MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. RCC307 chromosome

Total Repeats: 48987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_009482	CGG	2	6	150507	150512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241254
3502	NC_009482	CTG	2	6	150563	150568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241254
3503	NC_009482	CAC	2	6	150575	150580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241254
3504	NC_009482	TC	3	6	150601	150606	0 %	50 %	0 %	50 %	148241254
3505	NC_009482	CGG	2	6	150607	150612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241254
3506	NC_009482	AAC	2	6	150647	150652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148241254
3507	NC_009482	ACC	2	6	150716	150721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241254
3508	NC_009482	GATG	2	8	150733	150740	25 %	25 %	50 %	0 %	148241254
3509	NC_009482	CGAT	2	8	150747	150754	25 %	25 %	25 %	25 %	148241254
3510	NC_009482	TGG	2	6	150840	150845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241254
3511	NC_009482	CCG	2	6	150880	150885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241254
3512	NC_009482	GCA	2	6	150897	150902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241254
3513	NC_009482	GAG	2	6	150905	150910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148241254
3514	NC_009482	T	6	6	150948	150953	0 %	100 %	0 %	0 %	148241255
3515	NC_009482	GGT	2	6	151047	151052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241255
3516	NC_009482	CGG	2	6	151060	151065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241255
3517	NC_009482	CT	3	6	151087	151092	0 %	50 %	0 %	50 %	148241255
3518	NC_009482	CTG	2	6	151096	151101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241255
3519	NC_009482	TGGT	2	8	151132	151139	0 %	50 %	50 %	0 %	148241255
3520	NC_009482	GCT	2	6	151164	151169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241255
3521	NC_009482	GGCC	2	8	151183	151190	0 %	0 %	50 %	50 %	148241255
3522	NC_009482	CAG	2	6	151235	151240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241255
3523	NC_009482	AGC	2	6	151415	151420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241255
3524	NC_009482	TGC	2	6	151421	151426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241255
3525	NC_009482	GCA	2	6	151461	151466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241255
3526	NC_009482	GAT	2	6	151477	151482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241255
3527	NC_009482	GGT	2	6	151509	151514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241255
3528	NC_009482	CG	3	6	151543	151548	0 %	0 %	50 %	50 %	148241255
3529	NC_009482	GTGA	2	8	151552	151559	25 %	25 %	50 %	0 %	148241255
3530	NC_009482	GCC	2	6	151572	151577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241255
3531	NC_009482	GTG	2	6	151603	151608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241255
3532	NC_009482	CAG	2	6	151611	151616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241255
3533	NC_009482	CTGGC	2	10	151657	151666	0 %	20 %	40 %	40 %	148241255
3534	NC_009482	TGC	2	6	151754	151759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241255
3535	NC_009482	TTG	2	6	151765	151770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241255
3536	NC_009482	GGT	2	6	151821	151826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241255
3537	NC_009482	GTT	2	6	151846	151851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241255
3538	NC_009482	AGC	2	6	151859	151864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241255
3539	NC_009482	CT	3	6	151876	151881	0 %	50 %	0 %	50 %	148241255
3540	NC_009482	CGG	2	6	151903	151908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241255
3541	NC_009482	CGC	2	6	151924	151929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241255
3542	NC_009482	ATGAC	2	10	151980	151989	40 %	20 %	20 %	20 %	148241256
3543	NC_009482	GCTGG	2	10	151996	152005	0 %	20 %	60 %	20 %	148241256
3544	NC_009482	TTG	2	6	152033	152038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241256
3545	NC_009482	GCG	2	6	152068	152073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241256
3546	NC_009482	CTG	2	6	152081	152086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241256
3547	NC_009482	GTT	2	6	152089	152094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241256
3548	NC_009482	TCCT	2	8	152106	152113	0 %	50 %	0 %	50 %	148241256
3549	NC_009482	TGG	2	6	152133	152138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241256
3550	NC_009482	TGG	2	6	152154	152159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241256
3551	NC_009482	TGG	2	6	152166	152171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241256
3552	NC_009482	CGG	2	6	152212	152217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241256
3553	NC_009482	TC	3	6	152341	152346	0 %	50 %	0 %	50 %	148241256
3554	NC_009482	TGC	2	6	152367	152372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241256
3555	NC_009482	TCACC	2	10	152389	152398	20 %	20 %	0 %	60 %	148241256
3556	NC_009482	GCA	2	6	152400	152405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241256
3557	NC_009482	CTG	2	6	152406	152411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241256
3558	NC_009482	CAC	2	6	152416	152421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241256
3559	NC_009482	CTG	2	6	152504	152509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241256
3560	NC_009482	CT	3	6	152510	152515	0 %	50 %	0 %	50 %	148241256
3561	NC_009482	CTG	3	9	152552	152560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241256
3562	NC_009482	GTG	2	6	152567	152572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241256
3563	NC_009482	TGG	2	6	152595	152600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241256
3564	NC_009482	CAG	2	6	152627	152632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241256
3565	NC_009482	CAC	2	6	152653	152658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241256
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3567	NC_009482	TCGC	2	8	152675	152682	0 %	25 %	25 %	50 %	148241256
3568	NC_009482	GAA	2	6	152714	152719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148241256
3569	NC_009482	AGC	2	6	152729	152734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241256
3570	NC_009482	CAG	2	6	152737	152742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241256
3571	NC_009482	GCGA	2	8	152748	152755	25 %	0 %	50 %	25 %	148241256
3572	NC_009482	CGC	2	6	152759	152764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241256
3573	NC_009482	TGC	3	9	152781	152789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241256
3574	NC_009482	CAA	2	6	152867	152872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148241256
3575	NC_009482	TGC	2	6	152923	152928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241256
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3580	NC_009482	TGC	2	6	153147	153152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241256
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3587	NC_009482	TGA	2	6	153397	153402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241256
3588	NC_009482	GAC	2	6	153416	153421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241256
3589	NC_009482	CCA	2	6	153511	153516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241256
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3591	NC_009482	CAACGC	2	12	153530	153541	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	148241256
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3593	NC_009482	CGC	2	6	153659	153664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241256
3594	NC_009482	CGAC	2	8	153825	153832	25 %	0 %	25 %	50 %	148241256
3595	NC_009482	CTG	2	6	153836	153841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241256
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3599	NC_009482	GC	3	6	154009	154014	0 %	0 %	50 %	50 %	148241257
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3601	NC_009482	AGCC	2	8	154031	154038	25 %	0 %	25 %	50 %	148241257
3602	NC_009482	GC	3	6	154083	154088	0 %	0 %	50 %	50 %	148241257
3603	NC_009482	GCG	2	6	154111	154116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241257
3604	NC_009482	CAC	3	9	154131	154139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241257
3605	NC_009482	CGG	2	6	154143	154148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241257
3606	NC_009482	AGC	2	6	154174	154179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241257
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3608	NC_009482	CCA	2	6	154244	154249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241257
3609	NC_009482	CGT	2	6	154253	154258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241257
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3612	NC_009482	CTCGG	2	10	154418	154427	0 %	20 %	40 %	40 %	148241257
3613	NC_009482	GCT	2	6	154469	154474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241257
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3616	NC_009482	CAGC	2	8	154566	154573	25 %	0 %	25 %	50 %	148241257
3617	NC_009482	TGG	2	6	154738	154743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241257
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3619	NC_009482	GC	3	6	154846	154851	0 %	0 %	50 %	50 %	148241257
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3621	NC_009482	GCG	2	6	155013	155018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241257
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3742	NC_009482	CTT	2	6	160331	160336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241261
3743	NC_009482	TTC	2	6	160425	160430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241261
3744	NC_009482	CGT	2	6	160442	160447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241261
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3842	NC_009482	TGCT	2	8	165141	165148	0 %	50 %	25 %	25 %	148241265
3843	NC_009482	TCA	2	6	165154	165159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241265
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3845	NC_009482	GCT	2	6	165307	165312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241266
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3850	NC_009482	GTC	2	6	165621	165626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241266
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3858	NC_009482	CCAAG	2	10	165846	165855	40 %	0 %	20 %	40 %	148241266
3859	NC_009482	GTTG	2	8	166177	166184	0 %	50 %	50 %	0 %	148241266
3860	NC_009482	ACA	2	6	166231	166236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148241266
3861	NC_009482	CAG	2	6	166244	166249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241266
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3985	NC_009482	CTG	2	6	172543	172548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241272
3986	NC_009482	TGG	3	9	172574	172582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241272
3987	NC_009482	TGT	2	6	172664	172669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241272
3988	NC_009482	GGC	2	6	172675	172680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241272
3989	NC_009482	TTGG	2	8	172785	172792	0 %	50 %	50 %	0 %	148241272
3990	NC_009482	CTTT	2	8	172827	172834	0 %	75 %	0 %	25 %	148241272
3991	NC_009482	CTG	2	6	172840	172845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241272
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3993	NC_009482	GCAG	2	8	172953	172960	25 %	0 %	50 %	25 %	148241272
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3995	NC_009482	TCA	2	6	173111	173116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241272
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3997	NC_009482	GCC	2	6	173184	173189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241272
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3999	NC_009482	GCTG	2	8	173207	173214	0 %	25 %	50 %	25 %	148241272
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