MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Sinorhizobium medicae WSM419 plasmid pSMED02

Total Repeats: 674

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009621	GGATG	2	10	3223	3232	20 %	20 %	60 %	0 %	150377172
2	NC_009621	CGAGG	2	10	4622	4631	20 %	0 %	60 %	20 %	150377175
3	NC_009621	GTCCA	2	10	5641	5650	20 %	20 %	20 %	40 %	150377176
4	NC_009621	ACGAT	2	10	7058	7067	40 %	20 %	20 %	20 %	150377177
5	NC_009621	TGGGG	2	10	7447	7456	0 %	20 %	80 %	0 %	150377177
6	NC_009621	CGGCG	2	10	7584	7593	0 %	0 %	60 %	40 %	150377177
7	NC_009621	CGGCG	2	10	9346	9355	0 %	0 %	60 %	40 %	150377179
8	NC_009621	ACCGG	2	10	10698	10707	20 %	0 %	40 %	40 %	150377181
9	NC_009621	CGTCA	2	10	10850	10859	20 %	20 %	20 %	40 %	150377181
10	NC_009621	GGCGC	2	10	11437	11446	0 %	0 %	60 %	40 %	150377182
11	NC_009621	AAGGC	2	10	12266	12275	40 %	0 %	40 %	20 %	150377182
12	NC_009621	TCAGT	2	10	12384	12393	20 %	40 %	20 %	20 %	150377182
13	NC_009621	GCCAA	2	10	12864	12873	40 %	0 %	20 %	40 %	150377183
14	NC_009621	CCATT	2	10	13435	13444	20 %	40 %	0 %	40 %	150377184
15	NC_009621	TCCCC	2	10	14249	14258	0 %	20 %	0 %	80 %	150377184
16	NC_009621	GGATC	2	10	14409	14418	20 %	20 %	40 %	20 %	150377184
17	NC_009621	GGTCA	2	10	14443	14452	20 %	20 %	40 %	20 %	150377184
18	NC_009621	TCGGG	2	10	17509	17518	0 %	20 %	60 %	20 %	150377187
19	NC_009621	GCCGC	2	10	18723	18732	0 %	0 %	40 %	60 %	150377188
20	NC_009621	CGGGC	2	10	20616	20625	0 %	0 %	60 %	40 %	150377190
21	NC_009621	AGACG	2	10	21737	21746	40 %	0 %	40 %	20 %	150377191
22	NC_009621	GCCCT	2	10	24374	24383	0 %	20 %	20 %	60 %	150377194
23	NC_009621	GCTTC	2	10	24640	24649	0 %	40 %	20 %	40 %	150377194
24	NC_009621	CGCCC	2	10	25060	25069	0 %	0 %	20 %	80 %	150377194
25	NC_009621	GTTCA	2	10	25177	25186	20 %	40 %	20 %	20 %	150377194
26	NC_009621	GCCAG	2	10	26529	26538	20 %	0 %	40 %	40 %	150377196
27	NC_009621	GAGCG	2	10	28071	28080	20 %	0 %	60 %	20 %	150377197
28	NC_009621	CCGGG	2	10	29033	29042	0 %	0 %	60 %	40 %	150377198
29	NC_009621	GCATC	2	10	32064	32073	20 %	20 %	20 %	40 %	150377200
30	NC_009621	TGCCC	2	10	34501	34510	0 %	20 %	20 %	60 %	150377201
31	NC_009621	GACGT	2	10	35183	35192	20 %	20 %	40 %	20 %	150377202
32	NC_009621	CGCGC	2	10	35460	35469	0 %	0 %	40 %	60 %	150377202
33	NC_009621	GGCGC	2	10	35529	35538	0 %	0 %	60 %	40 %	150377202
34	NC_009621	GAACC	2	10	39782	39791	40 %	0 %	20 %	40 %	150377206
35	NC_009621	GCGAG	2	10	40829	40838	20 %	0 %	60 %	20 %	150377207
36	NC_009621	TCGCC	2	10	44256	44265	0 %	20 %	20 %	60 %	150377211
37	NC_009621	TGCCA	2	10	46563	46572	20 %	20 %	20 %	40 %	150377213
38	NC_009621	CGCGG	2	10	47072	47081	0 %	0 %	60 %	40 %	150377213
39	NC_009621	CGATG	2	10	47707	47716	20 %	20 %	40 %	20 %	150377214
40	NC_009621	TCGCC	2	10	48787	48796	0 %	20 %	20 %	60 %	150377216
41	NC_009621	GATCG	2	10	53208	53217	20 %	20 %	40 %	20 %	150377220
42	NC_009621	CGTGA	2	10	53457	53466	20 %	20 %	40 %	20 %	150377221
43	NC_009621	CGGAT	2	10	53549	53558	20 %	20 %	40 %	20 %	150377221
44	NC_009621	CATCG	2	10	57999	58008	20 %	20 %	20 %	40 %	150377225
45	NC_009621	GAGCG	2	10	60187	60196	20 %	0 %	60 %	20 %	150377227
46	NC_009621	CGGCG	2	10	60571	60580	0 %	0 %	60 %	40 %	150377227
47	NC_009621	GCCGG	2	10	62050	62059	0 %	0 %	60 %	40 %	150377227
48	NC_009621	CTCGC	2	10	62074	62083	0 %	20 %	20 %	60 %	150377227
49	NC_009621	TCGAA	2	10	62085	62094	40 %	20 %	20 %	20 %	150377227
50	NC_009621	GGCAC	2	10	64729	64738	20 %	0 %	40 %	40 %	150377228
51	NC_009621	CGTTG	2	10	68299	68308	0 %	40 %	40 %	20 %	150377230
52	NC_009621	TCCCG	2	10	68407	68416	0 %	20 %	20 %	60 %	150377231
53	NC_009621	GACTG	2	10	68431	68440	20 %	20 %	40 %	20 %	150377231
54	NC_009621	GCGCC	2	10	68533	68542	0 %	0 %	40 %	60 %	150377231
55	NC_009621	GACCA	2	10	70187	70196	40 %	0 %	20 %	40 %	150377232
56	NC_009621	GCTCG	2	10	70621	70630	0 %	20 %	40 %	40 %	150377232
57	NC_009621	CACGG	2	10	73128	73137	20 %	0 %	40 %	40 %	150377234
58	NC_009621	TCGCT	2	10	75873	75882	0 %	40 %	20 %	40 %	150377236
59	NC_009621	GCACC	2	10	78749	78758	20 %	0 %	20 %	60 %	150377240
60	NC_009621	TGCTT	2	10	79591	79600	0 %	60 %	20 %	20 %	150377240
61	NC_009621	ATTAG	2	10	85235	85244	40 %	40 %	20 %	0 %	150377247
62	NC_009621	CGACG	2	10	90778	90787	20 %	0 %	40 %	40 %	150377252
63	NC_009621	TTCCG	2	10	96698	96707	0 %	40 %	20 %	40 %	150377259
64	NC_009621	GATGC	2	10	101710	101719	20 %	20 %	40 %	20 %	150377263
65	NC_009621	GCTCT	2	10	105654	105663	0 %	40 %	20 %	40 %	150377268
66	NC_009621	TGGAC	2	10	105722	105731	20 %	20 %	40 %	20 %	150377268
67	NC_009621	GCCGA	2	10	106101	106110	20 %	0 %	40 %	40 %	150377268
68	NC_009621	TGCCG	2	10	109791	109800	0 %	20 %	40 %	40 %	150377269
69	NC_009621	GCCGG	2	10	112870	112879	0 %	0 %	60 %	40 %	150377273
70	NC_009621	TCAAT	2	10	113309	113318	40 %	40 %	0 %	20 %	150377274
71	NC_009621	TTGAA	2	10	115245	115254	40 %	40 %	20 %	0 %	150377277
72	NC_009621	GAAGC	2	10	115646	115655	40 %	0 %	40 %	20 %	150377278
73	NC_009621	AGATC	2	10	118280	118289	40 %	20 %	20 %	20 %	150377281
74	NC_009621	GAAGC	2	10	119169	119178	40 %	0 %	40 %	20 %	150377281
75	NC_009621	CAGCG	2	10	119559	119568	20 %	0 %	40 %	40 %	150377282
76	NC_009621	GCGCG	2	10	122121	122130	0 %	0 %	60 %	40 %	150377283
77	NC_009621	CGGCG	2	10	124382	124391	0 %	0 %	60 %	40 %	150377285
78	NC_009621	GTCGA	2	10	130187	130196	20 %	20 %	40 %	20 %	150377289
79	NC_009621	CTTCG	2	10	130679	130688	0 %	40 %	20 %	40 %	150377289
80	NC_009621	GGGCA	2	10	132149	132158	20 %	0 %	60 %	20 %	150377290
81	NC_009621	AGGGC	2	10	132348	132357	20 %	0 %	60 %	20 %	150377291
82	NC_009621	CGGCA	2	10	135651	135660	20 %	0 %	40 %	40 %	150377295
83	NC_009621	GCCTT	2	10	137443	137452	0 %	40 %	20 %	40 %	150377297
84	NC_009621	GCCGG	2	10	140888	140897	0 %	0 %	60 %	40 %	150377301
85	NC_009621	ACGAA	2	10	141850	141859	60 %	0 %	20 %	20 %	150377301
86	NC_009621	GAGCG	2	10	142846	142855	20 %	0 %	60 %	20 %	150377302
87	NC_009621	TCGTG	2	10	145786	145795	0 %	40 %	40 %	20 %	150377305
88	NC_009621	ATCAC	2	10	146796	146805	40 %	20 %	0 %	40 %	150377306
89	NC_009621	CACCG	2	10	147376	147385	20 %	0 %	20 %	60 %	150377307
90	NC_009621	ATCGT	2	10	148570	148579	20 %	40 %	20 %	20 %	150377308
91	NC_009621	TCCGC	2	10	148886	148895	0 %	20 %	20 %	60 %	150377308
92	NC_009621	ACGCA	2	10	149016	149025	40 %	0 %	20 %	40 %	150377308
93	NC_009621	ATTCC	2	10	150211	150220	20 %	40 %	0 %	40 %	150377309
94	NC_009621	CCATG	2	10	151620	151629	20 %	20 %	20 %	40 %	150377310
95	NC_009621	GGTCC	2	10	152570	152579	0 %	20 %	40 %	40 %	150377310
96	NC_009621	TGGAA	2	10	153207	153216	40 %	20 %	40 %	0 %	150377310
97	NC_009621	CCGCA	2	10	154095	154104	20 %	0 %	20 %	60 %	150377311
98	NC_009621	TGGCG	2	10	155165	155174	0 %	20 %	60 %	20 %	150377311
99	NC_009621	ATGAA	2	10	155857	155866	60 %	20 %	20 %	0 %	150377312
100	NC_009621	CAATG	2	10	156091	156100	40 %	20 %	20 %	20 %	150377312
101	NC_009621	CGGCG	2	10	162797	162806	0 %	0 %	60 %	40 %	150377317
102	NC_009621	GGCAA	2	10	166070	166079	40 %	0 %	40 %	20 %	150377320
103	NC_009621	AGCCG	2	10	170745	170754	20 %	0 %	40 %	40 %	150377324
104	NC_009621	ACGCG	2	10	172117	172126	20 %	0 %	40 %	40 %	150377324
105	NC_009621	GACGC	2	10	174264	174273	20 %	0 %	40 %	40 %	150377326
106	NC_009621	CAGGG	2	10	174794	174803	20 %	0 %	60 %	20 %	150377326
107	NC_009621	GGCGA	2	10	178235	178244	20 %	0 %	60 %	20 %	150377330
108	NC_009621	ACAGC	2	10	181822	181831	40 %	0 %	20 %	40 %	150377335
109	NC_009621	CGAAA	2	10	185934	185943	60 %	0 %	20 %	20 %	150377340
110	NC_009621	CTTTC	2	10	186876	186885	0 %	60 %	0 %	40 %	150377341
111	NC_009621	GAAGC	2	10	186999	187008	40 %	0 %	40 %	20 %	150377341
112	NC_009621	GGGGA	2	10	187156	187165	20 %	0 %	80 %	0 %	150377342
113	NC_009621	AACCG	2	10	188570	188579	40 %	0 %	20 %	40 %	150377343
114	NC_009621	AGGGA	2	10	189244	189253	40 %	0 %	60 %	0 %	150377344
115	NC_009621	TCCCG	2	10	191165	191174	0 %	20 %	20 %	60 %	150377345
116	NC_009621	GAACA	2	10	191642	191651	60 %	0 %	20 %	20 %	150377346
117	NC_009621	GGCGA	2	10	195090	195099	20 %	0 %	60 %	20 %	150377349
118	NC_009621	AGCGA	2	10	196556	196565	40 %	0 %	40 %	20 %	150377349
119	NC_009621	CGGGT	2	10	197794	197803	0 %	20 %	60 %	20 %	150377350
120	NC_009621	CGCTT	2	10	201573	201582	0 %	40 %	20 %	40 %	150377353
121	NC_009621	GCATC	2	10	203108	203117	20 %	20 %	20 %	40 %	150377354
122	NC_009621	CATTC	2	10	204382	204391	20 %	40 %	0 %	40 %	150377355
123	NC_009621	TCGGT	2	10	204579	204588	0 %	40 %	40 %	20 %	150377355
124	NC_009621	GGCGC	2	10	205143	205152	0 %	0 %	60 %	40 %	150377356
125	NC_009621	ATCTC	2	10	205853	205862	20 %	40 %	0 %	40 %	150377357
126	NC_009621	GGTGC	2	10	207146	207155	0 %	20 %	60 %	20 %	150377358
127	NC_009621	CGGCG	2	10	208514	208523	0 %	0 %	60 %	40 %	150377359
128	NC_009621	ATCAC	2	10	210576	210585	40 %	20 %	0 %	40 %	150377361
129	NC_009621	TCCAG	2	10	210623	210632	20 %	20 %	20 %	40 %	150377361
130	NC_009621	CAGCA	2	10	212152	212161	40 %	0 %	20 %	40 %	150377362
131	NC_009621	ACGGC	2	10	212510	212519	20 %	0 %	40 %	40 %	150377362
132	NC_009621	CCTCG	2	10	213781	213790	0 %	20 %	20 %	60 %	150377365
133	NC_009621	AAGGC	2	10	220710	220719	40 %	0 %	40 %	20 %	150377374
134	NC_009621	GGCGG	2	10	220957	220966	0 %	0 %	80 %	20 %	150377374
135	NC_009621	CGTGC	2	10	221787	221796	0 %	20 %	40 %	40 %	150377375
136	NC_009621	CGGGG	2	10	224236	224245	0 %	0 %	80 %	20 %	150377377
137	NC_009621	GACCG	2	10	226227	226236	20 %	0 %	40 %	40 %	150377379
138	NC_009621	GACAT	2	10	226930	226939	40 %	20 %	20 %	20 %	150377380
139	NC_009621	TGACC	2	10	228494	228503	20 %	20 %	20 %	40 %	150377382
140	NC_009621	GAAGA	2	10	230494	230503	60 %	0 %	40 %	0 %	150377385
141	NC_009621	CGGCA	2	10	230773	230782	20 %	0 %	40 %	40 %	150377386
142	NC_009621	ATGCG	2	10	230799	230808	20 %	20 %	40 %	20 %	150377386
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146	NC_009621	GCACG	2	10	236743	236752	20 %	0 %	40 %	40 %	150377391
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148	NC_009621	GGGCA	2	10	240002	240011	20 %	0 %	60 %	20 %	150377392
149	NC_009621	CGACG	2	10	240712	240721	20 %	0 %	40 %	40 %	150377392
150	NC_009621	TTCGA	2	10	241049	241058	20 %	40 %	20 %	20 %	150377392
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152	NC_009621	GCCGG	2	10	246591	246600	0 %	0 %	60 %	40 %	150377398
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156	NC_009621	CGATC	2	10	249530	249539	20 %	20 %	20 %	40 %	150377401
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174	NC_009621	CGTCC	2	10	292313	292322	0 %	20 %	20 %	60 %	150377441
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176	NC_009621	GACCA	2	10	293633	293642	40 %	0 %	20 %	40 %	150377442
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250	NC_009621	AGGGG	2	10	389596	389605	20 %	0 %	80 %	0 %	150377532
251	NC_009621	AGGGG	2	10	390101	390110	20 %	0 %	80 %	0 %	150377532
252	NC_009621	CGGTC	2	10	394856	394865	0 %	20 %	40 %	40 %	150377536
253	NC_009621	GATTG	2	10	395307	395316	20 %	40 %	40 %	0 %	150377536
254	NC_009621	ATCGT	2	10	401217	401226	20 %	40 %	20 %	20 %	150377540
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257	NC_009621	CGTGA	2	10	407448	407457	20 %	20 %	40 %	20 %	150377542
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259	NC_009621	CGTTC	2	10	411588	411597	0 %	40 %	20 %	40 %	150377546
260	NC_009621	CCGCT	2	10	413120	413129	0 %	20 %	20 %	60 %	150377548
261	NC_009621	CCCAA	2	10	414233	414242	40 %	0 %	0 %	60 %	150377548
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