MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus gordonii str. Challis substr. CH1 chromosome

Total Repeats: 38640

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_009785	ATCA	2	8	216598	216605	50 %	25 %	0 %	25 %	157150004
4002	NC_009785	TGT	2	6	216617	216622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157150004
4003	NC_009785	ATTG	2	8	216665	216672	25 %	50 %	25 %	0 %	157150004
4004	NC_009785	TTG	2	6	216694	216699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157150004
4005	NC_009785	G	6	6	216719	216724	0 %	0 %	100 %	0 %	157150004
4006	NC_009785	TGA	3	9	216743	216751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157150004
4007	NC_009785	AAC	2	6	216752	216757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157150004
4008	NC_009785	GAA	2	6	216759	216764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157150004
4009	NC_009785	AAG	2	6	216814	216819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157150004
4010	NC_009785	GTG	2	6	216847	216852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157150004
4011	NC_009785	GAC	3	9	216854	216862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157150004
4012	NC_009785	ATG	2	6	216865	216870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157150004
4013	NC_009785	ATG	2	6	216898	216903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157150004
4014	NC_009785	CTG	2	6	216934	216939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157150004
4015	NC_009785	GTCT	2	8	217066	217073	0 %	50 %	25 %	25 %	157150004
4016	NC_009785	CTTG	2	8	217166	217173	0 %	50 %	25 %	25 %	157150004
4017	NC_009785	ATC	2	6	217186	217191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157150004
4018	NC_009785	AATAAA	2	12	217221	217232	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	157150004
4019	NC_009785	AGA	2	6	217316	217321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157150004
4020	NC_009785	ACT	2	6	217383	217388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157150004
4021	NC_009785	GTT	2	6	217413	217418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157150004
4022	NC_009785	TGC	2	6	217427	217432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157150004
4023	NC_009785	AAG	2	6	217438	217443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157150004
4024	NC_009785	AAG	2	6	217555	217560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157150004
4025	NC_009785	TCT	2	6	217573	217578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157150004
4026	NC_009785	TCT	2	6	217911	217916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157150004
4027	NC_009785	GAA	2	6	217929	217934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157150004
4028	NC_009785	AGA	2	6	217955	217960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157150004
4029	NC_009785	GGC	2	6	218039	218044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157150004
4030	NC_009785	A	6	6	218073	218078	100 %	0 %	0 %	0 %	157150004
4031	NC_009785	A	6	6	218445	218450	100 %	0 %	0 %	0 %	157149863
4032	NC_009785	TCGT	2	8	218455	218462	0 %	50 %	25 %	25 %	157149863
4033	NC_009785	CAA	2	6	218530	218535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149863
4034	NC_009785	TC	3	6	218575	218580	0 %	50 %	0 %	50 %	157149863
4035	NC_009785	AGA	2	6	218597	218602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149863
4036	NC_009785	AAG	2	6	218611	218616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149863
4037	NC_009785	GCT	2	6	218637	218642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149863
4038	NC_009785	GCT	2	6	218649	218654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149863
4039	NC_009785	GTG	2	6	218695	218700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157149863
4040	NC_009785	AGC	2	6	218711	218716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149863
4041	NC_009785	AAGA	2	8	218784	218791	75 %	0 %	25 %	0 %	157149863
4042	NC_009785	TCT	2	6	218936	218941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157149863
4043	NC_009785	AAG	2	6	218965	218970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149863
4044	NC_009785	TGG	2	6	219008	219013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157149863
4045	NC_009785	CTTG	2	8	219050	219057	0 %	50 %	25 %	25 %	157149863
4046	NC_009785	GGT	2	6	219081	219086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157149863
4047	NC_009785	AGA	3	9	219143	219151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149863
4048	NC_009785	CTT	2	6	219174	219179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157149863
4049	NC_009785	AAG	2	6	219220	219225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149863
4050	NC_009785	TGT	2	6	219356	219361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157149863
4051	NC_009785	AAC	2	6	219439	219444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149863
4052	NC_009785	ATCA	2	8	219455	219462	50 %	25 %	0 %	25 %	157149863
4053	NC_009785	GGT	3	9	219465	219473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157149863
4054	NC_009785	GCT	2	6	219480	219485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149863
4055	NC_009785	GCA	2	6	219486	219491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149863
4056	NC_009785	TGG	3	9	219533	219541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157149863
4057	NC_009785	CTT	2	6	219555	219560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157149863
4058	NC_009785	GCA	2	6	219585	219590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149863
4059	NC_009785	AAAAG	2	10	219794	219803	80 %	0 %	20 %	0 %	157151439
4060	NC_009785	AAAGT	2	10	219822	219831	60 %	20 %	20 %	0 %	157151439
4061	NC_009785	TGA	2	6	219901	219906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157151439
4062	NC_009785	CTA	2	6	219963	219968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157151439
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4064	NC_009785	TGA	2	6	220066	220071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157151439
4065	NC_009785	AGC	2	6	220099	220104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157151439
4066	NC_009785	TGT	2	6	220114	220119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157151439
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4092	NC_009785	GCA	2	6	221240	221245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157151439
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4103	NC_009785	CTT	2	6	221855	221860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157151439
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4108	NC_009785	CCG	2	6	222278	222283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157151439
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4115	NC_009785	GTTG	2	8	222823	222830	0 %	50 %	50 %	0 %	157151439
4116	NC_009785	TTGAA	2	10	222852	222861	40 %	40 %	20 %	0 %	157151439
4117	NC_009785	ACT	2	6	222893	222898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157151439
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4488	NC_009785	CAG	2	6	245432	245437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157150651
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4490	NC_009785	GCC	2	6	245520	245525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157150651
4491	NC_009785	GTC	2	6	245527	245532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157150651
4492	NC_009785	CAAT	2	8	245534	245541	50 %	25 %	0 %	25 %	157150651
4493	NC_009785	ATC	2	6	245586	245591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157150651
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4495	NC_009785	GAT	2	6	245607	245612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157150651
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4500	NC_009785	ATT	2	6	245847	245852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157150651

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