MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1 chromosome

Total Repeats: 56855

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_009632	AAAT	2	8	154288	154295	75 %	25 %	0 %	0 %	150392609
3002	NC_009632	T	6	6	154511	154516	0 %	100 %	0 %	0 %	150392610
3003	NC_009632	AGCC	2	8	154563	154570	25 %	0 %	25 %	50 %	150392610
3004	NC_009632	AAC	2	6	154807	154812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392610
3005	NC_009632	CAA	2	6	154860	154865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392610
3006	NC_009632	TGG	2	6	154916	154921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150392610
3007	NC_009632	CCGA	2	8	154950	154957	25 %	0 %	25 %	50 %	150392610
3008	NC_009632	AGATAT	2	12	155009	155020	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150392610
3009	NC_009632	TTA	2	6	155023	155028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392610
3010	NC_009632	TGA	2	6	155129	155134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392610
3011	NC_009632	GAT	2	6	155181	155186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392610
3012	NC_009632	TGA	2	6	155201	155206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392610
3013	NC_009632	TAC	2	6	155258	155263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392610
3014	NC_009632	ATATG	2	10	155270	155279	40 %	40 %	20 %	0 %	150392610
3015	NC_009632	A	6	6	155353	155358	100 %	0 %	0 %	0 %	150392610
3016	NC_009632	TTTG	2	8	155384	155391	0 %	75 %	25 %	0 %	150392610
3017	NC_009632	CAAG	2	8	155408	155415	50 %	0 %	25 %	25 %	150392610
3018	NC_009632	TTA	2	6	155434	155439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392610
3019	NC_009632	GTG	2	6	155482	155487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150392610
3020	NC_009632	AAG	2	6	155497	155502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392610
3021	NC_009632	CAG	2	6	155515	155520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150392610
3022	NC_009632	ATG	2	6	155539	155544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392610
3023	NC_009632	AAGT	2	8	155545	155552	50 %	25 %	25 %	0 %	150392610
3024	NC_009632	AT	4	8	155599	155606	50 %	50 %	0 %	0 %	150392610
3025	NC_009632	ATG	2	6	155664	155669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392610
3026	NC_009632	AAT	2	6	155718	155723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392610
3027	NC_009632	GGT	2	6	155739	155744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150392610
3028	NC_009632	T	6	6	155816	155821	0 %	100 %	0 %	0 %	150392610
3029	NC_009632	ATA	2	6	155827	155832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392610
3030	NC_009632	GTT	2	6	155853	155858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392610
3031	NC_009632	AAG	2	6	156052	156057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392611
3032	NC_009632	GA	3	6	156111	156116	50 %	0 %	50 %	0 %	150392611
3033	NC_009632	ATGCCT	2	12	156148	156159	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	150392611
3034	NC_009632	CAT	2	6	156241	156246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392611
3035	NC_009632	TAA	2	6	156269	156274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392611
3036	NC_009632	ATA	2	6	156289	156294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392611
3037	NC_009632	TGA	2	6	156326	156331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392611
3038	NC_009632	A	7	7	156331	156337	100 %	0 %	0 %	0 %	150392611
3039	NC_009632	TAT	2	6	156484	156489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392611
3040	NC_009632	AAG	2	6	156499	156504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392611
3041	NC_009632	T	6	6	156530	156535	0 %	100 %	0 %	0 %	150392611
3042	NC_009632	ATT	2	6	156537	156542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392611
3043	NC_009632	TGA	2	6	156629	156634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392611
3044	NC_009632	TAG	2	6	156661	156666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392611
3045	NC_009632	AGA	2	6	156671	156676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392611
3046	NC_009632	GAA	2	6	156690	156695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392611
3047	NC_009632	TGAAAG	2	12	156788	156799	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	150392611
3048	NC_009632	A	6	6	156876	156881	100 %	0 %	0 %	0 %	150392612
3049	NC_009632	A	6	6	156919	156924	100 %	0 %	0 %	0 %	150392612
3050	NC_009632	ATG	2	6	156926	156931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392612
3051	NC_009632	TATGA	2	10	156950	156959	40 %	40 %	20 %	0 %	150392612
3052	NC_009632	TTA	2	6	156990	156995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392612
3053	NC_009632	AGC	2	6	156999	157004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150392612
3054	NC_009632	TAA	2	6	157017	157022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392612
3055	NC_009632	A	6	6	157057	157062	100 %	0 %	0 %	0 %	150392612
3056	NC_009632	ATA	2	6	157161	157166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392612
3057	NC_009632	TAA	2	6	157179	157184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392612
3058	NC_009632	TTG	2	6	157199	157204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392612
3059	NC_009632	TAAA	2	8	157224	157231	75 %	25 %	0 %	0 %	150392612
3060	NC_009632	AAAG	2	8	157232	157239	75 %	0 %	25 %	0 %	150392612
3061	NC_009632	TTC	2	6	157275	157280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150392612
3062	NC_009632	TAT	2	6	157302	157307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392612
3063	NC_009632	TA	3	6	157333	157338	50 %	50 %	0 %	0 %	150392612
3064	NC_009632	TAT	2	6	157402	157407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392612
3065	NC_009632	G	6	6	157422	157427	0 %	0 %	100 %	0 %	150392612
3066	NC_009632	TTA	2	6	157502	157507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392612
3067	NC_009632	GAA	2	6	157514	157519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392612
3068	NC_009632	TAC	2	6	157566	157571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392612
3069	NC_009632	GAA	2	6	157574	157579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392612
3070	NC_009632	A	6	6	157586	157591	100 %	0 %	0 %	0 %	150392612
3071	NC_009632	A	6	6	157610	157615	100 %	0 %	0 %	0 %	150392612
3072	NC_009632	ATT	2	6	157626	157631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392612
3073	NC_009632	GAAA	2	8	157642	157649	75 %	0 %	25 %	0 %	150392612
3074	NC_009632	TTA	2	6	157687	157692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392612
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3077	NC_009632	A	6	6	157745	157750	100 %	0 %	0 %	0 %	150392612
3078	NC_009632	GAC	2	6	157775	157780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150392612
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3081	NC_009632	ATT	2	6	157869	157874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392612
3082	NC_009632	ATC	2	6	157899	157904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392612
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3084	NC_009632	TA	3	6	157974	157979	50 %	50 %	0 %	0 %	150392612
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3087	NC_009632	A	6	6	158453	158458	100 %	0 %	0 %	0 %	150392613
3088	NC_009632	AAG	2	6	158487	158492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392613
3089	NC_009632	TCA	2	6	158509	158514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392613
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3092	NC_009632	TA	3	6	158584	158589	50 %	50 %	0 %	0 %	150392613
3093	NC_009632	AT	4	8	158626	158633	50 %	50 %	0 %	0 %	150392613
3094	NC_009632	ATT	2	6	158666	158671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392613
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3098	NC_009632	TCG	2	6	158837	158842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150392613
3099	NC_009632	GCA	2	6	158849	158854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150392613
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3101	NC_009632	CAA	2	6	158934	158939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392613
3102	NC_009632	GGT	2	6	158984	158989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150392613
3103	NC_009632	A	6	6	159069	159074	100 %	0 %	0 %	0 %	150392613
3104	NC_009632	CA	3	6	159078	159083	50 %	0 %	0 %	50 %	150392613
3105	NC_009632	A	6	6	159227	159232	100 %	0 %	0 %	0 %	150392613
3106	NC_009632	ATGA	2	8	159263	159270	50 %	25 %	25 %	0 %	150392613
3107	NC_009632	A	6	6	159273	159278	100 %	0 %	0 %	0 %	150392613
3108	NC_009632	AC	3	6	159483	159488	50 %	0 %	0 %	50 %	150392613
3109	NC_009632	TGG	2	6	159496	159501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150392613
3110	NC_009632	AC	3	6	159508	159513	50 %	0 %	0 %	50 %	150392613
3111	NC_009632	AGA	2	6	159529	159534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392613
3112	NC_009632	TTA	2	6	159710	159715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392613
3113	NC_009632	ACG	2	6	159736	159741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150392613
3114	NC_009632	TAA	2	6	159742	159747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392613
3115	NC_009632	ATTT	2	8	159776	159783	25 %	75 %	0 %	0 %	150392613
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3118	NC_009632	TGA	2	6	159834	159839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392613
3119	NC_009632	TGGTA	2	10	159853	159862	20 %	40 %	40 %	0 %	150392613
3120	NC_009632	CGAAC	2	10	159943	159952	40 %	0 %	20 %	40 %	150392613
3121	NC_009632	TA	3	6	159969	159974	50 %	50 %	0 %	0 %	150392613
3122	NC_009632	ATG	2	6	159986	159991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392613
3123	NC_009632	TGG	3	9	160024	160032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150392613
3124	NC_009632	GATG	2	8	160039	160046	25 %	25 %	50 %	0 %	150392613
3125	NC_009632	CAT	2	6	160086	160091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392613
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3132	NC_009632	TAC	2	6	160617	160622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392613
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3153	NC_009632	TTAA	2	8	161982	161989	50 %	50 %	0 %	0 %	150392614
3154	NC_009632	A	6	6	162010	162015	100 %	0 %	0 %	0 %	150392615
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3157	NC_009632	CAT	2	6	162097	162102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392615
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3233	NC_009632	ATTA	2	8	165311	165318	50 %	50 %	0 %	0 %	150392618
3234	NC_009632	T	6	6	165391	165396	0 %	100 %	0 %	0 %	150392618
3235	NC_009632	A	6	6	165408	165413	100 %	0 %	0 %	0 %	150392618
3236	NC_009632	A	7	7	165428	165434	100 %	0 %	0 %	0 %	150392618
3237	NC_009632	TAA	2	6	165437	165442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392618
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3244	NC_009632	GTT	2	6	165915	165920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392618
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3492	NC_009632	ATA	2	6	177886	177891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392629
3493	NC_009632	ATA	2	6	178001	178006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392630
3494	NC_009632	TCA	2	6	178027	178032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392630
3495	NC_009632	CTT	2	6	178058	178063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150392630
3496	NC_009632	ATT	2	6	178086	178091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392630
3497	NC_009632	TTG	2	6	178173	178178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392630
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