MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus str. Newman chromosome

Total Repeats: 56203

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009641	TCG	2	6	25537	25542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	151220229
502	NC_009641	GAT	2	6	25562	25567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220229
503	NC_009641	AT	3	6	25582	25587	50 %	50 %	0 %	0 %	151220229
504	NC_009641	TCC	2	6	25614	25619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	151220229
505	NC_009641	AAC	2	6	25620	25625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	151220229
506	NC_009641	AAC	2	6	25659	25664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	151220230
507	NC_009641	GCT	2	6	25765	25770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	151220230
508	NC_009641	AAG	2	6	25781	25786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220230
509	NC_009641	TTA	2	6	25880	25885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220230
510	NC_009641	ATT	3	9	25943	25951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220230
511	NC_009641	CGA	3	9	25953	25961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	151220230
512	NC_009641	AATC	2	8	25981	25988	50 %	25 %	0 %	25 %	151220230
513	NC_009641	GGT	2	6	26069	26074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	151220230
514	NC_009641	TA	3	6	26091	26096	50 %	50 %	0 %	0 %	151220230
515	NC_009641	ATA	2	6	26178	26183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151220230
516	NC_009641	TTG	2	6	26199	26204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	151220230
517	NC_009641	ATT	2	6	26218	26223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220230
518	NC_009641	ACCAA	2	10	26264	26273	60 %	0 %	0 %	40 %	151220230
519	NC_009641	ATG	2	6	26346	26351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220230
520	NC_009641	TAA	2	6	26377	26382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151220230
521	NC_009641	AAG	2	6	26400	26405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220230
522	NC_009641	TAT	2	6	26470	26475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220230
523	NC_009641	CCG	2	6	26485	26490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	151220230
524	NC_009641	AGA	2	6	26545	26550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220230
525	NC_009641	CAT	2	6	26551	26556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151220230
526	NC_009641	GAA	2	6	26606	26611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220230
527	NC_009641	AAT	2	6	26621	26626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151220230
528	NC_009641	TTA	2	6	26636	26641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220230
529	NC_009641	GAA	3	9	26651	26659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220230
530	NC_009641	AAC	3	9	26748	26756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	151220230
531	NC_009641	CGT	2	6	26771	26776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	151220230
532	NC_009641	TTG	2	6	26781	26786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	151220230
533	NC_009641	GAA	2	6	26849	26854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220230
534	NC_009641	GAA	2	6	26906	26911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220230
535	NC_009641	ATCAA	2	10	26976	26985	60 %	20 %	0 %	20 %	151220230
536	NC_009641	TAA	2	6	27016	27021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151220230
537	NC_009641	ATT	2	6	27023	27028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220230
538	NC_009641	ACA	2	6	27056	27061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	151220230
539	NC_009641	GGT	2	6	27323	27328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	151220230
540	NC_009641	ATCT	2	8	27415	27422	25 %	50 %	0 %	25 %	151220230
541	NC_009641	AAT	2	6	27468	27473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151220230
542	NC_009641	ACT	2	6	27503	27508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151220231
543	NC_009641	TGA	2	6	27514	27519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220231
544	NC_009641	AT	3	6	27533	27538	50 %	50 %	0 %	0 %	151220231
545	NC_009641	AAG	2	6	27588	27593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220231
546	NC_009641	GAAAC	2	10	27597	27606	60 %	0 %	20 %	20 %	151220231
547	NC_009641	ATT	2	6	27660	27665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220231
548	NC_009641	ATC	2	6	27679	27684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151220231
549	NC_009641	GAAGT	2	10	27747	27756	40 %	20 %	40 %	0 %	151220231
550	NC_009641	TCG	2	6	27770	27775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	151220231
551	NC_009641	TGA	2	6	27787	27792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220231
552	NC_009641	TAT	2	6	27817	27822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220231
553	NC_009641	ATTTCA	2	12	27898	27909	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	151220231
554	NC_009641	ATG	2	6	27928	27933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220231
555	NC_009641	TGA	2	6	27935	27940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220231
556	NC_009641	AAC	2	6	27992	27997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	151220231
557	NC_009641	T	6	6	28016	28021	0 %	100 %	0 %	0 %	151220231
558	NC_009641	AGC	2	6	28031	28036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	151220231
559	NC_009641	A	6	6	28041	28046	100 %	0 %	0 %	0 %	151220231
560	NC_009641	ATC	2	6	28068	28073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151220231
561	NC_009641	ACAA	2	8	28074	28081	75 %	0 %	0 %	25 %	151220231
562	NC_009641	ACG	2	6	28098	28103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	151220231
563	NC_009641	AATG	2	8	28178	28185	50 %	25 %	25 %	0 %	151220231
564	NC_009641	TCGT	2	8	28210	28217	0 %	50 %	25 %	25 %	151220231
565	NC_009641	GTG	2	6	28228	28233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	151220231
566	NC_009641	ACA	2	6	28243	28248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	151220231
567	NC_009641	ATA	2	6	28249	28254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151220231
568	NC_009641	GAA	2	6	28338	28343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220231
569	NC_009641	TTA	2	6	28366	28371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220231
570	NC_009641	TGG	2	6	28379	28384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	151220231
571	NC_009641	AAT	2	6	28419	28424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151220231
572	NC_009641	TAA	2	6	28475	28480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151220231
573	NC_009641	TCG	2	6	28535	28540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	151220231
574	NC_009641	TTA	2	6	28545	28550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220231
575	NC_009641	GTT	2	6	28560	28565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	151220231
576	NC_009641	ATA	2	6	28579	28584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151220231
577	NC_009641	AACA	2	8	28655	28662	75 %	0 %	0 %	25 %	151220231
578	NC_009641	ATG	2	6	28756	28761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220231
579	NC_009641	TAA	2	6	28877	28882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151220232
580	NC_009641	CA	3	6	28894	28899	50 %	0 %	0 %	50 %	151220232
581	NC_009641	AAG	2	6	28939	28944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220232
582	NC_009641	CTAAAG	2	12	29032	29043	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	151220232
583	NC_009641	TGG	2	6	29069	29074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	151220232
584	NC_009641	ATT	2	6	29078	29083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220232
585	NC_009641	ATG	2	6	29227	29232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220232
586	NC_009641	AGA	2	6	29279	29284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220232
587	NC_009641	CAAT	2	8	29307	29314	50 %	25 %	0 %	25 %	151220232
588	NC_009641	GATG	2	8	29315	29322	25 %	25 %	50 %	0 %	151220232
589	NC_009641	AAG	2	6	29349	29354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220232
590	NC_009641	ATTAT	2	10	29390	29399	40 %	60 %	0 %	0 %	151220232
591	NC_009641	A	6	6	29412	29417	100 %	0 %	0 %	0 %	151220232
592	NC_009641	TGA	2	6	29420	29425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220232
593	NC_009641	TAC	2	6	29448	29453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151220232
594	NC_009641	TGAA	2	8	29461	29468	50 %	25 %	25 %	0 %	151220232
595	NC_009641	TACT	2	8	29537	29544	25 %	50 %	0 %	25 %	151220232
596	NC_009641	ATA	2	6	29560	29565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151220232
597	NC_009641	ATT	2	6	29574	29579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220232
598	NC_009641	GTA	2	6	30015	30020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220233
599	NC_009641	GAAA	2	8	30084	30091	75 %	0 %	25 %	0 %	151220233
600	NC_009641	GAA	2	6	30095	30100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220233
601	NC_009641	GGCA	2	8	30237	30244	25 %	0 %	50 %	25 %	151220233
602	NC_009641	AAAG	2	8	30250	30257	75 %	0 %	25 %	0 %	151220233
603	NC_009641	ATG	2	6	30351	30356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220233
604	NC_009641	ATA	2	6	30384	30389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	151220233
605	NC_009641	AAG	2	6	30395	30400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220233
606	NC_009641	AAC	2	6	30534	30539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	151220233
607	NC_009641	GAAC	2	8	30694	30701	50 %	0 %	25 %	25 %	151220233
608	NC_009641	AAG	2	6	30720	30725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220233
609	NC_009641	AT	3	6	30764	30769	50 %	50 %	0 %	0 %	151220233
610	NC_009641	TTA	2	6	31015	31020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	151220234
611	NC_009641	AGC	2	6	31091	31096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	151220234
612	NC_009641	AAC	2	6	31122	31127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	151220234
613	NC_009641	CAA	2	6	31139	31144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	151220234
614	NC_009641	CAA	2	6	31153	31158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	151220234
615	NC_009641	CAA	2	6	31166	31171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	151220234
616	NC_009641	TCA	2	6	31182	31187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	151220234
617	NC_009641	AAG	2	6	31196	31201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	151220234
618	NC_009641	CAAC	2	8	31205	31212	50 %	0 %	0 %	50 %	151220234
619	NC_009641	ATCAGC	2	12	31215	31226	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	151220234
620	NC_009641	TGA	2	6	31239	31244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220234
621	NC_009641	AGT	2	6	31293	31298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	151220234
622	NC_009641	CAA	2	6	31301	31306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	151220234
623	NC_009641	ACA	2	6	31335	31340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	151220234
624	NC_009641	CA	3	6	31363	31368	50 %	0 %	0 %	50 %	151220234
625	NC_009641	CAC	2	6	31409	31414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	151220234
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627	NC_009641	CAC	2	6	31433	31438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	151220234
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