MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium medicae WSM419 plasmid pSMED02

Total Repeats: 20671

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_009621	CCG	2	6	177486	177491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150377329
3502	NC_009621	CGC	2	6	177977	177982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150377330
3503	NC_009621	CGG	2	6	178012	178017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150377330
3504	NC_009621	AGA	2	6	178042	178047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150377330
3505	NC_009621	CGC	2	6	178056	178061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150377330
3506	NC_009621	GAAC	2	8	178064	178071	50 %	0 %	25 %	25 %	150377330
3507	NC_009621	GCCG	2	8	178100	178107	0 %	0 %	50 %	50 %	150377330
3508	NC_009621	GCG	2	6	178119	178124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150377330
3509	NC_009621	AAG	2	6	178172	178177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150377330
3510	NC_009621	CCG	2	6	178197	178202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150377330
3511	NC_009621	TG	3	6	178219	178224	0 %	50 %	50 %	0 %	150377330
3512	NC_009621	GGCGA	2	10	178235	178244	20 %	0 %	60 %	20 %	150377330
3513	NC_009621	GAA	2	6	178250	178255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150377330
3514	NC_009621	CT	3	6	178398	178403	0 %	50 %	0 %	50 %	150377330
3515	NC_009621	GC	3	6	178439	178444	0 %	0 %	50 %	50 %	150377330
3516	NC_009621	AGC	2	6	178479	178484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150377330
3517	NC_009621	CAGC	2	8	178537	178544	25 %	0 %	25 %	50 %	150377330
3518	NC_009621	TTCA	2	8	178547	178554	25 %	50 %	0 %	25 %	150377330
3519	NC_009621	GGCG	2	8	178616	178623	0 %	0 %	75 %	25 %	150377330
3520	NC_009621	GC	3	6	178654	178659	0 %	0 %	50 %	50 %	150377330
3521	NC_009621	GAA	2	6	178673	178678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150377330
3522	NC_009621	AAG	2	6	178757	178762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150377330
3523	NC_009621	GCT	2	6	178819	178824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150377330
3524	NC_009621	CCG	2	6	178925	178930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150377330
3525	NC_009621	TCG	2	6	178939	178944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150377330
3526	NC_009621	CGC	2	6	179202	179207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150377331
3527	NC_009621	CCG	2	6	179208	179213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150377331
3528	NC_009621	AAG	2	6	179236	179241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150377331
3529	NC_009621	CGG	2	6	179256	179261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150377331
3530	NC_009621	GATG	2	8	179280	179287	25 %	25 %	50 %	0 %	150377331
3531	NC_009621	CAA	2	6	179361	179366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150377331
3532	NC_009621	CGA	2	6	179409	179414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150377331
3533	NC_009621	ACG	2	6	179458	179463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150377331
3534	NC_009621	GCC	2	6	179464	179469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150377331
3535	NC_009621	GAT	2	6	179481	179486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150377331
3536	NC_009621	AGC	2	6	179489	179494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150377331
3537	NC_009621	CAT	2	6	179505	179510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150377331
3538	NC_009621	GTC	2	6	179517	179522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150377331
3539	NC_009621	TC	3	6	179550	179555	0 %	50 %	0 %	50 %	150377331
3540	NC_009621	CAG	2	6	179707	179712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150377331
3541	NC_009621	CCAG	2	8	179726	179733	25 %	0 %	25 %	50 %	150377331
3542	NC_009621	TCC	2	6	179741	179746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150377331
3543	NC_009621	ACGTCG	2	12	179798	179809	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	150377331
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3545	NC_009621	ATG	2	6	180016	180021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150377332
3546	NC_009621	CCG	2	6	180034	180039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150377332
3547	NC_009621	CGGC	2	8	180208	180215	0 %	0 %	50 %	50 %	150377332
3548	NC_009621	CAC	2	6	180367	180372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150377332
3549	NC_009621	CGG	2	6	180399	180404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150377332
3550	NC_009621	CA	3	6	180503	180508	50 %	0 %	0 %	50 %	150377333
3551	NC_009621	TCG	2	6	180524	180529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150377333
3552	NC_009621	ATCG	2	8	180552	180559	25 %	25 %	25 %	25 %	150377333
3553	NC_009621	GGT	2	6	180601	180606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150377333
3554	NC_009621	CTGGAG	2	12	180634	180645	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	150377333
3555	NC_009621	GCC	2	6	180655	180660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150377333
3556	NC_009621	TCA	2	6	180668	180673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150377333
3557	NC_009621	CGCT	2	8	180731	180738	0 %	25 %	25 %	50 %	150377333
3558	NC_009621	CAT	2	6	180768	180773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150377333
3559	NC_009621	GAA	2	6	180944	180949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150377334
3560	NC_009621	CTT	2	6	180963	180968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150377334
3561	NC_009621	TCG	2	6	180973	180978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150377334
3562	NC_009621	AGGA	2	8	180987	180994	50 %	0 %	50 %	0 %	150377334
3563	NC_009621	GGCT	2	8	180995	181002	0 %	25 %	50 %	25 %	150377334
3564	NC_009621	CCA	2	6	181019	181024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150377334
3565	NC_009621	ACG	2	6	181030	181035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150377334
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3567	NC_009621	ACCG	2	8	181395	181402	25 %	0 %	25 %	50 %	150377335
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3570	NC_009621	TGA	2	6	181508	181513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150377335
3571	NC_009621	CTT	2	6	181544	181549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150377335
3572	NC_009621	CGC	2	6	181596	181601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150377335
3573	NC_009621	ATCG	2	8	181625	181632	25 %	25 %	25 %	25 %	150377335
3574	NC_009621	CTA	2	6	181661	181666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150377335
3575	NC_009621	CGA	2	6	181672	181677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150377335
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3577	NC_009621	CGT	2	6	181842	181847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150377335
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3589	NC_009621	AAGG	2	8	183629	183636	50 %	0 %	50 %	0 %	150377337
3590	NC_009621	GAA	2	6	183733	183738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150377337
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3592	NC_009621	GC	3	6	183935	183940	0 %	0 %	50 %	50 %	150377337
3593	NC_009621	GGC	2	6	183988	183993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150377337
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3599	NC_009621	ATGGCG	2	12	184254	184265	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	150377337
3600	NC_009621	GAC	2	6	184298	184303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150377337
3601	NC_009621	ATG	2	6	184332	184337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150377337
3602	NC_009621	G	6	6	184372	184377	0 %	0 %	100 %	0 %	150377338
3603	NC_009621	GCT	2	6	184389	184394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150377338
3604	NC_009621	AGG	2	6	184397	184402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150377338
3605	NC_009621	CGA	2	6	184431	184436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150377338
3606	NC_009621	CCTT	2	8	184640	184647	0 %	50 %	0 %	50 %	150377338
3607	NC_009621	GTC	2	6	184687	184692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150377338
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3611	NC_009621	GCG	2	6	184750	184755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150377338
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3863	NC_009621	CCT	2	6	197938	197943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150377350
3864	NC_009621	GA	3	6	197964	197969	50 %	0 %	50 %	0 %	150377350
3865	NC_009621	GCA	2	6	197991	197996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150377350
3866	NC_009621	CAT	2	6	198026	198031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150377350
3867	NC_009621	CCAT	2	8	198034	198041	25 %	25 %	0 %	50 %	150377350
3868	NC_009621	GCA	2	6	198155	198160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150377351
3869	NC_009621	AGC	2	6	198282	198287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150377351
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3882	NC_009621	TTCG	2	8	198834	198841	0 %	50 %	25 %	25 %	150377351
3883	NC_009621	CG	3	6	198840	198845	0 %	0 %	50 %	50 %	150377351
3884	NC_009621	TCG	2	6	198856	198861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150377351
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3892	NC_009621	TCGA	2	8	200041	200048	25 %	25 %	25 %	25 %	150377352
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3900	NC_009621	TTGC	2	8	200433	200440	0 %	50 %	25 %	25 %	150377352
3901	NC_009621	CGT	2	6	200541	200546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150377352
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3974	NC_009621	A	6	6	204512	204517	100 %	0 %	0 %	0 %	150377355
3975	NC_009621	ACCG	2	8	204529	204536	25 %	0 %	25 %	50 %	150377355
3976	NC_009621	TCGGT	2	10	204579	204588	0 %	40 %	40 %	20 %	150377355
3977	NC_009621	CGGC	2	8	204643	204650	0 %	0 %	50 %	50 %	150377356
3978	NC_009621	ATCC	2	8	204739	204746	25 %	25 %	0 %	50 %	150377356
3979	NC_009621	CGG	2	6	204768	204773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150377356
3980	NC_009621	CTC	2	6	204827	204832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150377356
3981	NC_009621	TC	3	6	204853	204858	0 %	50 %	0 %	50 %	150377356
3982	NC_009621	TGA	2	6	204879	204884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150377356
3983	NC_009621	TGA	2	6	204930	204935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150377356
3984	NC_009621	CTCG	2	8	204997	205004	0 %	25 %	25 %	50 %	150377356
3985	NC_009621	GCA	2	6	205031	205036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150377356
3986	NC_009621	CTG	2	6	205058	205063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150377356
3987	NC_009621	CGG	2	6	205126	205131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150377356
3988	NC_009621	CTC	2	6	205133	205138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150377356
3989	NC_009621	GGCGC	2	10	205143	205152	0 %	0 %	60 %	40 %	150377356
3990	NC_009621	TGC	2	6	205155	205160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150377356
3991	NC_009621	CGC	2	6	205243	205248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150377356
3992	NC_009621	TCG	3	9	205269	205277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150377356
3993	NC_009621	CTG	2	6	205286	205291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150377356
3994	NC_009621	CCACCG	2	12	205294	205305	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	150377356
3995	NC_009621	GCGG	2	8	205403	205410	0 %	0 %	75 %	25 %	150377356
3996	NC_009621	CGC	2	6	205498	205503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150377356
3997	NC_009621	CGG	2	6	205513	205518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150377356
3998	NC_009621	GGA	2	6	205532	205537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150377356
3999	NC_009621	ATC	2	6	205547	205552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150377356
4000	NC_009621	TGC	2	6	205569	205574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150377356

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