MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. RCC307 chromosome

Total Repeats: 48987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
37001	NC_009482	GCA	2	6	1681460	1681465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243034
37002	NC_009482	AAG	2	6	1681501	1681506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148243034
37003	NC_009482	CAC	3	9	1681526	1681534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243034
37004	NC_009482	CAG	2	6	1681575	1681580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243034
37005	NC_009482	GC	3	6	1681631	1681636	0 %	0 %	50 %	50 %	148243034
37006	NC_009482	CAG	2	6	1681648	1681653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243034
37007	NC_009482	GAT	2	6	1681698	1681703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243034
37008	NC_009482	GTG	2	6	1681705	1681710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243034
37009	NC_009482	GCT	2	6	1681772	1681777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243034
37010	NC_009482	GAA	2	6	1681785	1681790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148243034
37011	NC_009482	ACC	2	6	1681829	1681834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243034
37012	NC_009482	A	6	6	1681863	1681868	100 %	0 %	0 %	0 %	148243034
37013	NC_009482	CCAG	2	8	1681901	1681908	25 %	0 %	25 %	50 %	148243034
37014	NC_009482	CGC	3	9	1681911	1681919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243034
37015	NC_009482	GC	3	6	1681946	1681951	0 %	0 %	50 %	50 %	148243034
37016	NC_009482	TGG	2	6	1681958	1681963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243034
37017	NC_009482	CAG	2	6	1681968	1681973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243034
37018	NC_009482	CCA	2	6	1682064	1682069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243035
37019	NC_009482	CGC	2	6	1682094	1682099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243035
37020	NC_009482	ATC	2	6	1682105	1682110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243035
37021	NC_009482	CAG	2	6	1682113	1682118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243035
37022	NC_009482	TCC	2	6	1682119	1682124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243035
37023	NC_009482	AAC	2	6	1682135	1682140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243035
37024	NC_009482	CGT	2	6	1682288	1682293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243036
37025	NC_009482	GTT	2	6	1682426	1682431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148243036
37026	NC_009482	TGT	2	6	1682436	1682441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148243036
37027	NC_009482	GTC	2	6	1682451	1682456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243036
37028	NC_009482	AGT	2	6	1682501	1682506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243036
37029	NC_009482	CTT	2	6	1682546	1682551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148243036
37030	NC_009482	ATCG	2	8	1682751	1682758	25 %	25 %	25 %	25 %	148243036
37031	NC_009482	CACC	2	8	1682789	1682796	25 %	0 %	0 %	75 %	148243036
37032	NC_009482	ACC	3	9	1682887	1682895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243036
37033	NC_009482	GC	3	6	1682945	1682950	0 %	0 %	50 %	50 %	148243036
37034	NC_009482	TCG	2	6	1682959	1682964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243036
37035	NC_009482	ACA	2	6	1682984	1682989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243036
37036	NC_009482	GCG	2	6	1683092	1683097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243036
37037	NC_009482	TGA	2	6	1683164	1683169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243036
37038	NC_009482	CCT	2	6	1683229	1683234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243037
37039	NC_009482	GCC	2	6	1683249	1683254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243037
37040	NC_009482	CAG	2	6	1683265	1683270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243037
37041	NC_009482	GCCA	2	8	1683294	1683301	25 %	0 %	25 %	50 %	148243037
37042	NC_009482	CAC	2	6	1683329	1683334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243037
37043	NC_009482	CAGGT	2	10	1683351	1683360	20 %	20 %	40 %	20 %	148243037
37044	NC_009482	CAGC	2	8	1683362	1683369	25 %	0 %	25 %	50 %	148243037
37045	NC_009482	CGA	2	6	1683433	1683438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243037
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37047	NC_009482	CAG	2	6	1683536	1683541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243037
37048	NC_009482	CGG	2	6	1683556	1683561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243037
37049	NC_009482	GAA	2	6	1683569	1683574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148243037
37050	NC_009482	TGC	2	6	1683583	1683588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243037
37051	NC_009482	CCA	2	6	1683864	1683869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243038
37052	NC_009482	GCC	2	6	1683938	1683943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243038
37053	NC_009482	ATCA	2	8	1683952	1683959	50 %	25 %	0 %	25 %	148243038
37054	NC_009482	CAC	2	6	1684000	1684005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243038
37055	NC_009482	CCA	2	6	1684158	1684163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243038
37056	NC_009482	ACC	2	6	1684229	1684234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243038
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37058	NC_009482	GATGG	2	10	1684270	1684279	20 %	20 %	60 %	0 %	148243038
37059	NC_009482	CATC	2	8	1684284	1684291	25 %	25 %	0 %	50 %	148243038
37060	NC_009482	GCG	2	6	1684314	1684319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243038
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37064	NC_009482	ACCA	2	8	1684610	1684617	50 %	0 %	0 %	50 %	148243039
37065	NC_009482	AGC	2	6	1684638	1684643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243039
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37067	NC_009482	CTG	2	6	1684714	1684719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243039
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37099	NC_009482	ATGGC	2	10	1686186	1686195	20 %	20 %	40 %	20 %	148243040
37100	NC_009482	GCA	2	6	1686224	1686229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243040
37101	NC_009482	TGG	2	6	1686360	1686365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243040
37102	NC_009482	CTG	3	9	1686436	1686444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243040
37103	NC_009482	CTG	2	6	1686459	1686464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243040
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37105	NC_009482	TGCC	2	8	1686596	1686603	0 %	25 %	25 %	50 %	148243040
37106	NC_009482	GCT	2	6	1686800	1686805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243040
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37110	NC_009482	ACG	2	6	1687051	1687056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243040
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37113	NC_009482	CTG	2	6	1687190	1687195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243041
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37115	NC_009482	GCA	2	6	1687225	1687230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243041
37116	NC_009482	CA	6	12	1687266	1687277	50 %	0 %	0 %	50 %	148243041
37117	NC_009482	CTG	2	6	1687302	1687307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243041
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37228	NC_009482	GGC	2	6	1692524	1692529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243051
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37459	NC_009482	GTC	2	6	1702113	1702118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243057
37460	NC_009482	CGC	2	6	1702181	1702186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243057
37461	NC_009482	GCT	2	6	1702250	1702255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243058
37462	NC_009482	CGC	2	6	1702257	1702262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243058
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37464	NC_009482	CGG	2	6	1702355	1702360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243058
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37471	NC_009482	CGG	2	6	1702589	1702594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243058
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37482	NC_009482	GCA	2	6	1703161	1703166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243058
37483	NC_009482	GGT	2	6	1703167	1703172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243058
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37487	NC_009482	CGT	3	9	1703374	1703382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243058
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37489	NC_009482	CGC	2	6	1703405	1703410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243058
37490	NC_009482	CGG	2	6	1703459	1703464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243058
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37494	NC_009482	GCG	2	6	1703819	1703824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243058
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