MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella pealeana ATCC 700345 chromosome

Total Repeats: 77137

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_009901	GTC	2	6	198849	198854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157960007
3003	NC_009901	CAA	2	6	198925	198930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157960007
3004	NC_009901	TGA	2	6	198982	198987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157960007
3005	NC_009901	GAA	2	6	199010	199015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157960007
3006	NC_009901	CGTTA	2	10	199019	199028	20 %	40 %	20 %	20 %	157960007
3007	NC_009901	ATG	2	6	199067	199072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157960007
3008	NC_009901	GTC	2	6	199089	199094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157960007
3009	NC_009901	CAC	2	6	199149	199154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157960007
3010	NC_009901	ATT	2	6	199160	199165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157960007
3011	NC_009901	GCG	2	6	199172	199177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157960007
3012	NC_009901	GAT	2	6	199202	199207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157960007
3013	NC_009901	TGC	2	6	199330	199335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157960007
3014	NC_009901	GTG	2	6	199341	199346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157960007
3015	NC_009901	GTT	2	6	199379	199384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157960007
3016	NC_009901	TTG	2	6	199489	199494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157960007
3017	NC_009901	GTG	2	6	199818	199823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157960007
3018	NC_009901	AGA	2	6	199873	199878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157960007
3019	NC_009901	ATC	2	6	199964	199969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157960007
3020	NC_009901	GAA	2	6	200050	200055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157960007
3021	NC_009901	TGC	2	6	200149	200154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157960007
3022	NC_009901	TTG	2	6	200171	200176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157960007
3023	NC_009901	GAT	2	6	200189	200194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157960007
3024	NC_009901	AAC	2	6	200217	200222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157960007
3025	NC_009901	AAG	2	6	200261	200266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157960007
3026	NC_009901	CGT	2	6	200279	200284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157960007
3027	NC_009901	TGA	2	6	200299	200304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157960007
3028	NC_009901	GTC	2	6	200385	200390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157960007
3029	NC_009901	ACG	2	6	200442	200447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157960007
3030	NC_009901	TGC	2	6	200536	200541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157960007
3031	NC_009901	AGC	2	6	200583	200588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157960007
3032	NC_009901	TGA	3	9	200677	200685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157960007
3033	NC_009901	AAAGAG	2	12	200753	200764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157960007
3034	NC_009901	TGAT	2	8	200817	200824	25 %	50 %	25 %	0 %	157960007
3035	NC_009901	GCTTAA	2	12	200878	200889	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	157960007
3036	NC_009901	GAC	2	6	200900	200905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157960007
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3040	NC_009901	GCA	2	6	201029	201034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157960007
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3050	NC_009901	CA	3	6	201626	201631	50 %	0 %	0 %	50 %	157960008
3051	NC_009901	TACTT	2	10	201704	201713	20 %	60 %	0 %	20 %	157960008
3052	NC_009901	GTA	2	6	201724	201729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157960008
3053	NC_009901	AGA	2	6	201774	201779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157960008
3054	NC_009901	TGA	2	6	201810	201815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157960008
3055	NC_009901	GAAA	2	8	201876	201883	75 %	0 %	25 %	0 %	157960008
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3057	NC_009901	GAA	2	6	201898	201903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157960008
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3059	NC_009901	AAG	2	6	201934	201939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157960008
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3061	NC_009901	GAT	2	6	201999	202004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157960008
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3063	NC_009901	CGT	2	6	202099	202104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157960008
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3102	NC_009901	AGCT	2	8	204233	204240	25 %	25 %	25 %	25 %	157960008
3103	NC_009901	TGA	2	6	204246	204251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157960008
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3106	NC_009901	GTA	2	6	204389	204394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157960008
3107	NC_009901	AACT	2	8	204446	204453	50 %	25 %	0 %	25 %	157960008
3108	NC_009901	TCTT	2	8	204456	204463	0 %	75 %	0 %	25 %	157960008
3109	NC_009901	TTG	2	6	204530	204535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157960008
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3113	NC_009901	CTT	2	6	204588	204593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157960008
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3117	NC_009901	GAT	2	6	204855	204860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157960008
3118	NC_009901	GCT	2	6	204937	204942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157960008
3119	NC_009901	TCTACG	2	12	204951	204962	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	157960008
3120	NC_009901	TGAA	2	8	204992	204999	50 %	25 %	25 %	0 %	157960008
3121	NC_009901	TGC	2	6	205070	205075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157960008
3122	NC_009901	TC	3	6	205136	205141	0 %	50 %	0 %	50 %	157960008
3123	NC_009901	AGC	2	6	205181	205186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157960008
3124	NC_009901	CTT	2	6	205207	205212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157960008
3125	NC_009901	GCA	2	6	205255	205260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157960008
3126	NC_009901	GAAA	2	8	205332	205339	75 %	0 %	25 %	0 %	157960008
3127	NC_009901	TTG	2	6	205346	205351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157960008
3128	NC_009901	GTC	2	6	205352	205357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157960008
3129	NC_009901	CTG	2	6	205364	205369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157960008
3130	NC_009901	ACC	2	6	205385	205390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157960008
3131	NC_009901	CTG	2	6	205418	205423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157960008
3132	NC_009901	TCT	2	6	205476	205481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157960008
3133	NC_009901	GTG	2	6	205787	205792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157960009
3134	NC_009901	ACT	2	6	205810	205815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157960009
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3136	NC_009901	CTAA	2	8	205864	205871	50 %	25 %	0 %	25 %	157960009
3137	NC_009901	CGG	2	6	205896	205901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157960009
3138	NC_009901	TCA	2	6	206227	206232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157960010
3139	NC_009901	TCA	2	6	206236	206241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157960010
3140	NC_009901	A	6	6	206269	206274	100 %	0 %	0 %	0 %	157960010
3141	NC_009901	AAAG	2	8	206306	206313	75 %	0 %	25 %	0 %	157960010
3142	NC_009901	AGC	2	6	206339	206344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157960010
3143	NC_009901	ACGT	2	8	206353	206360	25 %	25 %	25 %	25 %	157960010
3144	NC_009901	TCG	2	6	206381	206386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157960010
3145	NC_009901	TGG	2	6	206390	206395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157960010
3146	NC_009901	CGT	2	6	206433	206438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157960010
3147	NC_009901	TGGT	2	8	206457	206464	0 %	50 %	50 %	0 %	157960010
3148	NC_009901	GTG	2	6	206482	206487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157960010
3149	NC_009901	CTG	2	6	206548	206553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157960010
3150	NC_009901	AAG	2	6	206556	206561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157960010
3151	NC_009901	CAAA	2	8	206590	206597	75 %	0 %	0 %	25 %	157960010
3152	NC_009901	ACCACT	2	12	206766	206777	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	157960011
3153	NC_009901	GTTCT	2	10	206784	206793	0 %	60 %	20 %	20 %	157960011
3154	NC_009901	ATG	2	6	206827	206832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157960011
3155	NC_009901	CCA	2	6	206839	206844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157960011
3156	NC_009901	TGGAT	2	10	206845	206854	20 %	40 %	40 %	0 %	157960011
3157	NC_009901	ACT	2	6	206901	206906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157960011
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3174	NC_009901	GCT	2	6	207837	207842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157960011
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3178	NC_009901	TGA	2	6	208037	208042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157960011
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3200	NC_009901	TAG	2	6	209187	209192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157960012
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3203	NC_009901	TAG	2	6	209322	209327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157960012
3204	NC_009901	TGA	2	6	209371	209376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157960012
3205	NC_009901	AGCT	2	8	209448	209455	25 %	25 %	25 %	25 %	157960012
3206	NC_009901	CATT	2	8	209505	209512	25 %	50 %	0 %	25 %	157960012
3207	NC_009901	TGT	2	6	209554	209559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157960012
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3210	NC_009901	CTT	2	6	209669	209674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157960012
3211	NC_009901	TTC	2	6	209706	209711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157960012
3212	NC_009901	GCT	2	6	209756	209761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157960012
3213	NC_009901	CA	3	6	209778	209783	50 %	0 %	0 %	50 %	157960012
3214	NC_009901	AGA	2	6	209818	209823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157960012
3215	NC_009901	TTC	2	6	209843	209848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157960012
3216	NC_009901	ATC	2	6	210463	210468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157960013
3217	NC_009901	TGAT	2	8	210472	210479	25 %	50 %	25 %	0 %	157960013
3218	NC_009901	GC	3	6	210520	210525	0 %	0 %	50 %	50 %	157960013
3219	NC_009901	TAA	2	6	210593	210598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157960013
3220	NC_009901	TTG	2	6	210640	210645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157960013
3221	NC_009901	GA	3	6	210757	210762	50 %	0 %	50 %	0 %	157960014
3222	NC_009901	TGC	2	6	210851	210856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157960014
3223	NC_009901	ACT	2	6	210915	210920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157960014
3224	NC_009901	A	7	7	210926	210932	100 %	0 %	0 %	0 %	157960014
3225	NC_009901	AGGC	2	8	210973	210980	25 %	0 %	50 %	25 %	157960014
3226	NC_009901	GAAGGC	2	12	211026	211037	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	157960014
3227	NC_009901	GCTGA	2	10	211050	211059	20 %	20 %	40 %	20 %	157960014
3228	NC_009901	TCAA	2	8	211103	211110	50 %	25 %	0 %	25 %	157960014
3229	NC_009901	CA	3	6	211166	211171	50 %	0 %	0 %	50 %	157960014
3230	NC_009901	CTA	2	6	211357	211362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157960014
3231	NC_009901	ATC	2	6	211374	211379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157960014
3232	NC_009901	TCA	2	6	211501	211506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157960015
3233	NC_009901	CG	3	6	211531	211536	0 %	0 %	50 %	50 %	157960015
3234	NC_009901	AAG	2	6	211586	211591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157960015
3235	NC_009901	TGGCG	2	10	211649	211658	0 %	20 %	60 %	20 %	157960015
3236	NC_009901	GCT	2	6	211673	211678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157960015
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3238	NC_009901	GCT	2	6	211895	211900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157960015
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3354	NC_009901	GGTCTA	2	12	219033	219044	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	157960032
3355	NC_009901	CGC	2	6	219045	219050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157960032
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3359	NC_009901	CTG	2	6	219164	219169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157960033
3360	NC_009901	CAG	2	6	219182	219187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157960033
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3362	NC_009901	GGT	2	6	219295	219300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157960033
3363	NC_009901	AAT	2	6	219572	219577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157960033
3364	NC_009901	CTG	2	6	219647	219652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157960034
3365	NC_009901	GCT	2	6	219716	219721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157960034
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3377	NC_009901	CAT	2	6	220420	220425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157960034
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3379	NC_009901	ATT	2	6	220547	220552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157960034
3380	NC_009901	TTC	2	6	220553	220558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157960034
3381	NC_009901	TCT	2	6	220563	220568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157960034
3382	NC_009901	GAA	2	6	220612	220617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157960034
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3472	NC_009901	CCA	2	6	226119	226124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157960042
3473	NC_009901	TAA	2	6	226160	226165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157960042
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3475	NC_009901	GCCATG	2	12	226264	226275	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	157960042
3476	NC_009901	GAT	2	6	226317	226322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157960042
3477	NC_009901	TTG	2	6	226338	226343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157960042
3478	NC_009901	AAGCC	2	10	226361	226370	40 %	0 %	20 %	40 %	157960042
3479	NC_009901	ATC	2	6	226390	226395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157960042
3480	NC_009901	GTA	2	6	226421	226426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157960042
3481	NC_009901	TAGT	2	8	226490	226497	25 %	50 %	25 %	0 %	157960043
3482	NC_009901	ACTC	2	8	226498	226505	25 %	25 %	0 %	50 %	157960043
3483	NC_009901	AAT	2	6	226564	226569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157960043
3484	NC_009901	CAT	2	6	226581	226586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157960043
3485	NC_009901	CAG	2	6	226602	226607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157960043
3486	NC_009901	TAG	2	6	226620	226625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157960043
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