MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1 chromosome

Total Repeats: 56855

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_009632	TGATT	2	10	178303	178312	20 %	60 %	20 %	0 %	150392631
3502	NC_009632	CCA	2	6	178397	178402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150392631
3503	NC_009632	TGT	2	6	178456	178461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392631
3504	NC_009632	TAAA	2	8	178479	178486	75 %	25 %	0 %	0 %	150392631
3505	NC_009632	T	6	6	178511	178516	0 %	100 %	0 %	0 %	150392631
3506	NC_009632	TAA	2	6	178520	178525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392631
3507	NC_009632	CAAAA	2	10	178556	178565	80 %	0 %	0 %	20 %	150392631
3508	NC_009632	A	6	6	178562	178567	100 %	0 %	0 %	0 %	150392631
3509	NC_009632	A	6	6	178579	178584	100 %	0 %	0 %	0 %	150392631
3510	NC_009632	TTTA	2	8	179138	179145	25 %	75 %	0 %	0 %	150392632
3511	NC_009632	AAAGAT	2	12	179238	179249	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	150392632
3512	NC_009632	AAT	2	6	179391	179396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392632
3513	NC_009632	ACA	2	6	179415	179420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392632
3514	NC_009632	TGC	2	6	179438	179443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150392632
3515	NC_009632	ATT	2	6	179455	179460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392632
3516	NC_009632	AGA	2	6	179480	179485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392632
3517	NC_009632	CGT	2	6	179546	179551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150392632
3518	NC_009632	TGT	2	6	179558	179563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392632
3519	NC_009632	GCCA	2	8	179606	179613	25 %	0 %	25 %	50 %	150392632
3520	NC_009632	TGC	2	6	179615	179620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150392632
3521	NC_009632	ATG	2	6	179767	179772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392632
3522	NC_009632	GCA	2	6	179832	179837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150392632
3523	NC_009632	TGG	2	6	179867	179872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150392632
3524	NC_009632	GAT	2	6	179895	179900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392632
3525	NC_009632	ATT	2	6	179981	179986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392632
3526	NC_009632	A	6	6	179995	180000	100 %	0 %	0 %	0 %	150392632
3527	NC_009632	AT	3	6	180125	180130	50 %	50 %	0 %	0 %	150392632
3528	NC_009632	GCA	2	6	180135	180140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150392632
3529	NC_009632	GGT	2	6	180168	180173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150392632
3530	NC_009632	TTC	2	6	180207	180212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150392632
3531	NC_009632	ATC	2	6	180244	180249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392632
3532	NC_009632	AAG	2	6	180262	180267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392632
3533	NC_009632	AAG	2	6	180313	180318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392632
3534	NC_009632	GTAC	2	8	180408	180415	25 %	25 %	25 %	25 %	150392632
3535	NC_009632	TGG	2	6	180467	180472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150392632
3536	NC_009632	A	6	6	180477	180482	100 %	0 %	0 %	0 %	150392632
3537	NC_009632	CAA	2	6	180528	180533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392632
3538	NC_009632	TCA	2	6	181275	181280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392633
3539	NC_009632	ATC	2	6	181286	181291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392633
3540	NC_009632	A	6	6	181292	181297	100 %	0 %	0 %	0 %	150392633
3541	NC_009632	CAA	2	6	181300	181305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392633
3542	NC_009632	ATC	2	6	181336	181341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392633
3543	NC_009632	TTCAT	2	10	181410	181419	20 %	60 %	0 %	20 %	150392633
3544	NC_009632	ATTT	2	8	181462	181469	25 %	75 %	0 %	0 %	150392633
3545	NC_009632	TAT	2	6	181596	181601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392633
3546	NC_009632	ATT	2	6	181666	181671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392633
3547	NC_009632	AAG	2	6	181703	181708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392633
3548	NC_009632	CAATAT	2	12	181710	181721	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	150392633
3549	NC_009632	TTTAC	2	10	181793	181802	20 %	60 %	0 %	20 %	150392633
3550	NC_009632	CAT	2	6	181812	181817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392633
3551	NC_009632	TCA	2	6	181847	181852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392633
3552	NC_009632	GTG	2	6	181859	181864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150392633
3553	NC_009632	ACA	2	6	182002	182007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392633
3554	NC_009632	ATT	2	6	182012	182017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392633
3555	NC_009632	TGT	2	6	182031	182036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392633
3556	NC_009632	A	6	6	182044	182049	100 %	0 %	0 %	0 %	150392633
3557	NC_009632	TGA	2	6	182058	182063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392633
3558	NC_009632	ATC	2	6	182085	182090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392633
3559	NC_009632	TTG	2	6	182092	182097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392633
3560	NC_009632	ATAA	2	8	182187	182194	75 %	25 %	0 %	0 %	150392633
3561	NC_009632	CAT	2	6	182434	182439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392634
3562	NC_009632	TCA	2	6	182520	182525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392634
3563	NC_009632	TGTA	2	8	182528	182535	25 %	50 %	25 %	0 %	150392634
3564	NC_009632	ATG	2	6	182547	182552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392634
3565	NC_009632	ATT	2	6	182813	182818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392635
3566	NC_009632	TTA	2	6	182820	182825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392635
3567	NC_009632	AGA	2	6	182858	182863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392635
3568	NC_009632	GCA	2	6	182877	182882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150392635
3569	NC_009632	TTATT	2	10	182948	182957	20 %	80 %	0 %	0 %	150392635
3570	NC_009632	AAG	2	6	183028	183033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392635
3571	NC_009632	GAA	2	6	183171	183176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392635
3572	NC_009632	ATGT	2	8	183205	183212	25 %	50 %	25 %	0 %	150392635
3573	NC_009632	TGA	2	6	183251	183256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392635
3574	NC_009632	CG	4	8	183270	183277	0 %	0 %	50 %	50 %	150392635
3575	NC_009632	TAA	2	6	183318	183323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392635
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3577	NC_009632	ACA	2	6	183682	183687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392636
3578	NC_009632	CATC	2	8	183815	183822	25 %	25 %	0 %	50 %	150392636
3579	NC_009632	ATT	2	6	183836	183841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392636
3580	NC_009632	ACA	2	6	183856	183861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392636
3581	NC_009632	CAT	2	6	183893	183898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392636
3582	NC_009632	TGC	2	6	183903	183908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150392636
3583	NC_009632	ACA	2	6	183927	183932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392636
3584	NC_009632	GGATT	2	10	183936	183945	20 %	40 %	40 %	0 %	150392636
3585	NC_009632	TGA	2	6	183961	183966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392636
3586	NC_009632	AGA	2	6	184000	184005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392636
3587	NC_009632	AAC	2	6	184047	184052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392636
3588	NC_009632	GATG	2	8	184099	184106	25 %	25 %	50 %	0 %	150392636
3589	NC_009632	TAT	2	6	184189	184194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392636
3590	NC_009632	TGA	2	6	184213	184218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392636
3591	NC_009632	ATT	2	6	184268	184273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392636
3592	NC_009632	ATC	3	9	184368	184376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392636
3593	NC_009632	ATT	2	6	184392	184397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392636
3594	NC_009632	TCA	2	6	184438	184443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392637
3595	NC_009632	TGA	3	9	184564	184572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392637
3596	NC_009632	A	6	6	184575	184580	100 %	0 %	0 %	0 %	150392637
3597	NC_009632	TTA	2	6	184581	184586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392637
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3600	NC_009632	CAT	2	6	184755	184760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392637
3601	NC_009632	TAA	2	6	184808	184813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392637
3602	NC_009632	GAT	2	6	184818	184823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392637
3603	NC_009632	CAG	2	6	184933	184938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150392637
3604	NC_009632	TGA	2	6	185045	185050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392637
3605	NC_009632	TG	3	6	185073	185078	0 %	50 %	50 %	0 %	150392637
3606	NC_009632	ATGA	2	8	185163	185170	50 %	25 %	25 %	0 %	150392637
3607	NC_009632	GCAA	2	8	185173	185180	50 %	0 %	25 %	25 %	150392637
3608	NC_009632	CAT	2	6	185199	185204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392637
3609	NC_009632	ACA	2	6	185309	185314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392637
3610	NC_009632	ATG	2	6	185338	185343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392637
3611	NC_009632	TTG	2	6	185347	185352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392637
3612	NC_009632	AGG	2	6	185368	185373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150392637
3613	NC_009632	TAT	2	6	185419	185424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392638
3614	NC_009632	TAT	2	6	185431	185436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392638
3615	NC_009632	ATT	3	9	185462	185470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392638
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3618	NC_009632	CTT	2	6	185629	185634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150392638
3619	NC_009632	GGAA	2	8	185639	185646	50 %	0 %	50 %	0 %	150392638
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3621	NC_009632	TTGGTA	2	12	185736	185747	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	150392638
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3740	NC_009632	GT	3	6	191735	191740	0 %	50 %	50 %	0 %	150392643
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3866	NC_009632	CAT	2	6	196999	197004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392643
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3893	NC_009632	TAAG	2	8	198216	198223	50 %	25 %	25 %	0 %	150392643
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3983	NC_009632	AATT	2	8	202967	202974	50 %	50 %	0 %	0 %	150392648
3984	NC_009632	ATC	2	6	203016	203021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392648
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3986	NC_009632	GCA	2	6	203204	203209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150392649
3987	NC_009632	TAAA	2	8	203232	203239	75 %	25 %	0 %	0 %	150392649
3988	NC_009632	TAA	2	6	203293	203298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392649
3989	NC_009632	GTT	2	6	203331	203336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392649
3990	NC_009632	ACC	2	6	203389	203394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150392649
3991	NC_009632	CAT	2	6	203436	203441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392649
3992	NC_009632	CAG	2	6	203454	203459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150392649
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3995	NC_009632	AT	3	6	203627	203632	50 %	50 %	0 %	0 %	150392649
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