MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Shewanella pealeana ATCC 700345 chromosome

Total Repeats: 2505

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009901	GTTTT	2	10	356	365	0 %	80 %	20 %	0 %	157959831
2	NC_009901	TAAAG	2	10	3148	3157	60 %	20 %	20 %	0 %	157959833
3	NC_009901	AGTTC	2	10	4942	4951	20 %	40 %	20 %	20 %	157959834
4	NC_009901	TACCT	2	10	9007	9016	20 %	40 %	0 %	40 %	157959836
5	NC_009901	GCCCA	2	10	9368	9377	20 %	0 %	20 %	60 %	157959836
6	NC_009901	GCGTG	2	10	9778	9787	0 %	20 %	60 %	20 %	157959837
7	NC_009901	ACCAC	2	10	11212	11221	40 %	0 %	0 %	60 %	157959838
8	NC_009901	GTGTA	2	10	13748	13757	20 %	40 %	40 %	0 %	157959840
9	NC_009901	AATGC	2	10	16117	16126	40 %	20 %	20 %	20 %	157959841
10	NC_009901	CAGCT	2	10	16909	16918	20 %	20 %	20 %	40 %	157959843
11	NC_009901	TTTCA	2	10	18049	18058	20 %	60 %	0 %	20 %	157959845
12	NC_009901	AGTCC	2	10	18726	18735	20 %	20 %	20 %	40 %	157959846
13	NC_009901	CACAT	2	10	20009	20018	40 %	20 %	0 %	40 %	157959847
14	NC_009901	ACATC	2	10	20619	20628	40 %	20 %	0 %	40 %	157959848
15	NC_009901	CGTAC	2	10	21887	21896	20 %	20 %	20 %	40 %	157959848
16	NC_009901	TTACA	2	10	23381	23390	40 %	40 %	0 %	20 %	157959849
17	NC_009901	CAGCG	2	10	23412	23421	20 %	0 %	40 %	40 %	157959849
18	NC_009901	GTGCC	2	10	25060	25069	0 %	20 %	40 %	40 %	157959851
19	NC_009901	ATTCT	2	10	25188	25197	20 %	60 %	0 %	20 %	157959851
20	NC_009901	TTTAC	2	10	26223	26232	20 %	60 %	0 %	20 %	157959851
21	NC_009901	CCAAA	2	10	26447	26456	60 %	0 %	0 %	40 %	157959852
22	NC_009901	TGGAC	2	10	27215	27224	20 %	20 %	40 %	20 %	157959853
23	NC_009901	AATGA	2	10	27891	27900	60 %	20 %	20 %	0 %	157959854
24	NC_009901	AGCGC	2	10	29988	29997	20 %	0 %	40 %	40 %	157959857
25	NC_009901	CATGG	2	10	30253	30262	20 %	20 %	40 %	20 %	157959857
26	NC_009901	ATGGC	2	10	36823	36832	20 %	20 %	40 %	20 %	157959863
27	NC_009901	CGAAA	2	10	37039	37048	60 %	0 %	20 %	20 %	157959863
28	NC_009901	ATCTT	2	10	37944	37953	20 %	60 %	0 %	20 %	157959864
29	NC_009901	TTCTG	2	10	42451	42460	0 %	60 %	20 %	20 %	157959869
30	NC_009901	AAGCT	2	10	43056	43065	40 %	20 %	20 %	20 %	157959870
31	NC_009901	GTTCT	2	10	57833	57842	0 %	60 %	20 %	20 %	157959873
32	NC_009901	CATCT	2	10	58035	58044	20 %	40 %	0 %	40 %	157959873
33	NC_009901	TCCAT	2	10	58997	59006	20 %	40 %	0 %	40 %	157959873
34	NC_009901	GTATT	2	10	59200	59209	20 %	60 %	20 %	0 %	157959873
35	NC_009901	CAATC	2	10	59769	59778	40 %	20 %	0 %	40 %	157959874
36	NC_009901	TTTGC	2	10	61055	61064	0 %	60 %	20 %	20 %	157959875
37	NC_009901	TTATG	2	10	62993	63002	20 %	60 %	20 %	0 %	157959877
38	NC_009901	AGCAG	2	10	63862	63871	40 %	0 %	40 %	20 %	157959877
39	NC_009901	AAGTT	2	10	69196	69205	40 %	40 %	20 %	0 %	157959884
40	NC_009901	GGAGT	2	10	69867	69876	20 %	20 %	60 %	0 %	157959885
41	NC_009901	CATAG	2	10	72132	72141	40 %	20 %	20 %	20 %	157959887
42	NC_009901	AGATA	2	10	72218	72227	60 %	20 %	20 %	0 %	157959888
43	NC_009901	CTGAG	2	10	73543	73552	20 %	20 %	40 %	20 %	157959889
44	NC_009901	AACCA	2	10	76220	76229	60 %	0 %	0 %	40 %	157959893
45	NC_009901	AGCTT	2	10	78244	78253	20 %	40 %	20 %	20 %	157959894
46	NC_009901	GCTGC	2	10	78306	78315	0 %	20 %	40 %	40 %	157959894
47	NC_009901	TGGTT	2	10	86641	86650	0 %	60 %	40 %	0 %	157959904
48	NC_009901	CCTAT	2	10	88044	88053	20 %	40 %	0 %	40 %	157959906
49	NC_009901	TCTAC	2	10	89360	89369	20 %	40 %	0 %	40 %	157959910
50	NC_009901	AATGG	2	10	91542	91551	40 %	20 %	40 %	0 %	157959912
51	NC_009901	CAAGG	2	10	92177	92186	40 %	0 %	40 %	20 %	157959912
52	NC_009901	CGATA	2	10	93937	93946	40 %	20 %	20 %	20 %	157959913
53	NC_009901	AATCG	2	10	97669	97678	40 %	20 %	20 %	20 %	157959917
54	NC_009901	AACAT	2	10	98286	98295	60 %	20 %	0 %	20 %	157959917
55	NC_009901	TTTTC	2	10	100586	100595	0 %	80 %	0 %	20 %	157959921
56	NC_009901	CGGTG	2	10	102176	102185	0 %	20 %	60 %	20 %	157959923
57	NC_009901	TCCTA	2	10	103796	103805	20 %	40 %	0 %	40 %	157959923
58	NC_009901	GCTAA	2	10	104792	104801	40 %	20 %	20 %	20 %	157959924
59	NC_009901	TAGTG	2	10	109045	109054	20 %	40 %	40 %	0 %	157959927
60	NC_009901	AAGGT	2	10	113018	113027	40 %	20 %	40 %	0 %	157959931
61	NC_009901	TCACT	2	10	114341	114350	20 %	40 %	0 %	40 %	157959932
62	NC_009901	TTTAG	2	10	114679	114688	20 %	60 %	20 %	0 %	157959932
63	NC_009901	AGGTG	2	10	116473	116482	20 %	20 %	60 %	0 %	157959932
64	NC_009901	CTAAA	2	10	118615	118624	60 %	20 %	0 %	20 %	157959935
65	NC_009901	ATGCC	2	10	121067	121076	20 %	20 %	20 %	40 %	157959937
66	NC_009901	CATCG	2	10	121937	121946	20 %	20 %	20 %	40 %	157959938
67	NC_009901	AGTCG	2	10	127490	127499	20 %	20 %	40 %	20 %	157959943
68	NC_009901	TAGAA	2	10	128736	128745	60 %	20 %	20 %	0 %	157959944
69	NC_009901	GCAGA	2	10	133928	133937	40 %	0 %	40 %	20 %	157959951
70	NC_009901	AACAG	2	10	137736	137745	60 %	0 %	20 %	20 %	157959955
71	NC_009901	GCTTG	2	10	143049	143058	0 %	40 %	40 %	20 %	157959960
72	NC_009901	TGAAT	2	10	145084	145093	40 %	40 %	20 %	0 %	157959960
73	NC_009901	AGATC	2	10	146184	146193	40 %	20 %	20 %	20 %	157959961
74	NC_009901	GATTG	2	10	146278	146287	20 %	40 %	40 %	0 %	157959961
75	NC_009901	CGAGT	2	10	147226	147235	20 %	20 %	40 %	20 %	157959962
76	NC_009901	GGTGT	2	10	148442	148451	0 %	40 %	60 %	0 %	157959962
77	NC_009901	AGTAC	2	10	148879	148888	40 %	20 %	20 %	20 %	157959962
78	NC_009901	TGGCT	2	10	152829	152838	0 %	40 %	40 %	20 %	157959967
79	NC_009901	GCTCT	2	10	154687	154696	0 %	40 %	20 %	40 %	157959968
80	NC_009901	CCTTG	2	10	157329	157338	0 %	40 %	20 %	40 %	157959971
81	NC_009901	GAATC	2	10	157347	157356	40 %	20 %	20 %	20 %	157959971
82	NC_009901	TGCGC	2	10	157390	157399	0 %	20 %	40 %	40 %	157959971
83	NC_009901	GTCAA	2	10	158976	158985	40 %	20 %	20 %	20 %	157959973
84	NC_009901	AATAC	2	10	159297	159306	60 %	20 %	0 %	20 %	157959973
85	NC_009901	AAGCA	2	10	160206	160215	60 %	0 %	20 %	20 %	157959974
86	NC_009901	GAAAT	2	10	160716	160725	60 %	20 %	20 %	0 %	157959974
87	NC_009901	CAGAT	2	10	160776	160785	40 %	20 %	20 %	20 %	157959974
88	NC_009901	CAAAT	2	10	161152	161161	60 %	20 %	0 %	20 %	157959974
89	NC_009901	CTATC	2	10	164009	164018	20 %	40 %	0 %	40 %	157959976
90	NC_009901	GGGCG	2	10	165324	165333	0 %	0 %	80 %	20 %	157959978
91	NC_009901	GCTAA	2	10	166309	166318	40 %	20 %	20 %	20 %	157959980
92	NC_009901	TTAGA	2	10	167791	167800	40 %	40 %	20 %	0 %	157959981
93	NC_009901	CATTA	2	10	168094	168103	40 %	40 %	0 %	20 %	157959982
94	NC_009901	TGTGG	2	10	169170	169179	0 %	40 %	60 %	0 %	157959983
95	NC_009901	GTGAA	2	10	170242	170251	40 %	20 %	40 %	0 %	157959984
96	NC_009901	CCGAC	2	10	173820	173829	20 %	0 %	20 %	60 %	157959989
97	NC_009901	ATGGG	2	10	174734	174743	20 %	20 %	60 %	0 %	157959989
98	NC_009901	GCTCA	2	10	179107	179116	20 %	20 %	20 %	40 %	157959994
99	NC_009901	CAGTT	2	10	179398	179407	20 %	40 %	20 %	20 %	157959994
100	NC_009901	AGTTA	2	10	180911	180920	40 %	40 %	20 %	0 %	157959995
101	NC_009901	GATAA	2	10	189352	189361	60 %	20 %	20 %	0 %	157959997
102	NC_009901	TTTTA	2	10	189709	189718	20 %	80 %	0 %	0 %	157959998
103	NC_009901	TTTGG	2	10	191361	191370	0 %	60 %	40 %	0 %	157959999
104	NC_009901	AGCTA	2	10	198148	198157	40 %	20 %	20 %	20 %	157960007
105	NC_009901	CGTTA	2	10	199019	199028	20 %	40 %	20 %	20 %	157960007
106	NC_009901	AGCAA	2	10	201320	201329	60 %	0 %	20 %	20 %	157960008
107	NC_009901	TACTT	2	10	201704	201713	20 %	60 %	0 %	20 %	157960008
108	NC_009901	GGCAT	2	10	202861	202870	20 %	20 %	40 %	20 %	157960008
109	NC_009901	GTTCT	2	10	206784	206793	0 %	60 %	20 %	20 %	157960011
110	NC_009901	TGGAT	2	10	206845	206854	20 %	40 %	40 %	0 %	157960011
111	NC_009901	AAGAT	2	10	207973	207982	60 %	20 %	20 %	0 %	157960011
112	NC_009901	GCTGA	2	10	211050	211059	20 %	20 %	40 %	20 %	157960014
113	NC_009901	TGGCG	2	10	211649	211658	0 %	20 %	60 %	20 %	157960015
114	NC_009901	CTAAA	2	10	211824	211833	60 %	20 %	0 %	20 %	157960015
115	NC_009901	ACGCA	2	10	214075	214084	40 %	0 %	20 %	40 %	157960020
116	NC_009901	AGCGC	2	10	216968	216977	20 %	0 %	40 %	40 %	157960027
117	NC_009901	GCTAA	2	10	217220	217229	40 %	20 %	20 %	20 %	157960028
118	NC_009901	AAGCC	2	10	217293	217302	40 %	0 %	20 %	40 %	157960028
119	NC_009901	TTGAA	2	10	218668	218677	40 %	40 %	20 %	0 %	157960031
120	NC_009901	CATTG	2	10	221221	221230	20 %	40 %	20 %	20 %	157960035
121	NC_009901	AGACA	2	10	225194	225203	60 %	0 %	20 %	20 %	157960040
122	NC_009901	AAGCC	2	10	226361	226370	40 %	0 %	20 %	40 %	157960042
123	NC_009901	AAGTT	2	10	227784	227793	40 %	40 %	20 %	0 %	157960044
124	NC_009901	GCTTA	2	10	229371	229380	20 %	40 %	20 %	20 %	157960046
125	NC_009901	TTCTC	2	10	231063	231072	0 %	60 %	0 %	40 %	157960047
126	NC_009901	TGGTT	2	10	232769	232778	0 %	60 %	40 %	0 %	157960047
127	NC_009901	TGAGT	2	10	233238	233247	20 %	40 %	40 %	0 %	157960048
128	NC_009901	AGATT	2	10	234532	234541	40 %	40 %	20 %	0 %	157960050
129	NC_009901	TTAAC	2	10	241507	241516	40 %	40 %	0 %	20 %	157960051
130	NC_009901	ATGAA	2	10	249645	249654	60 %	20 %	20 %	0 %	157960052
131	NC_009901	CTGCA	2	10	252296	252305	20 %	20 %	20 %	40 %	157960054
132	NC_009901	TTTAT	2	10	254346	254355	20 %	80 %	0 %	0 %	157960055
133	NC_009901	GCAAA	2	10	255969	255978	60 %	0 %	20 %	20 %	157960056
134	NC_009901	TTTGA	2	10	256074	256083	20 %	60 %	20 %	0 %	157960056
135	NC_009901	GCAAG	2	10	259285	259294	40 %	0 %	40 %	20 %	157960059
136	NC_009901	GCCAG	2	10	259653	259662	20 %	0 %	40 %	40 %	157960059
137	NC_009901	CGATA	2	10	261560	261569	40 %	20 %	20 %	20 %	157960061
138	NC_009901	ATCTT	2	10	265079	265088	20 %	60 %	0 %	20 %	157960062
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155	NC_009901	ATTGA	2	10	298771	298780	40 %	40 %	20 %	0 %	157960094
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249	NC_009901	TAAAG	2	10	519118	519127	60 %	20 %	20 %	0 %	157960251
250	NC_009901	CTCGA	2	10	519184	519193	20 %	20 %	20 %	40 %	157960251
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252	NC_009901	GCTGG	2	10	521370	521379	0 %	20 %	60 %	20 %	157960251
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254	NC_009901	TACCG	2	10	524458	524467	20 %	20 %	20 %	40 %	157960252
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256	NC_009901	GACTG	2	10	530941	530950	20 %	20 %	40 %	20 %	157960256
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258	NC_009901	ATGGC	2	10	532463	532472	20 %	20 %	40 %	20 %	157960257
259	NC_009901	GTTTG	2	10	533326	533335	0 %	60 %	40 %	0 %	157960257
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