MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Shewanella baltica OS185 plasmid pS18501

Total Repeats: 180

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009661	TTAT	2	8	669	676	25 %	75 %	0 %	0 %	152998485
2	NC_009661	AAAC	2	8	756	763	75 %	0 %	0 %	25 %	152998485
3	NC_009661	AAAC	2	8	1034	1041	75 %	0 %	0 %	25 %	152998485
4	NC_009661	AAGA	2	8	1098	1105	75 %	0 %	25 %	0 %	152998485
5	NC_009661	GGTT	2	8	1346	1353	0 %	50 %	50 %	0 %	152998485
6	NC_009661	GAAT	2	8	2555	2562	50 %	25 %	25 %	0 %	152998486
7	NC_009661	TACT	2	8	2707	2714	25 %	50 %	0 %	25 %	152998486
8	NC_009661	TCAT	2	8	2933	2940	25 %	50 %	0 %	25 %	152998486
9	NC_009661	ATCA	2	8	3439	3446	50 %	25 %	0 %	25 %	152998487
10	NC_009661	TCAG	2	8	3452	3459	25 %	25 %	25 %	25 %	152998487
11	NC_009661	ACTT	2	8	3555	3562	25 %	50 %	0 %	25 %	152998487
12	NC_009661	TTTA	2	8	4146	4153	25 %	75 %	0 %	0 %	152998488
13	NC_009661	AATA	2	8	5205	5212	75 %	25 %	0 %	0 %	152998489
14	NC_009661	ATTG	2	8	5220	5227	25 %	50 %	25 %	0 %	152998489
15	NC_009661	GCTT	2	8	5712	5719	0 %	50 %	25 %	25 %	152998490
16	NC_009661	TACC	2	8	6001	6008	25 %	25 %	0 %	50 %	152998490
17	NC_009661	TTTA	2	8	6990	6997	25 %	75 %	0 %	0 %	152998491
18	NC_009661	GGAA	2	8	7562	7569	50 %	0 %	50 %	0 %	152998492
19	NC_009661	GAAA	2	8	7665	7672	75 %	0 %	25 %	0 %	152998492
20	NC_009661	AAGG	2	8	7929	7936	50 %	0 %	50 %	0 %	152998492
21	NC_009661	TCGT	2	8	7957	7964	0 %	50 %	25 %	25 %	152998492
22	NC_009661	CAAC	2	8	8445	8452	50 %	0 %	0 %	50 %	152998492
23	NC_009661	TAAA	2	8	8837	8844	75 %	25 %	0 %	0 %	152998493
24	NC_009661	AATG	2	8	8864	8871	50 %	25 %	25 %	0 %	152998493
25	NC_009661	TTCA	2	8	8951	8958	25 %	50 %	0 %	25 %	152998493
26	NC_009661	AAGC	2	8	9239	9246	50 %	0 %	25 %	25 %	152998493
27	NC_009661	AGCA	2	8	10931	10938	50 %	0 %	25 %	25 %	152998494
28	NC_009661	GATC	2	8	11450	11457	25 %	25 %	25 %	25 %	152998495
29	NC_009661	ATGG	2	8	11657	11664	25 %	25 %	50 %	0 %	152998495
30	NC_009661	CAAC	2	8	12784	12791	50 %	0 %	0 %	50 %	152998498
31	NC_009661	AAAC	2	8	13990	13997	75 %	0 %	0 %	25 %	152998499
32	NC_009661	TCAA	2	8	14298	14305	50 %	25 %	0 %	25 %	152998499
33	NC_009661	AGCG	2	8	14317	14324	25 %	0 %	50 %	25 %	152998499
34	NC_009661	GATC	2	8	14682	14689	25 %	25 %	25 %	25 %	152998499
35	NC_009661	ACGA	2	8	16878	16885	50 %	0 %	25 %	25 %	152998501
36	NC_009661	CCTT	2	8	16906	16913	0 %	50 %	0 %	50 %	152998501
37	NC_009661	TTTC	2	8	17170	17177	0 %	75 %	0 %	25 %	152998501
38	NC_009661	TTCC	2	8	17273	17280	0 %	50 %	0 %	50 %	152998501
39	NC_009661	ATCA	2	8	18299	18306	50 %	25 %	0 %	25 %	152998502
40	NC_009661	AAGC	2	8	18319	18326	50 %	0 %	25 %	25 %	152998502
41	NC_009661	GGGT	2	8	18395	18402	0 %	25 %	75 %	0 %	152998502
42	NC_009661	TGAA	2	8	18680	18687	50 %	25 %	25 %	0 %	152998502
43	NC_009661	AAGA	2	8	18792	18799	75 %	0 %	25 %	0 %	152998502
44	NC_009661	ACTT	2	8	19318	19325	25 %	50 %	0 %	25 %	152998503
45	NC_009661	TGGG	2	8	19756	19763	0 %	25 %	75 %	0 %	152998503
46	NC_009661	AATA	2	8	19970	19977	75 %	25 %	0 %	0 %	152998503
47	NC_009661	AGCG	2	8	20090	20097	25 %	0 %	50 %	25 %	152998503
48	NC_009661	CAAC	2	8	20250	20257	50 %	0 %	0 %	50 %	152998503
49	NC_009661	GCAT	2	8	20856	20863	25 %	25 %	25 %	25 %	152998503
50	NC_009661	GGTG	2	8	21955	21962	0 %	25 %	75 %	0 %	152998504
51	NC_009661	CAAC	2	8	22172	22179	50 %	0 %	0 %	50 %	152998504
52	NC_009661	ATAG	2	8	22835	22842	50 %	25 %	25 %	0 %	152998505
53	NC_009661	TAAT	2	8	23487	23494	50 %	50 %	0 %	0 %	152998505
54	NC_009661	CAAA	2	8	23838	23845	75 %	0 %	0 %	25 %	152998506
55	NC_009661	GAAT	2	8	23877	23884	50 %	25 %	25 %	0 %	152998506
56	NC_009661	GATT	2	8	24048	24055	25 %	50 %	25 %	0 %	152998506
57	NC_009661	TGAA	2	8	24424	24431	50 %	25 %	25 %	0 %	152998507
58	NC_009661	GTAT	2	8	25744	25751	25 %	50 %	25 %	0 %	152998508
59	NC_009661	TTTA	2	8	25786	25793	25 %	75 %	0 %	0 %	152998508
60	NC_009661	TAAA	2	8	25831	25838	75 %	25 %	0 %	0 %	152998508
61	NC_009661	GGAA	2	8	27957	27964	50 %	0 %	50 %	0 %	152998510
62	NC_009661	GAAA	2	8	28060	28067	75 %	0 %	25 %	0 %	152998510
63	NC_009661	AAGG	2	8	28324	28331	50 %	0 %	50 %	0 %	152998510
64	NC_009661	TCGT	2	8	28352	28359	0 %	50 %	25 %	25 %	152998510
65	NC_009661	CAAC	2	8	28840	28847	50 %	0 %	0 %	50 %	152998510
66	NC_009661	ACTG	2	8	29768	29775	25 %	25 %	25 %	25 %	152998511
67	NC_009661	CGAA	2	8	29864	29871	50 %	0 %	25 %	25 %	152998511
68	NC_009661	GCTT	2	8	30229	30236	0 %	50 %	25 %	25 %	152998511
69	NC_009661	GCAA	2	8	32365	32372	50 %	0 %	25 %	25 %	152998514
70	NC_009661	GCCA	2	8	32399	32406	25 %	0 %	25 %	50 %	152998514
71	NC_009661	GCGG	2	8	33170	33177	0 %	0 %	75 %	25 %	152998514
72	NC_009661	AGTT	2	8	33312	33319	25 %	50 %	25 %	0 %	152998514
73	NC_009661	TCTG	2	8	33674	33681	0 %	50 %	25 %	25 %	152998514
74	NC_009661	AGCC	2	8	33811	33818	25 %	0 %	25 %	50 %	152998514
75	NC_009661	AGAA	2	8	33891	33898	75 %	0 %	25 %	0 %	152998514
76	NC_009661	TGAA	2	8	34546	34553	50 %	25 %	25 %	0 %	152998515
77	NC_009661	TGGC	2	8	34596	34603	0 %	25 %	50 %	25 %	152998515
78	NC_009661	CAAA	2	8	34634	34641	75 %	0 %	0 %	25 %	152998515
79	NC_009661	TGAT	2	8	35129	35136	25 %	50 %	25 %	0 %	152998516
80	NC_009661	TTGA	2	8	35179	35186	25 %	50 %	25 %	0 %	152998516
81	NC_009661	AGCG	2	8	35547	35554	25 %	0 %	50 %	25 %	152998517
82	NC_009661	GCAA	2	8	35920	35927	50 %	0 %	25 %	25 %	152998518
83	NC_009661	GCGA	2	8	36162	36169	25 %	0 %	50 %	25 %	152998518
84	NC_009661	AGCA	2	8	36212	36219	50 %	0 %	25 %	25 %	152998518
85	NC_009661	AAAG	2	8	37997	38004	75 %	0 %	25 %	0 %	152998521
86	NC_009661	AGCA	2	8	38651	38658	50 %	0 %	25 %	25 %	152998522
87	NC_009661	TTAA	2	8	40550	40557	50 %	50 %	0 %	0 %	152998524
88	NC_009661	CAGA	2	8	40620	40627	50 %	0 %	25 %	25 %	152998524
89	NC_009661	TTAT	2	8	42202	42209	25 %	75 %	0 %	0 %	152998526
90	NC_009661	CTTG	2	8	42383	42390	0 %	50 %	25 %	25 %	152998526
91	NC_009661	GAGT	2	8	42408	42415	25 %	25 %	50 %	0 %	152998526
92	NC_009661	GTTC	2	8	42539	42546	0 %	50 %	25 %	25 %	152998526
93	NC_009661	TTAA	2	8	42610	42617	50 %	50 %	0 %	0 %	152998526
94	NC_009661	GTTA	2	8	43041	43048	25 %	50 %	25 %	0 %	152998526
95	NC_009661	TGAT	2	8	43771	43778	25 %	50 %	25 %	0 %	152998526
96	NC_009661	ATTG	2	8	43962	43969	25 %	50 %	25 %	0 %	152998526
97	NC_009661	TCAA	2	8	44065	44072	50 %	25 %	0 %	25 %	152998526
98	NC_009661	GTCT	2	8	44516	44523	0 %	50 %	25 %	25 %	152998526
99	NC_009661	TTTG	2	8	45215	45222	0 %	75 %	25 %	0 %	152998526
100	NC_009661	CTTG	2	8	45809	45816	0 %	50 %	25 %	25 %	152998526
101	NC_009661	CTTT	2	8	46199	46206	0 %	75 %	0 %	25 %	152998526
102	NC_009661	CAAA	2	8	46802	46809	75 %	0 %	0 %	25 %	152998526
103	NC_009661	GTGA	2	8	47002	47009	25 %	25 %	50 %	0 %	152998526
104	NC_009661	GCAA	2	8	47215	47222	50 %	0 %	25 %	25 %	152998526
105	NC_009661	CATC	2	8	48640	48647	25 %	25 %	0 %	50 %	152998527
106	NC_009661	CTTT	2	8	49977	49984	0 %	75 %	0 %	25 %	152998528
107	NC_009661	TAAG	2	8	50035	50042	50 %	25 %	25 %	0 %	152998528
108	NC_009661	TTGA	2	8	50542	50549	25 %	50 %	25 %	0 %	152998529
109	NC_009661	GTTG	2	8	51200	51207	0 %	50 %	50 %	0 %	152998529
110	NC_009661	ACAT	2	8	51429	51436	50 %	25 %	0 %	25 %	152998529
111	NC_009661	GCTT	2	8	51635	51642	0 %	50 %	25 %	25 %	152998529
112	NC_009661	CTTG	2	8	51814	51821	0 %	50 %	25 %	25 %	152998529
113	NC_009661	GTGA	2	8	52263	52270	25 %	25 %	50 %	0 %	152998529
114	NC_009661	TATT	2	8	52794	52801	25 %	75 %	0 %	0 %	152998529
115	NC_009661	CATA	2	8	52987	52994	50 %	25 %	0 %	25 %	152998529
116	NC_009661	GCAA	2	8	53109	53116	50 %	0 %	25 %	25 %	152998529
117	NC_009661	CTTG	2	8	53275	53282	0 %	50 %	25 %	25 %	152998529
118	NC_009661	AAGG	2	8	54004	54011	50 %	0 %	50 %	0 %	152998530
119	NC_009661	TCTT	2	8	54077	54084	0 %	75 %	0 %	25 %	152998530
120	NC_009661	CCGC	2	8	54113	54120	0 %	0 %	25 %	75 %	152998530
121	NC_009661	GAAA	2	8	55214	55221	75 %	0 %	25 %	0 %	152998531
122	NC_009661	GGTG	2	8	55382	55389	0 %	25 %	75 %	0 %	152998532
123	NC_009661	TTTG	2	8	55649	55656	0 %	75 %	25 %	0 %	152998532
124	NC_009661	GGCG	2	8	55751	55758	0 %	0 %	75 %	25 %	152998532
125	NC_009661	TTGA	2	8	55838	55845	25 %	50 %	25 %	0 %	152998532
126	NC_009661	TAAC	2	8	56217	56224	50 %	25 %	0 %	25 %	152998533
127	NC_009661	TGGC	2	8	56283	56290	0 %	25 %	50 %	25 %	152998533
128	NC_009661	TGCT	2	8	56755	56762	0 %	50 %	25 %	25 %	152998533
129	NC_009661	CGGT	2	8	56772	56779	0 %	25 %	50 %	25 %	152998533
130	NC_009661	AGTT	2	8	57923	57930	25 %	50 %	25 %	0 %	152998534
131	NC_009661	TGAG	2	8	58022	58029	25 %	25 %	50 %	0 %	152998534
132	NC_009661	ATCG	2	8	58458	58465	25 %	25 %	25 %	25 %	152998534
133	NC_009661	AAGT	2	8	58853	58860	50 %	25 %	25 %	0 %	152998535
134	NC_009661	ATCT	2	8	60048	60055	25 %	50 %	0 %	25 %	152998536
135	NC_009661	AACG	2	8	60465	60472	50 %	0 %	25 %	25 %	152998536
136	NC_009661	GTTT	2	8	60568	60575	0 %	75 %	25 %	0 %	152998537
137	NC_009661	GCCC	2	8	61839	61846	0 %	0 %	25 %	75 %	152998539
138	NC_009661	TGAG	2	8	62717	62724	25 %	25 %	50 %	0 %	152998539
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.