MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium medicae WSM419 plasmid pSMED01

Total Repeats: 31436

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_009620	GCCGG	2	10	147634	147643	0 %	0 %	60 %	40 %	150375855
3002	NC_009620	TCC	2	6	147722	147727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150375855
3003	NC_009620	GAG	2	6	147745	147750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150375855
3004	NC_009620	AAG	2	6	147751	147756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150375855
3005	NC_009620	TCG	2	6	147767	147772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375855
3006	NC_009620	GCG	2	6	147773	147778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150375855
3007	NC_009620	CAGA	2	8	147808	147815	50 %	0 %	25 %	25 %	150375855
3008	NC_009620	GAA	2	6	147825	147830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150375855
3009	NC_009620	TCG	2	6	147833	147838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375855
3010	NC_009620	CTG	2	6	147925	147930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375856
3011	NC_009620	CTG	2	6	148131	148136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375856
3012	NC_009620	CGG	2	6	148350	148355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150375856
3013	NC_009620	CGAACT	2	12	148464	148475	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	150375856
3014	NC_009620	GC	3	6	148503	148508	0 %	0 %	50 %	50 %	150375856
3015	NC_009620	TCA	2	6	148542	148547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150375856
3016	NC_009620	GGC	3	9	148678	148686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150375857
3017	NC_009620	CGG	2	6	148687	148692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150375857
3018	NC_009620	CTC	2	6	148736	148741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150375857
3019	NC_009620	CGGC	2	8	148761	148768	0 %	0 %	50 %	50 %	150375857
3020	NC_009620	TCC	2	6	148905	148910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150375857
3021	NC_009620	C	7	7	148952	148958	0 %	0 %	0 %	100 %	150375857
3022	NC_009620	CGA	2	6	149029	149034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150375857
3023	NC_009620	GCC	2	6	149090	149095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150375857
3024	NC_009620	ACG	2	6	149103	149108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150375857
3025	NC_009620	CGTG	2	8	149143	149150	0 %	25 %	50 %	25 %	150375857
3026	NC_009620	TCG	2	6	149161	149166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375857
3027	NC_009620	GGC	2	6	149258	149263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150375857
3028	NC_009620	CGCC	2	8	149279	149286	0 %	0 %	25 %	75 %	150375857
3029	NC_009620	CGC	2	6	149366	149371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150375857
3030	NC_009620	TTC	2	6	149415	149420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150375857
3031	NC_009620	GAC	2	6	149519	149524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150375857
3032	NC_009620	ATC	2	6	149574	149579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150375857
3033	NC_009620	CAG	2	6	149582	149587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150375857
3034	NC_009620	CGA	2	6	149614	149619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150375857
3035	NC_009620	CGC	2	6	149656	149661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150375857
3036	NC_009620	GAC	2	6	149770	149775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150375858
3037	NC_009620	CGG	2	6	149785	149790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150375858
3038	NC_009620	GAT	3	9	149872	149880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150375858
3039	NC_009620	TCGT	2	8	149897	149904	0 %	50 %	25 %	25 %	150375858
3040	NC_009620	CAG	2	6	149908	149913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150375858
3041	NC_009620	GCA	2	6	149988	149993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150375858
3042	NC_009620	CGC	2	6	150037	150042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150375858
3043	NC_009620	AGAA	2	8	150068	150075	75 %	0 %	25 %	0 %	150375858
3044	NC_009620	CGA	2	6	150156	150161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150375858
3045	NC_009620	TGA	2	6	150210	150215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150375858
3046	NC_009620	ATC	2	6	150218	150223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150375858
3047	NC_009620	GA	3	6	150275	150280	50 %	0 %	50 %	0 %	150375858
3048	NC_009620	CCA	2	6	150318	150323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150375858
3049	NC_009620	CGA	2	6	150360	150365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150375858
3050	NC_009620	CTCG	2	8	150366	150373	0 %	25 %	25 %	50 %	150375858
3051	NC_009620	CGC	2	6	150375	150380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150375858
3052	NC_009620	CGG	2	6	150436	150441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150375858
3053	NC_009620	GAT	2	6	150445	150450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150375858
3054	NC_009620	CGA	2	6	150474	150479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150375858
3055	NC_009620	GTA	2	6	150484	150489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150375858
3056	NC_009620	GAT	2	6	150505	150510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150375858
3057	NC_009620	CGA	2	6	150602	150607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150375859
3058	NC_009620	GCG	2	6	150664	150669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150375859
3059	NC_009620	CGT	2	6	150698	150703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375859
3060	NC_009620	CGC	2	6	150746	150751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150375859
3061	NC_009620	GAT	2	6	150765	150770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150375859
3062	NC_009620	GAA	2	6	150783	150788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150375859
3063	NC_009620	ACC	2	6	150805	150810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150375859
3064	NC_009620	GAA	2	6	150816	150821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150375859
3065	NC_009620	GTC	2	6	150823	150828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375859
3066	NC_009620	CAG	2	6	150834	150839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150375859
3067	NC_009620	CCG	2	6	150861	150866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150375859
3068	NC_009620	CG	3	6	150872	150877	0 %	0 %	50 %	50 %	150375859
3069	NC_009620	ATCG	2	8	150882	150889	25 %	25 %	25 %	25 %	150375859
3070	NC_009620	AGA	2	6	150938	150943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150375859
3071	NC_009620	GCC	2	6	150970	150975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150375859
3072	NC_009620	CGA	3	9	150977	150985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150375859
3073	NC_009620	CAG	2	6	151134	151139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150375859
3074	NC_009620	ACG	2	6	151165	151170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150375859
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3077	NC_009620	AG	3	6	151252	151257	50 %	0 %	50 %	0 %	150375859
3078	NC_009620	AGA	2	6	151382	151387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150375859
3079	NC_009620	CGA	2	6	151412	151417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150375859
3080	NC_009620	GGA	2	6	151427	151432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150375859
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3082	NC_009620	TGC	3	9	151589	151597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375860
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3085	NC_009620	TCGG	2	8	151737	151744	0 %	25 %	50 %	25 %	150375860
3086	NC_009620	CAT	2	6	151754	151759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150375860
3087	NC_009620	TTC	2	6	151788	151793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150375860
3088	NC_009620	CTT	2	6	151808	151813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150375860
3089	NC_009620	GCTTG	2	10	151867	151876	0 %	40 %	40 %	20 %	150375860
3090	NC_009620	TCTG	2	8	151881	151888	0 %	50 %	25 %	25 %	150375860
3091	NC_009620	GAA	2	6	151901	151906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150375860
3092	NC_009620	TCG	2	6	151929	151934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375860
3093	NC_009620	GCTC	2	8	151958	151965	0 %	25 %	25 %	50 %	150375860
3094	NC_009620	CGC	2	6	152032	152037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150375860
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3099	NC_009620	TCT	2	6	152344	152349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150375860
3100	NC_009620	CGG	2	6	152381	152386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150375860
3101	NC_009620	GTA	2	6	152429	152434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150375860
3102	NC_009620	AAT	2	6	152491	152496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150375860
3103	NC_009620	GCC	2	6	152540	152545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150375860
3104	NC_009620	GGA	2	6	152551	152556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150375860
3105	NC_009620	CGG	2	6	152560	152565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150375860
3106	NC_009620	GCC	2	6	152586	152591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150375860
3107	NC_009620	ATC	2	6	152592	152597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150375860
3108	NC_009620	CGG	2	6	152633	152638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150375860
3109	NC_009620	CAC	2	6	152705	152710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150375860
3110	NC_009620	CTC	2	6	152750	152755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150375860
3111	NC_009620	GTT	2	6	152765	152770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150375860
3112	NC_009620	CCA	2	6	152789	152794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150375860
3113	NC_009620	GGC	2	6	152807	152812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150375860
3114	NC_009620	CGA	2	6	152833	152838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150375860
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3116	NC_009620	ATG	2	6	153238	153243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150375861
3117	NC_009620	TCGGC	2	10	153275	153284	0 %	20 %	40 %	40 %	150375861
3118	NC_009620	GTC	2	6	153319	153324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375861
3119	NC_009620	CTG	2	6	153362	153367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375861
3120	NC_009620	GGAC	2	8	153468	153475	25 %	0 %	50 %	25 %	150375861
3121	NC_009620	CG	3	6	153501	153506	0 %	0 %	50 %	50 %	150375861
3122	NC_009620	CGT	2	6	153678	153683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375861
3123	NC_009620	GC	3	6	153710	153715	0 %	0 %	50 %	50 %	150375861
3124	NC_009620	CGC	2	6	153729	153734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150375861
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3148	NC_009620	CGT	2	6	155198	155203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375863
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3150	NC_009620	TTG	2	6	155438	155443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150375863
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3154	NC_009620	TTC	2	6	155782	155787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150375863
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3240	NC_009620	AGC	2	6	159516	159521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150375866
3241	NC_009620	TCC	2	6	159527	159532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150375866
3242	NC_009620	AGC	2	6	159551	159556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150375866
3243	NC_009620	CGC	2	6	159557	159562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150375866
3244	NC_009620	AGC	2	6	159628	159633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150375867
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3246	NC_009620	CGT	2	6	159678	159683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375867
3247	NC_009620	GAT	2	6	159696	159701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150375867
3248	NC_009620	CGG	2	6	159818	159823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150375867
3249	NC_009620	GCC	2	6	159833	159838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150375867
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3252	NC_009620	TCGA	2	8	159991	159998	25 %	25 %	25 %	25 %	150375867
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3260	NC_009620	GTC	2	6	160173	160178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375867
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3266	NC_009620	CGC	2	6	160399	160404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150375867
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3268	NC_009620	GCT	2	6	160450	160455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375867
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3272	NC_009620	GCC	2	6	160605	160610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150375867
3273	NC_009620	CGGCGC	2	12	160637	160648	0 %	0 %	50 %	50 %	150375867
3274	NC_009620	CGAG	2	8	160658	160665	25 %	0 %	50 %	25 %	150375867
3275	NC_009620	GCCGGC	2	12	160701	160712	0 %	0 %	50 %	50 %	150375867
3276	NC_009620	CG	3	6	160793	160798	0 %	0 %	50 %	50 %	150375867
3277	NC_009620	AGG	2	6	160817	160822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150375867
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3282	NC_009620	CG	3	6	161039	161044	0 %	0 %	50 %	50 %	150375867
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3302	NC_009620	CGA	2	6	162195	162200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150375868
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3341	NC_009620	GC	3	6	164646	164651	0 %	0 %	50 %	50 %	150375872
3342	NC_009620	GAG	2	6	164681	164686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150375872
3343	NC_009620	CGA	2	6	164695	164700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150375872
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3345	NC_009620	CCG	2	6	164785	164790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150375872
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3347	NC_009620	AAAAG	2	10	164829	164838	80 %	0 %	20 %	0 %	150375872
3348	NC_009620	GTC	2	6	164846	164851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375872
3349	NC_009620	ACC	2	6	164901	164906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150375872
3350	NC_009620	GACC	2	8	165292	165299	25 %	0 %	25 %	50 %	150375873
3351	NC_009620	AGC	2	6	165347	165352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150375873
3352	NC_009620	CGCT	2	8	165399	165406	0 %	25 %	25 %	50 %	150375873
3353	NC_009620	ATCG	2	8	165415	165422	25 %	25 %	25 %	25 %	150375873
3354	NC_009620	GTT	2	6	165427	165432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150375873
3355	NC_009620	GAT	2	6	165436	165441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150375873
3356	NC_009620	CT	3	6	165492	165497	0 %	50 %	0 %	50 %	150375873
3357	NC_009620	TGC	2	6	165499	165504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375873
3358	NC_009620	GCA	2	6	165569	165574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150375873
3359	NC_009620	GCG	2	6	165601	165606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150375873
3360	NC_009620	CG	3	6	165621	165626	0 %	0 %	50 %	50 %	150375873
3361	NC_009620	AAAT	2	8	165653	165660	75 %	25 %	0 %	0 %	150375873
3362	NC_009620	GCCG	2	8	165667	165674	0 %	0 %	50 %	50 %	150375873
3363	NC_009620	AAT	2	6	165681	165686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150375873
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3420	NC_009620	GC	3	6	167979	167984	0 %	0 %	50 %	50 %	150375876
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3482	NC_009620	GAT	2	6	171147	171152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150375877
3483	NC_009620	ACGA	2	8	171535	171542	50 %	0 %	25 %	25 %	150375878
3484	NC_009620	GCT	2	6	171552	171557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375878
3485	NC_009620	CGCT	2	8	171565	171572	0 %	25 %	25 %	50 %	150375878
3486	NC_009620	CGC	2	6	171651	171656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150375878
3487	NC_009620	CAT	2	6	171663	171668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150375878
3488	NC_009620	CGA	2	6	171669	171674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150375878
3489	NC_009620	CG	3	6	171725	171730	0 %	0 %	50 %	50 %	150375878
3490	NC_009620	GTC	2	6	171751	171756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375878
3491	NC_009620	CGT	2	6	171822	171827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375878
3492	NC_009620	GC	3	6	171857	171862	0 %	0 %	50 %	50 %	150375878
3493	NC_009620	GGCC	2	8	171910	171917	0 %	0 %	50 %	50 %	150375878
3494	NC_009620	TC	3	6	171924	171929	0 %	50 %	0 %	50 %	150375878
3495	NC_009620	TCG	2	6	172094	172099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375878
3496	NC_009620	ATGG	2	8	172159	172166	25 %	25 %	50 %	0 %	150375878
3497	NC_009620	GCC	2	6	172225	172230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150375878
3498	NC_009620	TCA	2	6	172247	172252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150375878
3499	NC_009620	GCG	2	6	172280	172285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150375878
3500	NC_009620	CGG	2	6	172416	172421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150375878

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