MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. RCC307 chromosome

Total Repeats: 48987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
48501	NC_009482	GC	3	6	2202327	2202332	0 %	0 %	50 %	50 %	148243613
48502	NC_009482	GAT	2	6	2202447	2202452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243613
48503	NC_009482	CTGAG	2	10	2202466	2202475	20 %	20 %	40 %	20 %	148243613
48504	NC_009482	TGC	2	6	2202535	2202540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243614
48505	NC_009482	CAG	2	6	2202543	2202548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243614
48506	NC_009482	CCA	2	6	2202551	2202556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243614
48507	NC_009482	CGC	2	6	2202636	2202641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243614
48508	NC_009482	GCG	2	6	2202662	2202667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243614
48509	NC_009482	CGAT	2	8	2202669	2202676	25 %	25 %	25 %	25 %	148243614
48510	NC_009482	TGC	2	6	2202682	2202687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243614
48511	NC_009482	TGC	3	9	2202730	2202738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243614
48512	NC_009482	GCA	2	6	2202782	2202787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243614
48513	NC_009482	CTG	2	6	2202804	2202809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243614
48514	NC_009482	CAA	2	6	2202824	2202829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243614
48515	NC_009482	AGC	2	6	2202842	2202847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243614
48516	NC_009482	CAATG	2	10	2202913	2202922	40 %	20 %	20 %	20 %	148243614
48517	NC_009482	CAG	2	6	2202927	2202932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243614
48518	NC_009482	GCA	2	6	2203081	2203086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243614
48519	NC_009482	ACC	2	6	2203169	2203174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243614
48520	NC_009482	CGG	2	6	2203230	2203235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243614
48521	NC_009482	CTGG	2	8	2203238	2203245	0 %	25 %	50 %	25 %	148243614
48522	NC_009482	TGC	2	6	2203345	2203350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243614
48523	NC_009482	CTG	2	6	2203422	2203427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243614
48524	NC_009482	GTG	2	6	2203428	2203433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243614
48525	NC_009482	GCA	2	6	2203485	2203490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243614
48526	NC_009482	GC	3	6	2203535	2203540	0 %	0 %	50 %	50 %	148243615
48527	NC_009482	TCA	2	6	2203560	2203565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243615
48528	NC_009482	CGG	2	6	2203609	2203614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243615
48529	NC_009482	GGC	2	6	2203667	2203672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243615
48530	NC_009482	CCT	2	6	2203692	2203697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243615
48531	NC_009482	CAA	2	6	2203727	2203732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243615
48532	NC_009482	GTG	2	6	2203880	2203885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243615
48533	NC_009482	ACA	2	6	2203923	2203928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243615
48534	NC_009482	CAA	2	6	2203955	2203960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243615
48535	NC_009482	GCG	2	6	2204013	2204018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243615
48536	NC_009482	GTT	2	6	2204033	2204038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148243615
48537	NC_009482	ACC	2	6	2204060	2204065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243615
48538	NC_009482	CCTG	2	8	2204099	2204106	0 %	25 %	25 %	50 %	148243615
48539	NC_009482	CGC	2	6	2204179	2204184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243615
48540	NC_009482	GGC	2	6	2204204	2204209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243615
48541	NC_009482	AGC	2	6	2204251	2204256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243615
48542	NC_009482	GAAAGT	2	12	2204300	2204311	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	148243615
48543	NC_009482	GCA	2	6	2204352	2204357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243615
48544	NC_009482	AAG	2	6	2204415	2204420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148243615
48545	NC_009482	GGA	2	6	2204521	2204526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148243615
48546	NC_009482	GTG	2	6	2204528	2204533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243615
48547	NC_009482	TCA	2	6	2204669	2204674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243616
48548	NC_009482	CTG	2	6	2204676	2204681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243616
48549	NC_009482	GCT	2	6	2204683	2204688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243616
48550	NC_009482	TGC	2	6	2204706	2204711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243616
48551	NC_009482	CGG	3	9	2204715	2204723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243616
48552	NC_009482	GCA	2	6	2204726	2204731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243616
48553	NC_009482	CAG	2	6	2204754	2204759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243616
48554	NC_009482	CTG	2	6	2204779	2204784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243616
48555	NC_009482	GTC	2	6	2204818	2204823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243616
48556	NC_009482	CCT	2	6	2204835	2204840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243616
48557	NC_009482	TCA	2	6	2204876	2204881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243616
48558	NC_009482	TCT	2	6	2205015	2205020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148243616
48559	NC_009482	G	7	7	2205166	2205172	0 %	0 %	100 %	0 %	148243616
48560	NC_009482	TTG	2	6	2205203	2205208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148243616
48561	NC_009482	TCT	2	6	2205291	2205296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148243616
48562	NC_009482	TGG	2	6	2205297	2205302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243616
48563	NC_009482	ATC	2	6	2205323	2205328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243616
48564	NC_009482	TCA	2	6	2205333	2205338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243616
48565	NC_009482	CCG	2	6	2205341	2205346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243616
48566	NC_009482	CAG	2	6	2205385	2205390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243616
48567	NC_009482	CCAG	2	8	2205407	2205414	25 %	0 %	25 %	50 %	148243616
48568	NC_009482	GGC	2	6	2205430	2205435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243616
48569	NC_009482	CCA	2	6	2205444	2205449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243616
48570	NC_009482	TTGG	2	8	2205469	2205476	0 %	50 %	50 %	0 %	148243616
48571	NC_009482	ACC	2	6	2205532	2205537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243616
48572	NC_009482	TCG	2	6	2205551	2205556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243616
48573	NC_009482	GCA	2	6	2205629	2205634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243616
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48575	NC_009482	TGA	2	6	2205699	2205704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243616
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48578	NC_009482	GGTG	2	8	2205879	2205886	0 %	25 %	75 %	0 %	148243616
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48580	NC_009482	GCC	3	9	2205952	2205960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243616
48581	NC_009482	TGA	2	6	2206035	2206040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243616
48582	NC_009482	GCA	2	6	2206044	2206049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243616
48583	NC_009482	TGG	2	6	2206080	2206085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243616
48584	NC_009482	TCA	2	6	2206304	2206309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243616
48585	NC_009482	CCA	2	6	2206389	2206394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243616
48586	NC_009482	CCA	2	6	2206419	2206424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243616
48587	NC_009482	GTG	2	6	2206433	2206438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243616
48588	NC_009482	GCC	2	6	2206474	2206479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243616
48589	NC_009482	TGG	2	6	2206503	2206508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243616
48590	NC_009482	CGA	2	6	2206524	2206529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243616
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48599	NC_009482	TGC	2	6	2207061	2207066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243617
48600	NC_009482	GCT	2	6	2207070	2207075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243617
48601	NC_009482	GGT	2	6	2207095	2207100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243617
48602	NC_009482	GCA	2	6	2207118	2207123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243617
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48604	NC_009482	CAG	2	6	2207176	2207181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243617
48605	NC_009482	GCA	2	6	2207214	2207219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243617
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48607	NC_009482	CTG	2	6	2207297	2207302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243617
48608	NC_009482	CGT	2	6	2207314	2207319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243617
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48610	NC_009482	AC	3	6	2207334	2207339	50 %	0 %	0 %	50 %	148243617
48611	NC_009482	GCT	2	6	2207350	2207355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243617
48612	NC_009482	GCC	2	6	2207366	2207371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243617
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48614	NC_009482	TGC	2	6	2207422	2207427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243617
48615	NC_009482	GATGC	2	10	2207468	2207477	20 %	20 %	40 %	20 %	148243617
48616	NC_009482	AGC	2	6	2207482	2207487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243617
48617	NC_009482	CCTA	2	8	2207563	2207570	25 %	25 %	0 %	50 %	148243618
48618	NC_009482	TGC	2	6	2207662	2207667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243618
48619	NC_009482	TGG	3	9	2207719	2207727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243618
48620	NC_009482	CTA	2	6	2207747	2207752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243618
48621	NC_009482	TGC	2	6	2207767	2207772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243618
48622	NC_009482	TGG	2	6	2207797	2207802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243618
48623	NC_009482	TGGCCT	2	12	2207806	2207817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243618
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48626	NC_009482	TCCA	2	8	2207913	2207920	25 %	25 %	0 %	50 %	148243618
48627	NC_009482	AAG	2	6	2207935	2207940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148243618
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48632	NC_009482	TGG	2	6	2208161	2208166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243619
48633	NC_009482	GGT	2	6	2208175	2208180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243619
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48639	NC_009482	CG	3	6	2208634	2208639	0 %	0 %	50 %	50 %	148243620
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48642	NC_009482	GAG	2	6	2208887	2208892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148243620
48643	NC_009482	GCC	2	6	2208898	2208903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243620
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48715	NC_009482	GGAA	2	8	2211846	2211853	50 %	0 %	50 %	0 %	148243625
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48721	NC_009482	GGA	2	6	2212063	2212068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148243625
48722	NC_009482	CAG	2	6	2212069	2212074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243625
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48725	NC_009482	ACG	2	6	2212253	2212258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243626
48726	NC_009482	CTG	2	6	2212325	2212330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243627
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48958	NC_009482	CGG	2	6	2223435	2223440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243633
48959	NC_009482	CGA	2	6	2223480	2223485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243633
48960	NC_009482	CAT	2	6	2223516	2223521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243633
48961	NC_009482	CTT	2	6	2223555	2223560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148243633
48962	NC_009482	TCCGT	2	10	2223646	2223655	0 %	40 %	20 %	40 %	148243634
48963	NC_009482	CAC	2	6	2223677	2223682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243634
48964	NC_009482	CCG	2	6	2223713	2223718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243634
48965	NC_009482	CAGT	2	8	2223727	2223734	25 %	25 %	25 %	25 %	148243634
48966	NC_009482	TG	3	6	2223757	2223762	0 %	50 %	50 %	0 %	148243634
48967	NC_009482	TCCAGC	2	12	2223782	2223793	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148243634
48968	NC_009482	AAG	2	6	2223904	2223909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148243634
48969	NC_009482	CAGCTG	2	12	2223952	2223963	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148243634
48970	NC_009482	CGG	2	6	2223980	2223985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243634
48971	NC_009482	GCTG	2	8	2224067	2224074	0 %	25 %	50 %	25 %	148243634
48972	NC_009482	CGG	2	6	2224183	2224188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243634
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48974	NC_009482	ATG	2	6	2224326	2224331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243634
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48976	NC_009482	AG	3	6	2224457	2224462	50 %	0 %	50 %	0 %	148243634
48977	NC_009482	GGC	2	6	2224467	2224472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243634
48978	NC_009482	TGC	2	6	2224475	2224480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243634
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48982	NC_009482	TCT	2	6	2224537	2224542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148243634
48983	NC_009482	GCC	2	6	2224557	2224562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243634
48984	NC_009482	CTG	2	6	2224575	2224580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243634
48985	NC_009482	GCG	2	6	2224603	2224608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243634
48986	NC_009482	GTGC	2	8	2224619	2224626	0 %	25 %	50 %	25 %	148243634
48987	NC_009482	CCA	2	6	2224651	2224656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243634

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