MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus USA300_TCH1516 chromosome

Total Repeats: 54239

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_010079	CAA	2	6	153112	153117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161508401
3002	NC_010079	TAA	2	6	153252	153257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161508401
3003	NC_010079	CAT	2	6	153317	153322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161508401
3004	NC_010079	TTTA	2	8	153323	153330	25 %	75 %	0 %	0 %	161508401
3005	NC_010079	TGA	2	6	153368	153373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161508401
3006	NC_010079	TTA	2	6	153433	153438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161508401
3007	NC_010079	AATAA	2	10	153445	153454	80 %	20 %	0 %	0 %	161508401
3008	NC_010079	TA	3	6	153458	153463	50 %	50 %	0 %	0 %	161508401
3009	NC_010079	TAT	2	6	153500	153505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161508401
3010	NC_010079	TAT	2	6	153507	153512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161508401
3011	NC_010079	AT	3	6	153517	153522	50 %	50 %	0 %	0 %	161508401
3012	NC_010079	TGC	2	6	153540	153545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161508401
3013	NC_010079	TGC	2	6	153651	153656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161508401
3014	NC_010079	ATG	2	6	153661	153666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161508401
3015	NC_010079	ATT	2	6	153692	153697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161508401
3016	NC_010079	TACGC	2	10	153712	153721	20 %	20 %	20 %	40 %	161508401
3017	NC_010079	TAG	2	6	153743	153748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161508401
3018	NC_010079	ATG	2	6	153763	153768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161508401
3019	NC_010079	CATATG	2	12	154121	154132	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	161508402
3020	NC_010079	AT	3	6	154146	154151	50 %	50 %	0 %	0 %	161508402
3021	NC_010079	TCA	2	6	154173	154178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161508402
3022	NC_010079	TACG	2	8	154194	154201	25 %	25 %	25 %	25 %	161508402
3023	NC_010079	ATCA	2	8	154244	154251	50 %	25 %	0 %	25 %	161508402
3024	NC_010079	TAA	2	6	154311	154316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161508402
3025	NC_010079	GGT	2	6	154321	154326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161508402
3026	NC_010079	CATT	2	8	154336	154343	25 %	50 %	0 %	25 %	161508402
3027	NC_010079	GAA	2	6	154372	154377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161508402
3028	NC_010079	CAA	2	6	154454	154459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161508402
3029	NC_010079	ATT	2	6	154461	154466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161508402
3030	NC_010079	GTT	2	6	154489	154494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161508402
3031	NC_010079	ATG	2	6	154496	154501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161508402
3032	NC_010079	CTA	2	6	154593	154598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161508402
3033	NC_010079	A	6	6	154660	154665	100 %	0 %	0 %	0 %	161508402
3034	NC_010079	TGA	2	6	154668	154673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161508402
3035	NC_010079	AGC	2	6	154683	154688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161508402
3036	NC_010079	ATA	2	6	154692	154697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161508402
3037	NC_010079	GACAA	2	10	155054	155063	60 %	0 %	20 %	20 %	161508403
3038	NC_010079	A	6	6	155066	155071	100 %	0 %	0 %	0 %	161508403
3039	NC_010079	AATG	2	8	155158	155165	50 %	25 %	25 %	0 %	161508403
3040	NC_010079	ATC	2	6	155196	155201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161508403
3041	NC_010079	AGT	2	6	155215	155220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161508403
3042	NC_010079	ATG	2	6	155319	155324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161508403
3043	NC_010079	TGG	2	6	155482	155487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161508403
3044	NC_010079	CAA	2	6	155525	155530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161508403
3045	NC_010079	AC	4	8	155547	155554	50 %	0 %	0 %	50 %	161508403
3046	NC_010079	CA	3	6	155568	155573	50 %	0 %	0 %	50 %	161508403
3047	NC_010079	CAA	2	6	155576	155581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161508403
3048	NC_010079	ATC	2	6	155593	155598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161508403
3049	NC_010079	ATG	2	6	155609	155614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161508403
3050	NC_010079	TCA	2	6	155636	155641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161508403
3051	NC_010079	ATC	2	6	155643	155648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161508403
3052	NC_010079	A	6	6	155666	155671	100 %	0 %	0 %	0 %	161508403
3053	NC_010079	GCT	2	6	155681	155686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161508403
3054	NC_010079	ACT	2	6	155731	155736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161508403
3055	NC_010079	GAC	2	6	155766	155771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161508403
3056	NC_010079	CAA	2	6	155775	155780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161508403
3057	NC_010079	ATAA	2	8	155781	155788	75 %	25 %	0 %	0 %	161508403
3058	NC_010079	TAA	2	6	155981	155986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161508404
3059	NC_010079	TTA	2	6	156044	156049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161508404
3060	NC_010079	AAT	2	6	156088	156093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161508404
3061	NC_010079	CAA	2	6	156098	156103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161508404
3062	NC_010079	TGAT	2	8	156175	156182	25 %	50 %	25 %	0 %	161508404
3063	NC_010079	GTC	2	6	156223	156228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161508404
3064	NC_010079	GCTT	2	8	156299	156306	0 %	50 %	25 %	25 %	161508404
3065	NC_010079	T	7	7	156320	156326	0 %	100 %	0 %	0 %	161508404
3066	NC_010079	ATA	2	6	156328	156333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161508404
3067	NC_010079	CAAA	2	8	156369	156376	75 %	0 %	0 %	25 %	161508404
3068	NC_010079	TAAT	2	8	156410	156417	50 %	50 %	0 %	0 %	161508404
3069	NC_010079	TGA	2	6	156418	156423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161508404
3070	NC_010079	TTTG	2	8	156497	156504	0 %	75 %	25 %	0 %	161508404
3071	NC_010079	TCCCT	2	10	156520	156529	0 %	40 %	0 %	60 %	161508404
3072	NC_010079	CT	3	6	156536	156541	0 %	50 %	0 %	50 %	161508404
3073	NC_010079	GC	3	6	156604	156609	0 %	0 %	50 %	50 %	161508404
3074	NC_010079	TA	3	6	156672	156677	50 %	50 %	0 %	0 %	161508404
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3077	NC_010079	AATG	2	8	156997	157004	50 %	25 %	25 %	0 %	161508405
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3080	NC_010079	GGTATG	2	12	157166	157177	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	161508405
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3082	NC_010079	A	6	6	157226	157231	100 %	0 %	0 %	0 %	161508405
3083	NC_010079	ATG	2	6	157281	157286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161508405
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3091	NC_010079	CAA	2	6	157611	157616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161508405
3092	NC_010079	GAT	2	6	157678	157683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161508405
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3094	NC_010079	TAT	2	6	157728	157733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161508406
3095	NC_010079	TGA	2	6	157795	157800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161508406
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3098	NC_010079	ATT	2	6	157952	157957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161508406
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3102	NC_010079	AGA	2	6	158082	158087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161508406
3103	NC_010079	ATTT	2	8	158152	158159	25 %	75 %	0 %	0 %	161508406
3104	NC_010079	GTA	2	6	158204	158209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161508406
3105	NC_010079	ATT	2	6	158233	158238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161508406
3106	NC_010079	ATA	2	6	158250	158255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161508406
3107	NC_010079	TTG	2	6	158277	158282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161508406
3108	NC_010079	ACA	2	6	158309	158314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161508406
3109	NC_010079	TTA	2	6	158325	158330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161508406
3110	NC_010079	TA	3	6	158346	158351	50 %	50 %	0 %	0 %	161508406
3111	NC_010079	TA	3	6	158388	158393	50 %	50 %	0 %	0 %	161508406
3112	NC_010079	TAAA	2	8	158418	158425	75 %	25 %	0 %	0 %	161508406
3113	NC_010079	TTTA	2	8	158458	158465	25 %	75 %	0 %	0 %	161508406
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3118	NC_010079	TTG	2	6	158595	158600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161508406
3119	NC_010079	ATT	2	6	158660	158665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161508406
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3121	NC_010079	TAATT	2	10	158839	158848	40 %	60 %	0 %	0 %	161508406
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3123	NC_010079	ATG	2	6	158925	158930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161508406
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3240	NC_010079	AATG	2	8	165334	165341	50 %	25 %	25 %	0 %	161508413
3241	NC_010079	AGA	2	6	165388	165393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161508413
3242	NC_010079	A	6	6	165393	165398	100 %	0 %	0 %	0 %	161508413
3243	NC_010079	TGCAA	2	10	165406	165415	40 %	20 %	20 %	20 %	161508413
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3493	NC_010079	TGGT	2	8	183173	183180	0 %	50 %	50 %	0 %	161508424
3494	NC_010079	ATTA	2	8	183186	183193	50 %	50 %	0 %	0 %	161508424
3495	NC_010079	ATT	2	6	183252	183257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161508424
3496	NC_010079	TAT	2	6	183289	183294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161508424
3497	NC_010079	ATA	2	6	183329	183334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161508424
3498	NC_010079	AT	3	6	183390	183395	50 %	50 %	0 %	0 %	161508424
3499	NC_010079	T	6	6	183418	183423	0 %	100 %	0 %	0 %	161508424
3500	NC_010079	ATTT	2	8	183453	183460	25 %	75 %	0 %	0 %	161508424

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