MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. RCC307 chromosome

Total Repeats: 48987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_009482	CTC	2	6	268089	268094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148241364
6002	NC_009482	TTCC	2	8	268099	268106	0 %	50 %	0 %	50 %	148241364
6003	NC_009482	TTC	2	6	268151	268156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241364
6004	NC_009482	CTG	2	6	268164	268169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241364
6005	NC_009482	GT	3	6	268170	268175	0 %	50 %	50 %	0 %	148241364
6006	NC_009482	ACCGGT	2	12	268187	268198	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148241364
6007	NC_009482	AAG	2	6	268229	268234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148241364
6008	NC_009482	AAG	2	6	268394	268399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148241364
6009	NC_009482	CAA	2	6	268435	268440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148241364
6010	NC_009482	AGCA	2	8	268541	268548	50 %	0 %	25 %	25 %	148241364
6011	NC_009482	CAG	2	6	268600	268605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241364
6012	NC_009482	CAG	2	6	268651	268656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241364
6013	NC_009482	GAT	2	6	268660	268665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241364
6014	NC_009482	CAA	2	6	268699	268704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148241364
6015	NC_009482	GGCT	2	8	268705	268712	0 %	25 %	50 %	25 %	148241364
6016	NC_009482	GGT	2	6	268721	268726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241364
6017	NC_009482	GCA	2	6	268770	268775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241364
6018	NC_009482	ACA	2	6	268818	268823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148241364
6019	NC_009482	GT	3	6	268839	268844	0 %	50 %	50 %	0 %	148241364
6020	NC_009482	ACG	2	6	268863	268868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241364
6021	NC_009482	AGA	2	6	268869	268874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148241364
6022	NC_009482	GGTCA	2	10	268886	268895	20 %	20 %	40 %	20 %	148241364
6023	NC_009482	GGC	2	6	268925	268930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241364
6024	NC_009482	CTTATT	2	12	269059	269070	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	148241365
6025	NC_009482	CG	3	6	269103	269108	0 %	0 %	50 %	50 %	148241365
6026	NC_009482	TTG	2	6	269140	269145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241365
6027	NC_009482	A	7	7	269170	269176	100 %	0 %	0 %	0 %	148241365
6028	NC_009482	TGC	2	6	269287	269292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241365
6029	NC_009482	TGC	2	6	269350	269355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241365
6030	NC_009482	AGC	2	6	269356	269361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241365
6031	NC_009482	GCT	2	6	269376	269381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241365
6032	NC_009482	GC	3	6	269409	269414	0 %	0 %	50 %	50 %	148241365
6033	NC_009482	CCAA	2	8	269437	269444	50 %	0 %	0 %	50 %	148241365
6034	NC_009482	TGG	2	6	269477	269482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241365
6035	NC_009482	TGC	2	6	269527	269532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241365
6036	NC_009482	CAT	2	6	269589	269594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241365
6037	NC_009482	AGTTG	2	10	269615	269624	20 %	40 %	40 %	0 %	148241365
6038	NC_009482	GAT	2	6	269754	269759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241365
6039	NC_009482	GCA	2	6	269780	269785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241365
6040	NC_009482	AGC	2	6	269866	269871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241365
6041	NC_009482	TCC	2	6	269888	269893	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148241365
6042	NC_009482	TGC	2	6	269957	269962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241365
6043	NC_009482	CTG	2	6	270000	270005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241365
6044	NC_009482	GCTT	2	8	270050	270057	0 %	50 %	25 %	25 %	148241365
6045	NC_009482	TGGC	2	8	270073	270080	0 %	25 %	50 %	25 %	148241365
6046	NC_009482	GCT	2	6	270116	270121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241365
6047	NC_009482	T	7	7	270167	270173	0 %	100 %	0 %	0 %	148241365
6048	NC_009482	CTG	2	6	270199	270204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241365
6049	NC_009482	CAG	2	6	270243	270248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241365
6050	NC_009482	CAT	2	6	270284	270289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241365
6051	NC_009482	TGA	2	6	270358	270363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241365
6052	NC_009482	TCG	2	6	270402	270407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241365
6053	NC_009482	ATCT	2	8	270416	270423	25 %	50 %	0 %	25 %	148241365
6054	NC_009482	GTT	2	6	270439	270444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241365
6055	NC_009482	T	6	6	270468	270473	0 %	100 %	0 %	0 %	148241365
6056	NC_009482	T	6	6	270506	270511	0 %	100 %	0 %	0 %	148241365
6057	NC_009482	GGC	2	6	270541	270546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241365
6058	NC_009482	GTGTTG	2	12	270577	270588	0 %	50 %	50 %	0 %	148241365
6059	NC_009482	GGC	2	6	270597	270602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241365
6060	NC_009482	TGG	2	6	270607	270612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241365
6061	NC_009482	ATCG	2	8	270625	270632	25 %	25 %	25 %	25 %	148241365
6062	NC_009482	TCA	2	6	270752	270757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241365
6063	NC_009482	GCC	2	6	270792	270797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241365
6064	NC_009482	GCA	2	6	270830	270835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241365
6065	NC_009482	GCT	2	6	270840	270845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241365
6066	NC_009482	CGCC	2	8	270868	270875	0 %	0 %	25 %	75 %	148241365
6067	NC_009482	CTG	2	6	270895	270900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241365
6068	NC_009482	AGC	2	6	270966	270971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241365
6069	NC_009482	AGCTG	2	10	271060	271069	20 %	20 %	40 %	20 %	148241365
6070	NC_009482	CAC	2	6	271100	271105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241366
6071	NC_009482	TTGG	2	8	271107	271114	0 %	50 %	50 %	0 %	148241366
6072	NC_009482	AGA	2	6	271151	271156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148241366
6073	NC_009482	TCG	2	6	271174	271179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241366
6074	NC_009482	GAT	2	6	271235	271240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241366
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6077	NC_009482	TGG	2	6	271330	271335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241366
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6079	NC_009482	TGC	2	6	271510	271515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241366
6080	NC_009482	GCC	2	6	271551	271556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241366
6081	NC_009482	ACC	2	6	271557	271562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241366
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6083	NC_009482	TGG	2	6	271606	271611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241366
6084	NC_009482	GGC	2	6	271626	271631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241366
6085	NC_009482	AGC	2	6	271660	271665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241366
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6087	NC_009482	CCGCA	2	10	271737	271746	20 %	0 %	20 %	60 %	148241366
6088	NC_009482	CCCT	2	8	271788	271795	0 %	25 %	0 %	75 %	148241366
6089	NC_009482	TGA	2	6	271799	271804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241366
6090	NC_009482	CGA	2	6	271817	271822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241366
6091	NC_009482	GCTC	2	8	271850	271857	0 %	25 %	25 %	50 %	148241366
6092	NC_009482	GGC	2	6	271892	271897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241366
6093	NC_009482	GGC	2	6	271901	271906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241366
6094	NC_009482	GTG	3	9	271953	271961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241366
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6096	NC_009482	CG	3	6	272093	272098	0 %	0 %	50 %	50 %	148241367
6097	NC_009482	AGC	2	6	272106	272111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241367
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6099	NC_009482	TGA	2	6	272140	272145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241367
6100	NC_009482	CGC	2	6	272170	272175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241367
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6102	NC_009482	AGCGC	2	10	272232	272241	20 %	0 %	40 %	40 %	148241367
6103	NC_009482	CCAGG	2	10	272254	272263	20 %	0 %	40 %	40 %	148241367
6104	NC_009482	CGC	3	9	272279	272287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241367
6105	NC_009482	ACG	2	6	272298	272303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241367
6106	NC_009482	GAC	2	6	272414	272419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241367
6107	NC_009482	CCATG	2	10	272496	272505	20 %	20 %	20 %	40 %	148241367
6108	NC_009482	TCA	2	6	272510	272515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241367
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6110	NC_009482	TGGAGC	2	12	272574	272585	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148241367
6111	NC_009482	GAT	2	6	272632	272637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241367
6112	NC_009482	GCCT	2	8	272645	272652	0 %	25 %	25 %	50 %	148241367
6113	NC_009482	GCG	2	6	272653	272658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241367
6114	NC_009482	ATCC	2	8	272701	272708	25 %	25 %	0 %	50 %	148241368
6115	NC_009482	GGA	2	6	272804	272809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148241368
6116	NC_009482	TGGCTT	2	12	272820	272831	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	148241368
6117	NC_009482	GCT	2	6	272836	272841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241368
6118	NC_009482	T	6	6	272878	272883	0 %	100 %	0 %	0 %	148241368
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6120	NC_009482	CTG	2	6	272978	272983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241369
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6239	NC_009482	TCGAT	2	10	277612	277621	20 %	40 %	20 %	20 %	148241374
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6354	NC_009482	GCAGC	2	10	282058	282067	20 %	0 %	40 %	40 %	148241379
6355	NC_009482	CAGC	2	8	282117	282124	25 %	0 %	25 %	50 %	148241379
6356	NC_009482	TCG	2	6	282137	282142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241379
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6361	NC_009482	CAG	2	6	282300	282305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241380
6362	NC_009482	GCG	2	6	282366	282371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241380
6363	NC_009482	GCTCA	2	10	282387	282396	20 %	20 %	20 %	40 %	148241380
6364	NC_009482	GCC	2	6	282412	282417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241380
6365	NC_009482	GCCA	2	8	282426	282433	25 %	0 %	25 %	50 %	148241380
6366	NC_009482	GCTC	2	8	282446	282453	0 %	25 %	25 %	50 %	148241380
6367	NC_009482	TGC	2	6	282487	282492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241380
6368	NC_009482	CGCC	2	8	282497	282504	0 %	0 %	25 %	75 %	148241380
6369	NC_009482	ACC	2	6	282505	282510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241380
6370	NC_009482	TCA	2	6	282547	282552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241380
6371	NC_009482	ATC	2	6	282592	282597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241380
6372	NC_009482	GCA	2	6	282668	282673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241381
6373	NC_009482	GAGCGT	2	12	282675	282686	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148241381
6374	NC_009482	AGC	2	6	282688	282693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241381
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6376	NC_009482	CGG	2	6	282722	282727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241381
6377	NC_009482	GC	3	6	282744	282749	0 %	0 %	50 %	50 %	148241381
6378	NC_009482	CGCC	2	8	282886	282893	0 %	0 %	25 %	75 %	148241381
6379	NC_009482	GGC	2	6	282954	282959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241382
6380	NC_009482	TGC	2	6	283049	283054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241382
6381	NC_009482	GCC	2	6	283144	283149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241382
6382	NC_009482	GC	3	6	283152	283157	0 %	0 %	50 %	50 %	148241382
6383	NC_009482	GTT	2	6	283164	283169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241382
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6385	NC_009482	CCGC	2	8	283205	283212	0 %	0 %	25 %	75 %	148241382
6386	NC_009482	GC	3	6	283256	283261	0 %	0 %	50 %	50 %	148241382
6387	NC_009482	GCT	2	6	283284	283289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241382
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6389	NC_009482	GGT	2	6	283327	283332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241382
6390	NC_009482	TGC	2	6	283343	283348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241382
6391	NC_009482	AGC	2	6	283382	283387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241382
6392	NC_009482	AGC	2	6	283403	283408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241382
6393	NC_009482	TGG	2	6	283418	283423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241382
6394	NC_009482	GCC	2	6	283456	283461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241382
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6399	NC_009482	CTG	2	6	283824	283829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241383
6400	NC_009482	GTC	2	6	283860	283865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241383
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6402	NC_009482	CTG	2	6	284004	284009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241383
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6434	NC_009482	GGT	2	6	285028	285033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241384
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6440	NC_009482	GGT	2	6	285178	285183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241384
6441	NC_009482	GGCC	2	8	285199	285206	0 %	0 %	50 %	50 %	148241384
6442	NC_009482	AGC	2	6	285219	285224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241384
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6448	NC_009482	GGT	2	6	285353	285358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241384
6449	NC_009482	GCA	3	9	285363	285371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241384
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6453	NC_009482	CTG	2	6	285518	285523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241384
6454	NC_009482	AGC	2	6	285525	285530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241384
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6456	NC_009482	GCAGC	2	10	285554	285563	20 %	0 %	40 %	40 %	148241384
6457	NC_009482	CAG	2	6	285574	285579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241384
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6459	NC_009482	TCAG	2	8	285593	285600	25 %	25 %	25 %	25 %	148241385
6460	NC_009482	TGCTGG	2	12	285620	285631	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	148241385
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6463	NC_009482	GCGCC	2	10	285789	285798	0 %	0 %	40 %	60 %	148241385
6464	NC_009482	CAG	2	6	285868	285873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241385
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6467	NC_009482	TGG	2	6	285926	285931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241385
6468	NC_009482	CTG	2	6	285962	285967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241385
6469	NC_009482	GCG	2	6	286008	286013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241385
6470	NC_009482	GGC	2	6	286018	286023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241385
6471	NC_009482	CGCT	2	8	286082	286089	0 %	25 %	25 %	50 %	148241385
6472	NC_009482	TGGC	2	8	286095	286102	0 %	25 %	50 %	25 %	148241385
6473	NC_009482	CTT	2	6	286133	286138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241386
6474	NC_009482	CAG	2	6	286212	286217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241386
6475	NC_009482	AGGCG	2	10	286251	286260	20 %	0 %	60 %	20 %	148241386
6476	NC_009482	GGGCAT	2	12	286328	286339	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148241386
6477	NC_009482	GGC	2	6	286351	286356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241386
6478	NC_009482	GC	3	6	286376	286381	0 %	0 %	50 %	50 %	148241386
6479	NC_009482	CAG	2	6	286416	286421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241386
6480	NC_009482	CAC	2	6	286428	286433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241386
6481	NC_009482	TCT	2	6	286448	286453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241386
6482	NC_009482	ATG	2	6	286525	286530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241386
6483	NC_009482	CAG	2	6	286573	286578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241386
6484	NC_009482	AGCC	2	8	286629	286636	25 %	0 %	25 %	50 %	148241386
6485	NC_009482	CGCTGC	2	12	286640	286651	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	148241386
6486	NC_009482	TCA	2	6	286667	286672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241386
6487	NC_009482	CACAGG	2	12	286674	286685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241386
6488	NC_009482	GGCC	2	8	286703	286710	0 %	0 %	50 %	50 %	148241386
6489	NC_009482	TTC	2	6	286722	286727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241386
6490	NC_009482	GCA	2	6	286793	286798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241386
6491	NC_009482	GCC	2	6	286806	286811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241386
6492	NC_009482	GGT	2	6	286875	286880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241386
6493	NC_009482	ATTC	2	8	286887	286894	25 %	50 %	0 %	25 %	148241386
6494	NC_009482	TCA	2	6	286914	286919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241387
6495	NC_009482	TGC	2	6	286957	286962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241387
6496	NC_009482	C	6	6	286982	286987	0 %	0 %	0 %	100 %	148241387
6497	NC_009482	GCA	2	6	286999	287004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241387
6498	NC_009482	GCC	2	6	287007	287012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241387
6499	NC_009482	GCTG	2	8	287018	287025	0 %	25 %	50 %	25 %	148241387
6500	NC_009482	CACC	2	8	287035	287042	25 %	0 %	0 %	75 %	148241387

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