MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1 plasmid pSJH101

Total Repeats: 354

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009619	TTG	2	6	56	61	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150375693
2	NC_009619	TGA	2	6	105	110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150375693
3	NC_009619	ATG	2	6	119	124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150375693
4	NC_009619	TAA	2	6	351	356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150375694
5	NC_009619	AAT	2	6	357	362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150375694
6	NC_009619	ATG	2	6	421	426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150375694
7	NC_009619	TCT	2	6	485	490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150375694
8	NC_009619	ATA	2	6	501	506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150375694
9	NC_009619	TCT	2	6	519	524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150375694
10	NC_009619	ATC	2	6	568	573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150375694
11	NC_009619	AAT	3	9	709	717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150375695
12	NC_009619	AAT	2	6	739	744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150375695
13	NC_009619	CAA	2	6	771	776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150375695
14	NC_009619	AAG	2	6	824	829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150375695
15	NC_009619	ATC	2	6	1018	1023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150375695
16	NC_009619	ATA	2	6	1139	1144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150375695
17	NC_009619	TAA	2	6	1213	1218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150375695
18	NC_009619	TAA	2	6	1225	1230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150375695
19	NC_009619	CTG	2	6	1236	1241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375695
20	NC_009619	CAG	3	9	1257	1265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150375695
21	NC_009619	CAA	2	6	1266	1271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150375695
22	NC_009619	ATA	2	6	1283	1288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150375695
23	NC_009619	TCA	2	6	2491	2496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150375696
24	NC_009619	ATT	2	6	2718	2723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150375697
25	NC_009619	AAT	2	6	2727	2732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150375697
26	NC_009619	GAA	2	6	2785	2790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150375697
27	NC_009619	AGA	2	6	2964	2969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150375697
28	NC_009619	TAA	2	6	3036	3041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150375697
29	NC_009619	ACA	2	6	3101	3106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150375697
30	NC_009619	TTA	2	6	3170	3175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150375697
31	NC_009619	GTA	2	6	3269	3274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150375697
32	NC_009619	ACT	2	6	3299	3304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150375697
33	NC_009619	CGG	2	6	3336	3341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150375697
34	NC_009619	ATT	2	6	4568	4573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150375698
35	NC_009619	TTC	2	6	4629	4634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150375698
36	NC_009619	AAG	2	6	4739	4744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150375698
37	NC_009619	TAA	2	6	4866	4871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150375698
38	NC_009619	ATC	2	6	4917	4922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150375698
39	NC_009619	ATT	2	6	5007	5012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150375698
40	NC_009619	TCT	2	6	5173	5178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150375698
41	NC_009619	CGT	2	6	5254	5259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375698
42	NC_009619	TCA	2	6	5380	5385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150375698
43	NC_009619	ATT	2	6	5653	5658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150375699
44	NC_009619	TTA	2	6	5712	5717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150375699
45	NC_009619	GAA	2	6	6002	6007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150375700
46	NC_009619	TAA	2	6	6034	6039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150375700
47	NC_009619	AGA	2	6	6094	6099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150375700
48	NC_009619	TAC	2	6	6163	6168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150375700
49	NC_009619	ATA	2	6	6195	6200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150375700
50	NC_009619	TAG	2	6	6231	6236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150375700
51	NC_009619	AAT	2	6	6266	6271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150375700
52	NC_009619	GTC	2	6	6291	6296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150375700
53	NC_009619	ACA	2	6	6302	6307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150375700
54	NC_009619	TAA	2	6	6382	6387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150375700
55	NC_009619	CTA	2	6	6453	6458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150375700
56	NC_009619	TAC	2	6	6496	6501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150375700
57	NC_009619	GAA	2	6	6530	6535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150375700
58	NC_009619	CGA	2	6	6583	6588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150375700
59	NC_009619	GAA	2	6	6602	6607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150375700
60	NC_009619	AGA	2	6	6658	6663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150375700
61	NC_009619	GAA	2	6	6671	6676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150375700
62	NC_009619	CTA	2	6	7142	7147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150375701
63	NC_009619	GTG	2	6	7198	7203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150375701
64	NC_009619	TCA	2	6	7211	7216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150375701
65	NC_009619	GAA	2	6	7271	7276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150375701
66	NC_009619	TTA	2	6	7292	7297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150375701
67	NC_009619	TGA	2	6	7310	7315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150375701
68	NC_009619	GAA	2	6	8073	8078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150375702
69	NC_009619	TGA	2	6	8087	8092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150375702
70	NC_009619	ATA	2	6	8170	8175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150375702
71	NC_009619	ATT	2	6	8291	8296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150375702
72	NC_009619	TTA	2	6	8302	8307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150375702
73	NC_009619	GTT	2	6	8329	8334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150375702
74	NC_009619	TAA	2	6	8347	8352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150375702
75	NC_009619	GGT	2	6	8397	8402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150375702
76	NC_009619	GAT	3	9	8505	8513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150375703
77	NC_009619	TGA	2	6	8540	8545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150375703
78	NC_009619	TGG	2	6	8564	8569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150375703
79	NC_009619	ATT	2	6	8646	8651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150375703
80	NC_009619	ATG	2	6	8698	8703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150375703
81	NC_009619	TGA	2	6	8735	8740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150375703
82	NC_009619	ATT	2	6	8779	8784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150375703
83	NC_009619	AAT	2	6	8880	8885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150375703
84	NC_009619	ATT	2	6	8925	8930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150375703
85	NC_009619	ATG	2	6	8998	9003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150375703
86	NC_009619	AAT	2	6	9080	9085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150375703
87	NC_009619	TAA	2	6	9119	9124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150375703
88	NC_009619	TAA	2	6	9155	9160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150375703
89	NC_009619	TGA	2	6	9260	9265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150375703
90	NC_009619	CTA	2	6	9325	9330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150375703
91	NC_009619	AGA	3	9	9335	9343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150375703
92	NC_009619	ATA	2	6	9430	9435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150375703
93	NC_009619	AGA	2	6	9449	9454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150375703
94	NC_009619	TTG	2	6	9462	9467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150375703
95	NC_009619	CAA	2	6	9541	9546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150375703
96	NC_009619	ATC	2	6	9595	9600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150375703
97	NC_009619	AAT	2	6	9615	9620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150375703
98	NC_009619	AAT	2	6	9632	9637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150375703
99	NC_009619	GAA	3	9	9702	9710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150375703
100	NC_009619	GAA	2	6	9795	9800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150375703
101	NC_009619	TAT	2	6	9801	9806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150375703
102	NC_009619	CTA	2	6	10500	10505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150375704
103	NC_009619	GTG	2	6	10556	10561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150375704
104	NC_009619	TCA	2	6	10569	10574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150375704
105	NC_009619	GAA	2	6	10629	10634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150375704
106	NC_009619	TTA	2	6	10650	10655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150375704
107	NC_009619	TGA	2	6	10668	10673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150375704
108	NC_009619	ATT	2	6	11234	11239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150375705
109	NC_009619	CCA	2	6	11240	11245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150375705
110	NC_009619	TTC	2	6	11381	11386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150375705
111	NC_009619	ACT	2	6	11451	11456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150375705
112	NC_009619	TAT	2	6	11500	11505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150375705
113	NC_009619	ATT	3	9	11594	11602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150375705
114	NC_009619	TAT	2	6	11617	11622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150375705
115	NC_009619	TCT	2	6	11708	11713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150375705
116	NC_009619	ATT	2	6	11714	11719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150375705
117	NC_009619	TGT	2	6	11750	11755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150375705
118	NC_009619	TTC	2	6	11777	11782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150375705
119	NC_009619	TAA	2	6	11809	11814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150375705
120	NC_009619	TTG	2	6	12078	12083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150375705
121	NC_009619	TCT	3	9	12177	12185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150375705
122	NC_009619	CAG	2	6	12220	12225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150375705
123	NC_009619	ATT	2	6	12255	12260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150375705
124	NC_009619	AAT	2	6	12351	12356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150375705
125	NC_009619	TTG	2	6	12440	12445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150375705
126	NC_009619	TAA	2	6	12500	12505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150375705
127	NC_009619	TTC	2	6	12530	12535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150375705
128	NC_009619	TTA	2	6	12661	12666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150375705
129	NC_009619	ATG	2	6	12667	12672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150375705
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131	NC_009619	ACG	2	6	12939	12944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150375706
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.