MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sphingomonas wittichii RW1 plasmid pSWIT02

Total Repeats: 4061

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_009508	GTCATG	2	12	116355	116366	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	148550952
2002	NC_009508	CCAC	2	8	116401	116408	25 %	0 %	0 %	75 %	148550953
2003	NC_009508	GGT	2	6	116476	116481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550953
2004	NC_009508	CCA	2	6	116486	116491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550953
2005	NC_009508	GC	4	8	116555	116562	0 %	0 %	50 %	50 %	148550953
2006	NC_009508	TCG	2	6	116602	116607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550953
2007	NC_009508	CAA	2	6	116610	116615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148550953
2008	NC_009508	GGC	2	6	116616	116621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550953
2009	NC_009508	CTT	2	6	116622	116627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148550953
2010	NC_009508	CTG	2	6	116656	116661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550953
2011	NC_009508	CTCGC	2	10	116662	116671	0 %	20 %	20 %	60 %	148550953
2012	NC_009508	TGG	2	6	116681	116686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550953
2013	NC_009508	CGA	2	6	116688	116693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550953
2014	NC_009508	TGGG	2	8	116729	116736	0 %	25 %	75 %	0 %	148550953
2015	NC_009508	CAT	2	6	116859	116864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550953
2016	NC_009508	TGC	2	6	116894	116899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550953
2017	NC_009508	GAT	2	6	117033	117038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550953
2018	NC_009508	TCG	2	6	117040	117045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550953
2019	NC_009508	GGCG	2	8	117164	117171	0 %	0 %	75 %	25 %	148550953
2020	NC_009508	TCG	2	6	117175	117180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550953
2021	NC_009508	GCC	2	6	117204	117209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550953
2022	NC_009508	GATC	2	8	117236	117243	25 %	25 %	25 %	25 %	148550953
2023	NC_009508	GCT	2	6	117245	117250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550953
2024	NC_009508	GGA	2	6	117251	117256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148550953
2025	NC_009508	AGAT	2	8	117307	117314	50 %	25 %	25 %	0 %	148550953
2026	NC_009508	GCA	2	6	117367	117372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550953
2027	NC_009508	AC	4	8	117473	117480	50 %	0 %	0 %	50 %	148550953
2028	NC_009508	GCT	2	6	117503	117508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550953
2029	NC_009508	CCT	2	6	117512	117517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148550953
2030	NC_009508	CGA	2	6	117518	117523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550953
2031	NC_009508	GCC	2	6	117560	117565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550953
2032	NC_009508	GCCGAC	2	12	117618	117629	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	148550953
2033	NC_009508	GGC	2	6	117633	117638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550953
2034	NC_009508	GC	4	8	117637	117644	0 %	0 %	50 %	50 %	148550953
2035	NC_009508	GCC	2	6	117693	117698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550953
2036	NC_009508	TCT	2	6	117701	117706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148550953
2037	NC_009508	GTC	2	6	117729	117734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550953
2038	NC_009508	CG	4	8	117823	117830	0 %	0 %	50 %	50 %	148550953
2039	NC_009508	CAC	3	9	117873	117881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550953
2040	NC_009508	GC	3	6	117934	117939	0 %	0 %	50 %	50 %	148550953
2041	NC_009508	GCC	2	6	117969	117974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550953
2042	NC_009508	GCC	2	6	117990	117995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550953
2043	NC_009508	CGA	2	6	118004	118009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550953
2044	NC_009508	TGC	2	6	118022	118027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550953
2045	NC_009508	CGG	2	6	118039	118044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550953
2046	NC_009508	TTTCAC	2	12	118046	118057	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	148550953
2047	NC_009508	GAT	2	6	118101	118106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550953
2048	NC_009508	CGC	2	6	118130	118135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550953
2049	NC_009508	GC	3	6	118142	118147	0 %	0 %	50 %	50 %	148550953
2050	NC_009508	AGC	2	6	118168	118173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550953
2051	NC_009508	CGC	2	6	118178	118183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550953
2052	NC_009508	ATA	2	6	118185	118190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148550953
2053	NC_009508	CGA	2	6	118310	118315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550953
2054	NC_009508	CCT	2	6	118365	118370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148550954
2055	NC_009508	GC	3	6	118388	118393	0 %	0 %	50 %	50 %	148550954
2056	NC_009508	GAC	2	6	118405	118410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550954
2057	NC_009508	CGA	2	6	118416	118421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550954
2058	NC_009508	GTC	2	6	118444	118449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550954
2059	NC_009508	CGCC	2	8	118463	118470	0 %	0 %	25 %	75 %	148550954
2060	NC_009508	GCT	2	6	118497	118502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550954
2061	NC_009508	AAG	2	6	118580	118585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148550954
2062	NC_009508	AGG	2	6	118610	118615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148550954
2063	NC_009508	GCGCA	2	10	118633	118642	20 %	0 %	40 %	40 %	148550954
2064	NC_009508	AGC	2	6	118649	118654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550954
2065	NC_009508	TCGC	2	8	118684	118691	0 %	25 %	25 %	50 %	148550954
2066	NC_009508	ACG	2	6	118709	118714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550954
2067	NC_009508	CGA	3	9	118725	118733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550954
2068	NC_009508	CG	3	6	118737	118742	0 %	0 %	50 %	50 %	148550954
2069	NC_009508	CAG	2	6	118756	118761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550954
2070	NC_009508	CGGG	2	8	118770	118777	0 %	0 %	75 %	25 %	148550954
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2078	NC_009508	GC	3	6	119031	119036	0 %	0 %	50 %	50 %	148550954
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2081	NC_009508	ATGCCA	2	12	119194	119205	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	148550954
2082	NC_009508	GAT	2	6	119211	119216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550954
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2088	NC_009508	CTCG	2	8	119467	119474	0 %	25 %	25 %	50 %	148550955
2089	NC_009508	CGT	2	6	119482	119487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550955
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2097	NC_009508	GCCC	2	8	119618	119625	0 %	0 %	25 %	75 %	148550955
2098	NC_009508	GCG	2	6	119670	119675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550955
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2103	NC_009508	GAA	2	6	119853	119858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148550955
2104	NC_009508	CGG	2	6	119877	119882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550955
2105	NC_009508	GCA	2	6	119904	119909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550955
2106	NC_009508	C	6	6	120047	120052	0 %	0 %	0 %	100 %	148550955
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2108	NC_009508	ACG	2	6	120097	120102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550955
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2111	NC_009508	CGG	2	6	120202	120207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550955
2112	NC_009508	CAT	2	6	120276	120281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550955
2113	NC_009508	CG	3	6	120294	120299	0 %	0 %	50 %	50 %	148550955
2114	NC_009508	GATCG	2	10	120454	120463	20 %	20 %	40 %	20 %	148550955
2115	NC_009508	GAT	2	6	120478	120483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550955
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2117	NC_009508	CGA	2	6	120518	120523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550955
2118	NC_009508	CACT	2	8	120552	120559	25 %	25 %	0 %	50 %	148550956
2119	NC_009508	GCG	2	6	120590	120595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550956
2120	NC_009508	GGCGCA	2	12	120671	120682	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	148550956
2121	NC_009508	GCC	2	6	120688	120693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550956
2122	NC_009508	GAC	2	6	120702	120707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550956
2123	NC_009508	TCG	2	6	120715	120720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550956
2124	NC_009508	AGAT	2	8	120766	120773	50 %	25 %	25 %	0 %	148550956
2125	NC_009508	TCGC	2	8	120850	120857	0 %	25 %	25 %	50 %	148550956
2126	NC_009508	GCG	2	6	120940	120945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550956
2127	NC_009508	CCT	2	6	120956	120961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148550956
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2129	NC_009508	GC	3	6	120975	120980	0 %	0 %	50 %	50 %	148550956
2130	NC_009508	CG	3	6	120998	121003	0 %	0 %	50 %	50 %	148550956
2131	NC_009508	GAA	2	6	121023	121028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148550956
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2133	NC_009508	GGTC	2	8	121128	121135	0 %	25 %	50 %	25 %	148550956
2134	NC_009508	CCGC	2	8	121136	121143	0 %	0 %	25 %	75 %	148550956
2135	NC_009508	TCGTC	2	10	121223	121232	0 %	40 %	20 %	40 %	148550956
2136	NC_009508	CAC	2	6	121242	121247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550956
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2138	NC_009508	CGA	2	6	121304	121309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550956
2139	NC_009508	CG	3	6	121316	121321	0 %	0 %	50 %	50 %	148550956
2140	NC_009508	CCG	2	6	121325	121330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550956
2141	NC_009508	CG	3	6	121337	121342	0 %	0 %	50 %	50 %	148550956
2142	NC_009508	TCC	2	6	121348	121353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148550956
2143	NC_009508	TAT	2	6	121371	121376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148550956
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2145	NC_009508	CAC	2	6	121415	121420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550957
2146	NC_009508	CG	3	6	121430	121435	0 %	0 %	50 %	50 %	148550957
2147	NC_009508	GCT	2	6	121532	121537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550957
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2150	NC_009508	GAC	2	6	121649	121654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550957
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2152	NC_009508	GCT	3	9	121699	121707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550957
2153	NC_009508	GCC	3	9	121752	121760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550957
2154	NC_009508	CT	4	8	121770	121777	0 %	50 %	0 %	50 %	148550957
2155	NC_009508	GAA	2	6	121799	121804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148550957
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2160	NC_009508	ACC	2	6	122451	122456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550958
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2164	NC_009508	C	6	6	122572	122577	0 %	0 %	0 %	100 %	148550958
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2172	NC_009508	ACCGA	2	10	123040	123049	40 %	0 %	20 %	40 %	148550958
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2224	NC_009508	ATG	2	6	125735	125740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550960
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2231	NC_009508	GAG	2	6	126197	126202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148550960
2232	NC_009508	GC	3	6	126233	126238	0 %	0 %	50 %	50 %	148550960
2233	NC_009508	CTCGTC	2	12	126242	126253	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	148550960
2234	NC_009508	CCT	2	6	126265	126270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148550960
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2238	NC_009508	CGA	2	6	126462	126467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550960
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2240	NC_009508	CGG	2	6	126559	126564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550960
2241	NC_009508	CAT	3	9	126593	126601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550960
2242	NC_009508	GTC	2	6	126632	126637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550960
2243	NC_009508	CG	3	6	126663	126668	0 %	0 %	50 %	50 %	148550960
2244	NC_009508	GGC	2	6	126707	126712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550960
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2360	NC_009508	CGG	2	6	136158	136163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550970
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2484	NC_009508	GCG	2	6	142782	142787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550977
2485	NC_009508	CTG	2	6	142792	142797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550977
2486	NC_009508	CGCC	2	8	142832	142839	0 %	0 %	25 %	75 %	148550977
2487	NC_009508	AT	3	6	142949	142954	50 %	50 %	0 %	0 %	148550977
2488	NC_009508	CTG	2	6	143245	143250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550978
2489	NC_009508	GGGC	2	8	143307	143314	0 %	0 %	75 %	25 %	148550978
2490	NC_009508	CTA	2	6	143322	143327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550978
2491	NC_009508	CGCC	2	8	143531	143538	0 %	0 %	25 %	75 %	148550978
2492	NC_009508	TGC	2	6	143543	143548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550978
2493	NC_009508	CCG	2	6	143558	143563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550978
2494	NC_009508	CGG	2	6	143579	143584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550978
2495	NC_009508	GGCGG	2	10	143615	143624	0 %	0 %	80 %	20 %	148550978
2496	NC_009508	TCA	2	6	143686	143691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550978
2497	NC_009508	AAC	2	6	143694	143699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148550978
2498	NC_009508	CAC	2	6	143861	143866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550979
2499	NC_009508	ATGGCG	2	12	143887	143898	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148550979
2500	NC_009508	CGT	2	6	143993	143998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550979

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