MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. RCC307 chromosome

Total Repeats: 48987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_009482	GCA	2	6	126852	126857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241229
3002	NC_009482	AGC	2	6	126866	126871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241229
3003	NC_009482	TTG	2	6	127016	127021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241229
3004	NC_009482	CCG	2	6	127163	127168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241230
3005	NC_009482	CGGGAT	2	12	127245	127256	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148241230
3006	NC_009482	TGG	2	6	127259	127264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241230
3007	NC_009482	TGG	2	6	127269	127274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241230
3008	NC_009482	CAC	2	6	127279	127284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241230
3009	NC_009482	TGG	2	6	127362	127367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241230
3010	NC_009482	GCC	2	6	127528	127533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241230
3011	NC_009482	TGG	2	6	127562	127567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241230
3012	NC_009482	ACC	2	6	127592	127597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241230
3013	NC_009482	CAC	2	6	127614	127619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241230
3014	NC_009482	TCG	2	6	127724	127729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241230
3015	NC_009482	AGCC	2	8	127761	127768	25 %	0 %	25 %	50 %	148241230
3016	NC_009482	GCC	2	6	127798	127803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241230
3017	NC_009482	TGC	2	6	127829	127834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241230
3018	NC_009482	GCG	2	6	127871	127876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241230
3019	NC_009482	GCC	2	6	127925	127930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241230
3020	NC_009482	ATC	3	9	127952	127960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241230
3021	NC_009482	GCC	2	6	128035	128040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241230
3022	NC_009482	GAT	2	6	128053	128058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241230
3023	NC_009482	CAC	2	6	128347	128352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241230
3024	NC_009482	CGG	2	6	128354	128359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241230
3025	NC_009482	GAC	2	6	128360	128365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241230
3026	NC_009482	CTT	2	6	128407	128412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241231
3027	NC_009482	CTT	2	6	128490	128495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241231
3028	NC_009482	GCT	2	6	128592	128597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241231
3029	NC_009482	GAAC	2	8	128609	128616	50 %	0 %	25 %	25 %	148241231
3030	NC_009482	TGCC	2	8	128833	128840	0 %	25 %	25 %	50 %	148241232
3031	NC_009482	ACC	2	6	128993	128998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241232
3032	NC_009482	CAG	2	6	129185	129190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241233
3033	NC_009482	GC	3	6	129228	129233	0 %	0 %	50 %	50 %	148241233
3034	NC_009482	TCA	2	6	129245	129250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241233
3035	NC_009482	CCAC	2	8	129317	129324	25 %	0 %	0 %	75 %	148241233
3036	NC_009482	GAG	2	6	129334	129339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148241233
3037	NC_009482	CCCACC	2	12	129347	129358	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	148241233
3038	NC_009482	GGT	2	6	129381	129386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241233
3039	NC_009482	CAT	2	6	129396	129401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241233
3040	NC_009482	ACC	2	6	129407	129412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241233
3041	NC_009482	AG	3	6	129421	129426	50 %	0 %	50 %	0 %	148241233
3042	NC_009482	GCA	2	6	129433	129438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241233
3043	NC_009482	GCC	2	6	129445	129450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241233
3044	NC_009482	TTG	2	6	129658	129663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241233
3045	NC_009482	GGTGAA	2	12	129673	129684	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	148241233
3046	NC_009482	AC	3	6	129701	129706	50 %	0 %	0 %	50 %	148241233
3047	NC_009482	GCA	2	6	129810	129815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241233
3048	NC_009482	AGC	2	6	129899	129904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241233
3049	NC_009482	CCG	2	6	129911	129916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241233
3050	NC_009482	GTTG	2	8	129920	129927	0 %	50 %	50 %	0 %	148241233
3051	NC_009482	GGC	2	6	129946	129951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241233
3052	NC_009482	TGG	2	6	129965	129970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241233
3053	NC_009482	GCC	2	6	130037	130042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241233
3054	NC_009482	CGCTG	2	10	130044	130053	0 %	20 %	40 %	40 %	148241233
3055	NC_009482	AGC	2	6	130073	130078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241233
3056	NC_009482	CCA	2	6	130091	130096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241233
3057	NC_009482	GA	3	6	130178	130183	50 %	0 %	50 %	0 %	148241233
3058	NC_009482	CCG	2	6	130184	130189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241233
3059	NC_009482	GCT	2	6	130198	130203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241233
3060	NC_009482	AGC	3	9	130214	130222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241233
3061	NC_009482	GC	3	6	130255	130260	0 %	0 %	50 %	50 %	148241233
3062	NC_009482	GCG	2	6	130351	130356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241233
3063	NC_009482	CCTT	2	8	130364	130371	0 %	50 %	0 %	50 %	148241233
3064	NC_009482	GTG	2	6	130421	130426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241233
3065	NC_009482	TTGA	2	8	130495	130502	25 %	50 %	25 %	0 %	148241233
3066	NC_009482	AC	3	6	130547	130552	50 %	0 %	0 %	50 %	148241233
3067	NC_009482	CCG	2	6	130652	130657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241233
3068	NC_009482	GTG	2	6	130705	130710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241233
3069	NC_009482	AAG	2	6	130760	130765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148241233
3070	NC_009482	GC	3	6	130780	130785	0 %	0 %	50 %	50 %	148241233
3071	NC_009482	TGC	2	6	130835	130840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241233
3072	NC_009482	CAG	2	6	130847	130852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241233
3073	NC_009482	CGC	2	6	130868	130873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241233
3074	NC_009482	GCT	2	6	130896	130901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241233
3075	NC_009482	CGC	2	6	130914	130919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241233
3076	NC_009482	CAG	2	6	130999	131004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241234
3077	NC_009482	G	6	6	131011	131016	0 %	0 %	100 %	0 %	148241234
3078	NC_009482	AGCC	2	8	131027	131034	25 %	0 %	25 %	50 %	148241234
3079	NC_009482	GCG	2	6	131086	131091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241234
3080	NC_009482	CCG	2	6	131129	131134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241234
3081	NC_009482	TGG	2	6	131135	131140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241234
3082	NC_009482	ACA	2	6	131150	131155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148241234
3083	NC_009482	GTC	2	6	131242	131247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241234
3084	NC_009482	GGC	2	6	131248	131253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241234
3085	NC_009482	CTG	2	6	131283	131288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241234
3086	NC_009482	CAC	2	6	131317	131322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241234
3087	NC_009482	GCCG	2	8	131346	131353	0 %	0 %	50 %	50 %	148241234
3088	NC_009482	CAG	2	6	131356	131361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241234
3089	NC_009482	TTG	2	6	131368	131373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241234
3090	NC_009482	CGG	2	6	131387	131392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241234
3091	NC_009482	CAGC	2	8	131395	131402	25 %	0 %	25 %	50 %	148241234
3092	NC_009482	CCA	2	6	131481	131486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241234
3093	NC_009482	TGA	2	6	131551	131556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241235
3094	NC_009482	GCA	2	6	131566	131571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241235
3095	NC_009482	GTGA	2	8	131580	131587	25 %	25 %	50 %	0 %	148241235
3096	NC_009482	GTT	2	6	131721	131726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241236
3097	NC_009482	CTT	2	6	131745	131750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241236
3098	NC_009482	CAC	2	6	131809	131814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241236
3099	NC_009482	TCT	2	6	131852	131857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241236
3100	NC_009482	TTG	2	6	131884	131889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241236
3101	NC_009482	GCTGC	2	10	131959	131968	0 %	20 %	40 %	40 %	148241236
3102	NC_009482	CCAA	2	8	132041	132048	50 %	0 %	0 %	50 %	148241236
3103	NC_009482	GC	3	6	132065	132070	0 %	0 %	50 %	50 %	148241236
3104	NC_009482	CTG	2	6	132093	132098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241236
3105	NC_009482	CTTG	2	8	132111	132118	0 %	50 %	25 %	25 %	148241236
3106	NC_009482	CAG	2	6	132141	132146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241236
3107	NC_009482	CAGC	2	8	132153	132160	25 %	0 %	25 %	50 %	148241236
3108	NC_009482	GC	3	6	132180	132185	0 %	0 %	50 %	50 %	148241236
3109	NC_009482	GTT	2	6	132220	132225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241236
3110	NC_009482	CTC	2	6	132226	132231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148241236
3111	NC_009482	GCA	2	6	132255	132260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241236
3112	NC_009482	TG	3	6	132328	132333	0 %	50 %	50 %	0 %	148241236
3113	NC_009482	GGC	2	6	132346	132351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241236
3114	NC_009482	GCT	2	6	132363	132368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241236
3115	NC_009482	GCA	2	6	133012	133017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241237
3116	NC_009482	GA	3	6	133025	133030	50 %	0 %	50 %	0 %	148241237
3117	NC_009482	TGTC	2	8	133062	133069	0 %	50 %	25 %	25 %	148241237
3118	NC_009482	CTG	2	6	133087	133092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241237
3119	NC_009482	GGTT	2	8	133169	133176	0 %	50 %	50 %	0 %	148241237
3120	NC_009482	GATGC	2	10	133181	133190	20 %	20 %	40 %	20 %	148241237
3121	NC_009482	GGT	2	6	133210	133215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241237
3122	NC_009482	ACC	2	6	133217	133222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241237
3123	NC_009482	CTGC	2	8	133235	133242	0 %	25 %	25 %	50 %	148241237
3124	NC_009482	TGA	2	6	133249	133254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241237
3125	NC_009482	GAC	3	9	133265	133273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241237
3126	NC_009482	CAG	2	6	133414	133419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241238
3127	NC_009482	GCG	2	6	133435	133440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241238
3128	NC_009482	A	7	7	133487	133493	100 %	0 %	0 %	0 %	148241238
3129	NC_009482	GCA	3	9	133522	133530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241238
3130	NC_009482	GGC	2	6	133531	133536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241238
3131	NC_009482	AGA	2	6	133545	133550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148241238
3132	NC_009482	CAG	2	6	133561	133566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241238
3133	NC_009482	GCTC	2	8	133689	133696	0 %	25 %	25 %	50 %	148241238
3134	NC_009482	GCT	2	6	133801	133806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241239
3135	NC_009482	CACG	2	8	133829	133836	25 %	0 %	25 %	50 %	148241239
3136	NC_009482	CAAAGA	2	12	133961	133972	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	148241239
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3143	NC_009482	GC	3	6	134225	134230	0 %	0 %	50 %	50 %	148241239
3144	NC_009482	GCCG	2	8	134274	134281	0 %	0 %	50 %	50 %	148241239
3145	NC_009482	AG	3	6	134295	134300	50 %	0 %	50 %	0 %	148241239
3146	NC_009482	CAGG	2	8	134345	134352	25 %	0 %	50 %	25 %	148241239
3147	NC_009482	ACC	2	6	134356	134361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241239
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3151	NC_009482	GTA	2	6	134442	134447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241239
3152	NC_009482	GCT	2	6	134455	134460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241239
3153	NC_009482	GCC	2	6	134463	134468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241239
3154	NC_009482	G	6	6	134483	134488	0 %	0 %	100 %	0 %	148241239
3155	NC_009482	CCA	2	6	134612	134617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241239
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3226	NC_009482	TGA	2	6	137861	137866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241242
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3233	NC_009482	CCTTG	2	10	138064	138073	0 %	40 %	20 %	40 %	148241242
3234	NC_009482	GTG	2	6	138150	138155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241243
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3236	NC_009482	GCT	2	6	138170	138175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241243
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3239	NC_009482	TGC	2	6	138460	138465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241243
3240	NC_009482	GCCGTT	2	12	138533	138544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241243
3241	NC_009482	TTG	2	6	138690	138695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241243
3242	NC_009482	TGG	2	6	138721	138726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241243
3243	NC_009482	CGG	2	6	138733	138738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241243
3244	NC_009482	CCG	2	6	138798	138803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241243
3245	NC_009482	CGAT	2	8	138804	138811	25 %	25 %	25 %	25 %	148241243
3246	NC_009482	GCA	2	6	138971	138976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241244
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3248	NC_009482	GGT	2	6	139206	139211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241244
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3250	NC_009482	TGC	2	6	139249	139254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241244
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3252	NC_009482	GCC	2	6	139295	139300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241244
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3261	NC_009482	CG	3	6	139689	139694	0 %	0 %	50 %	50 %	148241244
3262	NC_009482	TGG	2	6	139696	139701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241244
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3273	NC_009482	TGC	2	6	140314	140319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241244
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3299	NC_009482	CCAGGG	2	12	141515	141526	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	148241245
3300	NC_009482	GCT	2	6	141554	141559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241245
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3312	NC_009482	GC	3	6	142081	142086	0 %	0 %	50 %	50 %	148241245
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3318	NC_009482	GCT	2	6	142279	142284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241246
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3329	NC_009482	CTG	2	6	142823	142828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241246
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3334	NC_009482	CAG	2	6	142955	142960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241246
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3348	NC_009482	TGC	2	6	143446	143451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241247
3349	NC_009482	TCAGC	2	10	143489	143498	20 %	20 %	20 %	40 %	148241247
3350	NC_009482	CTT	2	6	143546	143551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241247
3351	NC_009482	GCA	2	6	143586	143591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241247
3352	NC_009482	GC	3	6	143635	143640	0 %	0 %	50 %	50 %	148241247
3353	NC_009482	GCG	2	6	143659	143664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241247
3354	NC_009482	GCTG	2	8	143759	143766	0 %	25 %	50 %	25 %	148241247
3355	NC_009482	CCA	2	6	143864	143869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241247
3356	NC_009482	TGGC	2	8	143953	143960	0 %	25 %	50 %	25 %	148241247
3357	NC_009482	CTGG	3	12	143976	143987	0 %	25 %	50 %	25 %	148241247
3358	NC_009482	CAC	2	6	143991	143996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241247
3359	NC_009482	GCA	2	6	144014	144019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241247
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3361	NC_009482	GC	3	6	144091	144096	0 %	0 %	50 %	50 %	148241247
3362	NC_009482	TCT	2	6	144145	144150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241247
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3364	NC_009482	GGC	2	6	144177	144182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241247
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3472	NC_009482	TGC	2	6	148714	148719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241252
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3477	NC_009482	GCGTT	2	10	149024	149033	0 %	40 %	40 %	20 %	148241252
3478	NC_009482	CTT	2	6	149035	149040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241252
3479	NC_009482	T	7	7	149080	149086	0 %	100 %	0 %	0 %	148241252
3480	NC_009482	AGT	2	6	149136	149141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241252
3481	NC_009482	CGG	2	6	149161	149166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241252
3482	NC_009482	TCT	2	6	149190	149195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241252
3483	NC_009482	GTA	2	6	149261	149266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241252
3484	NC_009482	AGCG	2	8	149322	149329	25 %	0 %	50 %	25 %	148241252
3485	NC_009482	CAC	2	6	149335	149340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241252
3486	NC_009482	GTG	2	6	149349	149354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241252
3487	NC_009482	TGC	2	6	149482	149487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241252
3488	NC_009482	CGC	2	6	149560	149565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241252
3489	NC_009482	CAC	2	6	149594	149599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241252
3490	NC_009482	CGC	2	6	149626	149631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241252
3491	NC_009482	G	6	6	149639	149644	0 %	0 %	100 %	0 %	148241252
3492	NC_009482	TAAC	2	8	149658	149665	50 %	25 %	0 %	25 %	148241252
3493	NC_009482	GCTCA	2	10	149763	149772	20 %	20 %	20 %	40 %	148241253
3494	NC_009482	AGC	2	6	149965	149970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241253
3495	NC_009482	CAG	2	6	150096	150101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241253
3496	NC_009482	GCT	2	6	150288	150293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241254
3497	NC_009482	TGG	2	6	150333	150338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241254
3498	NC_009482	GGA	2	6	150367	150372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148241254
3499	NC_009482	AGC	2	6	150423	150428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241254
3500	NC_009482	CCG	2	6	150433	150438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241254

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