MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sphingomonas wittichii RW1 plasmid pSWIT02

Total Repeats: 4061

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009508	GAT	2	6	27096	27101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550872
502	NC_009508	AGC	2	6	27154	27159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550873
503	NC_009508	ACT	2	6	27166	27171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550873
504	NC_009508	AGT	2	6	27190	27195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550873
505	NC_009508	CGG	2	6	27226	27231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550873
506	NC_009508	TGC	2	6	27260	27265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550873
507	NC_009508	TGCG	2	8	27289	27296	0 %	25 %	50 %	25 %	148550873
508	NC_009508	CG	3	6	27295	27300	0 %	0 %	50 %	50 %	148550873
509	NC_009508	GGC	2	6	27344	27349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550873
510	NC_009508	GCCT	2	8	27396	27403	0 %	25 %	25 %	50 %	148550873
511	NC_009508	GCA	2	6	27454	27459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550873
512	NC_009508	CGATGC	2	12	27525	27536	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148550873
513	NC_009508	GCC	2	6	27578	27583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550874
514	NC_009508	GCG	2	6	27607	27612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550874
515	NC_009508	TGA	2	6	27649	27654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550874
516	NC_009508	GCA	2	6	27656	27661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550874
517	NC_009508	GCT	2	6	27731	27736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550874
518	NC_009508	GGT	2	6	27821	27826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550874
519	NC_009508	CGG	2	6	27832	27837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550874
520	NC_009508	GGC	3	9	27871	27879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550874
521	NC_009508	GCG	2	6	29444	29449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550875
522	NC_009508	CCT	2	6	29483	29488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148550875
523	NC_009508	GGC	2	6	29532	29537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550875
524	NC_009508	CGG	2	6	29570	29575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550875
525	NC_009508	GC	3	6	29622	29627	0 %	0 %	50 %	50 %	148550875
526	NC_009508	GGC	2	6	29676	29681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550875
527	NC_009508	ACC	2	6	29696	29701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550875
528	NC_009508	GAT	2	6	29718	29723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550875
529	NC_009508	GGC	2	6	29730	29735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550875
530	NC_009508	GAT	2	6	29856	29861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550875
531	NC_009508	GGA	2	6	29879	29884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148550875
532	NC_009508	GCT	2	6	29885	29890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550875
533	NC_009508	GAC	2	6	29891	29896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550875
534	NC_009508	GCT	2	6	30034	30039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550875
535	NC_009508	GCAG	2	8	30087	30094	25 %	0 %	50 %	25 %	148550875
536	NC_009508	GA	3	6	30111	30116	50 %	0 %	50 %	0 %	148550875
537	NC_009508	TGC	2	6	30133	30138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550875
538	NC_009508	CCA	2	6	30149	30154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550875
539	NC_009508	TTC	2	6	30165	30170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148550875
540	NC_009508	GGCC	2	8	30349	30356	0 %	0 %	50 %	50 %	148550875
541	NC_009508	CG	3	6	30417	30422	0 %	0 %	50 %	50 %	148550875
542	NC_009508	CCA	2	6	30424	30429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550875
543	NC_009508	GCC	2	6	30444	30449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550875
544	NC_009508	ACTC	2	8	30497	30504	25 %	25 %	0 %	50 %	148550875
545	NC_009508	TGA	2	6	30523	30528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550875
546	NC_009508	AGC	2	6	30535	30540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550875
547	NC_009508	CATAGA	2	12	30626	30637	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	148550875
548	NC_009508	TTC	2	6	30655	30660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148550875
549	NC_009508	GGCG	2	8	30776	30783	0 %	0 %	75 %	25 %	148550875
550	NC_009508	CCT	2	6	30824	30829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148550875
551	NC_009508	GCCTT	2	10	30914	30923	0 %	40 %	20 %	40 %	148550875
552	NC_009508	GC	4	8	30925	30932	0 %	0 %	50 %	50 %	148550875
553	NC_009508	TGC	2	6	30980	30985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550875
554	NC_009508	CAA	3	9	30996	31004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148550875
555	NC_009508	GATC	2	8	31043	31050	25 %	25 %	25 %	25 %	148550875
556	NC_009508	CG	3	6	31052	31057	0 %	0 %	50 %	50 %	148550875
557	NC_009508	CA	3	6	31070	31075	50 %	0 %	0 %	50 %	148550875
558	NC_009508	GGT	2	6	31085	31090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550875
559	NC_009508	AAGCA	2	10	31129	31138	60 %	0 %	20 %	20 %	148550875
560	NC_009508	TCG	2	6	31228	31233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550875
561	NC_009508	GTT	2	6	31308	31313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148550875
562	NC_009508	AGGC	2	8	31925	31932	25 %	0 %	50 %	25 %	148550876
563	NC_009508	GCC	2	6	31945	31950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550876
564	NC_009508	CGCT	2	8	32046	32053	0 %	25 %	25 %	50 %	148550876
565	NC_009508	GCC	2	6	32107	32112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550876
566	NC_009508	CAA	2	6	32555	32560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148550877
567	NC_009508	GCT	2	6	32561	32566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550877
568	NC_009508	ATTG	2	8	32762	32769	25 %	50 %	25 %	0 %	148550877
569	NC_009508	CGC	2	6	32807	32812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550877
570	NC_009508	CTTG	2	8	32833	32840	0 %	50 %	25 %	25 %	148550877
571	NC_009508	AAG	2	6	32903	32908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148550877
572	NC_009508	GCG	2	6	33002	33007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550877
573	NC_009508	CG	3	6	33194	33199	0 %	0 %	50 %	50 %	148550877
574	NC_009508	GCA	2	6	33259	33264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550877
575	NC_009508	GCC	3	9	33282	33290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550877
576	NC_009508	GAC	2	6	33291	33296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550877
577	NC_009508	CGAT	2	8	33316	33323	25 %	25 %	25 %	25 %	148550877
578	NC_009508	GCTCC	2	10	33380	33389	0 %	20 %	20 %	60 %	148550877
579	NC_009508	CAC	2	6	33413	33418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550877
580	NC_009508	G	6	6	33550	33555	0 %	0 %	100 %	0 %	148550877
581	NC_009508	TC	3	6	33581	33586	0 %	50 %	0 %	50 %	148550877
582	NC_009508	CGAC	2	8	33640	33647	25 %	0 %	25 %	50 %	148550877
583	NC_009508	AGC	2	6	33839	33844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550878
584	NC_009508	TCA	2	6	33869	33874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550878
585	NC_009508	GAT	2	6	33904	33909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550878
586	NC_009508	CGATC	2	10	33915	33924	20 %	20 %	20 %	40 %	148550878
587	NC_009508	CTG	2	6	33928	33933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550878
588	NC_009508	TCG	2	6	33939	33944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550878
589	NC_009508	TAA	2	6	33962	33967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148550878
590	NC_009508	GCCC	2	8	33996	34003	0 %	0 %	25 %	75 %	148550878
591	NC_009508	GGCC	2	8	34036	34043	0 %	0 %	50 %	50 %	148550878
592	NC_009508	CAGG	2	8	34074	34081	25 %	0 %	50 %	25 %	148550878
593	NC_009508	TGC	2	6	34094	34099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550878
594	NC_009508	GCAA	2	8	34195	34202	50 %	0 %	25 %	25 %	148550878
595	NC_009508	GCGACG	2	12	34293	34304	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	148550878
596	NC_009508	TCA	2	6	34308	34313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550878
597	NC_009508	AAG	2	6	34332	34337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148550878
598	NC_009508	GCC	2	6	34430	34435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550878
599	NC_009508	CGC	3	9	34458	34466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550878
600	NC_009508	TTG	2	6	34475	34480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148550878
601	NC_009508	GCGA	2	8	34497	34504	25 %	0 %	50 %	25 %	148550878
602	NC_009508	CGT	2	6	34551	34556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550878
603	NC_009508	ACG	2	6	34583	34588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550878
604	NC_009508	AGC	2	6	34605	34610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550878
605	NC_009508	CCG	2	6	34679	34684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550878
606	NC_009508	GAT	2	6	34906	34911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550879
607	NC_009508	CGG	2	6	34938	34943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550879
608	NC_009508	CAA	2	6	34968	34973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148550879
609	NC_009508	CTT	2	6	34975	34980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148550879
610	NC_009508	TGA	2	6	35052	35057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550879
611	NC_009508	GGT	2	6	35079	35084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550879
612	NC_009508	GAC	2	6	35098	35103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550879
613	NC_009508	GCG	2	6	35125	35130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550879
614	NC_009508	GTC	2	6	35152	35157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550879
615	NC_009508	CAT	2	6	35221	35226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550879
616	NC_009508	AGC	2	6	35267	35272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550879
617	NC_009508	CTT	2	6	35293	35298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148550879
618	NC_009508	GCG	3	9	35327	35335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550879
619	NC_009508	GGT	2	6	35398	35403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550879
620	NC_009508	G	7	7	35416	35422	0 %	0 %	100 %	0 %	148550879
621	NC_009508	GCC	2	6	35467	35472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550879
622	NC_009508	CCG	2	6	35519	35524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550879
623	NC_009508	TCG	2	6	35541	35546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550879
624	NC_009508	CGA	2	6	35579	35584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550880
625	NC_009508	GCG	2	6	35613	35618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550880
626	NC_009508	CAGCGT	2	12	35715	35726	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148550880
627	NC_009508	ACGG	2	8	35739	35746	25 %	0 %	50 %	25 %	148550880
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