MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus USA300_TCH1516 chromosome

Total Repeats: 54239

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_010079	GTT	2	6	209967	209972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161508443
4002	NC_010079	ATT	2	6	209994	209999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161508443
4003	NC_010079	TGA	4	12	210029	210040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161508443
4004	NC_010079	CAA	2	6	210090	210095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161508443
4005	NC_010079	CAT	2	6	210096	210101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161508443
4006	NC_010079	AT	3	6	210111	210116	50 %	50 %	0 %	0 %	161508443
4007	NC_010079	AGA	2	6	210158	210163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161508443
4008	NC_010079	ACT	2	6	210200	210205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161508443
4009	NC_010079	AAT	2	6	210264	210269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161508443
4010	NC_010079	AATG	2	8	210368	210375	50 %	25 %	25 %	0 %	161508443
4011	NC_010079	AC	3	6	210481	210486	50 %	0 %	0 %	50 %	161508443
4012	NC_010079	TAA	2	6	210515	210520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161508443
4013	NC_010079	AAC	3	9	210652	210660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161508443
4014	NC_010079	GATA	2	8	210668	210675	50 %	25 %	25 %	0 %	161508443
4015	NC_010079	AACATT	2	12	210677	210688	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	161508443
4016	NC_010079	AAT	2	6	210692	210697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161508443
4017	NC_010079	TAAC	2	8	210727	210734	50 %	25 %	0 %	25 %	161508443
4018	NC_010079	AT	3	6	210758	210763	50 %	50 %	0 %	0 %	161508443
4019	NC_010079	TAAG	2	8	210779	210786	50 %	25 %	25 %	0 %	161508443
4020	NC_010079	GAA	2	6	210843	210848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161508444
4021	NC_010079	A	6	6	210876	210881	100 %	0 %	0 %	0 %	161508444
4022	NC_010079	TTA	2	6	210975	210980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161508444
4023	NC_010079	GT	4	8	211092	211099	0 %	50 %	50 %	0 %	161508444
4024	NC_010079	AAAG	2	8	211239	211246	75 %	0 %	25 %	0 %	161508444
4025	NC_010079	ATTG	2	8	211256	211263	25 %	50 %	25 %	0 %	161508444
4026	NC_010079	TATGA	2	10	211293	211302	40 %	40 %	20 %	0 %	161508444
4027	NC_010079	ATCA	2	8	211318	211325	50 %	25 %	0 %	25 %	161508444
4028	NC_010079	GTGAA	2	10	211327	211336	40 %	20 %	40 %	0 %	161508444
4029	NC_010079	ATTT	2	8	211346	211353	25 %	75 %	0 %	0 %	161508444
4030	NC_010079	A	6	6	211407	211412	100 %	0 %	0 %	0 %	161508444
4031	NC_010079	AGT	2	6	211434	211439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161508444
4032	NC_010079	TTAAT	2	10	211770	211779	40 %	60 %	0 %	0 %	161508445
4033	NC_010079	TGT	2	6	211798	211803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161508445
4034	NC_010079	TCA	2	6	211820	211825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161508445
4035	NC_010079	CA	3	6	211879	211884	50 %	0 %	0 %	50 %	161508445
4036	NC_010079	AAT	2	6	211924	211929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161508445
4037	NC_010079	TAAG	2	8	211971	211978	50 %	25 %	25 %	0 %	161508445
4038	NC_010079	T	6	6	211983	211988	0 %	100 %	0 %	0 %	161508445
4039	NC_010079	AAT	2	6	212004	212009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161508445
4040	NC_010079	ACT	2	6	212100	212105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161508445
4041	NC_010079	TTG	2	6	212115	212120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161508445
4042	NC_010079	TTG	2	6	212533	212538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161508446
4043	NC_010079	CAA	2	6	212542	212547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161508446
4044	NC_010079	ATT	2	6	212552	212557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161508446
4045	NC_010079	AT	3	6	212685	212690	50 %	50 %	0 %	0 %	161508446
4046	NC_010079	TGA	2	6	212691	212696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161508446
4047	NC_010079	AAC	2	6	212723	212728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161508446
4048	NC_010079	TGA	2	6	212734	212739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161508446
4049	NC_010079	ATG	3	9	212782	212790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161508446
4050	NC_010079	CAT	2	6	212836	212841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161508446
4051	NC_010079	TGA	2	6	212863	212868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161508446
4052	NC_010079	TTG	2	6	212942	212947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161508446
4053	NC_010079	CTA	2	6	213028	213033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161508446
4054	NC_010079	GT	3	6	213060	213065	0 %	50 %	50 %	0 %	161508446
4055	NC_010079	TAA	2	6	213151	213156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161508446
4056	NC_010079	TGT	2	6	213190	213195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161508446
4057	NC_010079	TGT	2	6	213214	213219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161508446
4058	NC_010079	TAA	2	6	213220	213225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161508446
4059	NC_010079	GATG	2	8	213228	213235	25 %	25 %	50 %	0 %	161508446
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4062	NC_010079	TCA	2	6	213438	213443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161508447
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4064	NC_010079	CAA	2	6	213739	213744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161508447
4065	NC_010079	TAA	2	6	213881	213886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161508447
4066	NC_010079	TGA	2	6	213888	213893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161508447
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4087	NC_010079	ATCA	2	8	214654	214661	50 %	25 %	0 %	25 %	161508448
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4090	NC_010079	TAC	2	6	214722	214727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161508448
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4093	NC_010079	GAT	2	6	214838	214843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161508448
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4095	NC_010079	GATA	2	8	214930	214937	50 %	25 %	25 %	0 %	161508448
4096	NC_010079	TCAT	2	8	214997	215004	25 %	50 %	0 %	25 %	161508448
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4101	NC_010079	TAA	2	6	215122	215127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161508448
4102	NC_010079	ATC	2	6	215224	215229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161508448
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4104	NC_010079	AT	3	6	215263	215268	50 %	50 %	0 %	0 %	161508448
4105	NC_010079	CTA	2	6	215325	215330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161508448
4106	NC_010079	AGGG	2	8	215331	215338	25 %	0 %	75 %	0 %	161508448
4107	NC_010079	TTAC	2	8	215348	215355	25 %	50 %	0 %	25 %	161508448
4108	NC_010079	ATT	2	6	215392	215397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161508448
4109	NC_010079	ATA	2	6	215426	215431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161508448
4110	NC_010079	TGT	2	6	215432	215437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161508448
4111	NC_010079	TG	3	6	215490	215495	0 %	50 %	50 %	0 %	161508448
4112	NC_010079	AATT	2	8	215530	215537	50 %	50 %	0 %	0 %	161508448
4113	NC_010079	ATC	2	6	215579	215584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161508448
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4116	NC_010079	TAAA	2	8	215795	215802	75 %	25 %	0 %	0 %	161508449
4117	NC_010079	TAA	2	6	215856	215861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161508449
4118	NC_010079	GTT	2	6	215894	215899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161508449
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4123	NC_010079	CAAT	2	8	216143	216150	50 %	25 %	0 %	25 %	161508449
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4488	NC_010079	TTA	2	6	233738	233743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161508462
4489	NC_010079	ATT	2	6	233747	233752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161508462
4490	NC_010079	AAG	2	6	233813	233818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161508462
4491	NC_010079	GAC	2	6	233845	233850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161508462
4492	NC_010079	GAT	2	6	233911	233916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161508462
4493	NC_010079	TAGA	2	8	233924	233931	50 %	25 %	25 %	0 %	161508462
4494	NC_010079	TAG	2	6	233948	233953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161508462
4495	NC_010079	A	6	6	233974	233979	100 %	0 %	0 %	0 %	161508462
4496	NC_010079	AAT	2	6	234007	234012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161508462
4497	NC_010079	GGAT	2	8	234018	234025	25 %	25 %	50 %	0 %	161508462
4498	NC_010079	ATA	3	9	234059	234067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161508462
4499	NC_010079	TTCT	2	8	234091	234098	0 %	75 %	0 %	25 %	161508462
4500	NC_010079	ACT	2	6	234106	234111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161508462

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