MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. RCC307 chromosome

Total Repeats: 48987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2502	NC_009482	GAA	2	6	106378	106383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148241208
2503	NC_009482	GTGCG	2	10	106421	106430	0 %	20 %	60 %	20 %	148241208
2504	NC_009482	TGC	2	6	106464	106469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241208
2505	NC_009482	GAT	2	6	106476	106481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241208
2506	NC_009482	TGG	2	6	106520	106525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241208
2507	NC_009482	C	6	6	106526	106531	0 %	0 %	0 %	100 %	148241208
2508	NC_009482	GCG	2	6	106601	106606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241208
2509	NC_009482	TGAT	2	8	106622	106629	25 %	50 %	25 %	0 %	148241208
2510	NC_009482	GCT	3	9	106639	106647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241208
2511	NC_009482	GAT	2	6	106686	106691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241208
2512	NC_009482	CGG	2	6	106701	106706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241208
2513	NC_009482	CAC	2	6	106710	106715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241208
2514	NC_009482	TGA	2	6	106776	106781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241208
2515	NC_009482	TGG	3	9	106826	106834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241208
2516	NC_009482	TCGGC	2	10	106868	106877	0 %	20 %	40 %	40 %	148241208
2517	NC_009482	CGA	2	6	106884	106889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241208
2518	NC_009482	CT	3	6	106933	106938	0 %	50 %	0 %	50 %	148241208
2519	NC_009482	GC	3	6	106962	106967	0 %	0 %	50 %	50 %	148241208
2520	NC_009482	GCT	2	6	107056	107061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241208
2521	NC_009482	CAT	2	6	107079	107084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241208
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2523	NC_009482	GCT	2	6	107172	107177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241208
2524	NC_009482	GT	3	6	107178	107183	0 %	50 %	50 %	0 %	148241208
2525	NC_009482	GGA	2	6	107208	107213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148241208
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2528	NC_009482	CTG	2	6	107347	107352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241209
2529	NC_009482	CTT	2	6	107355	107360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241209
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2533	NC_009482	CAG	2	6	107533	107538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241209
2534	NC_009482	GCC	2	6	107582	107587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241209
2535	NC_009482	TGG	2	6	107599	107604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241209
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2538	NC_009482	CAG	2	6	107691	107696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241209
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2541	NC_009482	TGG	2	6	107861	107866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241209
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2543	NC_009482	GGGTGC	2	12	107996	108007	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	148241209
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2545	NC_009482	CTG	2	6	108060	108065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241210
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2552	NC_009482	TGG	2	6	108270	108275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241210
2553	NC_009482	GC	3	6	108291	108296	0 %	0 %	50 %	50 %	148241210
2554	NC_009482	GCA	2	6	108310	108315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241210
2555	NC_009482	CTTG	2	8	108335	108342	0 %	50 %	25 %	25 %	148241210
2556	NC_009482	TGC	2	6	108349	108354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241210
2557	NC_009482	GCTGCA	2	12	108371	108382	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148241210
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2559	NC_009482	GGT	2	6	108458	108463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241210
2560	NC_009482	TGC	2	6	108478	108483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241210
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2562	NC_009482	GCT	2	6	108525	108530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241211
2563	NC_009482	G	6	6	108558	108563	0 %	0 %	100 %	0 %	148241211
2564	NC_009482	GCCCAA	2	12	108576	108587	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	148241211
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2568	NC_009482	GCA	2	6	108825	108830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241211
2569	NC_009482	CGCA	2	8	108927	108934	25 %	0 %	25 %	50 %	148241211
2570	NC_009482	GCT	2	6	108954	108959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241211
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2573	NC_009482	AGCTG	2	10	109080	109089	20 %	20 %	40 %	20 %	148241211
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2581	NC_009482	GCG	2	6	109265	109270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241211
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2589	NC_009482	TGA	2	6	109598	109603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241211
2590	NC_009482	CAT	2	6	109671	109676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241211
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2592	NC_009482	CGCT	2	8	109767	109774	0 %	25 %	25 %	50 %	148241211
2593	NC_009482	TGG	2	6	109943	109948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241212
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2596	NC_009482	GTG	2	6	110011	110016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241212
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2599	NC_009482	ATG	2	6	110089	110094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241212
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2601	NC_009482	GTT	2	6	110284	110289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241212
2602	NC_009482	TGGC	2	8	110327	110334	0 %	25 %	50 %	25 %	148241212
2603	NC_009482	TGG	3	9	110360	110368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241212
2604	NC_009482	CGC	2	6	110377	110382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241212
2605	NC_009482	GTG	2	6	110393	110398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241212
2606	NC_009482	TCAC	2	8	110410	110417	25 %	25 %	0 %	50 %	148241212
2607	NC_009482	CCGGG	2	10	110458	110467	0 %	0 %	60 %	40 %	148241212
2608	NC_009482	CG	3	6	110476	110481	0 %	0 %	50 %	50 %	148241212
2609	NC_009482	AGC	2	6	110492	110497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241212
2610	NC_009482	CGT	2	6	110535	110540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241212
2611	NC_009482	TGAGCG	2	12	110668	110679	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148241212
2612	NC_009482	AGCCA	2	10	110755	110764	40 %	0 %	20 %	40 %	148241213
2613	NC_009482	GCA	2	6	110780	110785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241213
2614	NC_009482	TGA	2	6	110848	110853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241213
2615	NC_009482	TGA	2	6	110894	110899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241213
2616	NC_009482	TGG	2	6	110968	110973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241213
2617	NC_009482	ATGGC	2	10	111092	111101	20 %	20 %	40 %	20 %	148241213
2618	NC_009482	CCG	3	9	111176	111184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241213
2619	NC_009482	CG	3	6	111183	111188	0 %	0 %	50 %	50 %	148241213
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2621	NC_009482	CTGG	2	8	111212	111219	0 %	25 %	50 %	25 %	148241213
2622	NC_009482	TGC	2	6	111253	111258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241213
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2741	NC_009482	G	6	6	116035	116040	0 %	0 %	100 %	0 %	148241219
2742	NC_009482	CCA	2	6	116090	116095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241219
2743	NC_009482	ATC	2	6	116158	116163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241219
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2754	NC_009482	GCA	2	6	116712	116717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241220
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2860	NC_009482	TGAC	2	8	120753	120760	25 %	25 %	25 %	25 %	148241223
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2982	NC_009482	CAGG	2	8	125961	125968	25 %	0 %	50 %	25 %	148241229
2983	NC_009482	CAGA	2	8	125986	125993	50 %	0 %	25 %	25 %	148241229
2984	NC_009482	CGG	2	6	126030	126035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241229
2985	NC_009482	GCA	2	6	126081	126086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241229
2986	NC_009482	TGC	2	6	126120	126125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241229
2987	NC_009482	CCT	2	6	126204	126209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148241229
2988	NC_009482	CCCAG	2	10	126234	126243	20 %	0 %	20 %	60 %	148241229
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2990	NC_009482	TTG	2	6	126311	126316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241229
2991	NC_009482	TGG	3	9	126333	126341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241229
2992	NC_009482	TGA	2	6	126348	126353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241229
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2994	NC_009482	GCCA	2	8	126444	126451	25 %	0 %	25 %	50 %	148241229
2995	NC_009482	GTC	2	6	126523	126528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241229
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