MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus str. Newman chromosome

Total Repeats: 56203

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_009641	A	6	6	50026	50031	100 %	0 %	0 %	0 %	151220250
1003	NC_009641	AAATAA	2	12	50037	50048	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	151220250
1004	NC_009641	GTT	2	6	50393	50398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	151220251
1005	NC_009641	AGCA	2	8	50479	50486	50 %	0 %	25 %	25 %	151220251
1006	NC_009641	TGA	2	6	50501	50506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220251
1007	NC_009641	TAT	2	6	50537	50542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220251
1008	NC_009641	AGA	2	6	50546	50551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220251
1009	NC_009641	AATT	2	8	50612	50619	50 %	50 %	0 %	0 %	151220251
1010	NC_009641	TGA	2	6	50639	50644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220251
1011	NC_009641	AC	3	6	50673	50678	50 %	0 %	0 %	50 %	151220251
1012	NC_009641	GAT	2	6	50744	50749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220251
1013	NC_009641	AGA	2	6	50795	50800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220251
1014	NC_009641	GAA	2	6	50882	50887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220251
1015	NC_009641	ATG	2	6	50902	50907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220251
1016	NC_009641	AAAG	2	8	50930	50937	75 %	0 %	25 %	0 %	151220251
1017	NC_009641	ATT	2	6	50942	50947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220251
1018	NC_009641	CTT	2	6	51011	51016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	151220251
1019	NC_009641	CCAA	2	8	51049	51056	50 %	0 %	0 %	50 %	151220251
1020	NC_009641	AGA	2	6	51083	51088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220251
1021	NC_009641	CAA	2	6	51204	51209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	151220251
1022	NC_009641	CCA	2	6	51264	51269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	151220251
1023	NC_009641	ACT	2	6	51282	51287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151220251
1024	NC_009641	TTA	2	6	51288	51293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220251
1025	NC_009641	AT	3	6	51298	51303	50 %	50 %	0 %	0 %	151220251
1026	NC_009641	TAG	2	6	51313	51318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220251
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1028	NC_009641	CAAAA	2	10	51371	51380	80 %	0 %	0 %	20 %	151220251
1029	NC_009641	GAT	2	6	51393	51398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220251
1030	NC_009641	TACT	2	8	51408	51415	25 %	50 %	0 %	25 %	151220251
1031	NC_009641	TAA	2	6	51458	51463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151220251
1032	NC_009641	AT	3	6	51478	51483	50 %	50 %	0 %	0 %	151220251
1033	NC_009641	GAA	2	6	51504	51509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220251
1034	NC_009641	TAC	2	6	51727	51732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151220251
1035	NC_009641	AAT	2	6	51741	51746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151220251
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1037	NC_009641	AGA	2	6	51833	51838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220251
1038	NC_009641	ATG	2	6	51853	51858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220251
1039	NC_009641	TTA	2	6	51898	51903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220251
1040	NC_009641	A	6	6	51910	51915	100 %	0 %	0 %	0 %	151220251
1041	NC_009641	GAA	2	6	51924	51929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220251
1042	NC_009641	AGA	2	6	51977	51982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220251
1043	NC_009641	AATT	2	8	51995	52002	50 %	50 %	0 %	0 %	151220251
1044	NC_009641	TTAA	2	8	52035	52042	50 %	50 %	0 %	0 %	151220251
1045	NC_009641	AAAG	2	8	52050	52057	75 %	0 %	25 %	0 %	151220251
1046	NC_009641	CAA	2	6	52058	52063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	151220251
1047	NC_009641	TTA	2	6	52069	52074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220251
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1050	NC_009641	CAA	2	6	52140	52145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	151220251
1051	NC_009641	TTA	2	6	52146	52151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220251
1052	NC_009641	ACA	2	6	52154	52159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	151220251
1053	NC_009641	GTTAGA	2	12	52160	52171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220251
1054	NC_009641	A	8	8	52179	52186	100 %	0 %	0 %	0 %	151220251
1055	NC_009641	AAAAGA	2	12	52214	52225	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	151220251
1056	NC_009641	ATTA	2	8	52229	52236	50 %	50 %	0 %	0 %	151220251
1057	NC_009641	ACA	2	6	52351	52356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	151220251
1058	NC_009641	ATG	2	6	52360	52365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220251
1059	NC_009641	ATT	3	9	52451	52459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220251
1060	NC_009641	TAA	2	6	52466	52471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151220251
1061	NC_009641	TATT	2	8	52478	52485	25 %	75 %	0 %	0 %	151220251
1062	NC_009641	AATT	2	8	52516	52523	50 %	50 %	0 %	0 %	151220251
1063	NC_009641	AGT	2	6	52580	52585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220251
1064	NC_009641	ACG	2	6	52590	52595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	151220251
1065	NC_009641	TATG	2	8	52613	52620	25 %	50 %	25 %	0 %	151220251
1066	NC_009641	ACT	2	6	52645	52650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151220251
1067	NC_009641	TATT	2	8	52651	52658	25 %	75 %	0 %	0 %	151220251
1068	NC_009641	AGC	2	6	52685	52690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	151220251
1069	NC_009641	A	7	7	52712	52718	100 %	0 %	0 %	0 %	151220251
1070	NC_009641	AAG	2	6	52828	52833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220251
1071	NC_009641	CAAT	2	8	52862	52869	50 %	25 %	0 %	25 %	151220251
1072	NC_009641	A	6	6	52906	52911	100 %	0 %	0 %	0 %	151220251
1073	NC_009641	TAA	3	9	52988	52996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151220251
1074	NC_009641	AGT	2	6	53099	53104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220251
1075	NC_009641	ATT	2	6	53108	53113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220251
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1081	NC_009641	AAGA	2	8	53421	53428	75 %	0 %	25 %	0 %	151220251
1082	NC_009641	AAAG	2	8	53490	53497	75 %	0 %	25 %	0 %	151220251
1083	NC_009641	AAT	2	6	53563	53568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151220252
1084	NC_009641	AAC	2	6	53579	53584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	151220252
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1088	NC_009641	ATCA	2	8	53743	53750	50 %	25 %	0 %	25 %	151220252
1089	NC_009641	ATC	3	9	53759	53767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151220252
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1091	NC_009641	CAT	2	6	53907	53912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151220252
1092	NC_009641	CAG	2	6	53922	53927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	151220252
1093	NC_009641	AT	3	6	53940	53945	50 %	50 %	0 %	0 %	151220252
1094	NC_009641	GGT	2	6	53999	54004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	151220252
1095	NC_009641	TAG	2	6	54294	54299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220253
1096	NC_009641	TGA	2	6	54300	54305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220253
1097	NC_009641	TGGT	2	8	54307	54314	0 %	50 %	50 %	0 %	151220253
1098	NC_009641	TGA	2	6	54376	54381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220253
1099	NC_009641	TTACC	2	10	54487	54496	20 %	40 %	0 %	40 %	151220253
1100	NC_009641	T	6	6	54518	54523	0 %	100 %	0 %	0 %	151220253
1101	NC_009641	ATA	2	6	54549	54554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151220253
1102	NC_009641	TCA	2	6	54565	54570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151220253
1103	NC_009641	CAT	2	6	54587	54592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151220253
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1105	NC_009641	GAA	2	6	54710	54715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220253
1106	NC_009641	ATT	2	6	54729	54734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220253
1107	NC_009641	ATA	2	6	54735	54740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151220253
1108	NC_009641	T	6	6	54759	54764	0 %	100 %	0 %	0 %	151220253
1109	NC_009641	G	6	6	54832	54837	0 %	0 %	100 %	0 %	151220253
1110	NC_009641	TAA	2	6	54916	54921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151220253
1111	NC_009641	A	6	6	54971	54976	100 %	0 %	0 %	0 %	151220253
1112	NC_009641	GCTAAA	2	12	55001	55012	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	151220253
1113	NC_009641	TTG	2	6	55167	55172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	151220253
1114	NC_009641	ATG	2	6	55200	55205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220253
1115	NC_009641	TAA	2	6	55231	55236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151220253
1116	NC_009641	GAT	2	6	55460	55465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220254
1117	NC_009641	ATT	2	6	55494	55499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220254
1118	NC_009641	CTG	2	6	55525	55530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	151220254
1119	NC_009641	AAG	2	6	55546	55551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220254
1120	NC_009641	A	6	6	55573	55578	100 %	0 %	0 %	0 %	151220254
1121	NC_009641	AAGG	2	8	55623	55630	50 %	0 %	50 %	0 %	151220254
1122	NC_009641	TGA	2	6	55637	55642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220254
1123	NC_009641	TAA	2	6	55703	55708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151220254
1124	NC_009641	TA	3	6	55738	55743	50 %	50 %	0 %	0 %	151220254
1125	NC_009641	ACA	2	6	55761	55766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	151220254
1126	NC_009641	TAC	2	6	55773	55778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151220254
1127	NC_009641	A	6	6	55828	55833	100 %	0 %	0 %	0 %	151220254
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1131	NC_009641	A	7	7	55898	55904	100 %	0 %	0 %	0 %	151220254
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1149	NC_009641	AAG	2	6	56579	56584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220255
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1259	NC_009641	CAT	2	6	60882	60887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151220258
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1374	NC_009641	ATG	2	6	67403	67408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220262
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