MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Shewanella sediminis HAW-EB3 chromosome

Total Repeats: 10256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009831	CACG	2	8	1017	1024	25 %	0 %	25 %	50 %	157373142
2	NC_009831	CTTG	2	8	1258	1265	0 %	50 %	25 %	25 %	157373142
3	NC_009831	GATC	2	8	1705	1712	25 %	25 %	25 %	25 %	157373142
4	NC_009831	TATT	2	8	3636	3643	25 %	75 %	0 %	0 %	157373144
5	NC_009831	CTTT	2	8	4041	4048	0 %	75 %	0 %	25 %	157373145
6	NC_009831	ATGG	2	8	4908	4915	25 %	25 %	50 %	0 %	157373147
7	NC_009831	TTTA	2	8	5489	5496	25 %	75 %	0 %	0 %	157373147
8	NC_009831	AGAC	2	8	5633	5640	50 %	0 %	25 %	25 %	157373147
9	NC_009831	AACC	2	8	6047	6054	50 %	0 %	0 %	50 %	157373147
10	NC_009831	AGTG	2	8	6327	6334	25 %	25 %	50 %	0 %	157373148
11	NC_009831	TCAC	2	8	6336	6343	25 %	25 %	0 %	50 %	157373148
12	NC_009831	AGGA	2	8	6410	6417	50 %	0 %	50 %	0 %	157373148
13	NC_009831	AATT	2	8	9821	9828	50 %	50 %	0 %	0 %	157373150
14	NC_009831	AATG	2	8	10893	10900	50 %	25 %	25 %	0 %	157373150
15	NC_009831	GCAG	2	8	11654	11661	25 %	0 %	50 %	25 %	157373151
16	NC_009831	ATCT	2	8	12952	12959	25 %	50 %	0 %	25 %	157373152
17	NC_009831	TCCA	2	8	13076	13083	25 %	25 %	0 %	50 %	157373152
18	NC_009831	TCTG	3	12	14029	14040	0 %	50 %	25 %	25 %	157373153
19	NC_009831	ATCG	2	8	14042	14049	25 %	25 %	25 %	25 %	157373153
20	NC_009831	TCAG	2	8	14720	14727	25 %	25 %	25 %	25 %	157373154
21	NC_009831	AGGG	2	8	14858	14865	25 %	0 %	75 %	0 %	157373154
22	NC_009831	GCGT	2	8	16590	16597	0 %	25 %	50 %	25 %	157373155
23	NC_009831	TCTT	2	8	16825	16832	0 %	75 %	0 %	25 %	157373155
24	NC_009831	GCTT	2	8	17256	17263	0 %	50 %	25 %	25 %	157373155
25	NC_009831	ACCA	2	8	17472	17479	50 %	0 %	0 %	50 %	157373155
26	NC_009831	CAAG	2	8	17983	17990	50 %	0 %	25 %	25 %	157373156
27	NC_009831	AGGC	2	8	18025	18032	25 %	0 %	50 %	25 %	157373156
28	NC_009831	CATA	2	8	18172	18179	50 %	25 %	0 %	25 %	157373156
29	NC_009831	CCAC	2	8	18300	18307	25 %	0 %	0 %	75 %	157373156
30	NC_009831	AAGT	2	8	18315	18322	50 %	25 %	25 %	0 %	157373156
31	NC_009831	TGAG	2	8	19673	19680	25 %	25 %	50 %	0 %	157373158
32	NC_009831	AGCA	2	8	19743	19750	50 %	0 %	25 %	25 %	157373158
33	NC_009831	GACC	2	8	19973	19980	25 %	0 %	25 %	50 %	157373158
34	NC_009831	TGGT	2	8	20018	20025	0 %	50 %	50 %	0 %	157373158
35	NC_009831	TACA	2	8	21401	21408	50 %	25 %	0 %	25 %	157373159
36	NC_009831	AACC	2	8	21502	21509	50 %	0 %	0 %	50 %	157373159
37	NC_009831	TAGA	2	8	21543	21550	50 %	25 %	25 %	0 %	157373159
38	NC_009831	TGGA	2	8	21901	21908	25 %	25 %	50 %	0 %	157373159
39	NC_009831	ATGG	2	8	23273	23280	25 %	25 %	50 %	0 %	157373159
40	NC_009831	AAGC	2	8	23389	23396	50 %	0 %	25 %	25 %	157373159
41	NC_009831	CTGA	2	8	23552	23559	25 %	25 %	25 %	25 %	157373159
42	NC_009831	GATA	2	8	23947	23954	50 %	25 %	25 %	0 %	157373159
43	NC_009831	GGCT	2	8	24080	24087	0 %	25 %	50 %	25 %	157373159
44	NC_009831	TGCG	2	8	24510	24517	0 %	25 %	50 %	25 %	157373160
45	NC_009831	CTTG	2	8	24803	24810	0 %	50 %	25 %	25 %	157373160
46	NC_009831	TGGC	2	8	24916	24923	0 %	25 %	50 %	25 %	157373161
47	NC_009831	TAAC	2	8	26486	26493	50 %	25 %	0 %	25 %	157373163
48	NC_009831	TGGA	2	8	26835	26842	25 %	25 %	50 %	0 %	157373163
49	NC_009831	TCTT	2	8	27601	27608	0 %	75 %	0 %	25 %	157373164
50	NC_009831	GCCA	2	8	27809	27816	25 %	0 %	25 %	50 %	157373164
51	NC_009831	CTTT	2	8	28493	28500	0 %	75 %	0 %	25 %	157373164
52	NC_009831	TTGC	2	8	29408	29415	0 %	50 %	25 %	25 %	157373164
53	NC_009831	CTAA	2	8	29804	29811	50 %	25 %	0 %	25 %	157373165
54	NC_009831	AATC	2	8	30488	30495	50 %	25 %	0 %	25 %	157373165
55	NC_009831	TTCC	2	8	30511	30518	0 %	50 %	0 %	50 %	157373165
56	NC_009831	CTTC	2	8	30832	30839	0 %	50 %	0 %	50 %	157373165
57	NC_009831	GCCA	2	8	31314	31321	25 %	0 %	25 %	50 %	157373166
58	NC_009831	CTCA	2	8	31542	31549	25 %	25 %	0 %	50 %	157373166
59	NC_009831	AGAT	2	8	31658	31665	50 %	25 %	25 %	0 %	157373166
60	NC_009831	GCTG	2	8	32387	32394	0 %	25 %	50 %	25 %	157373167
61	NC_009831	GATT	2	8	33888	33895	25 %	50 %	25 %	0 %	157373168
62	NC_009831	ACTG	2	8	33988	33995	25 %	25 %	25 %	25 %	157373168
63	NC_009831	TTTG	2	8	35974	35981	0 %	75 %	25 %	0 %	157373171
64	NC_009831	AGCG	2	8	36873	36880	25 %	0 %	50 %	25 %	157373172
65	NC_009831	CTTT	2	8	36915	36922	0 %	75 %	0 %	25 %	157373172
66	NC_009831	GATA	2	8	37202	37209	50 %	25 %	25 %	0 %	157373172
67	NC_009831	TGAT	2	8	37416	37423	25 %	50 %	25 %	0 %	157373172
68	NC_009831	TGCC	2	8	37441	37448	0 %	25 %	25 %	50 %	157373172
69	NC_009831	TAAT	2	8	37755	37762	50 %	50 %	0 %	0 %	157373172
70	NC_009831	ATGC	2	8	37877	37884	25 %	25 %	25 %	25 %	157373172
71	NC_009831	TTGG	2	8	38104	38111	0 %	50 %	50 %	0 %	157373173
72	NC_009831	TGAG	2	8	38344	38351	25 %	25 %	50 %	0 %	157373173
73	NC_009831	CCTG	2	8	38890	38897	0 %	25 %	25 %	50 %	157373173
74	NC_009831	AGCG	2	8	39381	39388	25 %	0 %	50 %	25 %	157373173
75	NC_009831	ATCC	2	8	39535	39542	25 %	25 %	0 %	50 %	157373174
76	NC_009831	AGGA	2	8	39668	39675	50 %	0 %	50 %	0 %	157373174
77	NC_009831	TTCC	2	8	40126	40133	0 %	50 %	0 %	50 %	157373174
78	NC_009831	TTGC	2	8	40574	40581	0 %	50 %	25 %	25 %	157373174
79	NC_009831	GACA	2	8	40718	40725	50 %	0 %	25 %	25 %	157373174
80	NC_009831	TTTC	2	8	41643	41650	0 %	75 %	0 %	25 %	157373175
81	NC_009831	CATA	2	8	42295	42302	50 %	25 %	0 %	25 %	157373176
82	NC_009831	TCGT	2	8	42477	42484	0 %	50 %	25 %	25 %	157373177
83	NC_009831	TATC	2	8	42641	42648	25 %	50 %	0 %	25 %	157373177
84	NC_009831	TGGG	2	8	44340	44347	0 %	25 %	75 %	0 %	157373178
85	NC_009831	ATCG	2	8	44989	44996	25 %	25 %	25 %	25 %	157373179
86	NC_009831	TCTT	2	8	45725	45732	0 %	75 %	0 %	25 %	157373180
87	NC_009831	AATA	2	8	46189	46196	75 %	25 %	0 %	0 %	157373180
88	NC_009831	TGAT	2	8	46214	46221	25 %	50 %	25 %	0 %	157373180
89	NC_009831	CTTG	2	8	46356	46363	0 %	50 %	25 %	25 %	157373180
90	NC_009831	GTGA	2	8	46832	46839	25 %	25 %	50 %	0 %	157373180
91	NC_009831	GATC	2	8	47283	47290	25 %	25 %	25 %	25 %	157373181
92	NC_009831	TTGC	2	8	48062	48069	0 %	50 %	25 %	25 %	157373182
93	NC_009831	CCCA	2	8	48285	48292	25 %	0 %	0 %	75 %	157373182
94	NC_009831	GCAG	2	8	48704	48711	25 %	0 %	50 %	25 %	157373183
95	NC_009831	TCAA	2	8	49105	49112	50 %	25 %	0 %	25 %	157373183
96	NC_009831	GAAA	2	8	49761	49768	75 %	0 %	25 %	0 %	157373184
97	NC_009831	CTAC	2	8	50935	50942	25 %	25 %	0 %	50 %	157373186
98	NC_009831	TACA	2	8	51306	51313	50 %	25 %	0 %	25 %	157373186
99	NC_009831	GTTA	2	8	58269	58276	25 %	50 %	25 %	0 %	157373187
100	NC_009831	GGCA	2	8	59027	59034	25 %	0 %	50 %	25 %	157373187
101	NC_009831	TTGT	2	8	59368	59375	0 %	75 %	25 %	0 %	157373187
102	NC_009831	TCCC	2	8	59942	59949	0 %	25 %	0 %	75 %	157373187
103	NC_009831	GAAG	2	8	59971	59978	50 %	0 %	50 %	0 %	157373187
104	NC_009831	TCAG	2	8	60573	60580	25 %	25 %	25 %	25 %	157373187
105	NC_009831	GCTG	2	8	61195	61202	0 %	25 %	50 %	25 %	157373189
106	NC_009831	TGTT	2	8	61652	61659	0 %	75 %	25 %	0 %	157373190
107	NC_009831	CTGC	2	8	62232	62239	0 %	25 %	25 %	50 %	157373190
108	NC_009831	GATC	2	8	62353	62360	25 %	25 %	25 %	25 %	157373190
109	NC_009831	ATGG	2	8	62361	62368	25 %	25 %	50 %	0 %	157373190
110	NC_009831	GTTC	2	8	62442	62449	0 %	50 %	25 %	25 %	157373190
111	NC_009831	CATA	2	8	63291	63298	50 %	25 %	0 %	25 %	157373191
112	NC_009831	CTGC	2	8	63522	63529	0 %	25 %	25 %	50 %	157373192
113	NC_009831	GCTT	2	8	64168	64175	0 %	50 %	25 %	25 %	157373192
114	NC_009831	CTTC	2	8	64402	64409	0 %	50 %	0 %	50 %	157373193
115	NC_009831	TGAA	2	8	64630	64637	50 %	25 %	25 %	0 %	157373193
116	NC_009831	ATCT	2	8	64832	64839	25 %	50 %	0 %	25 %	157373194
117	NC_009831	GCAT	2	8	64920	64927	25 %	25 %	25 %	25 %	157373194
118	NC_009831	TCCA	2	8	64946	64953	25 %	25 %	0 %	50 %	157373194
119	NC_009831	TTGC	2	8	65409	65416	0 %	50 %	25 %	25 %	157373194
120	NC_009831	TGAG	2	8	65536	65543	25 %	25 %	50 %	0 %	157373194
121	NC_009831	GTTG	2	8	66547	66554	0 %	50 %	50 %	0 %	157373197
122	NC_009831	ATCT	2	8	66812	66819	25 %	50 %	0 %	25 %	157373197
123	NC_009831	CCAT	2	8	67320	67327	25 %	25 %	0 %	50 %	157373197
124	NC_009831	TAGA	2	8	68989	68996	50 %	25 %	25 %	0 %	157373198
125	NC_009831	GGGA	2	8	70577	70584	25 %	0 %	75 %	0 %	157373199
126	NC_009831	GCTG	2	8	70733	70740	0 %	25 %	50 %	25 %	157373200
127	NC_009831	GGCA	2	8	71103	71110	25 %	0 %	50 %	25 %	157373200
128	NC_009831	TGGC	2	8	71143	71150	0 %	25 %	50 %	25 %	157373200
129	NC_009831	GATA	2	8	71159	71166	50 %	25 %	25 %	0 %	157373200
130	NC_009831	TCAG	2	8	71203	71210	25 %	25 %	25 %	25 %	157373200
131	NC_009831	TCAT	2	8	71281	71288	25 %	50 %	0 %	25 %	157373200
132	NC_009831	CGCT	2	8	71467	71474	0 %	25 %	25 %	50 %	157373200
133	NC_009831	CTCC	2	8	72205	72212	0 %	25 %	0 %	75 %	157373201
134	NC_009831	TTCA	2	8	72618	72625	25 %	50 %	0 %	25 %	157373201
135	NC_009831	CTGA	2	8	73748	73755	25 %	25 %	25 %	25 %	157373203
136	NC_009831	GGTA	2	8	74141	74148	25 %	25 %	50 %	0 %	157373203
137	NC_009831	ATCT	2	8	74405	74412	25 %	50 %	0 %	25 %	157373203
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