MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1 plasmid pSJH101

Total Repeats: 85

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009619	T	6	6	534	539	0 %	100 %	0 %	0 %	150375694
2	NC_009619	A	6	6	578	583	100 %	0 %	0 %	0 %	150375694
3	NC_009619	T	6	6	991	996	0 %	100 %	0 %	0 %	150375695
4	NC_009619	A	6	6	1204	1209	100 %	0 %	0 %	0 %	150375695
5	NC_009619	A	7	7	2470	2476	100 %	0 %	0 %	0 %	150375696
6	NC_009619	A	6	6	2508	2513	100 %	0 %	0 %	0 %	150375696
7	NC_009619	A	6	6	2792	2797	100 %	0 %	0 %	0 %	150375697
8	NC_009619	A	6	6	2935	2940	100 %	0 %	0 %	0 %	150375697
9	NC_009619	A	7	7	2950	2956	100 %	0 %	0 %	0 %	150375697
10	NC_009619	A	6	6	3056	3061	100 %	0 %	0 %	0 %	150375697
11	NC_009619	A	7	7	3106	3112	100 %	0 %	0 %	0 %	150375697
12	NC_009619	A	6	6	3131	3136	100 %	0 %	0 %	0 %	150375697
13	NC_009619	T	6	6	4722	4727	0 %	100 %	0 %	0 %	150375698
14	NC_009619	T	7	7	4809	4815	0 %	100 %	0 %	0 %	150375698
15	NC_009619	T	7	7	5292	5298	0 %	100 %	0 %	0 %	150375698
16	NC_009619	T	6	6	5316	5321	0 %	100 %	0 %	0 %	150375698
17	NC_009619	A	6	6	6111	6116	100 %	0 %	0 %	0 %	150375700
18	NC_009619	A	8	8	6180	6187	100 %	0 %	0 %	0 %	150375700
19	NC_009619	A	6	6	6486	6491	100 %	0 %	0 %	0 %	150375700
20	NC_009619	A	7	7	6610	6616	100 %	0 %	0 %	0 %	150375700
21	NC_009619	A	6	6	7284	7289	100 %	0 %	0 %	0 %	150375701
22	NC_009619	A	6	6	7643	7648	100 %	0 %	0 %	0 %	150375701
23	NC_009619	A	6	6	8577	8582	100 %	0 %	0 %	0 %	150375703
24	NC_009619	A	7	7	8600	8606	100 %	0 %	0 %	0 %	150375703
25	NC_009619	A	6	6	8835	8840	100 %	0 %	0 %	0 %	150375703
26	NC_009619	A	6	6	8964	8969	100 %	0 %	0 %	0 %	150375703
27	NC_009619	A	6	6	9162	9167	100 %	0 %	0 %	0 %	150375703
28	NC_009619	T	6	6	9197	9202	0 %	100 %	0 %	0 %	150375703
29	NC_009619	T	6	6	9302	9307	0 %	100 %	0 %	0 %	150375703
30	NC_009619	T	6	6	9374	9379	0 %	100 %	0 %	0 %	150375703
31	NC_009619	A	6	6	10642	10647	100 %	0 %	0 %	0 %	150375704
32	NC_009619	A	6	6	11001	11006	100 %	0 %	0 %	0 %	150375704
33	NC_009619	T	6	6	11330	11335	0 %	100 %	0 %	0 %	150375705
34	NC_009619	T	8	8	11625	11632	0 %	100 %	0 %	0 %	150375705
35	NC_009619	T	6	6	11657	11662	0 %	100 %	0 %	0 %	150375705
36	NC_009619	T	8	8	11896	11903	0 %	100 %	0 %	0 %	150375705
37	NC_009619	A	6	6	12323	12328	100 %	0 %	0 %	0 %	150375705
38	NC_009619	T	6	6	12377	12382	0 %	100 %	0 %	0 %	150375705
39	NC_009619	T	6	6	13042	13047	0 %	100 %	0 %	0 %	150375706
40	NC_009619	T	6	6	13201	13206	0 %	100 %	0 %	0 %	150375706
41	NC_009619	T	6	6	13405	13410	0 %	100 %	0 %	0 %	150375706
42	NC_009619	T	6	6	14211	14216	0 %	100 %	0 %	0 %	150375707
43	NC_009619	T	6	6	15018	15023	0 %	100 %	0 %	0 %	150375707
44	NC_009619	A	6	6	15477	15482	100 %	0 %	0 %	0 %	150375707
45	NC_009619	A	6	6	15779	15784	100 %	0 %	0 %	0 %	150375708
46	NC_009619	A	7	7	17121	17127	100 %	0 %	0 %	0 %	150375710
47	NC_009619	T	7	7	17558	17564	0 %	100 %	0 %	0 %	150375711
48	NC_009619	T	6	6	17602	17607	0 %	100 %	0 %	0 %	150375711
49	NC_009619	T	6	6	17844	17849	0 %	100 %	0 %	0 %	150375711
50	NC_009619	T	6	6	17961	17966	0 %	100 %	0 %	0 %	150375711
51	NC_009619	T	6	6	17970	17975	0 %	100 %	0 %	0 %	150375711
52	NC_009619	A	6	6	18884	18889	100 %	0 %	0 %	0 %	150375713
53	NC_009619	A	6	6	18893	18898	100 %	0 %	0 %	0 %	150375713
54	NC_009619	T	6	6	19495	19500	0 %	100 %	0 %	0 %	150375714
55	NC_009619	A	6	6	19865	19870	100 %	0 %	0 %	0 %	150375714
56	NC_009619	A	6	6	20000	20005	100 %	0 %	0 %	0 %	150375714
57	NC_009619	A	6	6	20198	20203	100 %	0 %	0 %	0 %	150375715
58	NC_009619	A	6	6	20456	20461	100 %	0 %	0 %	0 %	150375715
59	NC_009619	T	6	6	20569	20574	0 %	100 %	0 %	0 %	150375715
60	NC_009619	A	7	7	20897	20903	100 %	0 %	0 %	0 %	150375715
61	NC_009619	A	7	7	21261	21267	100 %	0 %	0 %	0 %	150375715
62	NC_009619	T	6	6	21491	21496	0 %	100 %	0 %	0 %	150375716
63	NC_009619	T	6	6	22418	22423	0 %	100 %	0 %	0 %	150375717
64	NC_009619	T	6	6	22944	22949	0 %	100 %	0 %	0 %	150375718
65	NC_009619	T	7	7	22987	22993	0 %	100 %	0 %	0 %	150375718
66	NC_009619	A	6	6	23526	23531	100 %	0 %	0 %	0 %	150375718
67	NC_009619	T	6	6	24309	24314	0 %	100 %	0 %	0 %	150375718
68	NC_009619	T	9	9	24484	24492	0 %	100 %	0 %	0 %	150375719
69	NC_009619	T	6	6	24840	24845	0 %	100 %	0 %	0 %	150375719
70	NC_009619	T	6	6	25407	25412	0 %	100 %	0 %	0 %	150375720
71	NC_009619	T	6	6	25503	25508	0 %	100 %	0 %	0 %	150375720
72	NC_009619	T	6	6	25596	25601	0 %	100 %	0 %	0 %	150375721
73	NC_009619	T	6	6	25807	25812	0 %	100 %	0 %	0 %	150375721
74	NC_009619	A	7	7	26359	26365	100 %	0 %	0 %	0 %	150375721
75	NC_009619	T	6	6	26455	26460	0 %	100 %	0 %	0 %	150375721
76	NC_009619	T	7	7	26846	26852	0 %	100 %	0 %	0 %	150375722
77	NC_009619	T	7	7	26887	26893	0 %	100 %	0 %	0 %	150375722
78	NC_009619	A	6	6	27252	27257	100 %	0 %	0 %	0 %	150375722
79	NC_009619	A	8	8	27515	27522	100 %	0 %	0 %	0 %	150375723
80	NC_009619	A	6	6	27673	27678	100 %	0 %	0 %	0 %	150375723
81	NC_009619	A	6	6	27832	27837	100 %	0 %	0 %	0 %	150375723
82	NC_009619	A	6	6	27925	27930	100 %	0 %	0 %	0 %	150375723
83	NC_009619	A	8	8	27997	28004	100 %	0 %	0 %	0 %	150375723
84	NC_009619	A	7	7	29907	29913	100 %	0 %	0 %	0 %	150375725
85	NC_009619	A	6	6	29962	29967	100 %	0 %	0 %	0 %	150375725

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.