MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sphingomonas wittichii RW1 chromosome

Total Repeats: 148116

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_009511	AGA	2	6	141302	141307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148553071
4002	NC_009511	GC	3	6	141326	141331	0 %	0 %	50 %	50 %	148553071
4003	NC_009511	ATA	2	6	141336	141341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148553071
4004	NC_009511	GCC	2	6	141342	141347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148553071
4005	NC_009511	GAC	2	6	141416	141421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148553071
4006	NC_009511	TCG	3	9	141433	141441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553071
4007	NC_009511	CGT	2	6	141452	141457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553071
4008	NC_009511	GCC	2	6	141485	141490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148553071
4009	NC_009511	GCC	2	6	141570	141575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148553071
4010	NC_009511	TCC	2	6	141598	141603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148553071
4011	NC_009511	CGAAGG	2	12	141611	141622	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	148553071
4012	NC_009511	CG	3	6	141706	141711	0 %	0 %	50 %	50 %	148553071
4013	NC_009511	GC	3	6	141728	141733	0 %	0 %	50 %	50 %	148553071
4014	NC_009511	ATC	2	6	141748	141753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148553071
4015	NC_009511	CGCC	2	8	141779	141786	0 %	0 %	25 %	75 %	148553071
4016	NC_009511	TGC	2	6	141795	141800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553071
4017	NC_009511	GGC	2	6	141900	141905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553072
4018	NC_009511	CTG	2	6	141906	141911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553072
4019	NC_009511	CGT	2	6	141923	141928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553072
4020	NC_009511	GGC	2	6	141948	141953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553072
4021	NC_009511	GC	3	6	142028	142033	0 %	0 %	50 %	50 %	148553072
4022	NC_009511	CAG	2	6	142041	142046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148553072
4023	NC_009511	CAT	2	6	142071	142076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148553072
4024	NC_009511	CCG	2	6	142107	142112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148553072
4025	NC_009511	GAC	2	6	142113	142118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148553072
4026	NC_009511	GC	3	6	142145	142150	0 %	0 %	50 %	50 %	148553072
4027	NC_009511	CCG	2	6	142196	142201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148553072
4028	NC_009511	CGG	2	6	142313	142318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553072
4029	NC_009511	GCC	2	6	142326	142331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148553072
4030	NC_009511	GC	3	6	142436	142441	0 %	0 %	50 %	50 %	148553072
4031	NC_009511	TCC	2	6	142447	142452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148553072
4032	NC_009511	AGC	2	6	142453	142458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148553072
4033	NC_009511	GCGCC	2	10	142616	142625	0 %	0 %	40 %	60 %	148553073
4034	NC_009511	ATC	2	6	142641	142646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148553073
4035	NC_009511	GCG	2	6	142655	142660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553073
4036	NC_009511	CG	3	6	142668	142673	0 %	0 %	50 %	50 %	148553073
4037	NC_009511	CCG	3	9	142678	142686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148553073
4038	NC_009511	CGC	2	6	142711	142716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148553073
4039	NC_009511	CGA	2	6	142796	142801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148553073
4040	NC_009511	GCC	2	6	142814	142819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148553073
4041	NC_009511	CGA	2	6	142835	142840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148553073
4042	NC_009511	GGC	2	6	142847	142852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553073
4043	NC_009511	GC	3	6	142861	142866	0 %	0 %	50 %	50 %	148553073
4044	NC_009511	CGGG	2	8	142877	142884	0 %	0 %	75 %	25 %	148553073
4045	NC_009511	GCG	2	6	142905	142910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553073
4046	NC_009511	CG	3	6	142909	142914	0 %	0 %	50 %	50 %	148553073
4047	NC_009511	GTC	2	6	142938	142943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553073
4048	NC_009511	TGC	2	6	142969	142974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553073
4049	NC_009511	CGG	2	6	142981	142986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553073
4050	NC_009511	CGGC	2	8	142989	142996	0 %	0 %	50 %	50 %	148553073
4051	NC_009511	CG	3	6	142998	143003	0 %	0 %	50 %	50 %	148553073
4052	NC_009511	CG	3	6	143005	143010	0 %	0 %	50 %	50 %	148553073
4053	NC_009511	GCCG	2	8	143049	143056	0 %	0 %	50 %	50 %	148553073
4054	NC_009511	CGA	2	6	143078	143083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148553073
4055	NC_009511	GGGC	2	8	143088	143095	0 %	0 %	75 %	25 %	148553073
4056	NC_009511	GTC	2	6	143118	143123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553073
4057	NC_009511	CTT	2	6	143129	143134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148553073
4058	NC_009511	CGC	2	6	143153	143158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148553073
4059	NC_009511	CGA	2	6	143225	143230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148553073
4060	NC_009511	GCCCG	2	10	143241	143250	0 %	0 %	40 %	60 %	148553073
4061	NC_009511	CCT	2	6	143299	143304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148553073
4062	NC_009511	GC	3	6	143350	143355	0 %	0 %	50 %	50 %	148553074
4063	NC_009511	GGTC	2	8	143377	143384	0 %	25 %	50 %	25 %	148553074
4064	NC_009511	TTC	2	6	143411	143416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148553074
4065	NC_009511	GAT	2	6	143471	143476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148553074
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4067	NC_009511	GTC	2	6	143709	143714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553075
4068	NC_009511	GCT	2	6	143724	143729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553075
4069	NC_009511	ACC	2	6	143737	143742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148553075
4070	NC_009511	GCA	3	9	143753	143761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148553075
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4072	NC_009511	CCG	2	6	143842	143847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148553075
4073	NC_009511	GTC	2	6	143943	143948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553075
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4076	NC_009511	CGA	2	6	143999	144004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148553076
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4082	NC_009511	GCG	2	6	144188	144193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553076
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4084	NC_009511	GGC	2	6	144218	144223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553076
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4086	NC_009511	CGA	2	6	144256	144261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148553076
4087	NC_009511	AGGGC	2	10	144271	144280	20 %	0 %	60 %	20 %	148553076
4088	NC_009511	GCG	2	6	144286	144291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553076
4089	NC_009511	CGATGG	2	12	144295	144306	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148553076
4090	NC_009511	GC	3	6	144330	144335	0 %	0 %	50 %	50 %	148553076
4091	NC_009511	TCG	2	6	144361	144366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553076
4092	NC_009511	GCG	2	6	144381	144386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553076
4093	NC_009511	GCG	2	6	144398	144403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553076
4094	NC_009511	CCG	2	6	144469	144474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148553076
4095	NC_009511	CG	3	6	144548	144553	0 %	0 %	50 %	50 %	148553076
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4097	NC_009511	CCGG	2	8	144589	144596	0 %	0 %	50 %	50 %	148553076
4098	NC_009511	CGGG	2	8	144635	144642	0 %	0 %	75 %	25 %	148553076
4099	NC_009511	G	6	6	144652	144657	0 %	0 %	100 %	0 %	148553076
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4102	NC_009511	CG	3	6	144718	144723	0 %	0 %	50 %	50 %	148553076
4103	NC_009511	CTCCG	2	10	144725	144734	0 %	20 %	20 %	60 %	148553076
4104	NC_009511	AGGA	2	8	144747	144754	50 %	0 %	50 %	0 %	148553076
4105	NC_009511	TGG	2	6	144766	144771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148553076
4106	NC_009511	CGAG	2	8	144796	144803	25 %	0 %	50 %	25 %	148553076
4107	NC_009511	CGA	2	6	144826	144831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148553076
4108	NC_009511	GAA	2	6	144836	144841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148553076
4109	NC_009511	CTG	2	6	144866	144871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553076
4110	NC_009511	GAT	2	6	144880	144885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148553076
4111	NC_009511	ATA	2	6	144896	144901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148553076
4112	NC_009511	AGCGCG	2	12	144954	144965	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	148553076
4113	NC_009511	CCG	2	6	144966	144971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148553076
4114	NC_009511	CGC	2	6	144974	144979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148553076
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4119	NC_009511	GAT	2	6	145151	145156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148553076
4120	NC_009511	CGA	2	6	145189	145194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148553076
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4122	NC_009511	AGCCC	2	10	145288	145297	20 %	0 %	20 %	60 %	148553076
4123	NC_009511	TCA	2	6	145309	145314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148553076
4124	NC_009511	GAT	2	6	145337	145342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148553076
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4126	NC_009511	GAG	2	6	145353	145358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148553076
4127	NC_009511	AGC	2	6	145359	145364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148553076
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4130	NC_009511	CGA	2	6	145432	145437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148553076
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4234	NC_009511	G	6	6	150691	150696	0 %	0 %	100 %	0 %	148553082
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4242	NC_009511	GCC	2	6	150933	150938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148553083
4243	NC_009511	GGC	3	9	150965	150973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553083
4244	NC_009511	TCG	2	6	150994	150999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553083
4245	NC_009511	GCCG	2	8	151058	151065	0 %	0 %	50 %	50 %	148553083
4246	NC_009511	GCG	2	6	151159	151164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553083
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4248	NC_009511	GCT	2	6	151193	151198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553083
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4251	NC_009511	ACC	2	6	151385	151390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148553084
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4253	NC_009511	CTG	2	6	151469	151474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553084
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4257	NC_009511	CGAT	2	8	151663	151670	25 %	25 %	25 %	25 %	148553084
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4266	NC_009511	GTC	2	6	152219	152224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553085
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4271	NC_009511	CGG	2	6	152373	152378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553085
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4273	NC_009511	CGC	2	6	152422	152427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148553085
4274	NC_009511	GCGCC	2	10	152488	152497	0 %	0 %	40 %	60 %	148553086
4275	NC_009511	TCG	2	6	152538	152543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553086
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4283	NC_009511	GGC	2	6	152876	152881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553086
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4322	NC_009511	TCG	2	6	154623	154628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553088
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4330	NC_009511	GCCTGC	2	12	154806	154817	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	148553088
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4340	NC_009511	TCA	3	9	155297	155305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148553089
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4342	NC_009511	GTCG	2	8	155385	155392	0 %	25 %	50 %	25 %	148553089
4343	NC_009511	CTT	2	6	155409	155414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148553089
4344	NC_009511	CTT	2	6	155421	155426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148553089
4345	NC_009511	GGC	2	6	155434	155439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553089
4346	NC_009511	GAG	2	6	155460	155465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148553090
4347	NC_009511	GCCGA	2	10	155505	155514	20 %	0 %	40 %	40 %	148553090
4348	NC_009511	GC	3	6	155527	155532	0 %	0 %	50 %	50 %	148553090
4349	NC_009511	CGC	3	9	155564	155572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148553090
4350	NC_009511	CGC	2	6	155645	155650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148553090
4351	NC_009511	GC	3	6	155649	155654	0 %	0 %	50 %	50 %	148553090
4352	NC_009511	TCC	2	6	155668	155673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148553090
4353	NC_009511	ATG	2	6	155727	155732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148553091
4354	NC_009511	TCC	2	6	155734	155739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148553091
4355	NC_009511	CGC	2	6	155751	155756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148553091
4356	NC_009511	GCG	2	6	155787	155792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553091
4357	NC_009511	CAA	2	6	155816	155821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148553091
4358	NC_009511	GCGCA	2	10	155961	155970	20 %	0 %	40 %	40 %	148553091
4359	NC_009511	CGA	2	6	156029	156034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148553091
4360	NC_009511	GCG	2	6	156038	156043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553091
4361	NC_009511	GCG	2	6	156058	156063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553091
4362	NC_009511	CTA	2	6	156092	156097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148553091
4363	NC_009511	C	6	6	156116	156121	0 %	0 %	0 %	100 %	148553091
4364	NC_009511	CGA	2	6	156125	156130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148553091
4365	NC_009511	CG	3	6	156136	156141	0 %	0 %	50 %	50 %	148553091
4366	NC_009511	CCT	2	6	156142	156147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148553091
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4369	NC_009511	ATC	2	6	156193	156198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148553091
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4468	NC_009511	CCG	2	6	159046	159051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148553093
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4470	NC_009511	CGA	2	6	159164	159169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148553093
4471	NC_009511	GCCGC	2	10	159175	159184	0 %	0 %	40 %	60 %	148553093
4472	NC_009511	TCG	2	6	159197	159202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553093
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4475	NC_009511	GAG	2	6	159273	159278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148553093
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4477	NC_009511	GGC	2	6	159365	159370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553094
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4479	NC_009511	TCATCG	2	12	159396	159407	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148553094
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4483	NC_009511	TTC	2	6	159494	159499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148553094
4484	NC_009511	ATCT	2	8	159539	159546	25 %	50 %	0 %	25 %	148553094
4485	NC_009511	GCC	2	6	159572	159577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148553094
4486	NC_009511	CCGG	2	8	159609	159616	0 %	0 %	50 %	50 %	148553094
4487	NC_009511	GGC	2	6	159642	159647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553094
4488	NC_009511	TGC	2	6	159717	159722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553094
4489	NC_009511	TGC	2	6	159741	159746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553094
4490	NC_009511	ATC	2	6	159758	159763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148553094
4491	NC_009511	CAT	3	9	159919	159927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148553094
4492	NC_009511	CGA	2	6	159949	159954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148553094
4493	NC_009511	CGC	2	6	159978	159983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148553094
4494	NC_009511	CGC	2	6	160060	160065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148553094
4495	NC_009511	GGC	2	6	160079	160084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553094
4496	NC_009511	TCG	2	6	160122	160127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148553094
4497	NC_009511	GGCGCG	2	12	160133	160144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148553094
4498	NC_009511	GCC	2	6	160160	160165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148553094
4499	NC_009511	CG	3	6	160197	160202	0 %	0 %	50 %	50 %	148553094
4500	NC_009511	CCG	2	6	160203	160208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148553094

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