MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1 chromosome

Total Repeats: 56855

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_009632	GCT	2	6	203915	203920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150392649
4002	NC_009632	TCTT	2	8	203960	203967	0 %	75 %	0 %	25 %	150392649
4003	NC_009632	T	6	6	203982	203987	0 %	100 %	0 %	0 %	150392649
4004	NC_009632	TTG	2	6	204072	204077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392649
4005	NC_009632	TA	3	6	204124	204129	50 %	50 %	0 %	0 %	150392649
4006	NC_009632	ACCTTT	2	12	204160	204171	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	150392649
4007	NC_009632	GTG	2	6	204189	204194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150392649
4008	NC_009632	ATT	2	6	204199	204204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392649
4009	NC_009632	TAA	2	6	204212	204217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392649
4010	NC_009632	AAT	2	6	204532	204537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392650
4011	NC_009632	AAC	2	6	204568	204573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392650
4012	NC_009632	ATG	2	6	204639	204644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392650
4013	NC_009632	CTA	2	6	204681	204686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392650
4014	NC_009632	GCA	2	6	204689	204694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150392650
4015	NC_009632	ATAA	2	8	204721	204728	75 %	25 %	0 %	0 %	150392650
4016	NC_009632	ATG	2	6	204736	204741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392650
4017	NC_009632	CTA	2	6	204749	204754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392650
4018	NC_009632	AAT	2	6	204755	204760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392650
4019	NC_009632	ATA	2	6	204821	204826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392650
4020	NC_009632	ACA	2	6	204987	204992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392650
4021	NC_009632	AGT	2	6	205014	205019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392650
4022	NC_009632	ACC	2	6	205045	205050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150392650
4023	NC_009632	TAG	2	6	205099	205104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392650
4024	NC_009632	AAT	2	6	205111	205116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392650
4025	NC_009632	CAT	2	6	205120	205125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392650
4026	NC_009632	CAA	2	6	205206	205211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392650
4027	NC_009632	TGA	2	6	205212	205217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392650
4028	NC_009632	TGAT	2	8	205288	205295	25 %	50 %	25 %	0 %	150392650
4029	NC_009632	ATGG	2	8	205332	205339	25 %	25 %	50 %	0 %	150392650
4030	NC_009632	ATA	2	6	205350	205355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392650
4031	NC_009632	AAT	2	6	205357	205362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392650
4032	NC_009632	TAA	2	6	205366	205371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392650
4033	NC_009632	AT	3	6	205403	205408	50 %	50 %	0 %	0 %	150392650
4034	NC_009632	A	6	6	205435	205440	100 %	0 %	0 %	0 %	150392650
4035	NC_009632	AGA	2	6	205455	205460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392650
4036	NC_009632	ATAA	2	8	205472	205479	75 %	25 %	0 %	0 %	150392650
4037	NC_009632	ATG	2	6	205530	205535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392650
4038	NC_009632	TTA	2	6	205613	205618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392650
4039	NC_009632	CAG	2	6	205740	205745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150392650
4040	NC_009632	AAGAT	2	10	205766	205775	60 %	20 %	20 %	0 %	150392650
4041	NC_009632	TCT	2	6	205842	205847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150392650
4042	NC_009632	AT	3	6	205850	205855	50 %	50 %	0 %	0 %	150392650
4043	NC_009632	AT	3	6	206138	206143	50 %	50 %	0 %	0 %	150392651
4044	NC_009632	TTGT	2	8	206165	206172	0 %	75 %	25 %	0 %	150392651
4045	NC_009632	CGTTT	2	10	206214	206223	0 %	60 %	20 %	20 %	150392651
4046	NC_009632	TCA	2	6	206231	206236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392651
4047	NC_009632	A	6	6	206247	206252	100 %	0 %	0 %	0 %	150392651
4048	NC_009632	ACC	2	6	206316	206321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150392651
4049	NC_009632	TC	3	6	206419	206424	0 %	50 %	0 %	50 %	150392651
4050	NC_009632	TAA	2	6	206430	206435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392651
4051	NC_009632	ATG	2	6	206436	206441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392651
4052	NC_009632	GTC	2	6	206454	206459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150392651
4053	NC_009632	CTT	2	6	206462	206467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150392651
4054	NC_009632	TGG	2	6	206469	206474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150392651
4055	NC_009632	CAT	2	6	206513	206518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392651
4056	NC_009632	T	6	6	206554	206559	0 %	100 %	0 %	0 %	150392651
4057	NC_009632	TTA	2	6	206578	206583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392651
4058	NC_009632	CTT	2	6	206639	206644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150392651
4059	NC_009632	TTA	2	6	206671	206676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392651
4060	NC_009632	ATC	2	6	206683	206688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392651
4061	NC_009632	ATT	2	6	206753	206758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392652
4062	NC_009632	TGT	2	6	206764	206769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392652
4063	NC_009632	TTC	2	6	206797	206802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150392652
4064	NC_009632	GACA	2	8	206814	206821	50 %	0 %	25 %	25 %	150392652
4065	NC_009632	TGA	2	6	206892	206897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392652
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4067	NC_009632	ATT	2	6	207024	207029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392652
4068	NC_009632	ATA	2	6	207038	207043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392652
4069	NC_009632	AGTT	2	8	207087	207094	25 %	50 %	25 %	0 %	150392652
4070	NC_009632	TAA	3	9	207114	207122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392652
4071	NC_009632	ACG	2	6	207126	207131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150392652
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4074	NC_009632	CAT	2	6	207278	207283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392652
4075	NC_009632	CAT	2	6	207303	207308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392652
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4081	NC_009632	TGA	2	6	207481	207486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392652
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4092	NC_009632	GTAAAT	2	12	207899	207910	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150392652
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4094	NC_009632	GTT	2	6	207961	207966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392652
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4100	NC_009632	GTT	2	6	208385	208390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392652
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4103	NC_009632	AAATG	2	10	208694	208703	60 %	20 %	20 %	0 %	150392653
4104	NC_009632	ATA	2	6	208758	208763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392653
4105	NC_009632	TAA	2	6	208817	208822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392653
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4107	NC_009632	GTAAA	2	10	208858	208867	60 %	20 %	20 %	0 %	150392653
4108	NC_009632	TTTAA	2	10	208878	208887	40 %	60 %	0 %	0 %	150392653
4109	NC_009632	TTG	2	6	208954	208959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392653
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4111	NC_009632	T	6	6	209041	209046	0 %	100 %	0 %	0 %	150392653
4112	NC_009632	TTG	2	6	209128	209133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392653
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4121	NC_009632	AGT	2	6	209527	209532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392653
4122	NC_009632	ACC	2	6	209569	209574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150392653
4123	NC_009632	TTA	2	6	209583	209588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392653
4124	NC_009632	GTA	2	6	209590	209595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392653
4125	NC_009632	ACC	2	6	209621	209626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150392653
4126	NC_009632	AAT	3	9	209706	209714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392653
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4162	NC_009632	CAA	2	6	211850	211855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392654
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4232	NC_009632	GACA	2	8	214689	214696	50 %	0 %	25 %	25 %	150392656
4233	NC_009632	TTG	2	6	214700	214705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392656
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4236	NC_009632	AAAAT	2	10	215006	215015	80 %	20 %	0 %	0 %	150392657
4237	NC_009632	CTA	2	6	215051	215056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392657
4238	NC_009632	ATTTGG	2	12	215121	215132	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	150392657
4239	NC_009632	TTA	2	6	215197	215202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392657
4240	NC_009632	ATG	2	6	215240	215245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392657
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4242	NC_009632	CAT	2	6	215334	215339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392657
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4244	NC_009632	TGA	2	6	215409	215414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392657
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4353	NC_009632	CAA	3	9	221484	221492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392662
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4363	NC_009632	AT	3	6	221790	221795	50 %	50 %	0 %	0 %	150392663
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4374	NC_009632	GTAG	2	8	222125	222132	25 %	25 %	50 %	0 %	150392663
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4485	NC_009632	AC	3	6	225834	225839	50 %	0 %	0 %	50 %	150392667
4486	NC_009632	T	7	7	225851	225857	0 %	100 %	0 %	0 %	150392667
4487	NC_009632	TA	3	6	225903	225908	50 %	50 %	0 %	0 %	150392667
4488	NC_009632	AGA	2	6	225967	225972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392667
4489	NC_009632	TA	3	6	225987	225992	50 %	50 %	0 %	0 %	150392667
4490	NC_009632	TTA	2	6	226037	226042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392667
4491	NC_009632	TAT	2	6	226059	226064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392667
4492	NC_009632	A	7	7	226101	226107	100 %	0 %	0 %	0 %	150392667
4493	NC_009632	AAAGA	2	10	226139	226148	80 %	0 %	20 %	0 %	150392667
4494	NC_009632	TAA	2	6	226149	226154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392667
4495	NC_009632	ATTT	2	8	226202	226209	25 %	75 %	0 %	0 %	150392667
4496	NC_009632	GATG	2	8	226217	226224	25 %	25 %	50 %	0 %	150392667
4497	NC_009632	GTT	2	6	226279	226284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392667
4498	NC_009632	GAA	2	6	226313	226318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392667
4499	NC_009632	GTA	2	6	226341	226346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392668
4500	NC_009632	TA	3	6	226345	226350	50 %	50 %	0 %	0 %	150392668

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