MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. RCC307 chromosome

Total Repeats: 48987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_009482	CGC	2	6	84309	84314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241185
2003	NC_009482	GCGTTG	2	12	84368	84379	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	148241185
2004	NC_009482	TGC	2	6	84391	84396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241185
2005	NC_009482	TGA	2	6	84442	84447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241185
2006	NC_009482	CAGCG	2	10	84452	84461	20 %	0 %	40 %	40 %	148241185
2007	NC_009482	CGA	2	6	84472	84477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241185
2008	NC_009482	GGA	2	6	84511	84516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148241185
2009	NC_009482	TCA	2	6	84582	84587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241185
2010	NC_009482	GGT	2	6	84619	84624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241185
2011	NC_009482	TCG	2	6	84627	84632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241185
2012	NC_009482	AG	3	6	84703	84708	50 %	0 %	50 %	0 %	148241185
2013	NC_009482	CCAG	2	8	84718	84725	25 %	0 %	25 %	50 %	148241185
2014	NC_009482	AAACCC	2	12	84726	84737	50 %	0 %	0 %	50 %	148241185
2015	NC_009482	CTT	2	6	84760	84765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241185
2016	NC_009482	TGT	2	6	84768	84773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241185
2017	NC_009482	CTGG	2	8	84782	84789	0 %	25 %	50 %	25 %	148241185
2018	NC_009482	GAG	2	6	84812	84817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148241185
2019	NC_009482	CGT	2	6	84853	84858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241185
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2021	NC_009482	CCG	2	6	84880	84885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241185
2022	NC_009482	TGG	2	6	84891	84896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241185
2023	NC_009482	AAACGG	2	12	84909	84920	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	148241185
2024	NC_009482	GC	3	6	84928	84933	0 %	0 %	50 %	50 %	148241185
2025	NC_009482	CCG	2	6	84948	84953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241185
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2030	NC_009482	CCA	2	6	85137	85142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241185
2031	NC_009482	CAT	2	6	85165	85170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241185
2032	NC_009482	CGG	2	6	85174	85179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241185
2033	NC_009482	GC	3	6	85196	85201	0 %	0 %	50 %	50 %	148241185
2034	NC_009482	GCT	2	6	85219	85224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241185
2035	NC_009482	CAG	2	6	85285	85290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241185
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2041	NC_009482	CGC	2	6	85637	85642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241185
2042	NC_009482	GCC	2	6	85671	85676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241185
2043	NC_009482	GCA	2	6	85689	85694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241185
2044	NC_009482	CTT	2	6	85699	85704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241185
2045	NC_009482	CTG	2	6	85724	85729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241185
2046	NC_009482	TGG	2	6	85738	85743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241185
2047	NC_009482	TGGC	2	8	85752	85759	0 %	25 %	50 %	25 %	148241185
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2051	NC_009482	TAC	3	9	85853	85861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241185
2052	NC_009482	ACG	2	6	85887	85892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241185
2053	NC_009482	TGA	2	6	85896	85901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241185
2054	NC_009482	CAAC	2	8	85903	85910	50 %	0 %	0 %	50 %	148241185
2055	NC_009482	GC	3	6	85912	85917	0 %	0 %	50 %	50 %	148241185
2056	NC_009482	CGC	3	9	85931	85939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241185
2057	NC_009482	GAC	2	6	85997	86002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241185
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2246	NC_009482	TGG	2	6	94933	94938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241196
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2369	NC_009482	T	7	7	100384	100390	0 %	100 %	0 %	0 %	148241201
2370	NC_009482	A	7	7	100413	100419	100 %	0 %	0 %	0 %	148241201
2371	NC_009482	CCAGC	2	10	100441	100450	20 %	0 %	20 %	60 %	148241201
2372	NC_009482	T	8	8	100528	100535	0 %	100 %	0 %	0 %	148241201
2373	NC_009482	TGT	2	6	100537	100542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241201
2374	NC_009482	ATA	2	6	100562	100567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148241201
2375	NC_009482	ACT	2	6	100652	100657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241201
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2378	NC_009482	TCT	2	6	100769	100774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241201
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2489	NC_009482	CGT	3	9	105707	105715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241207
2490	NC_009482	CGC	3	9	105722	105730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241207
2491	NC_009482	CTC	2	6	105810	105815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148241207
2492	NC_009482	CGGT	2	8	105826	105833	0 %	25 %	50 %	25 %	148241207
2493	NC_009482	GAT	2	6	105858	105863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241207
2494	NC_009482	CAG	2	6	105867	105872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241207
2495	NC_009482	CAG	2	6	105893	105898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241207
2496	NC_009482	GCTT	2	8	105907	105914	0 %	50 %	25 %	25 %	148241207
2497	NC_009482	TCG	3	9	105946	105954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241207
2498	NC_009482	GCG	2	6	105960	105965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241207
2499	NC_009482	CAA	2	6	105989	105994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148241207
2500	NC_009482	CGT	2	6	106234	106239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241208

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