MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1 chromosome

Total Repeats: 56855

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009632	TGAATT	2	12	25540	25551	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	150392498
502	NC_009632	ATT	2	6	25557	25562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392498
503	NC_009632	TTA	2	6	25601	25606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392498
504	NC_009632	GTAC	2	8	25640	25647	25 %	25 %	25 %	25 %	150392498
505	NC_009632	TCG	2	6	25663	25668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150392498
506	NC_009632	GAT	2	6	25688	25693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392498
507	NC_009632	AT	3	6	25708	25713	50 %	50 %	0 %	0 %	150392498
508	NC_009632	TCC	2	6	25740	25745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150392498
509	NC_009632	AAC	2	6	25746	25751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392498
510	NC_009632	AAC	2	6	25785	25790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392499
511	NC_009632	AAT	2	6	25874	25879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392499
512	NC_009632	GCT	2	6	25891	25896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150392499
513	NC_009632	AAG	2	6	25907	25912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392499
514	NC_009632	TTA	2	6	26006	26011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392499
515	NC_009632	ATT	3	9	26069	26077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392499
516	NC_009632	CGA	3	9	26079	26087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150392499
517	NC_009632	AATC	2	8	26107	26114	50 %	25 %	0 %	25 %	150392499
518	NC_009632	GGT	2	6	26195	26200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150392499
519	NC_009632	TA	3	6	26217	26222	50 %	50 %	0 %	0 %	150392499
520	NC_009632	ATA	2	6	26304	26309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392499
521	NC_009632	TTG	2	6	26325	26330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392499
522	NC_009632	ATT	2	6	26344	26349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392499
523	NC_009632	ACCAA	2	10	26390	26399	60 %	0 %	0 %	40 %	150392499
524	NC_009632	ATG	2	6	26472	26477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392499
525	NC_009632	TAA	2	6	26503	26508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392499
526	NC_009632	AAG	2	6	26526	26531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392499
527	NC_009632	TAT	2	6	26596	26601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392499
528	NC_009632	CCG	2	6	26611	26616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150392499
529	NC_009632	AGA	2	6	26671	26676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392499
530	NC_009632	CAT	2	6	26677	26682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392499
531	NC_009632	GAA	2	6	26732	26737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392499
532	NC_009632	AAT	2	6	26747	26752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392499
533	NC_009632	T	6	6	26758	26763	0 %	100 %	0 %	0 %	150392499
534	NC_009632	GAA	3	9	26777	26785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392499
535	NC_009632	AAC	3	9	26874	26882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392499
536	NC_009632	CGT	2	6	26897	26902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150392499
537	NC_009632	TTG	2	6	26907	26912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392499
538	NC_009632	GAA	2	6	26975	26980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392499
539	NC_009632	GAA	2	6	27032	27037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392499
540	NC_009632	ATCAA	2	10	27102	27111	60 %	20 %	0 %	20 %	150392499
541	NC_009632	TAA	2	6	27142	27147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392499
542	NC_009632	ATT	2	6	27149	27154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392499
543	NC_009632	ACA	2	6	27182	27187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392499
544	NC_009632	GGT	2	6	27449	27454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150392499
545	NC_009632	ATCT	2	8	27541	27548	25 %	50 %	0 %	25 %	150392499
546	NC_009632	AAT	2	6	27594	27599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392499
547	NC_009632	TGA	2	6	27640	27645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392500
548	NC_009632	AT	3	6	27659	27664	50 %	50 %	0 %	0 %	150392500
549	NC_009632	AAG	2	6	27714	27719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392500
550	NC_009632	GAAAC	2	10	27723	27732	60 %	0 %	20 %	20 %	150392500
551	NC_009632	ATT	2	6	27786	27791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392500
552	NC_009632	ATC	2	6	27805	27810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392500
553	NC_009632	GAAGT	2	10	27873	27882	40 %	20 %	40 %	0 %	150392500
554	NC_009632	TCG	2	6	27896	27901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150392500
555	NC_009632	TGA	2	6	27913	27918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392500
556	NC_009632	ATT	2	6	27944	27949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392500
557	NC_009632	ATTTCA	2	12	28024	28035	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	150392500
558	NC_009632	ATG	2	6	28054	28059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392500
559	NC_009632	TGA	2	6	28061	28066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392500
560	NC_009632	AAC	2	6	28118	28123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392500
561	NC_009632	T	6	6	28142	28147	0 %	100 %	0 %	0 %	150392500
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563	NC_009632	A	6	6	28167	28172	100 %	0 %	0 %	0 %	150392500
564	NC_009632	ATC	2	6	28194	28199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392500
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567	NC_009632	AATG	2	8	28304	28311	50 %	25 %	25 %	0 %	150392500
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571	NC_009632	ATA	2	6	28375	28380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392500
572	NC_009632	GAA	2	6	28464	28469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392500
573	NC_009632	TTA	2	6	28492	28497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392500
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579	NC_009632	AACA	2	8	28781	28788	75 %	0 %	0 %	25 %	150392500
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582	NC_009632	CA	3	6	29020	29025	50 %	0 %	0 %	50 %	150392501
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585	NC_009632	ATT	2	6	29204	29209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392501
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587	NC_009632	AATT	2	8	29318	29325	50 %	50 %	0 %	0 %	150392501
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590	NC_009632	GATG	2	8	29441	29448	25 %	25 %	50 %	0 %	150392501
591	NC_009632	AAG	2	6	29475	29480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392501
592	NC_009632	ATTAT	2	10	29516	29525	40 %	60 %	0 %	0 %	150392501
593	NC_009632	A	6	6	29538	29543	100 %	0 %	0 %	0 %	150392501
594	NC_009632	TGA	2	6	29546	29551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392501
595	NC_009632	TAC	2	6	29574	29579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392501
596	NC_009632	AACGA	2	10	29589	29598	60 %	0 %	20 %	20 %	150392501
597	NC_009632	TACT	2	8	29663	29670	25 %	50 %	0 %	25 %	150392501
598	NC_009632	ATA	2	6	29686	29691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392501
599	NC_009632	ATT	2	6	29700	29705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392501
600	NC_009632	GTA	2	6	30140	30145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392502
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602	NC_009632	GGCA	2	8	30362	30369	25 %	0 %	50 %	25 %	150392502
603	NC_009632	AAAG	2	8	30375	30382	75 %	0 %	25 %	0 %	150392502
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605	NC_009632	ATA	2	6	30509	30514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392502
606	NC_009632	AAG	2	6	30520	30525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392502
607	NC_009632	AAC	2	6	30659	30664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392502
608	NC_009632	GAAC	2	8	30819	30826	50 %	0 %	25 %	25 %	150392502
609	NC_009632	AAG	2	6	30845	30850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392502
610	NC_009632	AT	3	6	30889	30894	50 %	50 %	0 %	0 %	150392502
611	NC_009632	TTA	2	6	31139	31144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392503
612	NC_009632	GTA	2	6	31241	31246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392503
613	NC_009632	CAA	2	6	31263	31268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392503
614	NC_009632	CAA	2	6	31277	31282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392503
615	NC_009632	CAA	2	6	31290	31295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392503
616	NC_009632	TCA	2	6	31306	31311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392503
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618	NC_009632	CAAC	2	8	31329	31336	50 %	0 %	0 %	50 %	150392503
619	NC_009632	ATCAGC	2	12	31339	31350	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	150392503
620	NC_009632	TGA	2	6	31363	31368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392503
621	NC_009632	CAG	2	6	31416	31421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150392503
622	NC_009632	CAA	2	6	31425	31430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392503
623	NC_009632	AAACG	2	10	31435	31444	60 %	0 %	20 %	20 %	150392503
624	NC_009632	ACA	2	6	31459	31464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392503
625	NC_009632	CAC	2	6	31533	31538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150392503
626	NC_009632	TGC	2	6	31546	31551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150392503
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