MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1 chromosome

Total Repeats: 56855

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_009632	T	6	6	226398	226403	0 %	100 %	0 %	0 %	150392668
4502	NC_009632	ATT	2	6	226425	226430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392668
4503	NC_009632	TA	3	6	226440	226445	50 %	50 %	0 %	0 %	150392668
4504	NC_009632	A	8	8	226463	226470	100 %	0 %	0 %	0 %	150392668
4505	NC_009632	AAT	2	6	226479	226484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392668
4506	NC_009632	AAT	2	6	226496	226501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392669
4507	NC_009632	CTAT	2	8	226523	226530	25 %	50 %	0 %	25 %	150392669
4508	NC_009632	ACAA	2	8	226570	226577	75 %	0 %	0 %	25 %	150392669
4509	NC_009632	CT	3	6	226609	226614	0 %	50 %	0 %	50 %	150392669
4510	NC_009632	GA	3	6	226671	226676	50 %	0 %	50 %	0 %	150392669
4511	NC_009632	TTTA	2	8	227196	227203	25 %	75 %	0 %	0 %	150392670
4512	NC_009632	ATA	2	6	227261	227266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392670
4513	NC_009632	TCT	2	6	227267	227272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150392670
4514	NC_009632	CATGT	2	10	227344	227353	20 %	40 %	20 %	20 %	150392670
4515	NC_009632	TGA	2	6	227355	227360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392670
4516	NC_009632	ATAA	2	8	227361	227368	75 %	25 %	0 %	0 %	150392670
4517	NC_009632	TAA	2	6	227398	227403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392670
4518	NC_009632	GAT	2	6	227407	227412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392670
4519	NC_009632	TTGAA	2	10	227419	227428	40 %	40 %	20 %	0 %	150392670
4520	NC_009632	TCG	2	6	227450	227455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150392670
4521	NC_009632	CCA	2	6	227516	227521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150392670
4522	NC_009632	AAC	2	6	227576	227581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392670
4523	NC_009632	TAA	2	6	227595	227600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392670
4524	NC_009632	TCA	2	6	227603	227608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392670
4525	NC_009632	ATGA	2	8	227626	227633	50 %	25 %	25 %	0 %	150392670
4526	NC_009632	TCA	2	6	227735	227740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392670
4527	NC_009632	TAAA	2	8	227745	227752	75 %	25 %	0 %	0 %	150392670
4528	NC_009632	CGA	2	6	227805	227810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150392670
4529	NC_009632	CCCTGA	2	12	227833	227844	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	150392670
4530	NC_009632	TAA	2	6	227959	227964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392670
4531	NC_009632	TGA	2	6	227999	228004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392670
4532	NC_009632	TGT	2	6	228044	228049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392670
4533	NC_009632	TCG	2	6	228116	228121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150392670
4534	NC_009632	GTGA	2	8	228148	228155	25 %	25 %	50 %	0 %	150392670
4535	NC_009632	ATA	2	6	228161	228166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392670
4536	NC_009632	GTT	2	6	228239	228244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392670
4537	NC_009632	ACC	2	6	228313	228318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150392670
4538	NC_009632	TTTG	2	8	228450	228457	0 %	75 %	25 %	0 %	150392670
4539	NC_009632	AG	3	6	228484	228489	50 %	0 %	50 %	0 %	150392670
4540	NC_009632	TGT	2	6	228530	228535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150392670
4541	NC_009632	ATT	2	6	228553	228558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392670
4542	NC_009632	AAT	2	6	228577	228582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392670
4543	NC_009632	TG	3	6	228595	228600	0 %	50 %	50 %	0 %	150392670
4544	NC_009632	GTA	2	6	228615	228620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392670
4545	NC_009632	TCCTGA	2	12	228652	228663	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	150392670
4546	NC_009632	CAA	2	6	228669	228674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392670
4547	NC_009632	T	7	7	228688	228694	0 %	100 %	0 %	0 %	150392670
4548	NC_009632	T	6	6	228713	228718	0 %	100 %	0 %	0 %	150392670
4549	NC_009632	TCA	2	6	228737	228742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392670
4550	NC_009632	AATTG	2	10	228744	228753	40 %	40 %	20 %	0 %	150392670
4551	NC_009632	TAA	2	6	228775	228780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392670
4552	NC_009632	ATG	2	6	228788	228793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392670
4553	NC_009632	TAT	2	6	228945	228950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392671
4554	NC_009632	TTTTC	2	10	228993	229002	0 %	80 %	0 %	20 %	150392671
4555	NC_009632	A	6	6	229012	229017	100 %	0 %	0 %	0 %	150392671
4556	NC_009632	TAA	2	6	229027	229032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392671
4557	NC_009632	GCA	2	6	229087	229092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150392671
4558	NC_009632	CA	3	6	229102	229107	50 %	0 %	0 %	50 %	150392671
4559	NC_009632	AAG	2	6	229116	229121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150392671
4560	NC_009632	TAT	2	6	229206	229211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392671
4561	NC_009632	TCA	2	6	229221	229226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392671
4562	NC_009632	TATT	2	8	229270	229277	25 %	75 %	0 %	0 %	150392671
4563	NC_009632	TTAG	2	8	229286	229293	25 %	50 %	25 %	0 %	150392671
4564	NC_009632	AT	3	6	229294	229299	50 %	50 %	0 %	0 %	150392671
4565	NC_009632	TCA	2	6	229329	229334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392671
4566	NC_009632	GT	3	6	229350	229355	0 %	50 %	50 %	0 %	150392671
4567	NC_009632	CAA	2	6	229413	229418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392671
4568	NC_009632	TCAAT	2	10	229432	229441	40 %	40 %	0 %	20 %	150392671
4569	NC_009632	CAT	2	6	229448	229453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392671
4570	NC_009632	TTATT	2	10	229465	229474	20 %	80 %	0 %	0 %	150392671
4571	NC_009632	AAT	2	6	229579	229584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392671
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4573	NC_009632	TAT	2	6	229636	229641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392671
4574	NC_009632	TAT	2	6	229731	229736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392671
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4581	NC_009632	TCT	2	6	229996	230001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150392671
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4584	NC_009632	CAG	2	6	230103	230108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150392671
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4586	NC_009632	TA	4	8	230124	230131	50 %	50 %	0 %	0 %	150392671
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4588	NC_009632	AT	3	6	230166	230171	50 %	50 %	0 %	0 %	150392671
4589	NC_009632	ACA	2	6	230242	230247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392672
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4592	NC_009632	AACA	2	8	230417	230424	75 %	0 %	0 %	25 %	150392672
4593	NC_009632	CAT	2	6	230431	230436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392672
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4601	NC_009632	TCAATT	2	12	230803	230814	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	150392672
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4604	NC_009632	TAA	2	6	230891	230896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392672
4605	NC_009632	CAT	2	6	230927	230932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392672
4606	NC_009632	ATT	2	6	230950	230955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392672
4607	NC_009632	CAT	2	6	230957	230962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392672
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4609	NC_009632	CAT	2	6	231014	231019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392672
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4612	NC_009632	AGT	2	6	231196	231201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392672
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4618	NC_009632	GCGA	2	8	231522	231529	25 %	0 %	50 %	25 %	150392673
4619	NC_009632	CAA	2	6	231531	231536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150392673
4620	NC_009632	CAAG	2	8	231551	231558	50 %	0 %	25 %	25 %	150392673
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4622	NC_009632	CTATG	2	10	231721	231730	20 %	40 %	20 %	20 %	150392673
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4990	NC_009632	ATT	2	6	250812	250817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150392688
4991	NC_009632	ATA	2	6	250848	250853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392688
4992	NC_009632	TAA	2	6	250884	250889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392688
4993	NC_009632	CAT	2	6	250910	250915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392688
4994	NC_009632	GAT	2	6	250916	250921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392688
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4996	NC_009632	TAA	2	6	250961	250966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392688
4997	NC_009632	TGAC	2	8	251001	251008	25 %	25 %	25 %	25 %	150392688
4998	NC_009632	TCA	2	6	251011	251016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150392688
4999	NC_009632	TGA	2	6	251023	251028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150392688
5000	NC_009632	AAT	3	9	251079	251087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150392688

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