MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. RCC307 chromosome

Total Repeats: 48987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_009482	GCTT	2	8	246660	246667	0 %	50 %	25 %	25 %	148241347
5502	NC_009482	CGG	3	9	246670	246678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241347
5503	NC_009482	TCA	2	6	246705	246710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241347
5504	NC_009482	GC	3	6	246719	246724	0 %	0 %	50 %	50 %	148241347
5505	NC_009482	TCA	2	6	246857	246862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241348
5506	NC_009482	TGGC	2	8	246893	246900	0 %	25 %	50 %	25 %	148241348
5507	NC_009482	TGC	2	6	246901	246906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241348
5508	NC_009482	TGC	3	9	246945	246953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241348
5509	NC_009482	CAG	3	9	246985	246993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241348
5510	NC_009482	GCC	2	6	246997	247002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241348
5511	NC_009482	GCG	2	6	247033	247038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241348
5512	NC_009482	CGG	2	6	247076	247081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241348
5513	NC_009482	CAGCT	2	10	247090	247099	20 %	20 %	20 %	40 %	148241348
5514	NC_009482	AGC	2	6	247112	247117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241348
5515	NC_009482	CAG	2	6	247144	247149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241348
5516	NC_009482	ACC	2	6	247175	247180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241348
5517	NC_009482	CCA	2	6	247248	247253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241348
5518	NC_009482	GGGT	2	8	247259	247266	0 %	25 %	75 %	0 %	148241348
5519	NC_009482	TTC	3	9	247294	247302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241348
5520	NC_009482	AGCACC	2	12	247427	247438	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	148241348
5521	NC_009482	TGG	2	6	247455	247460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241348
5522	NC_009482	GCC	2	6	247500	247505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241348
5523	NC_009482	TGC	2	6	247519	247524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241348
5524	NC_009482	CTGGC	2	10	247607	247616	0 %	20 %	40 %	40 %	148241348
5525	NC_009482	GCG	2	6	247621	247626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241348
5526	NC_009482	TGG	2	6	247632	247637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241348
5527	NC_009482	GCC	2	6	247739	247744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241348
5528	NC_009482	GAA	2	6	247765	247770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148241348
5529	NC_009482	TTC	2	6	247789	247794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241348
5530	NC_009482	CGC	2	6	247839	247844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241348
5531	NC_009482	GCC	2	6	247894	247899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241348
5532	NC_009482	GCG	2	6	247975	247980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241348
5533	NC_009482	CGG	2	6	248009	248014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241348
5534	NC_009482	GGCCGC	2	12	248015	248026	0 %	0 %	50 %	50 %	148241348
5535	NC_009482	CCA	2	6	248198	248203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241349
5536	NC_009482	CGC	2	6	248258	248263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241349
5537	NC_009482	CAG	2	6	248292	248297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241349
5538	NC_009482	CAG	2	6	248301	248306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241349
5539	NC_009482	ATTCC	2	10	248312	248321	20 %	40 %	0 %	40 %	148241349
5540	NC_009482	TTG	2	6	248362	248367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241349
5541	NC_009482	GCC	3	9	248418	248426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241349
5542	NC_009482	GC	3	6	248463	248468	0 %	0 %	50 %	50 %	148241349
5543	NC_009482	ACG	2	6	248497	248502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241349
5544	NC_009482	CAT	2	6	248631	248636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241349
5545	NC_009482	CAC	2	6	248646	248651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241349
5546	NC_009482	GCC	2	6	248701	248706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241349
5547	NC_009482	ACG	2	6	248710	248715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241349
5548	NC_009482	ATC	2	6	248725	248730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241349
5549	NC_009482	CCG	2	6	248751	248756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241349
5550	NC_009482	CCA	2	6	248774	248779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241349
5551	NC_009482	GCA	2	6	248812	248817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241349
5552	NC_009482	CAC	2	6	248931	248936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241350
5553	NC_009482	T	6	6	248974	248979	0 %	100 %	0 %	0 %	148241350
5554	NC_009482	TCC	2	6	248989	248994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148241350
5555	NC_009482	TGG	2	6	249014	249019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241350
5556	NC_009482	TCC	2	6	249033	249038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148241350
5557	NC_009482	GCC	3	9	249053	249061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241350
5558	NC_009482	GCGCC	2	10	249085	249094	0 %	0 %	40 %	60 %	148241350
5559	NC_009482	GCT	2	6	249109	249114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241350
5560	NC_009482	GGC	2	6	249178	249183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241350
5561	NC_009482	GCTGGT	2	12	249198	249209	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	148241350
5562	NC_009482	GGT	2	6	249211	249216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241350
5563	NC_009482	CTG	3	9	249241	249249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241350
5564	NC_009482	GCA	2	6	249256	249261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241350
5565	NC_009482	GGA	2	6	249300	249305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148241350
5566	NC_009482	CAG	2	6	249313	249318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241350
5567	NC_009482	GCT	2	6	249346	249351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241350
5568	NC_009482	GCT	2	6	249375	249380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241350
5569	NC_009482	TGG	2	6	249569	249574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241350
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5571	NC_009482	GCCA	2	8	249664	249671	25 %	0 %	25 %	50 %	148241350
5572	NC_009482	TGC	2	6	249677	249682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241350
5573	NC_009482	CTG	2	6	249748	249753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241350
5574	NC_009482	TGG	3	9	249845	249853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241350
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5577	NC_009482	TGGCGG	2	12	249995	250006	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	148241350
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5579	NC_009482	CGG	2	6	250052	250057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241350
5580	NC_009482	TGG	2	6	250058	250063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241350
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5582	NC_009482	TGG	2	6	250103	250108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241350
5583	NC_009482	AAG	2	6	250166	250171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148241350
5584	NC_009482	CCGC	2	8	250172	250179	0 %	0 %	25 %	75 %	148241350
5585	NC_009482	CGC	2	6	250189	250194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241350
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5591	NC_009482	TGG	2	6	250478	250483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241351
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5601	NC_009482	GC	3	6	250940	250945	0 %	0 %	50 %	50 %	148241352
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5603	NC_009482	CGG	2	6	251020	251025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241352
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5605	NC_009482	GCA	2	6	251102	251107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241352
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5608	NC_009482	GCT	2	6	251134	251139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241352
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5614	NC_009482	GGCC	2	8	251255	251262	0 %	0 %	50 %	50 %	148241352
5615	NC_009482	GCCG	2	8	251266	251273	0 %	0 %	50 %	50 %	148241352
5616	NC_009482	TGG	2	6	251329	251334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241352
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5619	NC_009482	TGC	2	6	251440	251445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241352
5620	NC_009482	GCCCGC	2	12	251463	251474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241352
5621	NC_009482	CGC	3	9	251472	251480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241352
5622	NC_009482	GCGCT	2	10	251485	251494	0 %	20 %	40 %	40 %	148241352
5623	NC_009482	GGA	2	6	251495	251500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148241352
5624	NC_009482	TGC	2	6	251533	251538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241352
5625	NC_009482	GCA	2	6	251557	251562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241352
5626	NC_009482	GTGG	2	8	251568	251575	0 %	25 %	75 %	0 %	148241352
5627	NC_009482	ATC	2	6	251590	251595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241352
5628	NC_009482	GTG	2	6	251634	251639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241352
5629	NC_009482	GTG	2	6	251707	251712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241352
5630	NC_009482	TGG	2	6	251809	251814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241352
5631	NC_009482	GGGC	2	8	251863	251870	0 %	0 %	75 %	25 %	148241352
5632	NC_009482	TGG	2	6	251919	251924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241352
5633	NC_009482	CTG	2	6	251925	251930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241352
5634	NC_009482	ATGGC	2	10	251959	251968	20 %	20 %	40 %	20 %	148241352
5635	NC_009482	TGCTG	2	10	252044	252053	0 %	40 %	40 %	20 %	148241352
5636	NC_009482	GTG	2	6	252054	252059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241352
5637	NC_009482	GCCGC	2	10	252115	252124	0 %	0 %	40 %	60 %	148241352
5638	NC_009482	CTG	2	6	252135	252140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241352
5639	NC_009482	CGG	2	6	252146	252151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241352
5640	NC_009482	GCT	2	6	252168	252173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241352
5641	NC_009482	CGGC	2	8	252218	252225	0 %	0 %	50 %	50 %	148241352
5642	NC_009482	CTG	2	6	252228	252233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241352
5643	NC_009482	TGC	2	6	252277	252282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241352
5644	NC_009482	ACC	2	6	252306	252311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241352
5645	NC_009482	GCT	2	6	252332	252337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241352
5646	NC_009482	GCA	4	12	252376	252387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241352
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5649	NC_009482	TGCC	2	8	252487	252494	0 %	25 %	25 %	50 %	148241352
5650	NC_009482	GCA	4	12	252509	252520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241352
5651	NC_009482	CTTGGC	2	12	252644	252655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241352
5652	NC_009482	TGG	2	6	252793	252798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241352
5653	NC_009482	GGC	3	9	252827	252835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241352
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5655	NC_009482	TTGGCC	2	12	252933	252944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241352
5656	NC_009482	CTG	2	6	252999	253004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241352
5657	NC_009482	TGC	3	9	253027	253035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241352
5658	NC_009482	CTC	2	6	253057	253062	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148241352
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5660	NC_009482	TGC	2	6	253120	253125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241352
5661	NC_009482	GC	3	6	253124	253129	0 %	0 %	50 %	50 %	148241352
5662	NC_009482	GCCA	2	8	253216	253223	25 %	0 %	25 %	50 %	148241353
5663	NC_009482	GC	3	6	253242	253247	0 %	0 %	50 %	50 %	148241353
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5671	NC_009482	GCT	2	6	253412	253417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241353
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5678	NC_009482	CAG	2	6	253727	253732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241353
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5684	NC_009482	CAG	2	6	253843	253848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241354
5685	NC_009482	CCG	2	6	253908	253913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241354
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5703	NC_009482	TCA	2	6	254747	254752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241355
5704	NC_009482	AGCC	2	8	254801	254808	25 %	0 %	25 %	50 %	148241355
5705	NC_009482	TGA	2	6	254822	254827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241355
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5708	NC_009482	GCA	2	6	254981	254986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241355
5709	NC_009482	TGCT	2	8	255088	255095	0 %	50 %	25 %	25 %	148241355
5710	NC_009482	GCG	2	6	255101	255106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241355
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5714	NC_009482	TTC	2	6	255150	255155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241355
5715	NC_009482	CAGTG	2	10	255228	255237	20 %	20 %	40 %	20 %	148241355
5716	NC_009482	GCGGT	2	10	255259	255268	0 %	20 %	60 %	20 %	148241355
5717	NC_009482	GCA	2	6	255314	255319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241355
5718	NC_009482	TGCAA	2	10	255352	255361	40 %	20 %	20 %	20 %	148241355
5719	NC_009482	GTC	2	6	255450	255455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241355
5720	NC_009482	ACCT	2	8	255815	255822	25 %	25 %	0 %	50 %	148241356
5721	NC_009482	GCTCC	2	10	255870	255879	0 %	20 %	20 %	60 %	148241356
5722	NC_009482	CGC	2	6	255900	255905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241356
5723	NC_009482	GGTG	2	8	255951	255958	0 %	25 %	75 %	0 %	148241356
5724	NC_009482	CAG	2	6	256030	256035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241356
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5727	NC_009482	GATC	2	8	256176	256183	25 %	25 %	25 %	25 %	148241356
5728	NC_009482	GCC	2	6	256184	256189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241356
5729	NC_009482	TTC	2	6	256204	256209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241356
5730	NC_009482	AGC	2	6	256250	256255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241356
5731	NC_009482	CGC	2	6	256308	256313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241356
5732	NC_009482	GCA	2	6	256344	256349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241356
5733	NC_009482	GCC	2	6	256372	256377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241356
5734	NC_009482	GGCCAG	2	12	256392	256403	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	148241356
5735	NC_009482	GCC	2	6	256494	256499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241357
5736	NC_009482	TGC	2	6	256520	256525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241357
5737	NC_009482	CTG	2	6	256573	256578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241357
5738	NC_009482	GCAG	2	8	256580	256587	25 %	0 %	50 %	25 %	148241357
5739	NC_009482	CGCAG	2	10	256610	256619	20 %	0 %	40 %	40 %	148241357
5740	NC_009482	GCTCA	2	10	256734	256743	20 %	20 %	20 %	40 %	148241357
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5855	NC_009482	CCAGAT	2	12	261406	261417	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	148241361
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5858	NC_009482	CGC	2	6	261499	261504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241361
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5861	NC_009482	GTC	3	9	261629	261637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241361
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5977	NC_009482	CCT	2	6	266925	266930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148241364
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5979	NC_009482	CGA	2	6	267060	267065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241364
5980	NC_009482	CCA	2	6	267087	267092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241364
5981	NC_009482	TTCC	2	8	267250	267257	0 %	50 %	0 %	50 %	148241364
5982	NC_009482	CTT	2	6	267271	267276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241364
5983	NC_009482	CAA	2	6	267403	267408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148241364
5984	NC_009482	CGT	2	6	267413	267418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241364
5985	NC_009482	ACT	2	6	267432	267437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241364
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5988	NC_009482	GCT	2	6	267575	267580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241364
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5995	NC_009482	GCT	2	6	267797	267802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241364
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