MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. RCC307 chromosome

Total Repeats: 48987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_009482	CTA	2	6	202654	202659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241299
4502	NC_009482	GGT	2	6	202660	202665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241299
4503	NC_009482	GA	3	6	202674	202679	50 %	0 %	50 %	0 %	148241299
4504	NC_009482	TTA	2	6	202773	202778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148241299
4505	NC_009482	ATT	2	6	202803	202808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148241299
4506	NC_009482	CTT	5	15	202884	202898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241299
4507	NC_009482	ATT	2	6	202980	202985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148241299
4508	NC_009482	TCA	2	6	202986	202991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241299
4509	NC_009482	TCG	2	6	203131	203136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241299
4510	NC_009482	AT	3	6	203164	203169	50 %	50 %	0 %	0 %	148241299
4511	NC_009482	TC	3	6	203189	203194	0 %	50 %	0 %	50 %	148241299
4512	NC_009482	CAA	2	6	203209	203214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148241299
4513	NC_009482	ACA	2	6	203223	203228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148241299
4514	NC_009482	ATCTT	2	10	203263	203272	20 %	60 %	0 %	20 %	148241299
4515	NC_009482	T	6	6	203288	203293	0 %	100 %	0 %	0 %	148241299
4516	NC_009482	CACTC	2	10	203320	203329	20 %	20 %	0 %	60 %	148241299
4517	NC_009482	CAT	2	6	203338	203343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241299
4518	NC_009482	A	6	6	203345	203350	100 %	0 %	0 %	0 %	148241299
4519	NC_009482	T	8	8	203401	203408	0 %	100 %	0 %	0 %	148241299
4520	NC_009482	CTT	2	6	203442	203447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241299
4521	NC_009482	TAG	2	6	203468	203473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241299
4522	NC_009482	CTT	2	6	203488	203493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241299
4523	NC_009482	AAT	2	6	203508	203513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148241299
4524	NC_009482	ATT	2	6	203578	203583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148241299
4525	NC_009482	TA	5	10	203718	203727	50 %	50 %	0 %	0 %	148241299
4526	NC_009482	TC	4	8	203828	203835	0 %	50 %	0 %	50 %	148241299
4527	NC_009482	TCCTT	2	10	204062	204071	0 %	60 %	0 %	40 %	148241300
4528	NC_009482	TCA	2	6	204080	204085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241300
4529	NC_009482	TGATT	2	10	204095	204104	20 %	60 %	20 %	0 %	148241300
4530	NC_009482	GCA	2	6	204112	204117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241300
4531	NC_009482	CGT	2	6	204120	204125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241300
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4533	NC_009482	A	6	6	204195	204200	100 %	0 %	0 %	0 %	148241300
4534	NC_009482	TGG	2	6	204230	204235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241300
4535	NC_009482	TTA	2	6	204244	204249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148241300
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4538	NC_009482	CTT	2	6	204387	204392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241300
4539	NC_009482	ATTT	2	8	204415	204422	25 %	75 %	0 %	0 %	148241300
4540	NC_009482	TC	3	6	204524	204529	0 %	50 %	0 %	50 %	148241300
4541	NC_009482	ATT	2	6	204548	204553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148241300
4542	NC_009482	T	6	6	204587	204592	0 %	100 %	0 %	0 %	148241300
4543	NC_009482	AAG	2	6	204640	204645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148241300
4544	NC_009482	TCT	2	6	204659	204664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241300
4545	NC_009482	GTG	2	6	204724	204729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241300
4546	NC_009482	AT	3	6	204789	204794	50 %	50 %	0 %	0 %	148241300
4547	NC_009482	TGA	2	6	204811	204816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241300
4548	NC_009482	T	6	6	204819	204824	0 %	100 %	0 %	0 %	148241300
4549	NC_009482	TGT	2	6	204857	204862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241301
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4551	NC_009482	CTT	2	6	204926	204931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241301
4552	NC_009482	GT	3	6	204933	204938	0 %	50 %	50 %	0 %	148241301
4553	NC_009482	CTTT	2	8	204961	204968	0 %	75 %	0 %	25 %	148241301
4554	NC_009482	CTG	2	6	204993	204998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241301
4555	NC_009482	TA	3	6	205019	205024	50 %	50 %	0 %	0 %	148241301
4556	NC_009482	T	7	7	205025	205031	0 %	100 %	0 %	0 %	148241301
4557	NC_009482	A	6	6	205073	205078	100 %	0 %	0 %	0 %	148241301
4558	NC_009482	CTG	2	6	205092	205097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241301
4559	NC_009482	AT	3	6	205188	205193	50 %	50 %	0 %	0 %	148241301
4560	NC_009482	TGA	3	9	205194	205202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241301
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4563	NC_009482	TAT	2	6	205303	205308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148241301
4564	NC_009482	TAT	2	6	205370	205375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148241301
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4569	NC_009482	T	6	6	205588	205593	0 %	100 %	0 %	0 %	148241301
4570	NC_009482	TTC	2	6	205632	205637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241302
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4572	NC_009482	TCT	2	6	205675	205680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241302
4573	NC_009482	TA	3	6	205681	205686	50 %	50 %	0 %	0 %	148241302
4574	NC_009482	A	7	7	205701	205707	100 %	0 %	0 %	0 %	148241302
4575	NC_009482	TGTT	2	8	205723	205730	0 %	75 %	25 %	0 %	148241302
4576	NC_009482	TAC	2	6	205763	205768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241302
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4578	NC_009482	ATT	2	6	205782	205787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148241302
4579	NC_009482	CAT	4	12	205831	205842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241302
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4585	NC_009482	GAC	3	9	206362	206370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241302
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4587	NC_009482	ACTC	2	8	206458	206465	25 %	25 %	0 %	50 %	148241302
4588	NC_009482	AT	3	6	206506	206511	50 %	50 %	0 %	0 %	148241302
4589	NC_009482	CCT	2	6	206512	206517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148241302
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4591	NC_009482	CTC	2	6	206535	206540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148241302
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4594	NC_009482	TGG	2	6	207400	207405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241303
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4603	NC_009482	CTG	2	6	207761	207766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241303
4604	NC_009482	GCC	2	6	207767	207772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241303
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4607	NC_009482	GAG	3	9	207911	207919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148241303
4608	NC_009482	TCC	2	6	207921	207926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148241303
4609	NC_009482	GCT	2	6	207976	207981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241303
4610	NC_009482	CTA	2	6	207988	207993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241303
4611	NC_009482	CAA	2	6	207994	207999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148241303
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4613	NC_009482	ACG	2	6	208101	208106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241303
4614	NC_009482	CTT	2	6	208132	208137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241303
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4618	NC_009482	GC	3	6	208344	208349	0 %	0 %	50 %	50 %	148241303
4619	NC_009482	CAA	2	6	208354	208359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148241303
4620	NC_009482	GCT	2	6	208413	208418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241303
4621	NC_009482	GAT	2	6	208451	208456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241303
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4623	NC_009482	TGG	2	6	208473	208478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241303
4624	NC_009482	ATT	2	6	208653	208658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148241304
4625	NC_009482	TTG	2	6	208741	208746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241304
4626	NC_009482	AATCA	2	10	208828	208837	60 %	20 %	0 %	20 %	148241304
4627	NC_009482	TCT	2	6	208845	208850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241304
4628	NC_009482	TTC	2	6	208877	208882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241304
4629	NC_009482	TGA	2	6	208907	208912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241304
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4640	NC_009482	TTC	2	6	209579	209584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241305
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4644	NC_009482	ATTG	2	8	209924	209931	25 %	50 %	25 %	0 %	148241305
4645	NC_009482	CCTT	2	8	210010	210017	0 %	50 %	0 %	50 %	148241305
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4654	NC_009482	CAA	2	6	210391	210396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148241305
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4712	NC_009482	ACG	2	6	212820	212825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241312
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4732	NC_009482	GC	3	6	213796	213801	0 %	0 %	50 %	50 %	148241313
4733	NC_009482	CAA	2	6	213809	213814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148241313
4734	NC_009482	TC	3	6	213840	213845	0 %	50 %	0 %	50 %	148241313
4735	NC_009482	CT	3	6	213953	213958	0 %	50 %	0 %	50 %	148241314
4736	NC_009482	ACC	2	6	214007	214012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241314
4737	NC_009482	TGG	2	6	214055	214060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241314
4738	NC_009482	ACC	2	6	214148	214153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241314
4739	NC_009482	CCCCA	2	10	214324	214333	20 %	0 %	0 %	80 %	148241314
4740	NC_009482	CTG	2	6	214339	214344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241314
4741	NC_009482	GGTT	2	8	214359	214366	0 %	50 %	50 %	0 %	148241314
4742	NC_009482	TTTG	2	8	214443	214450	0 %	75 %	25 %	0 %	148241315
4743	NC_009482	GTT	2	6	214533	214538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241315
4744	NC_009482	CTTG	2	8	214578	214585	0 %	50 %	25 %	25 %	148241315
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4746	NC_009482	GTA	2	6	214630	214635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241315
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4748	NC_009482	GTT	2	6	214692	214697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241315
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4859	NC_009482	GGGTT	2	10	219138	219147	0 %	40 %	60 %	0 %	148241319
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4868	NC_009482	CTG	2	6	219530	219535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241319
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4987	NC_009482	CGC	2	6	224311	224316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241322
4988	NC_009482	GGGC	2	8	224336	224343	0 %	0 %	75 %	25 %	148241322
4989	NC_009482	TCA	2	6	224362	224367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241322
4990	NC_009482	GGT	2	6	224372	224377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241322
4991	NC_009482	GCT	2	6	224378	224383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241322
4992	NC_009482	CAG	2	6	224415	224420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241322
4993	NC_009482	GCA	2	6	224423	224428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241322
4994	NC_009482	GCT	2	6	224439	224444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241322
4995	NC_009482	TGC	2	6	224572	224577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241322
4996	NC_009482	GGC	2	6	224585	224590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241322
4997	NC_009482	GCC	2	6	224609	224614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241322
4998	NC_009482	GAG	2	6	224667	224672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148241322
4999	NC_009482	CCG	2	6	224673	224678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241322
5000	NC_009482	AGC	2	6	224683	224688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241322

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