MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Sinorhizobium medicae WSM419 plasmid pSMED01

Total Repeats: 1015

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009620	CGCAG	2	10	245	254	20 %	0 %	40 %	40 %	150375727
2	NC_009620	GCTTT	2	10	2061	2070	0 %	60 %	20 %	20 %	150375727
3	NC_009620	TCGCT	2	10	2331	2340	0 %	40 %	20 %	40 %	150375727
4	NC_009620	CCAAT	2	10	2673	2682	40 %	20 %	0 %	40 %	150375727
5	NC_009620	GTCTC	2	10	4293	4302	0 %	40 %	20 %	40 %	150375728
6	NC_009620	ATCGC	2	10	7357	7366	20 %	20 %	20 %	40 %	150375731
7	NC_009620	GCGCG	2	10	7425	7434	0 %	0 %	60 %	40 %	150375731
8	NC_009620	CCTGC	2	10	7627	7636	0 %	20 %	20 %	60 %	150375731
9	NC_009620	TCGCT	2	10	7720	7729	0 %	40 %	20 %	40 %	150375731
10	NC_009620	AAATC	2	10	13228	13237	60 %	20 %	0 %	20 %	150375737
11	NC_009620	CTCCC	2	10	13815	13824	0 %	20 %	0 %	80 %	150375738
12	NC_009620	CCGAG	2	10	16339	16348	20 %	0 %	40 %	40 %	150375740
13	NC_009620	CCGCA	2	10	16367	16376	20 %	0 %	20 %	60 %	150375740
14	NC_009620	GGTGA	2	10	18771	18780	20 %	20 %	60 %	0 %	150375742
15	NC_009620	TGATG	2	10	20817	20826	20 %	40 %	40 %	0 %	150375744
16	NC_009620	TCGCT	2	10	21075	21084	0 %	40 %	20 %	40 %	150375744
17	NC_009620	CGCCT	2	10	21969	21978	0 %	20 %	20 %	60 %	150375745
18	NC_009620	CGCGG	2	10	22246	22255	0 %	0 %	60 %	40 %	150375745
19	NC_009620	CCTTT	2	10	23125	23134	0 %	60 %	0 %	40 %	150375746
20	NC_009620	GCGCC	2	10	24939	24948	0 %	0 %	40 %	60 %	150375748
21	NC_009620	TCGCG	2	10	25651	25660	0 %	20 %	40 %	40 %	150375749
22	NC_009620	CTTTG	2	10	27208	27217	0 %	60 %	20 %	20 %	150375751
23	NC_009620	GATCA	2	10	28928	28937	40 %	20 %	20 %	20 %	150375752
24	NC_009620	TCGCG	2	10	29945	29954	0 %	20 %	40 %	40 %	150375753
25	NC_009620	GCCGC	2	10	31688	31697	0 %	0 %	40 %	60 %	150375754
26	NC_009620	TCGCC	2	10	33880	33889	0 %	20 %	20 %	60 %	150375756
27	NC_009620	TCGGC	2	10	35274	35283	0 %	20 %	40 %	40 %	150375757
28	NC_009620	TACGG	2	10	38138	38147	20 %	20 %	40 %	20 %	150375759
29	NC_009620	GCCGC	2	10	43448	43457	0 %	0 %	40 %	60 %	150375763
30	NC_009620	CACTG	2	10	43554	43563	20 %	20 %	20 %	40 %	150375763
31	NC_009620	ACCGG	2	10	43831	43840	20 %	0 %	40 %	40 %	150375763
32	NC_009620	AGCGG	2	10	50707	50716	20 %	0 %	60 %	20 %	150375767
33	NC_009620	GCGCG	2	10	53482	53491	0 %	0 %	60 %	40 %	150375769
34	NC_009620	TCTCC	2	10	54163	54172	0 %	40 %	0 %	60 %	150375769
35	NC_009620	TCGGT	2	10	54994	55003	0 %	40 %	40 %	20 %	150375770
36	NC_009620	CCGGG	2	10	55084	55093	0 %	0 %	60 %	40 %	150375770
37	NC_009620	ACTGA	2	10	56833	56842	40 %	20 %	20 %	20 %	150375772
38	NC_009620	GAACA	2	10	57818	57827	60 %	0 %	20 %	20 %	150375774
39	NC_009620	ACGGC	2	10	58827	58836	20 %	0 %	40 %	40 %	150375775
40	NC_009620	GACCG	2	10	62212	62221	20 %	0 %	40 %	40 %	150375777
41	NC_009620	ATGCC	2	10	62367	62376	20 %	20 %	20 %	40 %	150375777
42	NC_009620	GCGAC	2	10	63291	63300	20 %	0 %	40 %	40 %	150375779
43	NC_009620	CCGCT	2	10	69263	69272	0 %	20 %	20 %	60 %	150375784
44	NC_009620	GCCGT	2	10	71943	71952	0 %	20 %	40 %	40 %	150375787
45	NC_009620	GCGAT	2	10	72587	72596	20 %	20 %	40 %	20 %	150375788
46	NC_009620	ATCGC	2	10	72679	72688	20 %	20 %	20 %	40 %	150375788
47	NC_009620	CGAAG	2	10	72693	72702	40 %	0 %	40 %	20 %	150375788
48	NC_009620	TGCGG	2	10	76158	76167	0 %	20 %	60 %	20 %	150375791
49	NC_009620	CGTCA	2	10	76371	76380	20 %	20 %	20 %	40 %	150375791
50	NC_009620	GCGAT	2	10	77912	77921	20 %	20 %	40 %	20 %	150375791
51	NC_009620	GTGAT	2	10	78011	78020	20 %	40 %	40 %	0 %	150375792
52	NC_009620	GCGCA	2	10	78967	78976	20 %	0 %	40 %	40 %	150375792
53	NC_009620	AGCGC	2	10	79245	79254	20 %	0 %	40 %	40 %	150375792
54	NC_009620	CATGC	2	10	79389	79398	20 %	20 %	20 %	40 %	150375792
55	NC_009620	GTCCG	2	10	79618	79627	0 %	20 %	40 %	40 %	150375792
56	NC_009620	GTCGG	2	10	79987	79996	0 %	20 %	60 %	20 %	150375793
57	NC_009620	CATGG	2	10	80313	80322	20 %	20 %	40 %	20 %	150375793
58	NC_009620	GCGAC	2	10	81107	81116	20 %	0 %	40 %	40 %	150375794
59	NC_009620	CTCCC	2	10	82220	82229	0 %	20 %	0 %	80 %	150375795
60	NC_009620	CCGAT	2	10	82894	82903	20 %	20 %	20 %	40 %	150375795
61	NC_009620	ACGCG	2	10	87588	87597	20 %	0 %	40 %	40 %	150375800
62	NC_009620	CGCGG	2	10	87871	87880	0 %	0 %	60 %	40 %	150375800
63	NC_009620	TGCCC	2	10	88091	88100	0 %	20 %	20 %	60 %	150375801
64	NC_009620	CATTC	2	10	88130	88139	20 %	40 %	0 %	40 %	150375801
65	NC_009620	CACCG	2	10	88341	88350	20 %	0 %	20 %	60 %	150375801
66	NC_009620	CGGCA	2	10	92356	92365	20 %	0 %	40 %	40 %	150375804
67	NC_009620	GACGT	2	10	92823	92832	20 %	20 %	40 %	20 %	150375805
68	NC_009620	CGGAT	2	10	94162	94171	20 %	20 %	40 %	20 %	150375805
69	NC_009620	GACCG	2	10	97717	97726	20 %	0 %	40 %	40 %	150375809
70	NC_009620	CGCGG	2	10	98487	98496	0 %	0 %	60 %	40 %	150375810
71	NC_009620	AAAGC	2	10	105777	105786	60 %	0 %	20 %	20 %	150375816
72	NC_009620	TAGCG	2	10	111865	111874	20 %	20 %	40 %	20 %	150375822
73	NC_009620	GTCGG	2	10	112502	112511	0 %	20 %	60 %	20 %	150375823
74	NC_009620	CGAGC	2	10	114641	114650	20 %	0 %	40 %	40 %	150375824
75	NC_009620	TGCCG	2	10	114863	114872	0 %	20 %	40 %	40 %	150375824
76	NC_009620	AGCCT	2	10	117176	117185	20 %	20 %	20 %	40 %	150375828
77	NC_009620	CGGCT	2	10	117375	117384	0 %	20 %	40 %	40 %	150375828
78	NC_009620	GCCCG	2	10	118040	118049	0 %	0 %	40 %	60 %	150375829
79	NC_009620	GTCCT	2	10	118900	118909	0 %	40 %	20 %	40 %	150375830
80	NC_009620	AAGCG	2	10	119199	119208	40 %	0 %	40 %	20 %	150375830
81	NC_009620	GATCC	2	10	123311	123320	20 %	20 %	20 %	40 %	150375833
82	NC_009620	CGCGC	2	10	123437	123446	0 %	0 %	40 %	60 %	150375833
83	NC_009620	CGCTG	2	10	127692	127701	0 %	20 %	40 %	40 %	150375836
84	NC_009620	CCGTT	2	10	128834	128843	0 %	40 %	20 %	40 %	150375838
85	NC_009620	GCCGC	2	10	129886	129895	0 %	0 %	40 %	60 %	150375839
86	NC_009620	GGACG	2	10	130546	130555	20 %	0 %	60 %	20 %	150375840
87	NC_009620	TGGCT	2	10	132808	132817	0 %	40 %	40 %	20 %	150375841
88	NC_009620	CGCGT	2	10	133539	133548	0 %	20 %	40 %	40 %	150375842
89	NC_009620	CCGTC	2	10	134021	134030	0 %	20 %	20 %	60 %	150375842
90	NC_009620	AGGCA	2	10	134433	134442	40 %	0 %	40 %	20 %	150375843
91	NC_009620	CTCGC	2	10	134851	134860	0 %	20 %	20 %	60 %	150375843
92	NC_009620	CGAAC	2	10	135229	135238	40 %	0 %	20 %	40 %	150375843
93	NC_009620	GGTTG	2	10	135567	135576	0 %	40 %	60 %	0 %	150375843
94	NC_009620	CGCGC	2	10	137439	137448	0 %	0 %	40 %	60 %	150375845
95	NC_009620	GCGCC	2	10	137565	137574	0 %	0 %	40 %	60 %	150375845
96	NC_009620	GCGAG	2	10	141980	141989	20 %	0 %	60 %	20 %	150375851
97	NC_009620	GCCGT	2	10	142021	142030	0 %	20 %	40 %	40 %	150375851
98	NC_009620	GAAAG	2	10	142667	142676	60 %	0 %	40 %	0 %	150375851
99	NC_009620	GTGTC	2	10	143042	143051	0 %	40 %	40 %	20 %	150375851
100	NC_009620	GCTCG	2	10	143624	143633	0 %	20 %	40 %	40 %	150375852
101	NC_009620	CCCTG	2	10	143750	143759	0 %	20 %	20 %	60 %	150375852
102	NC_009620	GCAAG	2	10	144156	144165	40 %	0 %	40 %	20 %	150375853
103	NC_009620	CTTCC	2	10	144336	144345	0 %	40 %	0 %	60 %	150375853
104	NC_009620	CGGGC	2	10	144457	144466	0 %	0 %	60 %	40 %	150375853
105	NC_009620	TTGCC	2	10	144729	144738	0 %	40 %	20 %	40 %	150375853
106	NC_009620	CACGG	2	10	145673	145682	20 %	0 %	40 %	40 %	150375854
107	NC_009620	TCGGC	2	10	147371	147380	0 %	20 %	40 %	40 %	150375855
108	NC_009620	GCCGG	2	10	147634	147643	0 %	0 %	60 %	40 %	150375855
109	NC_009620	GCTTG	2	10	151867	151876	0 %	40 %	40 %	20 %	150375860
110	NC_009620	TCGGC	2	10	153275	153284	0 %	20 %	40 %	40 %	150375861
111	NC_009620	TGTTC	2	10	158163	158172	0 %	60 %	20 %	20 %	150375866
112	NC_009620	ATCGC	2	10	160573	160582	20 %	20 %	20 %	40 %	150375867
113	NC_009620	GTCGG	2	10	160594	160603	0 %	20 %	60 %	20 %	150375867
114	NC_009620	CAAGG	2	10	162875	162884	40 %	0 %	40 %	20 %	150375869
115	NC_009620	AGCCA	2	10	163467	163476	40 %	0 %	20 %	40 %	150375870
116	NC_009620	GAATG	2	10	164554	164563	40 %	20 %	40 %	0 %	150375872
117	NC_009620	GGAGA	2	10	164588	164597	40 %	0 %	60 %	0 %	150375872
118	NC_009620	AAAAG	2	10	164829	164838	80 %	0 %	20 %	0 %	150375872
119	NC_009620	TCGTC	2	10	169276	169285	0 %	40 %	20 %	40 %	150375876
120	NC_009620	ACCGT	2	10	171050	171059	20 %	20 %	20 %	40 %	150375877
121	NC_009620	ACGGC	2	10	172843	172852	20 %	0 %	40 %	40 %	150375879
122	NC_009620	AATGA	2	10	174554	174563	60 %	20 %	20 %	0 %	150375880
123	NC_009620	GAGCC	2	10	176282	176291	20 %	0 %	40 %	40 %	150375881
124	NC_009620	GCACG	2	10	176994	177003	20 %	0 %	40 %	40 %	150375882
125	NC_009620	GGCGG	2	10	177092	177101	0 %	0 %	80 %	20 %	150375883
126	NC_009620	CGCTT	2	10	177555	177564	0 %	40 %	20 %	40 %	150375883
127	NC_009620	CTCGG	2	10	180054	180063	0 %	20 %	40 %	40 %	150375885
128	NC_009620	GCACC	2	10	183493	183502	20 %	0 %	20 %	60 %	150375889
129	NC_009620	GGCGA	2	10	183789	183798	20 %	0 %	60 %	20 %	150375889
130	NC_009620	TTCCT	2	10	188120	188129	0 %	60 %	0 %	40 %	150375894
131	NC_009620	TGCCG	2	10	188608	188617	0 %	20 %	40 %	40 %	150375895
132	NC_009620	TCGCT	2	10	189069	189078	0 %	40 %	20 %	40 %	150375895
133	NC_009620	CTCGA	2	10	189428	189437	20 %	20 %	20 %	40 %	150375895
134	NC_009620	GAGAA	2	10	191126	191135	60 %	0 %	40 %	0 %	150375898
135	NC_009620	CGGCG	2	10	193867	193876	0 %	0 %	60 %	40 %	150375900
136	NC_009620	AACCG	2	10	193957	193966	40 %	0 %	20 %	40 %	150375900
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142	NC_009620	CGATC	2	10	200527	200536	20 %	20 %	20 %	40 %	150375905
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146	NC_009620	GCCGG	2	10	207499	207508	0 %	0 %	60 %	40 %	150375912
147	NC_009620	TTCAT	2	10	207905	207914	20 %	60 %	0 %	20 %	150375913
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149	NC_009620	GTGCG	2	10	208711	208720	0 %	20 %	60 %	20 %	150375914
150	NC_009620	GCCGG	2	10	211105	211114	0 %	0 %	60 %	40 %	150375915
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152	NC_009620	GCCAT	2	10	212595	212604	20 %	20 %	20 %	40 %	150375916
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166	NC_009620	CTCTC	2	10	236558	236567	0 %	40 %	0 %	60 %	150375938
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234	NC_009620	CGAAA	2	10	340010	340019	60 %	0 %	20 %	20 %	150376032
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248	NC_009620	TTCGC	2	10	355948	355957	0 %	40 %	20 %	40 %	150376047
249	NC_009620	ATCGG	2	10	357272	357281	20 %	20 %	40 %	20 %	150376050
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252	NC_009620	ATGCG	2	10	361057	361066	20 %	20 %	40 %	20 %	150376055
253	NC_009620	GCGCC	2	10	361472	361481	0 %	0 %	40 %	60 %	150376055
254	NC_009620	CCCGG	2	10	363076	363085	0 %	0 %	40 %	60 %	150376057
255	NC_009620	TCGCC	2	10	365364	365373	0 %	20 %	20 %	60 %	150376059
256	NC_009620	GGCAT	2	10	367287	367296	20 %	20 %	40 %	20 %	150376062
257	NC_009620	CCGAT	2	10	367690	367699	20 %	20 %	20 %	40 %	150376062
258	NC_009620	GGCGC	2	10	368944	368953	0 %	0 %	60 %	40 %	150376064
259	NC_009620	GCATG	2	10	369075	369084	20 %	20 %	40 %	20 %	150376064
260	NC_009620	AAGGC	2	10	371327	371336	40 %	0 %	40 %	20 %	150376066
261	NC_009620	CCGGT	2	10	371427	371436	0 %	20 %	40 %	40 %	150376066
262	NC_009620	CGCTC	2	10	372638	372647	0 %	20 %	20 %	60 %	150376067
263	NC_009620	GGCGT	2	10	372950	372959	0 %	20 %	60 %	20 %	150376068
264	NC_009620	TTCGG	2	10	373006	373015	0 %	40 %	40 %	20 %	150376068
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373	NC_009620	CGCAT	2	10	538810	538819	20 %	20 %	20 %	40 %	150376221
374	NC_009620	CTGAT	2	10	540031	540040	20 %	40 %	20 %	20 %	150376223
375	NC_009620	CGTCC	2	10	541554	541563	0 %	20 %	20 %	60 %	150376224
376	NC_009620	GCTCG	2	10	541888	541897	0 %	20 %	40 %	40 %	150376225
377	NC_009620	CCATG	2	10	544887	544896	20 %	20 %	20 %	40 %	150376227
378	NC_009620	CCGCC	2	10	545267	545276	0 %	0 %	20 %	80 %	150376227
379	NC_009620	AGCGC	2	10	545381	545390	20 %	0 %	40 %	40 %	150376227
380	NC_009620	CGTGA	2	10	545816	545825	20 %	20 %	40 %	20 %	150376228
381	NC_009620	GCACC	2	10	547451	547460	20 %	0 %	20 %	60 %	150376230
382	NC_009620	TCGCC	2	10	547492	547501	0 %	20 %	20 %	60 %	150376230
383	NC_009620	TTCGC	2	10	548110	548119	0 %	40 %	20 %	40 %	150376230
384	NC_009620	GCCGA	2	10	548221	548230	20 %	0 %	40 %	40 %	150376230
385	NC_009620	GAGAT	2	10	548458	548467	40 %	20 %	40 %	0 %	150376230
386	NC_009620	CAGCC	2	10	550535	550544	20 %	0 %	20 %	60 %	150376233
387	NC_009620	CTTGC	2	10	550809	550818	0 %	40 %	20 %	40 %	150376233
388	NC_009620	GCGAA	2	10	552879	552888	40 %	0 %	40 %	20 %	150376235
389	NC_009620	GCGAC	2	10	553087	553096	20 %	0 %	40 %	40 %	150376235
390	NC_009620	GGCGA	2	10	556054	556063	20 %	0 %	60 %	20 %	150376237
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