MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Sulfurovum sp. NBC37-1 chromosome

Total Repeats: 974

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009663	TATCAA	2	12	2057	2068	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	152991599
2	NC_009663	ATCCAG	2	12	12750	12761	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	152991609
3	NC_009663	TTGCCA	2	12	13344	13355	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	152991610
4	NC_009663	CAAAAA	2	12	13582	13593	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	152991611
5	NC_009663	GCAAGT	2	12	20275	20286	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	152991617
6	NC_009663	ACGATG	2	12	23014	23025	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	152991621
7	NC_009663	ATCAAC	2	12	23469	23480	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	152991622
8	NC_009663	AAAAGA	2	12	30728	30739	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	152991629
9	NC_009663	AGAAAA	2	12	30740	30751	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	152991629
10	NC_009663	AAGAAC	2	12	31000	31011	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	152991630
11	NC_009663	AAGCGA	2	12	34028	34039	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	152991632
12	NC_009663	GACAGG	2	12	46958	46969	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	152991639
13	NC_009663	GGCAGC	2	12	48263	48274	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	152991640
14	NC_009663	TGAAAA	2	12	50826	50837	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	152991642
15	NC_009663	GAGATA	2	12	55057	55068	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	152991646
16	NC_009663	CAAATT	2	12	55696	55707	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	152991647
17	NC_009663	CAAAGA	2	12	57541	57552	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	152991649
18	NC_009663	TATAGA	2	12	60987	60998	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	152991654
19	NC_009663	GTAGTT	2	12	61825	61836	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	152991654
20	NC_009663	TGAAGA	2	12	63375	63386	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	152991657
21	NC_009663	TGAGGT	2	12	70136	70147	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	152991664
22	NC_009663	GTACTG	2	12	72966	72977	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	152991668
23	NC_009663	GCAAGA	2	12	77189	77200	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	152991674
24	NC_009663	CAATGG	2	12	79930	79941	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	152991678
25	NC_009663	TGTAAC	2	12	85280	85291	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	152991683
26	NC_009663	GATACC	2	12	87882	87893	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	152991685
27	NC_009663	ACCCGG	2	12	90468	90479	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	152991688
28	NC_009663	GAAGGT	2	12	90994	91005	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	152991688
29	NC_009663	GGTATT	2	12	92677	92688	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	152991689
30	NC_009663	TCAAGC	2	12	93227	93238	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	152991689
31	NC_009663	TTTGCA	2	12	95032	95043	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	152991691
32	NC_009663	AAAAAC	2	12	101463	101474	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	152991698
33	NC_009663	TTTATC	2	12	103755	103766	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	152991699
34	NC_009663	TAAAAA	2	12	103876	103887	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	152991699
35	NC_009663	TTTTGG	2	12	107770	107781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152991703
36	NC_009663	GTCAAG	2	12	107982	107993	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	152991703
37	NC_009663	GATTTT	2	12	111875	111886	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	152991708
38	NC_009663	TTTCTT	2	12	113747	113758	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	152991710
39	NC_009663	TTTTTG	2	12	116722	116733	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	152991713
40	NC_009663	GGCTTT	2	12	118507	118518	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	152991715
41	NC_009663	TGACAT	2	12	128086	128097	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	152991727
42	NC_009663	GACCTT	2	12	132646	132657	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	152991728
43	NC_009663	AAAGAC	2	12	134143	134154	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	152991728
44	NC_009663	GCAGGA	2	12	137916	137927	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	152991731
45	NC_009663	GAAGAT	2	12	138643	138654	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	152991731
46	NC_009663	GTGGAC	2	12	139268	139279	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	152991731
47	NC_009663	AGTTGA	2	12	139584	139595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152991731
48	NC_009663	TATCAT	2	12	141014	141025	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	152991734
49	NC_009663	TCCCAG	2	12	142051	142062	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	152991736
50	NC_009663	GACCCC	2	12	144880	144891	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	152991737
51	NC_009663	CCCTGT	2	12	148106	148117	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	152991740
52	NC_009663	TGGCGA	2	12	148127	148138	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	152991740
53	NC_009663	GTTTCT	2	12	149874	149885	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	152991742
54	NC_009663	TCGATA	2	12	150595	150606	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	152991743
55	NC_009663	CCGTAT	2	12	152011	152022	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	152991744
56	NC_009663	GGAGAT	2	12	157695	157706	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	152991751
57	NC_009663	ATATTG	2	12	158788	158799	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	152991753
58	NC_009663	GCCAAA	2	12	164715	164726	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	152991760
59	NC_009663	CCAAAG	2	12	167122	167133	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	152991762
60	NC_009663	CAGTGC	2	12	169179	169190	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	152991763
61	NC_009663	TGTAGC	2	12	173223	173234	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	152991766
62	NC_009663	TCATCT	2	12	173309	173320	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	152991766
63	NC_009663	TCTCTT	2	12	173894	173905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152991767
64	NC_009663	GGTAGG	2	12	174464	174475	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	152991767
65	NC_009663	AAGGAA	2	12	177347	177358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152991770
66	NC_009663	TTGCAA	2	12	184256	184267	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	152991777
67	NC_009663	ATGCAG	2	12	184532	184543	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	152991777
68	NC_009663	GTGATT	2	12	185920	185931	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	152991779
69	NC_009663	TGAACT	2	12	187153	187164	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	152991781
70	NC_009663	AAGAGG	2	12	190187	190198	50 %	0 %	50 %	0 %	152991783
71	NC_009663	ACCTAC	2	12	196238	196249	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	152991788
72	NC_009663	TATGCC	2	12	197183	197194	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	152991789
73	NC_009663	TACCAT	2	12	200488	200499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152991791
74	NC_009663	TTTCAT	2	12	201141	201152	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	152991791
75	NC_009663	AAAGAG	2	12	202401	202412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152991792
76	NC_009663	AGAAAA	2	12	204577	204588	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	152991795
77	NC_009663	CCGTTC	2	12	205527	205538	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	152991796
78	NC_009663	GGTATT	2	12	207519	207530	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	152991798
79	NC_009663	ATTCAA	2	12	207852	207863	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	152991799
80	NC_009663	TCAAGA	2	12	211108	211119	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	152991802
81	NC_009663	GCCAAA	2	12	211955	211966	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	152991803
82	NC_009663	ATGAAG	2	12	222084	222095	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	152991814
83	NC_009663	ACTTCA	2	12	230456	230467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152991824
84	NC_009663	AATTGA	2	12	231719	231730	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	152991825
85	NC_009663	CTTGAT	2	12	236193	236204	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	152991831
86	NC_009663	TTCTCT	2	12	237949	237960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152991833
87	NC_009663	TTGATT	2	12	239570	239581	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	152991834
88	NC_009663	AGCAAT	2	12	239635	239646	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	152991834
89	NC_009663	GTTCCC	2	12	239707	239718	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	152991834
90	NC_009663	AATGAG	2	12	245842	245853	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	152991841
91	NC_009663	GGTTGT	2	12	248839	248850	0 %	50 %	50 %	0 %	152991843
92	NC_009663	CCTTTT	2	12	249201	249212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152991844
93	NC_009663	CTGATG	2	12	260922	260933	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	152991855
94	NC_009663	TCAATG	2	12	267712	267723	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	152991862
95	NC_009663	GCAGAA	2	12	270562	270573	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	152991865
96	NC_009663	AGATGA	2	12	271925	271936	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	152991867
97	NC_009663	AATGCC	2	12	274121	274132	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	152991869
98	NC_009663	CTATTA	2	12	274624	274635	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	152991869
99	NC_009663	ACCAAA	2	12	276034	276045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152991871
100	NC_009663	AGATAG	2	12	281838	281849	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	152991875
101	NC_009663	ATGCAG	2	12	290101	290112	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	152991882
102	NC_009663	GAGTTC	2	12	295111	295122	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	152991888
103	NC_009663	CATTGT	2	12	298000	298011	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	152991891
104	NC_009663	GAAGTG	2	12	300360	300371	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	152991894
105	NC_009663	GCAGCG	2	12	305587	305598	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	152991898
106	NC_009663	TGGAAG	2	12	311969	311980	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	152991907
107	NC_009663	ACGAGA	2	12	312401	312412	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	152991907
108	NC_009663	CCTTGA	2	12	313186	313197	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	152991908
109	NC_009663	ATGCAG	2	12	313553	313564	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	152991908
110	NC_009663	CTGAAG	2	12	316579	316590	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	152991910
111	NC_009663	GCAGCG	2	12	318232	318243	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	152991912
112	NC_009663	ACCGTA	2	12	321649	321660	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	152991915
113	NC_009663	ACGGAA	2	12	336566	336577	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	152991928
114	NC_009663	TTTCTG	2	12	342824	342835	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	152991931
115	NC_009663	GCAGTA	2	12	346182	346193	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	152991932
116	NC_009663	AAGTTC	2	12	351186	351197	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	152991936
117	NC_009663	TCTTTA	2	12	351803	351814	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	152991937
118	NC_009663	TCTTTT	2	12	357035	357046	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	152991941
119	NC_009663	GCTCTG	2	12	362498	362509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152991945
120	NC_009663	TACCGT	2	12	367491	367502	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	152991949
121	NC_009663	GAAGAT	2	12	369330	369341	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	152991951
122	NC_009663	GTTTTA	2	12	371781	371792	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	152991953
123	NC_009663	TTTATG	2	12	372281	372292	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	152991954
124	NC_009663	CCTCAA	2	12	372926	372937	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	152991955
125	NC_009663	TCGTAG	2	12	376019	376030	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	152991958
126	NC_009663	CAAAGA	2	12	378685	378696	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	152991962
127	NC_009663	ATATGT	2	12	379509	379520	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	152991962
128	NC_009663	AGAAAA	2	12	380635	380646	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	152991963
129	NC_009663	GCTTTT	2	12	385076	385087	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	152991970
130	NC_009663	GACAAA	2	12	388169	388180	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	152991975
131	NC_009663	TTTTCA	2	12	390834	390845	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	152991979
132	NC_009663	CTGGTC	2	12	391896	391907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152991980
133	NC_009663	AGGTGC	2	12	398287	398298	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	152991986
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135	NC_009663	AGAGCG	2	12	400362	400373	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	152991990
136	NC_009663	GACACT	2	12	401482	401493	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	152991990
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140	NC_009663	AATCTA	2	12	408331	408342	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	152991996
141	NC_009663	CATGCT	2	12	409475	409486	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	152991998
142	NC_009663	ATTGGC	2	12	409972	409983	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	152991998
143	NC_009663	TTTATG	2	12	411797	411808	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	152992002
144	NC_009663	GGATTT	2	12	413012	413023	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	152992003
145	NC_009663	ACCTGA	2	12	413714	413725	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	152992004
146	NC_009663	CAACAC	2	12	419286	419297	50 %	0 %	0 %	50 %	152992009
147	NC_009663	ATGGAG	2	12	419743	419754	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	152992009
148	NC_009663	AGTAGG	2	12	419937	419948	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	152992009
149	NC_009663	GGTCAA	2	12	420670	420681	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	152992010
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151	NC_009663	GGAAGA	2	12	422790	422801	50 %	0 %	50 %	0 %	152992012
152	NC_009663	TACCTA	2	12	423666	423677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152992013
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175	NC_009663	ATCAGG	2	12	472036	472047	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	152992062
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214	NC_009663	CCGGAA	2	12	594269	594280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152992163
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219	NC_009663	ATGTGC	2	12	605394	605405	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	152992172
220	NC_009663	GGTGAC	2	12	608397	608408	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	152992176
221	NC_009663	TTTCAT	2	12	617146	617157	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	152992182
222	NC_009663	AAGGAA	2	12	619432	619443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152992184
223	NC_009663	AAGATG	2	12	619866	619877	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	152992185
224	NC_009663	GAAACT	2	12	622152	622163	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	152992187
225	NC_009663	ATGGAA	2	12	624240	624251	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	152992190
226	NC_009663	CTTGTC	2	12	625313	625324	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	152992191
227	NC_009663	CGATGA	2	12	625660	625671	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	152992191
228	NC_009663	GCTGGA	2	12	628126	628137	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	152992194
229	NC_009663	GCGAAG	2	12	628709	628720	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	152992195
230	NC_009663	AAGAGG	2	12	628878	628889	50 %	0 %	50 %	0 %	152992195
231	NC_009663	AAAAGC	2	12	628953	628964	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	152992195
232	NC_009663	CTTTGG	2	12	632230	632241	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	152992199
233	NC_009663	TCTCGA	2	12	632905	632916	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	152992199
234	NC_009663	ATGCTG	2	12	635011	635022	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	152992200
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246	NC_009663	TACCGT	2	12	679256	679267	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	152992244
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326	NC_009663	CCCTTT	2	12	935655	935666	0 %	50 %	0 %	50 %	152992502
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332	NC_009663	GATTTT	2	12	948609	948620	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	152992516
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334	NC_009663	AAATTT	2	12	950433	950444	50 %	50 %	0 %	0 %	152992517
335	NC_009663	ACAAAA	2	12	954019	954030	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	152992522
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339	NC_009663	GATGCA	2	12	957624	957635	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	152992528
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445	NC_009663	TCCGTA	2	12	1221980	1221991	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	152992782
446	NC_009663	ATGGGT	2	12	1225782	1225793	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	152992783
447	NC_009663	GAAGCG	2	12	1227404	1227415	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	152992785
448	NC_009663	GGGTGT	2	12	1235420	1235431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152992792
449	NC_009663	CGGATC	2	12	1236097	1236108	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	152992793
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451	NC_009663	CTATGC	2	12	1237146	1237157	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	152992794
452	NC_009663	CATAGG	2	12	1241652	1241663	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	152992799
453	NC_009663	CGGATG	2	12	1244113	1244124	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	152992801
454	NC_009663	CATCGA	2	12	1245213	1245224	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	152992801
455	NC_009663	TGACCG	2	12	1245508	1245519	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	152992802
456	NC_009663	CATGTT	2	12	1245922	1245933	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	152992802
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