	8	7624	7631	50 %	25 %	25 %	0 %	161508272
24	NC_010079	TCGT	2	8	7870	7877	0 %	50 %	25 %	25 %	161508272
25	NC_010079	ACAA	2	8	7996	8003	75 %	0 %	0 %	25 %	161508272
26	NC_010079	AGTT	2	8	8431	8438	25 %	50 %	25 %	0 %	161508272
27	NC_010079	GTCA	2	8	8667	8674	25 %	25 %	25 %	25 %	161508272
28	NC_010079	AATA	2	8	8933	8940	75 %	25 %	0 %	0 %	161508272
29	NC_010079	TGTA	2	8	9293	9300	25 %	50 %	25 %	0 %	161508272
30	NC_010079	TGAT	2	8	9592	9599	25 %	50 %	25 %	0 %	161508272
31	NC_010079	GTCA	2	8	10325	10332	25 %	25 %	25 %	25 %	161508273
32	NC_010079	AATG	2	8	11831	11838	50 %	25 %	25 %	0 %	161508274
33	NC_010079	CCAT	2	8	12339	12346	25 %	25 %	0 %	50 %	161508274
34	NC_010079	CAAT	2	8	12402	12409	50 %	25 %	0 %	25 %	161508274
35	NC_010079	ATTA	2	8	12932	12939	50 %	50 %	0 %	0 %	161508275
36	NC_010079	ATTT	2	8	13462	13469	25 %	75 %	0 %	0 %	161508275
37	NC_010079	GCAA	2	8	13803	13810	50 %	0 %	25 %	25 %	161508275
38	NC_010079	TAAA	2	8	14093	14100	75 %	25 %	0 %	0 %	161508275
39	NC_010079	ATTT	2	8	15164	15171	25 %	75 %	0 %	0 %	161508276
40	NC_010079	GCAA	2	8	16537	16544	50 %	0 %	25 %	25 %	161508278
41	NC_010079	AAGG	2	8	16670	16677	50 %	0 %	50 %	0 %	161508278
42	NC_010079	GTAA	2	8	17094	17101	50 %	25 %	25 %	0 %	161508278
43	NC_010079	AAAG	2	8	17677	17684	75 %	0 %	25 %	0 %	161508279
44	NC_010079	AAAG	2	8	17692	17699	75 %	0 %	25 %	0 %	161508279
45	NC_010079	TTAA	2	8	17941	17948	50 %	50 %	0 %	0 %	161508279
46	NC_010079	TAGA	2	8	18724	18731	50 %	25 %	25 %	0 %	161508280
47	NC_010079	ACAA	2	8	18830	18837	75 %	0 %	0 %	25 %	161508280
48	NC_010079	ATGA	2	8	18912	18919	50 %	25 %	25 %	0 %	161508280
49	NC_010079	TAAA	2	8	19636	19643	75 %	25 %	0 %	0 %	161508280
50	NC_010079	CAAC	2	8	19770	19777	50 %	0 %	0 %	50 %	161508280
51	NC_010079	AATT	2	8	19969	19976	50 %	50 %	0 %	0 %	161508280
52	NC_010079	AGTA	2	8	20584	20591	50 %	25 %	25 %	0 %	161508281
53	NC_010079	ATTC	2	8	20669	20676	25 %	50 %	0 %	25 %	161508281
54	NC_010079	GTCT	2	8	20840	20847	0 %	50 %	25 %	25 %	161508282
55	NC_010079	TGAA	2	8	21025	21032	50 %	25 %	25 %	0 %	161508282
56	NC_010079	GCAT	2	8	21119	21126	25 %	25 %	25 %	25 %	161508282
57	NC_010079	GATT	2	8	21136	21143	25 %	50 %	25 %	0 %	161508282
58	NC_010079	GGTA	2	8	21626	21633	25 %	25 %	50 %	0 %	161508282
59	NC_010079	GGTT	2	8	23383	23390	0 %	50 %	50 %	0 %	161508283
60	NC_010079	AACA	2	8	23717	23724	75 %	0 %	0 %	25 %	161508283
61	NC_010079	GTAC	2	8	25534	25541	25 %	25 %	25 %	25 %	161508284
62	NC_010079	AATC	2	8	26001	26008	50 %	25 %	0 %	25 %	161508285
63	NC_010079	ATCT	2	8	27435	27442	25 %	50 %	0 %	25 %	161508285
64	NC_010079	ACAA	2	8	28094	28101	75 %	0 %	0 %	25 %	161508286
65	NC_010079	AATG	2	8	28198	28205	50 %	25 %	25 %	0 %	161508286
66	NC_010079	TCGT	2	8	28230	28237	0 %	50 %	25 %	25 %	161508286
67	NC_010079	AACA	2	8	28675	28682	75 %	0 %	0 %	25 %	161508286
68	NC_010079	CAAT	2	8	29327	29334	50 %	25 %	0 %	25 %	161508287
69	NC_010079	GATG	2	8	29335	29342	25 %	25 %	50 %	0 %	161508287
70	NC_010079	TGAA	2	8	29481	29488	50 %	25 %	25 %	0 %	161508287
71	NC_010079	TACT	2	8	29557	29564	25 %	50 %	0 %	25 %	161508287
72	NC_010079	GAAA	2	8	30104	30111	75 %	0 %	25 %	0 %	161508288
73	NC_010079	GGCA	2	8	30257	30264	25 %	0 %	50 %	25 %	161508288
74	NC_010079	AAAG	2	8	30270	30277	75 %	0 %	25 %	0 %	161508288
75	NC_010079	GAAC	2	8	30714	30721	50 %	0 %	25 %	25 %	161508288
76	NC_010079	CAAC	2	8	31225	31232	50 %	0 %	0 %	50 %	161508289
77	NC_010079	TACA	2	8	31480	31487	50 %	25 %	0 %	25 %	161508289
78	NC_010079	AATG	2	8	31655	31662	50 %	25 %	25 %	0 %	161508289
79	NC_010079	GACT	2	8	32453	32460	25 %	25 %	25 %	25 %	161508289
80	NC_010079	ATAA	2	8	32706	32713	75 %	25 %	0 %	0 %	161508289
81	NC_010079	TAAA	2	8	32749	32756	75 %	25 %	0 %	0 %	161508289
82	NC_010079	ATGA	2	8	32808	32815	50 %	25 %	25 %	0 %	161508289
83	NC_010079	CAAG	2	8	33175	33182	50 %	0 %	25 %	25 %	161508289
84	NC_010079	AGCT	2	8	33335	33342	25 %	25 %	25 %	25 %	161508289
85	NC_010079	AAGC	2	8	33760	33767	50 %	0 %	25 %	25 %	161508290
86	NC_010079	ATTA	2	8	34542	34549	50 %	50 %	0 %	0 %	161508291
87	NC_010079	GGAT	2	8	34758	34765	25 %	25 %	50 %	0 %	161508291
88	NC_010079	AATA	2	8	34906	34913	75 %	25 %	0 %	0 %	161508291
89	NC_010079	TGAA	2	8	35042	35049	50 %	25 %	25 %	0 %	161508291
90	NC_010079	AAGA	2	8	35404	35411	75 %	0 %	25 %	0 %	161508291
91	NC_010079	TCTT	2	8	36020	36027	0 %	75 %	0 %	25 %	161508292
92	NC_010079	ATGT	2	8	36254	36261	25 %	50 %	25 %	0 %	161508292
93	NC_010079	TCAT	2	8	37955	37962	25 %	50 %	0 %	25 %	161508294
94	NC_010079	AAAC	2	8	38463	38470	75 %	0 %	0 %	25 %	161508294
95	NC_010079	GCAT	2	8	38816	38823	25 %	25 %	25 %	25 %	161508295
96	NC_010079	TAGC	2	8	39203	39210	25 %	25 %	25 %	25 %	161508296
97	NC_010079	TTTA	2	8	39391	39398	25 %	75 %	0 %	0 %	161508296
98	NC_010079	TTTG	2	8	39616	39623	0 %	75 %	25 %	0 %	161508296
99	NC_010079	CATA	2	8	40014	40021	50 %	25 %	0 %	25 %	161508296
100	NC_010079	TAGT	2	8	40152	40159	25 %	50 %	25 %	0 %	161508296
101	NC_010079	ATGT	2	8	40197	40204	25 %	50 %	25 %	0 %	161508296
102	NC_010079	GTTT	2	8	40822	40829	0 %	75 %	25 %	0 %	161508296
103	NC_010079	ATGA	2	8	41809	41816	50 %	25 %	25 %	0 %	161508297
104	NC_010079	ATAA	2	8	42067	42074	75 %	25 %	0 %	0 %	161508297
105	NC_010079	TGTA	2	8	42192	42199	25 %	50 %	25 %	0 %	161508297
106	NC_010079	AGCA	2	8	42420	42427	50 %	0 %	25 %	25 %	161508298
107	NC_010079	GACA	2	8	42646	42653	50 %	0 %	25 %	25 %	161508299
108	NC_010079	GTTT	2	8	42808	42815	0 %	75 %	25 %	0 %	161508299
109	NC_010079	TCAT	2	8	43637	43644	25 %	50 %	0 %	25 %	161508299
110	NC_010079	AATA	2	8	43780	43787	75 %	25 %	0 %	0 %	161508299
111	NC_010079	CTTT	2	8	44187	44194	0 %	75 %	0 %	25 %	161508300
112	NC_010079	TGCA	2	8	44502	44509	25 %	25 %	25 %	25 %	161508300
113	NC_010079	CTTT	2	8	44511	44518	0 %	75 %	0 %	25 %	161508300
114	NC_010079	GATT	2	8	44921	44928	25 %	50 %	25 %	0 %	161508301
115	NC_010079	TCCC	2	8	44940	44947	0 %	25 %	0 %	75 %	161508302
116	NC_010079	GATA	2	8	45166	45173	50 %	25 %	25 %	0 %	161508303
117	NC_010079	ATCA	2	8	46057	46064	50 %	25 %	0 %	25 %	161508304
118	NC_010079	GATA	2	8	46067	46074	50 %	25 %	25 %	0 %	161508304
119	NC_010079	GTTG	2	8	46191	46198	0 %	50 %	50 %	0 %	161508304
120	NC_010079	TTAT	2	8	46298	46305	25 %	75 %	0 %	0 %	161508304
121	NC_010079	TTGA	2	8	46384	46391	25 %	50 %	25 %	0 %	161508304
122	NC_010079	TTGC	2	8	46583	46590	0 %	50 %	25 %	25 %	161508304
123	NC_010079	TGAC	2	8	46670	46677	25 %	25 %	25 %	25 %	161508304
124	NC_010079	ATGT	2	8	46844	46851	25 %	50 %	25 %	0 %	161508304
125	NC_010079	TTTG	2	8	47208	47215	0 %	75 %	25 %	0 %	161508304
126	NC_010079	GTTT	2	8	47266	47273	0 %	75 %	25 %	0 %	161508304
127	NC_010079	TTGA	2	8	47566	47573	25 %	50 %	25 %	0 %	161508305
128	NC_010079	ATTG	2	8	48219	48226	25 %	50 %	25 %	0 %	161508305
129	NC_010079	TGAT	2	8	48389	48396	25 %	50 %	25 %	0 %	161508305
130	NC_010079	AATC	2	8	48445	48452	50 %	25 %	0 %	25 %	161508305
131	NC_010079	GTCG	2	8	48549	48556	0 %	25 %	50 %	25 %	161508305
132	NC_010079	AATT	2	8	48709	48716	50 %	50 %	0 %	0 %	161508305
133	NC_010079	TTGT	2	8	48760	48767	0 %	75 %	25 %	0 %	161508305
134	NC_010079	TTGT	2	8	49741	49748	0 %	75 %	25 %	0 %	161508306
135	NC_010079	ATCT	2	8	50594	50601	25 %	50 %	0 %	25 %	161508306
136	NC_010079	TTAA	2	8	50665	50672	50 %	50 %	0 %	0 %	161508306
137	NC_010079	TTTC	2	8	50852	50859	0 %	75 %	0 %	25 %	161508306
138	NC_010079	TTTC	2	8	51095	51102	0 %	75 %	0 %	25 %	161508307
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