MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. RCC307 chromosome

Total Repeats: 48987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009482	GCG	2	6	41445	41450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241142
1002	NC_009482	CAC	2	6	41472	41477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241142
1003	NC_009482	A	6	6	41523	41528	100 %	0 %	0 %	0 %	148241143
1004	NC_009482	AAAG	2	8	41595	41602	75 %	0 %	25 %	0 %	148241143
1005	NC_009482	CT	3	6	41614	41619	0 %	50 %	0 %	50 %	148241143
1006	NC_009482	GTCCT	2	10	41638	41647	0 %	40 %	20 %	40 %	148241143
1007	NC_009482	AC	3	6	41649	41654	50 %	0 %	0 %	50 %	148241143
1008	NC_009482	TCG	2	6	41665	41670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241143
1009	NC_009482	TTG	2	6	41676	41681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241143
1010	NC_009482	CAG	2	6	41744	41749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241143
1011	NC_009482	GA	4	8	41948	41955	50 %	0 %	50 %	0 %	148241144
1012	NC_009482	AG	3	6	41984	41989	50 %	0 %	50 %	0 %	148241144
1013	NC_009482	ACG	2	6	42022	42027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241144
1014	NC_009482	GC	3	6	42104	42109	0 %	0 %	50 %	50 %	148241144
1015	NC_009482	CTTGC	2	10	42403	42412	0 %	40 %	20 %	40 %	148241145
1016	NC_009482	GTG	2	6	42437	42442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241145
1017	NC_009482	TTG	2	6	42446	42451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241145
1018	NC_009482	CCT	2	6	42468	42473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148241145
1019	NC_009482	GGC	2	6	42526	42531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241145
1020	NC_009482	GTT	2	6	42568	42573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241145
1021	NC_009482	GGCA	2	8	42714	42721	25 %	0 %	50 %	25 %	148241145
1022	NC_009482	CCA	2	6	42735	42740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241145
1023	NC_009482	CAG	2	6	42751	42756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241145
1024	NC_009482	GAC	2	6	42765	42770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241145
1025	NC_009482	GCG	2	6	42853	42858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241146
1026	NC_009482	GCA	2	6	42859	42864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241146
1027	NC_009482	GGC	2	6	42921	42926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241146
1028	NC_009482	CGG	2	6	42929	42934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241146
1029	NC_009482	CA	3	6	42952	42957	50 %	0 %	0 %	50 %	148241146
1030	NC_009482	GCC	2	6	43005	43010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241146
1031	NC_009482	CAG	2	6	43014	43019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241146
1032	NC_009482	CGG	2	6	43082	43087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241146
1033	NC_009482	CGG	2	6	43112	43117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241146
1034	NC_009482	GC	3	6	43138	43143	0 %	0 %	50 %	50 %	148241146
1035	NC_009482	GCG	2	6	43161	43166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241146
1036	NC_009482	G	7	7	43255	43261	0 %	0 %	100 %	0 %	148241146
1037	NC_009482	CGC	2	6	43281	43286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241146
1038	NC_009482	CCA	2	6	43484	43489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241146
1039	NC_009482	TGA	2	6	43544	43549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241146
1040	NC_009482	TGA	2	6	43664	43669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241146
1041	NC_009482	CGC	2	6	43751	43756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241146
1042	NC_009482	TGA	2	6	43769	43774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241146
1043	NC_009482	GCC	2	6	43789	43794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241146
1044	NC_009482	TTGGT	2	10	43828	43837	0 %	60 %	40 %	0 %	148241146
1045	NC_009482	GCT	2	6	43850	43855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241146
1046	NC_009482	GGT	2	6	43857	43862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241146
1047	NC_009482	TTG	2	6	43875	43880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241146
1048	NC_009482	GATGG	2	10	43902	43911	20 %	20 %	60 %	0 %	148241146
1049	NC_009482	ATC	2	6	43960	43965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241146
1050	NC_009482	TGGG	2	8	43991	43998	0 %	25 %	75 %	0 %	148241146
1051	NC_009482	G	6	6	43996	44001	0 %	0 %	100 %	0 %	148241146
1052	NC_009482	TGG	2	6	44014	44019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241146
1053	NC_009482	AGC	2	6	44036	44041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241147
1054	NC_009482	GGTGGC	2	12	44101	44112	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	148241147
1055	NC_009482	GCT	2	6	44173	44178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241147
1056	NC_009482	TGG	2	6	44379	44384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241147
1057	NC_009482	GAGGT	2	10	44388	44397	20 %	20 %	60 %	0 %	148241147
1058	NC_009482	CTG	2	6	44423	44428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241147
1059	NC_009482	GGT	2	6	44479	44484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241147
1060	NC_009482	GCC	2	6	44525	44530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241147
1061	NC_009482	GTG	2	6	44537	44542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241147
1062	NC_009482	GCG	2	6	44588	44593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241147
1063	NC_009482	GC	3	6	44632	44637	0 %	0 %	50 %	50 %	148241147
1064	NC_009482	GTTGGT	2	12	44662	44673	0 %	50 %	50 %	0 %	148241147
1065	NC_009482	ATTGG	2	10	44745	44754	20 %	40 %	40 %	0 %	148241147
1066	NC_009482	GCT	2	6	44758	44763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241147
1067	NC_009482	GCT	2	6	44794	44799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241147
1068	NC_009482	GTT	2	6	44800	44805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241147
1069	NC_009482	GGCG	2	8	44833	44840	0 %	0 %	75 %	25 %	148241147
1070	NC_009482	CACC	2	8	44851	44858	25 %	0 %	0 %	75 %	148241147
1071	NC_009482	ACC	3	9	44856	44864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241147
1072	NC_009482	CAG	2	6	44944	44949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241147
1073	NC_009482	CCA	2	6	44952	44957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241147
1074	NC_009482	GCT	2	6	44974	44979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241147
1075	NC_009482	AGC	2	6	45003	45008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241147
1076	NC_009482	GC	3	6	45043	45048	0 %	0 %	50 %	50 %	148241147
1077	NC_009482	CCA	2	6	45066	45071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241147
1078	NC_009482	GCT	2	6	45207	45212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241148
1079	NC_009482	GGAG	2	8	45224	45231	25 %	0 %	75 %	0 %	148241148
1080	NC_009482	GCC	2	6	45241	45246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241148
1081	NC_009482	TGG	2	6	45328	45333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241148
1082	NC_009482	CAC	3	9	45341	45349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241148
1083	NC_009482	CG	3	6	45376	45381	0 %	0 %	50 %	50 %	148241148
1084	NC_009482	ATC	2	6	45384	45389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241148
1085	NC_009482	GCG	2	6	45394	45399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241148
1086	NC_009482	GCA	2	6	45503	45508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241148
1087	NC_009482	TGTT	2	8	45562	45569	0 %	75 %	25 %	0 %	148241148
1088	NC_009482	CGA	2	6	45599	45604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241148
1089	NC_009482	CGA	2	6	45610	45615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241148
1090	NC_009482	ACA	2	6	45682	45687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148241148
1091	NC_009482	GCG	2	6	45696	45701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241148
1092	NC_009482	CAC	2	6	45708	45713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241148
1093	NC_009482	GGT	2	6	45749	45754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241148
1094	NC_009482	GT	3	6	45801	45806	0 %	50 %	50 %	0 %	148241148
1095	NC_009482	TGA	2	6	45842	45847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241148
1096	NC_009482	GC	3	6	45863	45868	0 %	0 %	50 %	50 %	148241148
1097	NC_009482	TGC	2	6	45889	45894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241148
1098	NC_009482	CTC	2	6	45917	45922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148241148
1099	NC_009482	TGC	2	6	45937	45942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241148
1100	NC_009482	TCA	2	6	46081	46086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241148
1101	NC_009482	CAT	2	6	46127	46132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241148
1102	NC_009482	ATTC	2	8	46142	46149	25 %	50 %	0 %	25 %	148241148
1103	NC_009482	CCA	2	6	46289	46294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241148
1104	NC_009482	GTGG	2	8	46299	46306	0 %	25 %	75 %	0 %	148241148
1105	NC_009482	TGG	2	6	46333	46338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241148
1106	NC_009482	CGTG	2	8	46508	46515	0 %	25 %	50 %	25 %	148241148
1107	NC_009482	GTTGC	2	10	46631	46640	0 %	40 %	40 %	20 %	148241148
1108	NC_009482	AATCG	2	10	46710	46719	40 %	20 %	20 %	20 %	148241148
1109	NC_009482	CGT	2	6	46745	46750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241148
1110	NC_009482	GCC	2	6	46769	46774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241148
1111	NC_009482	TTGA	2	8	46803	46810	25 %	50 %	25 %	0 %	148241149
1112	NC_009482	GGT	2	6	46821	46826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241149
1113	NC_009482	AG	3	6	46883	46888	50 %	0 %	50 %	0 %	148241149
1114	NC_009482	ACCG	2	8	46941	46948	25 %	0 %	25 %	50 %	148241149
1115	NC_009482	CGG	2	6	46998	47003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241149
1116	NC_009482	GGC	2	6	47065	47070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241149
1117	NC_009482	ACCG	2	8	47085	47092	25 %	0 %	25 %	50 %	148241149
1118	NC_009482	TCAAC	2	10	47111	47120	40 %	20 %	0 %	40 %	148241149
1119	NC_009482	GGT	2	6	47162	47167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241149
1120	NC_009482	TGA	2	6	47183	47188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241149
1121	NC_009482	GC	3	6	47192	47197	0 %	0 %	50 %	50 %	148241149
1122	NC_009482	GCT	2	6	47279	47284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241149
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1124	NC_009482	TGGG	2	8	47334	47341	0 %	25 %	75 %	0 %	148241149
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1126	NC_009482	GAA	2	6	47367	47372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148241149
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1249	NC_009482	GCA	2	6	52659	52664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241155
1250	NC_009482	CCA	2	6	52680	52685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241155
1251	NC_009482	CGG	2	6	52692	52697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241155
1252	NC_009482	ATCGG	2	10	52712	52721	20 %	20 %	40 %	20 %	148241155
1253	NC_009482	GCA	2	6	52722	52727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241155
1254	NC_009482	GCCA	2	8	52780	52787	25 %	0 %	25 %	50 %	148241155
1255	NC_009482	GCC	2	6	52790	52795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241155
1256	NC_009482	TCT	2	6	52829	52834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241155
1257	NC_009482	GGT	2	6	52837	52842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241155
1258	NC_009482	CGG	2	6	52848	52853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241155
1259	NC_009482	GCA	2	6	52860	52865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241155
1260	NC_009482	GCC	2	6	52900	52905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241155
1261	NC_009482	CTG	2	6	52978	52983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241155
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1263	NC_009482	TCA	2	6	53019	53024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241155
1264	NC_009482	CTG	2	6	53042	53047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241155
1265	NC_009482	GCG	2	6	53058	53063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241155
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1270	NC_009482	TGGC	2	8	53431	53438	0 %	25 %	50 %	25 %	148241156
1271	NC_009482	TGG	2	6	53497	53502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241156
1272	NC_009482	GCC	2	6	53562	53567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241156
1273	NC_009482	CTGCTC	2	12	53583	53594	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	148241156
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1276	NC_009482	GCC	2	6	53694	53699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241156
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1280	NC_009482	CTG	2	6	53967	53972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241157
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1283	NC_009482	GGC	2	6	54123	54128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241157
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1288	NC_009482	CTT	2	6	54386	54391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241158
1289	NC_009482	GAC	2	6	54463	54468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241158
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1300	NC_009482	GCTGGT	2	12	54977	54988	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	148241160
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1342	NC_009482	GCA	2	6	56901	56906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241161
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1360	NC_009482	GAC	2	6	57883	57888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241162
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1362	NC_009482	G	8	8	57976	57983	0 %	0 %	100 %	0 %	148241162
1363	NC_009482	GCC	2	6	58019	58024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241162
1364	NC_009482	TGG	3	9	58060	58068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241162
1365	NC_009482	GGC	2	6	58148	58153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241162
1366	NC_009482	CAC	2	6	58186	58191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241162
1367	NC_009482	GGC	2	6	58216	58221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241162
1368	NC_009482	CAG	2	6	58231	58236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241162
1369	NC_009482	AGGC	2	8	58237	58244	25 %	0 %	50 %	25 %	148241162
1370	NC_009482	CAC	2	6	58282	58287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241162
1371	NC_009482	TGC	2	6	58322	58327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241162
1372	NC_009482	CAG	2	6	58330	58335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241162
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1374	NC_009482	GGC	2	6	58402	58407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241162
1375	NC_009482	CGT	2	6	58444	58449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241162
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1378	NC_009482	GCTGGA	2	12	58526	58537	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148241162
1379	NC_009482	GCT	2	6	58541	58546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241162
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1497	NC_009482	CCA	2	6	62970	62975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241166
1498	NC_009482	CAG	2	6	62983	62988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241166
1499	NC_009482	GTT	2	6	63001	63006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241166
1500	NC_009482	GCT	2	6	63015	63020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241166

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