MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. RCC307 chromosome

Total Repeats: 48987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009482	GTC	2	6	20062	20067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241116
502	NC_009482	TGG	2	6	20082	20087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241116
503	NC_009482	GCT	2	6	20110	20115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241116
504	NC_009482	GGT	2	6	20135	20140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241116
505	NC_009482	CAG	2	6	20247	20252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241117
506	NC_009482	GATC	2	8	20253	20260	25 %	25 %	25 %	25 %	148241117
507	NC_009482	C	6	6	20269	20274	0 %	0 %	0 %	100 %	148241117
508	NC_009482	ACC	2	6	20275	20280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241117
509	NC_009482	GCA	2	6	20326	20331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241117
510	NC_009482	CGC	2	6	20381	20386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241117
511	NC_009482	TTC	2	6	20388	20393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241117
512	NC_009482	CAG	2	6	20400	20405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241117
513	NC_009482	GCG	2	6	20436	20441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241117
514	NC_009482	GCC	2	6	20463	20468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241117
515	NC_009482	CACG	2	8	20531	20538	25 %	0 %	25 %	50 %	148241117
516	NC_009482	CCAT	2	8	20659	20666	25 %	25 %	0 %	50 %	148241117
517	NC_009482	CGG	2	6	20671	20676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241117
518	NC_009482	TCA	2	6	20702	20707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241117
519	NC_009482	CAG	5	15	20712	20726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241117
520	NC_009482	CCG	2	6	20728	20733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241117
521	NC_009482	GCA	2	6	20759	20764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241117
522	NC_009482	GGCGAT	2	12	20874	20885	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148241117
523	NC_009482	CCT	2	6	20978	20983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148241117
524	NC_009482	CCG	2	6	20992	20997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241117
525	NC_009482	CCA	2	6	21011	21016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241117
526	NC_009482	GCG	2	6	21051	21056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241117
527	NC_009482	GAG	2	6	21073	21078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148241117
528	NC_009482	TGC	2	6	21136	21141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241117
529	NC_009482	TGC	2	6	21192	21197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241117
530	NC_009482	GCT	2	6	21279	21284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241117
531	NC_009482	CAG	2	6	21356	21361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241117
532	NC_009482	GCC	2	6	21506	21511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241118
533	NC_009482	CCA	2	6	21514	21519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241118
534	NC_009482	GC	3	6	21531	21536	0 %	0 %	50 %	50 %	148241118
535	NC_009482	GCC	2	6	21560	21565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241118
536	NC_009482	CGG	2	6	21690	21695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241118
537	NC_009482	CCA	2	6	21718	21723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241118
538	NC_009482	TTG	2	6	21755	21760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241118
539	NC_009482	CGG	2	6	21764	21769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241118
540	NC_009482	CCA	2	6	21778	21783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241118
541	NC_009482	GCT	2	6	21801	21806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241118
542	NC_009482	GCG	2	6	21849	21854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241118
543	NC_009482	CCA	2	6	21895	21900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241118
544	NC_009482	GGC	2	6	21926	21931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241118
545	NC_009482	GTTG	2	8	22054	22061	0 %	50 %	50 %	0 %	148241118
546	NC_009482	AGC	2	6	22071	22076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241118
547	NC_009482	GCC	2	6	22077	22082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241118
548	NC_009482	GTG	2	6	22086	22091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241118
549	NC_009482	CGCT	2	8	22140	22147	0 %	25 %	25 %	50 %	148241118
550	NC_009482	CAGG	2	8	22165	22172	25 %	0 %	50 %	25 %	148241118
551	NC_009482	TGC	3	9	22195	22203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241118
552	NC_009482	GCAG	2	8	22213	22220	25 %	0 %	50 %	25 %	148241118
553	NC_009482	GCT	2	6	22315	22320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241118
554	NC_009482	GTT	3	9	22328	22336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241118
555	NC_009482	GCG	2	6	22378	22383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241118
556	NC_009482	CATG	2	8	22387	22394	25 %	25 %	25 %	25 %	148241118
557	NC_009482	CAC	2	6	22405	22410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241118
558	NC_009482	GGC	2	6	22425	22430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241118
559	NC_009482	CGG	2	6	22435	22440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241118
560	NC_009482	CCA	2	6	22468	22473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241118
561	NC_009482	GCTC	2	8	22509	22516	0 %	25 %	25 %	50 %	148241118
562	NC_009482	CAG	2	6	22663	22668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241119
563	NC_009482	CCT	2	6	22680	22685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148241119
564	NC_009482	CAG	2	6	22729	22734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241119
565	NC_009482	GTT	2	6	22885	22890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241119
566	NC_009482	AGG	2	6	22894	22899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148241119
567	NC_009482	TGGC	2	8	22925	22932	0 %	25 %	50 %	25 %	148241119
568	NC_009482	CTT	2	6	22959	22964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241119
569	NC_009482	GGC	2	6	22980	22985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241119
570	NC_009482	GCA	2	6	23004	23009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241119
571	NC_009482	CAG	2	6	23044	23049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241119
572	NC_009482	CGT	2	6	23097	23102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241119
573	NC_009482	CG	3	6	23175	23180	0 %	0 %	50 %	50 %	148241119
574	NC_009482	CCAG	2	8	23282	23289	25 %	0 %	25 %	50 %	148241119
575	NC_009482	CAG	2	6	23350	23355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241119
576	NC_009482	GTG	2	6	23366	23371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241119
577	NC_009482	TGC	2	6	23421	23426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241119
578	NC_009482	TGA	2	6	23463	23468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241119
579	NC_009482	CAG	2	6	23503	23508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241119
580	NC_009482	GCA	2	6	23511	23516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241119
581	NC_009482	T	6	6	23520	23525	0 %	100 %	0 %	0 %	148241119
582	NC_009482	GCA	2	6	23541	23546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241119
583	NC_009482	CCG	2	6	23581	23586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241119
584	NC_009482	GGC	2	6	23610	23615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241119
585	NC_009482	GCA	2	6	23703	23708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241119
586	NC_009482	AGCCGC	2	12	23717	23728	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	148241119
587	NC_009482	GTCC	2	8	23736	23743	0 %	25 %	25 %	50 %	148241119
588	NC_009482	CTGGC	2	10	23768	23777	0 %	20 %	40 %	40 %	148241119
589	NC_009482	CCA	2	6	23850	23855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241119
590	NC_009482	CGG	5	15	23869	23883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241119
591	NC_009482	TCG	2	6	23903	23908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241119
592	NC_009482	GCT	2	6	23927	23932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241119
593	NC_009482	CCG	2	6	24034	24039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241120
594	NC_009482	CCT	2	6	24042	24047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148241120
595	NC_009482	CTCC	2	8	24058	24065	0 %	25 %	0 %	75 %	148241120
596	NC_009482	GGA	2	6	24083	24088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148241120
597	NC_009482	CAA	2	6	24093	24098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148241120
598	NC_009482	AGC	2	6	24121	24126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241120
599	NC_009482	GCT	2	6	24138	24143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241120
600	NC_009482	CTG	2	6	24163	24168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241120
601	NC_009482	GCT	2	6	24207	24212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241120
602	NC_009482	GCA	2	6	24349	24354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241120
603	NC_009482	CAG	2	6	24402	24407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241120
604	NC_009482	AGC	2	6	24466	24471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241120
605	NC_009482	TGG	2	6	24472	24477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241120
606	NC_009482	AGC	2	6	24487	24492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241120
607	NC_009482	TGC	2	6	24553	24558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241120
608	NC_009482	TGC	2	6	24634	24639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241120
609	NC_009482	CGG	2	6	24679	24684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241120
610	NC_009482	TAC	2	6	24725	24730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241121
611	NC_009482	GCT	2	6	24733	24738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241121
612	NC_009482	TGATGC	2	12	24751	24762	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	148241121
613	NC_009482	GC	3	6	24775	24780	0 %	0 %	50 %	50 %	148241121
614	NC_009482	ACC	2	6	24804	24809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241121
615	NC_009482	CAA	2	6	24817	24822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148241121
616	NC_009482	GAG	2	6	24836	24841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148241121
617	NC_009482	CGGC	2	8	24936	24943	0 %	0 %	50 %	50 %	148241121
618	NC_009482	GGC	2	6	24968	24973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241121
619	NC_009482	TTC	2	6	24995	25000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241121
620	NC_009482	GGC	2	6	25010	25015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241121
621	NC_009482	TGG	2	6	25021	25026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241121
622	NC_009482	CAACGG	2	12	25031	25042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241121
623	NC_009482	CGA	2	6	25057	25062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241121
624	NC_009482	GGC	2	6	25106	25111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241121
625	NC_009482	GCG	2	6	25164	25169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241121
626	NC_009482	AAG	2	6	25172	25177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148241121
627	NC_009482	GCA	2	6	25197	25202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241121
628	NC_009482	GGT	2	6	25208	25213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241121
629	NC_009482	GCA	2	6	25342	25347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241121
630	NC_009482	GCG	2	6	25413	25418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241121
631	NC_009482	CCG	2	6	25608	25613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241121
632	NC_009482	CGGTG	2	10	25624	25633	0 %	20 %	60 %	20 %	148241121
633	NC_009482	TCCCA	2	10	25778	25787	20 %	20 %	0 %	60 %	148241121
634	NC_009482	GGT	2	6	25796	25801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241121
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640	NC_009482	ATC	2	6	26039	26044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241122
641	NC_009482	ATC	2	6	26110	26115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241123
642	NC_009482	GTT	2	6	26135	26140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241123
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646	NC_009482	GATTG	2	10	26220	26229	20 %	40 %	40 %	0 %	148241123
647	NC_009482	CG	3	6	26235	26240	0 %	0 %	50 %	50 %	148241123
648	NC_009482	CGC	2	6	26262	26267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241123
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650	NC_009482	CAGC	2	8	26331	26338	25 %	0 %	25 %	50 %	148241123
651	NC_009482	CCG	2	6	26383	26388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241123
652	NC_009482	CAG	4	12	26436	26447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241123
653	NC_009482	TGG	2	6	26464	26469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241123
654	NC_009482	GCC	2	6	26497	26502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241123
655	NC_009482	CTG	2	6	26509	26514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241123
656	NC_009482	TG	3	6	26560	26565	0 %	50 %	50 %	0 %	148241123
657	NC_009482	AGC	2	6	26586	26591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241123
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665	NC_009482	CTT	2	6	27033	27038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241124
666	NC_009482	GTTG	2	8	27084	27091	0 %	50 %	50 %	0 %	148241124
667	NC_009482	GCT	2	6	27124	27129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241124
668	NC_009482	CTT	2	6	27156	27161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241124
669	NC_009482	CTG	2	6	27178	27183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241124
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702	NC_009482	CCA	2	6	28530	28535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241126
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723	NC_009482	GCCAG	2	10	29298	29307	20 %	0 %	40 %	40 %	148241126
724	NC_009482	CAC	2	6	29323	29328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241126
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742	NC_009482	GCGCC	2	10	30377	30386	0 %	0 %	40 %	60 %	148241127
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744	NC_009482	CAC	3	9	30413	30421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241127
745	NC_009482	TGC	2	6	30425	30430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241127
746	NC_009482	TGG	2	6	30514	30519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241127
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748	NC_009482	CAT	2	6	30605	30610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241127
749	NC_009482	GAC	2	6	30657	30662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241127
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751	NC_009482	TTG	2	6	30670	30675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241127
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