MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella baltica OS185 chromosome

Total Repeats: 76510

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009665	ATA	2	6	30914	30919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152998579
502	NC_009665	GC	3	6	30973	30978	0 %	0 %	50 %	50 %	152998579
503	NC_009665	GCC	2	6	31052	31057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152998579
504	NC_009665	TTG	2	6	31150	31155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152998579
505	NC_009665	GGC	2	6	31187	31192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152998579
506	NC_009665	TCT	2	6	31239	31244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152998579
507	NC_009665	ATT	2	6	31361	31366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152998579
508	NC_009665	TAA	2	6	31463	31468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152998580
509	NC_009665	TTGTC	2	10	31494	31503	0 %	60 %	20 %	20 %	152998580
510	NC_009665	TC	3	6	31577	31582	0 %	50 %	0 %	50 %	152998580
511	NC_009665	AAG	2	6	31640	31645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152998580
512	NC_009665	TGT	2	6	31692	31697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152998580
513	NC_009665	TTC	2	6	31709	31714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152998580
514	NC_009665	CCA	2	6	31820	31825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152998580
515	NC_009665	TGT	2	6	31890	31895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152998580
516	NC_009665	ACC	2	6	31976	31981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152998580
517	NC_009665	ATTC	2	8	32008	32015	25 %	50 %	0 %	25 %	152998580
518	NC_009665	CGC	2	6	32036	32041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152998580
519	NC_009665	GCGCC	2	10	32047	32056	0 %	0 %	40 %	60 %	152998580
520	NC_009665	CTG	2	6	32139	32144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152998580
521	NC_009665	TCGC	2	8	32148	32155	0 %	25 %	25 %	50 %	152998580
522	NC_009665	AGC	2	6	32177	32182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152998580
523	NC_009665	ATG	2	6	32256	32261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152998580
524	NC_009665	CTT	2	6	32284	32289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152998580
525	NC_009665	GCG	2	6	32350	32355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152998580
526	NC_009665	CGG	2	6	32434	32439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152998580
527	NC_009665	TGG	2	6	32508	32513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152998580
528	NC_009665	TTG	2	6	32648	32653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152998580
529	NC_009665	CAGC	2	8	32713	32720	25 %	0 %	25 %	50 %	152998580
530	NC_009665	GC	4	8	32719	32726	0 %	0 %	50 %	50 %	152998580
531	NC_009665	GCGAG	2	10	32752	32761	20 %	0 %	60 %	20 %	152998581
532	NC_009665	CAG	2	6	32841	32846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152998581
533	NC_009665	CGG	2	6	32861	32866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152998581
534	NC_009665	T	6	6	32883	32888	0 %	100 %	0 %	0 %	152998581
535	NC_009665	ATA	2	6	32899	32904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152998581
536	NC_009665	TGG	2	6	32924	32929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152998581
537	NC_009665	CTT	2	6	33014	33019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152998581
538	NC_009665	CTT	3	9	33059	33067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152998581
539	NC_009665	GGCT	2	8	33194	33201	0 %	25 %	50 %	25 %	152998581
540	NC_009665	CATC	2	8	33266	33273	25 %	25 %	0 %	50 %	152998581
541	NC_009665	GC	3	6	33314	33319	0 %	0 %	50 %	50 %	152998581
542	NC_009665	CAC	2	6	33335	33340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152998581
543	NC_009665	ACC	2	6	33433	33438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152998581
544	NC_009665	ATA	2	6	33439	33444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152998581
545	NC_009665	TTG	2	6	33468	33473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152998581
546	NC_009665	TTG	2	6	33517	33522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152998581
547	NC_009665	GAT	2	6	33672	33677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152998581
548	NC_009665	CTT	2	6	33706	33711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152998582
549	NC_009665	TTTG	2	8	33742	33749	0 %	75 %	25 %	0 %	152998582
550	NC_009665	GCG	2	6	33766	33771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152998582
551	NC_009665	ACAA	2	8	33783	33790	75 %	0 %	0 %	25 %	152998582
552	NC_009665	CAA	2	6	33850	33855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152998582
553	NC_009665	CTT	2	6	33946	33951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152998582
554	NC_009665	CGC	2	6	33964	33969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152998582
555	NC_009665	GTT	2	6	34042	34047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152998582
556	NC_009665	ATC	2	6	34112	34117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152998582
557	NC_009665	CATA	2	8	34211	34218	50 %	25 %	0 %	25 %	152998582
558	NC_009665	ACA	2	6	34334	34339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152998583
559	NC_009665	GCC	2	6	34402	34407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152998583
560	NC_009665	GTG	2	6	34447	34452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152998583
561	NC_009665	TTAT	2	8	34556	34563	25 %	75 %	0 %	0 %	152998583
562	NC_009665	GAA	2	6	34653	34658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152998583
563	NC_009665	TTGA	2	8	34717	34724	25 %	50 %	25 %	0 %	152998583
564	NC_009665	GTGAT	2	10	34823	34832	20 %	40 %	40 %	0 %	152998583
565	NC_009665	TTA	2	6	34990	34995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152998583
566	NC_009665	CGT	2	6	35103	35108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152998583
567	NC_009665	GTCATC	2	12	35227	35238	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	152998583
568	NC_009665	ATG	2	6	35243	35248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152998583
569	NC_009665	TGCC	2	8	35258	35265	0 %	25 %	25 %	50 %	152998583
570	NC_009665	TTG	2	6	35350	35355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152998583
571	NC_009665	CGA	2	6	35421	35426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152998583
572	NC_009665	GAC	2	6	35562	35567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152998584
573	NC_009665	GA	4	8	35589	35596	50 %	0 %	50 %	0 %	152998584
574	NC_009665	GCA	3	9	35672	35680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152998584
575	NC_009665	CAT	2	6	35691	35696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152998584
576	NC_009665	GTTT	2	8	35700	35707	0 %	75 %	25 %	0 %	152998584
577	NC_009665	CCG	2	6	35724	35729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152998584
578	NC_009665	TTA	2	6	35730	35735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152998584
579	NC_009665	AAC	2	6	35737	35742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152998584
580	NC_009665	CCGC	2	8	35751	35758	0 %	0 %	25 %	75 %	152998584
581	NC_009665	GTT	2	6	35776	35781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152998584
582	NC_009665	CCTT	2	8	35795	35802	0 %	50 %	0 %	50 %	152998584
583	NC_009665	TTG	2	6	35812	35817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152998584
584	NC_009665	GCTG	2	8	35861	35868	0 %	25 %	50 %	25 %	152998584
585	NC_009665	CAG	2	6	36036	36041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152998584
586	NC_009665	CGAAA	2	10	36100	36109	60 %	0 %	20 %	20 %	152998584
587	NC_009665	ATT	2	6	36114	36119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152998584
588	NC_009665	TCTT	2	8	36125	36132	0 %	75 %	0 %	25 %	152998584
589	NC_009665	TTA	2	6	36267	36272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152998584
590	NC_009665	GCC	2	6	36300	36305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152998584
591	NC_009665	GGA	2	6	36314	36319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	152998584
592	NC_009665	ACC	2	6	36340	36345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152998584
593	NC_009665	GAA	2	6	36348	36353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152998584
594	NC_009665	CCA	2	6	36365	36370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152998584
595	NC_009665	AGT	2	6	36452	36457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152998584
596	NC_009665	GGT	2	6	36540	36545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152998584
597	NC_009665	ACT	2	6	36625	36630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152998585
598	NC_009665	TGA	2	6	36634	36639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152998585
599	NC_009665	ACTC	2	8	36658	36665	25 %	25 %	0 %	50 %	152998585
600	NC_009665	TCA	2	6	36676	36681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152998585
601	NC_009665	AAG	2	6	36732	36737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152998585
602	NC_009665	TTCGT	2	10	36772	36781	0 %	60 %	20 %	20 %	152998585
603	NC_009665	AGA	2	6	36928	36933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152998585
604	NC_009665	GTT	2	6	36958	36963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152998585
605	NC_009665	TGA	2	6	37176	37181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152998586
606	NC_009665	ATT	2	6	37185	37190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152998586
607	NC_009665	CGG	2	6	37275	37280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152998586
608	NC_009665	TAA	2	6	37293	37298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152998586
609	NC_009665	GCA	2	6	37332	37337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152998586
610	NC_009665	AGCG	2	8	37479	37486	25 %	0 %	50 %	25 %	152998586
611	NC_009665	TCC	2	6	37608	37613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	152998586
612	NC_009665	GCG	2	6	37669	37674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152998586
613	NC_009665	A	6	6	37697	37702	100 %	0 %	0 %	0 %	152998586
614	NC_009665	CAT	2	6	37887	37892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152998587
615	NC_009665	CAG	2	6	38038	38043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152998587
616	NC_009665	TGA	2	6	38058	38063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152998587
617	NC_009665	AGC	2	6	38081	38086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152998587
618	NC_009665	TAA	2	6	38235	38240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152998587
619	NC_009665	AAC	2	6	38357	38362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152998587
620	NC_009665	TGC	2	6	38461	38466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152998588
621	NC_009665	CAAG	2	8	38534	38541	50 %	0 %	25 %	25 %	152998588
622	NC_009665	GCC	2	6	38546	38551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152998588
623	NC_009665	GGT	2	6	38576	38581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152998588
624	NC_009665	GT	3	6	38721	38726	0 %	50 %	50 %	0 %	152998588
625	NC_009665	ATCC	2	8	38735	38742	25 %	25 %	0 %	50 %	152998588
626	NC_009665	CGA	2	6	38760	38765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152998588
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