MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. RCC307 chromosome

Total Repeats: 48987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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36502	NC_009482	CTG	3	9	1656780	1656788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243005
36503	NC_009482	G	6	6	1656835	1656840	0 %	0 %	100 %	0 %	148243005
36504	NC_009482	TGG	2	6	1656867	1656872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243005
36505	NC_009482	CT	3	6	1657032	1657037	0 %	50 %	0 %	50 %	148243006
36506	NC_009482	GGT	2	6	1657045	1657050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243006
36507	NC_009482	GCT	2	6	1657052	1657057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243006
36508	NC_009482	CGC	2	6	1657094	1657099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243006
36509	NC_009482	GCG	2	6	1657178	1657183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243006
36510	NC_009482	AGC	2	6	1657187	1657192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243006
36511	NC_009482	CTGG	2	8	1657222	1657229	0 %	25 %	50 %	25 %	148243007
36512	NC_009482	CATGG	2	10	1657298	1657307	20 %	20 %	40 %	20 %	148243007
36513	NC_009482	TCG	2	6	1657329	1657334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243007
36514	NC_009482	CGA	2	6	1657366	1657371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243007
36515	NC_009482	GTG	2	6	1657454	1657459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243008
36516	NC_009482	CAC	2	6	1657461	1657466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243008
36517	NC_009482	AGGG	2	8	1657488	1657495	25 %	0 %	75 %	0 %	148243008
36518	NC_009482	TGG	2	6	1657541	1657546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243008
36519	NC_009482	CTC	2	6	1657578	1657583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243008
36520	NC_009482	CAA	2	6	1657610	1657615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243008
36521	NC_009482	TGA	2	6	1657860	1657865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243009
36522	NC_009482	TCA	2	6	1657873	1657878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243009
36523	NC_009482	ACA	2	6	1657894	1657899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243009
36524	NC_009482	AGC	2	6	1657968	1657973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243009
36525	NC_009482	CAC	2	6	1658097	1658102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243009
36526	NC_009482	GCT	2	6	1658126	1658131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243010
36527	NC_009482	CGC	2	6	1658165	1658170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243010
36528	NC_009482	TTTC	2	8	1658187	1658194	0 %	75 %	0 %	25 %	148243010
36529	NC_009482	TGG	2	6	1658196	1658201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243010
36530	NC_009482	GAA	2	6	1658234	1658239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148243010
36531	NC_009482	CAC	2	6	1658276	1658281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243010
36532	NC_009482	GCT	2	6	1658318	1658323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243010
36533	NC_009482	TGC	2	6	1658388	1658393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243010
36534	NC_009482	ATC	2	6	1658516	1658521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243010
36535	NC_009482	GCT	2	6	1658551	1658556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243010
36536	NC_009482	TGC	2	6	1659595	1659600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243011
36537	NC_009482	CGC	2	6	1659631	1659636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243011
36538	NC_009482	CAG	2	6	1659661	1659666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243011
36539	NC_009482	GTG	2	6	1659672	1659677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243011
36540	NC_009482	GCG	2	6	1659697	1659702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243011
36541	NC_009482	GTCCA	2	10	1659744	1659753	20 %	20 %	20 %	40 %	148243011
36542	NC_009482	CAG	3	9	1659803	1659811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243011
36543	NC_009482	GCT	2	6	1659931	1659936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243012
36544	NC_009482	TGA	2	6	1659960	1659965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243012
36545	NC_009482	AAG	2	6	1659972	1659977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148243012
36546	NC_009482	TGA	2	6	1659979	1659984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243012
36547	NC_009482	CTG	2	6	1660078	1660083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243012
36548	NC_009482	ACCA	2	8	1660184	1660191	50 %	0 %	0 %	50 %	148243012
36549	NC_009482	CAG	2	6	1660231	1660236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243012
36550	NC_009482	GCC	2	6	1660362	1660367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243013
36551	NC_009482	GAG	2	6	1660473	1660478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148243013
36552	NC_009482	CAGCC	2	10	1660479	1660488	20 %	0 %	20 %	60 %	148243013
36553	NC_009482	GTT	2	6	1660538	1660543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148243013
36554	NC_009482	A	6	6	1660727	1660732	100 %	0 %	0 %	0 %	148243014
36555	NC_009482	AAGC	2	8	1660739	1660746	50 %	0 %	25 %	25 %	148243014
36556	NC_009482	CAAT	2	8	1660760	1660767	50 %	25 %	0 %	25 %	148243014
36557	NC_009482	ATG	2	6	1660826	1660831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243014
36558	NC_009482	GGT	2	6	1661236	1661241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243015
36559	NC_009482	CAG	2	6	1661302	1661307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243015
36560	NC_009482	GTG	2	6	1661330	1661335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243015
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36562	NC_009482	CGG	2	6	1661486	1661491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243016
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36564	NC_009482	CA	3	6	1661560	1661565	50 %	0 %	0 %	50 %	148243016
36565	NC_009482	GCA	3	9	1661590	1661598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243016
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36569	NC_009482	ATG	3	9	1661708	1661716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243016
36570	NC_009482	ACT	2	6	1661722	1661727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243017
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36580	NC_009482	CGA	2	6	1662514	1662519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243018
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36583	NC_009482	ACG	2	6	1662747	1662752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243018
36584	NC_009482	ATGG	2	8	1662761	1662768	25 %	25 %	50 %	0 %	148243018
36585	NC_009482	TTCC	2	8	1662805	1662812	0 %	50 %	0 %	50 %	148243018
36586	NC_009482	TGC	2	6	1662865	1662870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243018
36587	NC_009482	TCG	2	6	1662930	1662935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243018
36588	NC_009482	AAC	2	6	1662977	1662982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243018
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36601	NC_009482	GCAC	2	8	1663693	1663700	25 %	0 %	25 %	50 %	148243019
36602	NC_009482	A	6	6	1663725	1663730	100 %	0 %	0 %	0 %	148243019
36603	NC_009482	GCG	2	6	1663771	1663776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243019
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36609	NC_009482	CTCA	2	8	1664182	1664189	25 %	25 %	0 %	50 %	148243019
36610	NC_009482	AGGG	2	8	1664243	1664250	25 %	0 %	75 %	0 %	148243019
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36616	NC_009482	TGC	2	6	1664498	1664503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243020
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36732	NC_009482	CGC	2	6	1669362	1669367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243023
36733	NC_009482	GGC	2	6	1669368	1669373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243023
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36847	NC_009482	GCCGA	2	10	1674388	1674397	20 %	0 %	40 %	40 %	148243030
36848	NC_009482	TGC	2	6	1674463	1674468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243030
36849	NC_009482	CTC	2	6	1674471	1674476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243030
36850	NC_009482	TGG	2	6	1674491	1674496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243030
36851	NC_009482	TCA	2	6	1674656	1674661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243030
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36853	NC_009482	CCA	2	6	1674791	1674796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243030
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36855	NC_009482	GCA	2	6	1674907	1674912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243030
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36857	NC_009482	GCT	2	6	1675013	1675018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243030
36858	NC_009482	CCTG	2	8	1675216	1675223	0 %	25 %	25 %	50 %	148243030
36859	NC_009482	CCA	2	6	1675235	1675240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243030
36860	NC_009482	GCT	2	6	1675241	1675246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243030
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36862	NC_009482	TCT	2	6	1675312	1675317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148243030
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36864	NC_009482	GA	3	6	1675400	1675405	50 %	0 %	50 %	0 %	148243030
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36867	NC_009482	AGCACC	2	12	1675627	1675638	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	148243030
36868	NC_009482	CCA	2	6	1675675	1675680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243030
36869	NC_009482	CAC	2	6	1675685	1675690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243030
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36881	NC_009482	GA	3	6	1676255	1676260	50 %	0 %	50 %	0 %	148243031
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36904	NC_009482	CTG	2	6	1677087	1677092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243031
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