MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9 chromosome

Total Repeats: 1325

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009487	GTTGAA	2	12	3246	3257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148266449
2	NC_009487	GTTATC	2	12	7352	7363	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	148266453
3	NC_009487	CAGATA	2	12	8261	8272	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	148266453
4	NC_009487	CAAGCT	2	12	8320	8331	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	148266453
5	NC_009487	GTAATG	2	12	9308	9319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148266453
6	NC_009487	AGATGA	2	12	9711	9722	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	148266453
7	NC_009487	ACAATT	2	12	11314	11325	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148266455
8	NC_009487	TAGCAT	2	12	11409	11420	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	148266455
9	NC_009487	GCTTTA	2	12	17505	17516	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	148266460
10	NC_009487	TTTGAA	2	12	18326	18337	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	148266460
11	NC_009487	TTGGTG	2	12	19170	19181	0 %	50 %	50 %	0 %	148266461
12	NC_009487	TAAAGG	2	12	20373	20384	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	148266462
13	NC_009487	TTGAAG	2	12	20570	20581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148266462
14	NC_009487	TGATTG	2	12	21774	21785	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	148266463
15	NC_009487	TGAAAT	2	12	22105	22116	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	148266463
16	NC_009487	AAGGAA	2	12	22543	22554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148266464
17	NC_009487	TGAATT	2	12	25471	25482	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	148266465
18	NC_009487	ATTTCA	2	12	27955	27966	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	148266467
19	NC_009487	ATCAGC	2	12	31270	31281	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	148266470
20	NC_009487	AAAAGA	2	12	33911	33922	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	148266471
21	NC_009487	ACATCT	2	12	35565	35576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148266472
22	NC_009487	GTTTAA	2	12	36708	36719	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	148266473
23	NC_009487	AATGAA	2	12	38638	38649	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	148266475
24	NC_009487	ACAACT	2	12	40703	40714	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	148266476
25	NC_009487	TTTTCT	2	12	51524	51535	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	148266486
26	NC_009487	AATTAA	2	12	51714	51725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148266486
27	NC_009487	GGCATG	2	12	52345	52356	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148266487
28	NC_009487	TAAAAA	2	12	53507	53518	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	148266487
29	NC_009487	CATTAA	2	12	54143	54154	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148266488
30	NC_009487	ATAAGA	2	12	66249	66260	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	148266501
31	NC_009487	AAATAA	2	12	67914	67925	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	148266503
32	NC_009487	TTTAAT	2	12	78981	78992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148266509
33	NC_009487	ACAAAT	2	12	81396	81407	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	148266512
34	NC_009487	AATTAA	2	12	81487	81498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148266512
35	NC_009487	TTAATG	2	12	84432	84443	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	148266513
36	NC_009487	AAGTCA	2	12	85637	85648	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	148266515
37	NC_009487	AAAAAG	2	12	85751	85762	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	148266515
38	NC_009487	GAAAAA	2	12	86064	86075	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	148266515
39	NC_009487	AATTAT	2	12	88303	88314	50 %	50 %	0 %	0 %	148266517
40	NC_009487	ACCCTT	2	12	90142	90153	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	148266519
41	NC_009487	TTTAGC	2	12	92051	92062	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	148266521
42	NC_009487	AAATAA	2	12	92102	92113	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	148266521
43	NC_009487	GCTAAA	2	12	97062	97073	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	148266523
44	NC_009487	TAAAGA	2	12	101210	101221	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	148266528
45	NC_009487	AACCAC	2	12	105082	105093	50 %	0 %	0 %	50 %	148266530
46	NC_009487	AACCGA	2	12	108393	108404	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	148266532
47	NC_009487	ATAGAT	2	12	113293	113304	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	148266535
48	NC_009487	TATCAT	2	12	114060	114071	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	148266536
49	NC_009487	TTTATT	2	12	114468	114479	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	148266537
50	NC_009487	TATTTG	2	12	114554	114565	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	148266537
51	NC_009487	TAAATA	2	12	115987	115998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148266537
52	NC_009487	TTTTTC	2	12	117831	117842	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	148266538
53	NC_009487	TAAGCC	2	12	119692	119703	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	148266540
54	NC_009487	ATCGCA	2	12	120907	120918	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	148266541
55	NC_009487	TTTGAA	2	12	121938	121949	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	148266542
56	NC_009487	CAATGG	2	12	130896	130907	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148266548
57	NC_009487	TGAAGA	2	12	131730	131741	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	148266549
58	NC_009487	TTTCAT	2	12	132411	132422	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	148266550
59	NC_009487	TGTATA	2	12	136631	136642	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	148266554
60	NC_009487	TCGAAA	2	12	138132	138143	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	148266556
61	NC_009487	CTATTG	2	12	140718	140729	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	148266558
62	NC_009487	CATATG	2	12	141921	141932	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	148266559
63	NC_009487	GGTATG	2	12	144964	144975	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	148266562
64	NC_009487	CAGATT	2	12	147562	147573	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	148266564
65	NC_009487	AGATAT	2	12	154940	154951	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	148266571
66	NC_009487	ATGCCT	2	12	156079	156090	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148266572
67	NC_009487	TGAAAG	2	12	156719	156730	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	148266572
68	NC_009487	GATATG	2	12	164219	164230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148266578
69	NC_009487	ATTTGA	2	12	168125	168136	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	148266581
70	NC_009487	GATTTT	2	12	172636	172647	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	148266586
71	NC_009487	ACAAAG	2	12	177156	177167	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	148266590
72	NC_009487	TGTAAT	2	12	178180	178191	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	148266591
73	NC_009487	AAAGAT	2	12	179169	179180	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	148266593
74	NC_009487	CAATAT	2	12	181641	181652	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148266594
75	NC_009487	TTGGTA	2	12	185667	185678	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	148266599
76	NC_009487	GCGATT	2	12	185687	185698	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	148266599
77	NC_009487	AAATTT	2	12	185785	185796	50 %	50 %	0 %	0 %	148266599
78	NC_009487	ACCTGC	2	12	188687	188698	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148266602
79	NC_009487	AAGATA	2	12	188833	188844	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	148266602
80	NC_009487	CGTTAA	2	12	191767	191778	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	148266604
81	NC_009487	CTATTA	2	12	193618	193629	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	148266604
82	NC_009487	TATGAT	2	12	195152	195163	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	148266604
83	NC_009487	TTGAAA	2	12	195604	195615	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	148266604
84	NC_009487	AACATT	2	12	198044	198055	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148266604
85	NC_009487	AGCAAC	2	12	201533	201544	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	148266608
86	NC_009487	TGTTTG	2	12	201581	201592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148266608
87	NC_009487	CACCTT	2	12	203585	203596	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	148266610
88	NC_009487	ACCTTT	2	12	204090	204101	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	148266610
89	NC_009487	GTAAAT	2	12	207829	207840	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	148266613
90	NC_009487	ATTTTA	2	12	209424	209435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148266614
91	NC_009487	TATCTT	2	12	214038	214049	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	148266617
92	NC_009487	ATTTGG	2	12	215051	215062	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	148266618
93	NC_009487	GAGTTT	2	12	218394	218405	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	148266620
94	NC_009487	TATACA	2	12	222394	222405	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148266624
95	NC_009487	TTATTT	2	12	224426	224437	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	148266626
96	NC_009487	ATTTAT	2	12	225005	225016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148266626
97	NC_009487	CCCTGA	2	12	227763	227774	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148266630
98	NC_009487	TCCTGA	2	12	228582	228593	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148266630
99	NC_009487	TCAATT	2	12	230733	230744	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	148266632
100	NC_009487	AATATG	2	12	232033	232044	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	148266633
101	NC_009487	AAAAAT	2	12	235540	235551	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	148266635
102	NC_009487	AGGACA	2	12	237400	237411	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	148266637
103	NC_009487	ACATTT	2	12	237736	237747	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	148266637
104	NC_009487	TTCTTG	2	12	242665	242676	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	148266641
105	NC_009487	GGACGT	2	12	253167	253178	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148266650
106	NC_009487	TGGTAT	2	12	282345	282356	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	148266671
107	NC_009487	TATAGA	2	12	285699	285710	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	148266675
108	NC_009487	ACGATG	2	12	292328	292339	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148266680
109	NC_009487	AGAATC	2	12	299886	299897	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	148266685
110	NC_009487	AAGTAA	2	12	303309	303320	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	148266690
111	NC_009487	ATAAAG	2	12	304290	304301	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	148266691
112	NC_009487	GACATT	2	12	305871	305882	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	148266692
113	NC_009487	GATTTC	2	12	307690	307701	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	148266694
114	NC_009487	TTCATA	2	12	308260	308271	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	148266695
115	NC_009487	GATTAT	2	12	312667	312678	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	148266699
116	NC_009487	ATGGTG	2	12	312800	312811	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	148266699
117	NC_009487	CAGCAA	2	12	313187	313198	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	148266699
118	NC_009487	TCTTCA	2	12	318766	318777	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	148266704
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234	NC_009487	CAGGTA	2	12	598579	598590	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148266978
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