MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sphingomonas wittichii RW1 plasmid pSWIT02

Total Repeats: 4061

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009508	GCG	2	6	55955	55960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550904
1002	NC_009508	CTT	2	6	56055	56060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148550904
1003	NC_009508	ATCGA	2	10	56097	56106	40 %	20 %	20 %	20 %	148550904
1004	NC_009508	CGC	2	6	56138	56143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550904
1005	NC_009508	CGC	2	6	56192	56197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550904
1006	NC_009508	CGAG	2	8	56260	56267	25 %	0 %	50 %	25 %	148550904
1007	NC_009508	CGA	2	6	56284	56289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550904
1008	NC_009508	CG	3	6	56309	56314	0 %	0 %	50 %	50 %	148550904
1009	NC_009508	GAT	2	6	56331	56336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550904
1010	NC_009508	TGG	2	6	56484	56489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550904
1011	NC_009508	GAGC	2	8	56507	56514	25 %	0 %	50 %	25 %	148550904
1012	NC_009508	TAT	2	6	56535	56540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148550904
1013	NC_009508	GA	3	6	56593	56598	50 %	0 %	50 %	0 %	148550904
1014	NC_009508	GAGCGA	2	12	56647	56658	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	148550904
1015	NC_009508	GCCA	2	8	57547	57554	25 %	0 %	25 %	50 %	148550905
1016	NC_009508	CGTC	2	8	57556	57563	0 %	25 %	25 %	50 %	148550905
1017	NC_009508	TCG	2	6	57669	57674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550905
1018	NC_009508	GC	3	6	57731	57736	0 %	0 %	50 %	50 %	148550905
1019	NC_009508	TGACC	2	10	57739	57748	20 %	20 %	20 %	40 %	148550905
1020	NC_009508	GC	3	6	57757	57762	0 %	0 %	50 %	50 %	148550905
1021	NC_009508	TAT	2	6	57791	57796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148550905
1022	NC_009508	GCTG	2	8	57843	57850	0 %	25 %	50 %	25 %	148550905
1023	NC_009508	GCA	2	6	57893	57898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550905
1024	NC_009508	CTC	2	6	57950	57955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148550905
1025	NC_009508	GGA	2	6	57961	57966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148550905
1026	NC_009508	AGCG	2	8	57969	57976	25 %	0 %	50 %	25 %	148550905
1027	NC_009508	GT	3	6	57978	57983	0 %	50 %	50 %	0 %	148550905
1028	NC_009508	AGG	2	6	57987	57992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148550905
1029	NC_009508	AGC	2	6	58008	58013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550905
1030	NC_009508	AGGC	2	8	58024	58031	25 %	0 %	50 %	25 %	148550905
1031	NC_009508	AAG	2	6	58085	58090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148550905
1032	NC_009508	TCG	2	6	58130	58135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550905
1033	NC_009508	GCT	2	6	58195	58200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550905
1034	NC_009508	GTG	2	6	58209	58214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550905
1035	NC_009508	ATC	2	6	58257	58262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550905
1036	NC_009508	CGT	2	6	58355	58360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550906
1037	NC_009508	GCC	2	6	58405	58410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550906
1038	NC_009508	GTC	2	6	58475	58480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550906
1039	NC_009508	ATGT	2	8	58528	58535	25 %	50 %	25 %	0 %	148550906
1040	NC_009508	CAG	2	6	58566	58571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550906
1041	NC_009508	AGC	2	6	58594	58599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550906
1042	NC_009508	AAC	2	6	58653	58658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148550906
1043	NC_009508	GCCGCT	2	12	58723	58734	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	148550906
1044	NC_009508	GAT	2	6	58742	58747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550906
1045	NC_009508	GAT	2	6	58815	58820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550906
1046	NC_009508	ATCG	2	8	58900	58907	25 %	25 %	25 %	25 %	148550906
1047	NC_009508	CAG	2	6	58908	58913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550906
1048	NC_009508	GGC	2	6	58965	58970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550906
1049	NC_009508	AAT	2	6	59051	59056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148550906
1050	NC_009508	GCC	2	6	59075	59080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550906
1051	NC_009508	ATC	2	6	59106	59111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550906
1052	NC_009508	TCG	2	6	59179	59184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550906
1053	NC_009508	GCG	2	6	59209	59214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550906
1054	NC_009508	CGGCG	2	10	59247	59256	0 %	0 %	60 %	40 %	148550906
1055	NC_009508	GGC	2	6	59285	59290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550906
1056	NC_009508	CGAT	2	8	59291	59298	25 %	25 %	25 %	25 %	148550906
1057	NC_009508	GCC	3	9	59299	59307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550906
1058	NC_009508	CTCCC	2	10	60015	60024	0 %	20 %	0 %	80 %	148550907
1059	NC_009508	CGC	2	6	60060	60065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550907
1060	NC_009508	TCG	2	6	60081	60086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550907
1061	NC_009508	CG	3	6	60085	60090	0 %	0 %	50 %	50 %	148550907
1062	NC_009508	TTC	2	6	60093	60098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148550907
1063	NC_009508	GGA	2	6	60148	60153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148550907
1064	NC_009508	CGC	2	6	60166	60171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550907
1065	NC_009508	CGC	2	6	60313	60318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550907
1066	NC_009508	TGG	2	6	60333	60338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550907
1067	NC_009508	GGA	2	6	60360	60365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148550907
1068	NC_009508	CG	3	6	60403	60408	0 %	0 %	50 %	50 %	148550907
1069	NC_009508	CCGTC	2	10	60409	60418	0 %	20 %	20 %	60 %	148550907
1070	NC_009508	CGCC	2	8	60511	60518	0 %	0 %	25 %	75 %	148550907
1071	NC_009508	CGG	2	6	60644	60649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550908
1072	NC_009508	GGCA	2	8	60666	60673	25 %	0 %	50 %	25 %	148550908
1073	NC_009508	CCCCT	2	10	60689	60698	0 %	20 %	0 %	80 %	148550908
1074	NC_009508	C	6	6	60727	60732	0 %	0 %	0 %	100 %	148550908
1075	NC_009508	CTTC	2	8	60743	60750	0 %	50 %	0 %	50 %	148550908
1076	NC_009508	CGG	2	6	60755	60760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550908
1077	NC_009508	CG	3	6	60833	60838	0 %	0 %	50 %	50 %	148550908
1078	NC_009508	GCT	2	6	60842	60847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550908
1079	NC_009508	CGATC	2	10	60851	60860	20 %	20 %	20 %	40 %	148550908
1080	NC_009508	CGTG	2	8	60941	60948	0 %	25 %	50 %	25 %	148550908
1081	NC_009508	TCC	2	6	60970	60975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148550908
1082	NC_009508	TTGCGA	2	12	61041	61052	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	148550908
1083	NC_009508	GC	3	6	61093	61098	0 %	0 %	50 %	50 %	148550908
1084	NC_009508	GATGGT	2	12	61202	61213	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	148550908
1085	NC_009508	CCA	2	6	61233	61238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550908
1086	NC_009508	GAT	2	6	61254	61259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550908
1087	NC_009508	ATC	2	6	61278	61283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550908
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1089	NC_009508	CTT	2	6	61317	61322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148550908
1090	NC_009508	GGC	2	6	61403	61408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550908
1091	NC_009508	ATG	2	6	61492	61497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550908
1092	NC_009508	CGGC	2	8	61502	61509	0 %	0 %	50 %	50 %	148550908
1093	NC_009508	TCG	3	9	61531	61539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550908
1094	NC_009508	CTG	2	6	61857	61862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550909
1095	NC_009508	GCC	2	6	62039	62044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550909
1096	NC_009508	CAT	2	6	62057	62062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550909
1097	NC_009508	CCCCG	2	10	62142	62151	0 %	0 %	20 %	80 %	148550909
1098	NC_009508	GCT	2	6	62164	62169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550909
1099	NC_009508	CGA	2	6	62218	62223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550909
1100	NC_009508	GGC	2	6	62229	62234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550909
1101	NC_009508	GCA	2	6	62263	62268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550909
1102	NC_009508	GTC	2	6	62324	62329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550909
1103	NC_009508	ACC	2	6	62331	62336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550909
1104	NC_009508	ATCG	2	8	62339	62346	25 %	25 %	25 %	25 %	148550909
1105	NC_009508	TTC	2	6	62382	62387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148550909
1106	NC_009508	GT	3	6	62462	62467	0 %	50 %	50 %	0 %	148550909
1107	NC_009508	GAT	2	6	62474	62479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550909
1108	NC_009508	AGC	2	6	62493	62498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550909
1109	NC_009508	TCC	2	6	62532	62537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148550909
1110	NC_009508	CAT	2	6	62567	62572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550909
1111	NC_009508	TGC	2	6	62634	62639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550909
1112	NC_009508	ACC	2	6	62672	62677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550909
1113	NC_009508	GAT	2	6	62696	62701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550909
1114	NC_009508	TCGG	2	8	62712	62719	0 %	25 %	50 %	25 %	148550909
1115	NC_009508	TTC	2	6	62765	62770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148550909
1116	NC_009508	CGTC	2	8	62823	62830	0 %	25 %	25 %	50 %	148550909
1117	NC_009508	CGA	2	6	62866	62871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550909
1118	NC_009508	TGC	2	6	62911	62916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550909
1119	NC_009508	CGG	2	6	63645	63650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550910
1120	NC_009508	AGA	2	6	63651	63656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148550910
1121	NC_009508	GCGT	2	8	63659	63666	0 %	25 %	50 %	25 %	148550910
1122	NC_009508	GAG	2	6	63727	63732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148550910
1123	NC_009508	TCC	2	6	63746	63751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148550910
1124	NC_009508	GAC	2	6	63796	63801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550910
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1126	NC_009508	CG	3	6	63971	63976	0 %	0 %	50 %	50 %	148550910
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