MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Synechococcus sp. WH 7803 chromosome

Total Repeats: 1645

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009481	CGTCC	2	10	238	247	0 %	20 %	20 %	60 %	148238337
2	NC_009481	CGGGA	2	10	2805	2814	20 %	0 %	60 %	20 %	148238339
3	NC_009481	GGCCT	2	10	3918	3927	0 %	20 %	40 %	40 %	148238339
4	NC_009481	ACCCC	2	10	5247	5256	20 %	0 %	0 %	80 %	148238340
5	NC_009481	GCGTT	2	10	8788	8797	0 %	40 %	40 %	20 %	148238342
6	NC_009481	CCAGC	3	15	9966	9980	20 %	0 %	20 %	60 %	148238343
7	NC_009481	CTCGG	2	10	10359	10368	0 %	20 %	40 %	40 %	148238343
8	NC_009481	TCGCG	2	10	10668	10677	0 %	20 %	40 %	40 %	148238344
9	NC_009481	GTCCA	2	10	11175	11184	20 %	20 %	20 %	40 %	148238345
10	NC_009481	TGCGC	2	10	14259	14268	0 %	20 %	40 %	40 %	148238348
11	NC_009481	GGTTC	2	10	14465	14474	0 %	40 %	40 %	20 %	148238348
12	NC_009481	TCAGC	2	10	14724	14733	20 %	20 %	20 %	40 %	148238348
13	NC_009481	GTGAT	2	10	14915	14924	20 %	40 %	40 %	0 %	148238348
14	NC_009481	TCGTT	2	10	15414	15423	0 %	60 %	20 %	20 %	148238348
15	NC_009481	GTGTG	2	10	15715	15724	0 %	40 %	60 %	0 %	148238349
16	NC_009481	CGCTG	2	10	17784	17793	0 %	20 %	40 %	40 %	148238351
17	NC_009481	TGATC	2	10	19306	19315	20 %	40 %	20 %	20 %	148238352
18	NC_009481	GCTGG	2	10	20093	20102	0 %	20 %	60 %	20 %	148238353
19	NC_009481	GGTGA	2	10	20372	20381	20 %	20 %	60 %	0 %	148238353
20	NC_009481	AGGAG	2	10	21021	21030	40 %	0 %	60 %	0 %	148238354
21	NC_009481	GGTGT	2	10	21038	21047	0 %	40 %	60 %	0 %	148238354
22	NC_009481	CGTGC	2	10	21188	21197	0 %	20 %	40 %	40 %	148238354
23	NC_009481	CGTGC	2	10	21557	21566	0 %	20 %	40 %	40 %	148238354
24	NC_009481	CGTGC	2	10	21926	21935	0 %	20 %	40 %	40 %	148238354
25	NC_009481	GGTTG	2	10	25483	25492	0 %	40 %	60 %	0 %	148238355
26	NC_009481	TGCAA	2	10	27462	27471	40 %	20 %	20 %	20 %	148238357
27	NC_009481	CCCAC	2	10	30207	30216	20 %	0 %	0 %	80 %	148238359
28	NC_009481	CGCTG	2	10	33685	33694	0 %	20 %	40 %	40 %	148238364
29	NC_009481	GAAGG	2	10	37106	37115	40 %	0 %	60 %	0 %	148238367
30	NC_009481	GTTGG	2	10	39146	39155	0 %	40 %	60 %	0 %	148238370
31	NC_009481	TTGGG	2	10	40231	40240	0 %	40 %	60 %	0 %	148238372
32	NC_009481	TGATC	2	10	40667	40676	20 %	40 %	20 %	20 %	148238372
33	NC_009481	AGGTG	2	10	40793	40802	20 %	20 %	60 %	0 %	148238372
34	NC_009481	GAGCG	2	10	41135	41144	20 %	0 %	60 %	20 %	148238373
35	NC_009481	GCGCA	2	10	42447	42456	20 %	0 %	40 %	40 %	148238375
36	NC_009481	GCGCC	2	10	45700	45709	0 %	0 %	40 %	60 %	148238381
37	NC_009481	CGGGG	2	10	47451	47460	0 %	0 %	80 %	20 %	148238383
38	NC_009481	TGGTG	2	10	47625	47634	0 %	40 %	60 %	0 %	148238383
39	NC_009481	GATCA	2	10	50810	50819	40 %	20 %	20 %	20 %	148238386
40	NC_009481	GATCG	2	10	51585	51594	20 %	20 %	40 %	20 %	148238387
41	NC_009481	CTGGA	2	10	52458	52467	20 %	20 %	40 %	20 %	148238387
42	NC_009481	CGGGC	2	10	52574	52583	0 %	0 %	60 %	40 %	148238387
43	NC_009481	TGCGT	2	10	60095	60104	0 %	40 %	40 %	20 %	148238397
44	NC_009481	GGCAC	2	10	62254	62263	20 %	0 %	40 %	40 %	148238398
45	NC_009481	CTGGC	2	10	63159	63168	0 %	20 %	40 %	40 %	148238399
46	NC_009481	GCCAG	2	10	64701	64710	20 %	0 %	40 %	40 %	148238400
47	NC_009481	TCCAC	2	10	66965	66974	20 %	20 %	0 %	60 %	148238402
48	NC_009481	CCAGT	2	10	69792	69801	20 %	20 %	20 %	40 %	148238404
49	NC_009481	CTGGC	2	10	70654	70663	0 %	20 %	40 %	40 %	148238405
50	NC_009481	GCCAG	2	10	71133	71142	20 %	0 %	40 %	40 %	148238406
51	NC_009481	CTCCG	2	10	72847	72856	0 %	20 %	20 %	60 %	148238407
52	NC_009481	TGGAT	2	10	76717	76726	20 %	40 %	40 %	0 %	148238410
53	NC_009481	GCCAG	2	10	77665	77674	20 %	0 %	40 %	40 %	148238411
54	NC_009481	CTGAT	2	10	79373	79382	20 %	40 %	20 %	20 %	148238413
55	NC_009481	CGATC	2	10	81963	81972	20 %	20 %	20 %	40 %	148238416
56	NC_009481	GGCCG	2	10	82324	82333	0 %	0 %	60 %	40 %	148238416
57	NC_009481	ATGGC	2	10	82601	82610	20 %	20 %	40 %	20 %	148238416
58	NC_009481	AGCTC	2	10	85221	85230	20 %	20 %	20 %	40 %	148238418
59	NC_009481	CCTGC	2	10	85236	85245	0 %	20 %	20 %	60 %	148238418
60	NC_009481	CAGCG	2	10	86030	86039	20 %	0 %	40 %	40 %	148238419
61	NC_009481	TGGCC	2	10	86210	86219	0 %	20 %	40 %	40 %	148238419
62	NC_009481	GGGGC	2	10	87445	87454	0 %	0 %	80 %	20 %	148238420
63	NC_009481	CCGGC	2	10	87636	87645	0 %	0 %	40 %	60 %	148238420
64	NC_009481	TTGAC	2	10	93603	93612	20 %	40 %	20 %	20 %	148238426
65	NC_009481	CTCTC	2	10	94606	94615	0 %	40 %	0 %	60 %	148238428
66	NC_009481	ATTGT	2	10	95970	95979	20 %	60 %	20 %	0 %	148238429
67	NC_009481	AGTCA	2	10	95981	95990	40 %	20 %	20 %	20 %	148238429
68	NC_009481	TTGTA	2	10	96491	96500	20 %	60 %	20 %	0 %	148238430
69	NC_009481	TGCTG	2	10	96943	96952	0 %	40 %	40 %	20 %	148238430
70	NC_009481	GATAA	2	10	100180	100189	60 %	20 %	20 %	0 %	148238433
71	NC_009481	CCGCT	2	10	101102	101111	0 %	20 %	20 %	60 %	148238434
72	NC_009481	CGATC	2	10	101721	101730	20 %	20 %	20 %	40 %	148238435
73	NC_009481	GGCCG	2	10	102341	102350	0 %	0 %	60 %	40 %	148238435
74	NC_009481	CAGCC	2	10	103122	103131	20 %	0 %	20 %	60 %	148238438
75	NC_009481	TGGCC	2	10	103136	103145	0 %	20 %	40 %	40 %	148238438
76	NC_009481	GCTGA	2	10	103936	103945	20 %	20 %	40 %	20 %	148238439
77	NC_009481	GCTGG	2	10	105477	105486	0 %	20 %	60 %	20 %	148238441
78	NC_009481	TGATT	2	10	107539	107548	20 %	60 %	20 %	0 %	148238442
79	NC_009481	TGGAT	2	10	107565	107574	20 %	40 %	40 %	0 %	148238442
80	NC_009481	TTTGG	2	10	107893	107902	0 %	60 %	40 %	0 %	148238442
81	NC_009481	TTGTT	2	10	109361	109370	0 %	80 %	20 %	0 %	148238444
82	NC_009481	GCAAT	2	10	109684	109693	40 %	20 %	20 %	20 %	148238444
83	NC_009481	CGAAT	2	10	109852	109861	40 %	20 %	20 %	20 %	148238444
84	NC_009481	TGCTC	2	10	111304	111313	0 %	40 %	20 %	40 %	148238445
85	NC_009481	CCATC	2	10	111390	111399	20 %	20 %	0 %	60 %	148238446
86	NC_009481	CAGCG	2	10	115236	115245	20 %	0 %	40 %	40 %	148238447
87	NC_009481	GGTGG	2	10	118848	118857	0 %	20 %	80 %	0 %	148238449
88	NC_009481	CACCG	2	10	119081	119090	20 %	0 %	20 %	60 %	148238449
89	NC_009481	GCTCG	2	10	119558	119567	0 %	20 %	40 %	40 %	148238450
90	NC_009481	CAGCA	2	10	122765	122774	40 %	0 %	20 %	40 %	148238452
91	NC_009481	AGCAG	2	10	123371	123380	40 %	0 %	40 %	20 %	148238453
92	NC_009481	TGCCT	2	10	124464	124473	0 %	40 %	20 %	40 %	148238454
93	NC_009481	GCTTT	2	10	128850	128859	0 %	60 %	20 %	20 %	148238458
94	NC_009481	TTGCC	2	10	133766	133775	0 %	40 %	20 %	40 %	148238460
95	NC_009481	AGCTC	2	10	133784	133793	20 %	20 %	20 %	40 %	148238460
96	NC_009481	GCACG	2	10	138300	138309	20 %	0 %	40 %	40 %	148238462
97	NC_009481	GATCA	2	10	139860	139869	40 %	20 %	20 %	20 %	148238463
98	NC_009481	CAGTC	2	10	140178	140187	20 %	20 %	20 %	40 %	148238463
99	NC_009481	GCCCC	2	10	141053	141062	0 %	0 %	20 %	80 %	148238464
100	NC_009481	GACCA	2	10	143442	143451	40 %	0 %	20 %	40 %	148238465
101	NC_009481	ACTCG	2	10	143808	143817	20 %	20 %	20 %	40 %	148238465
102	NC_009481	TGAGG	2	10	147889	147898	20 %	20 %	60 %	0 %	148238469
103	NC_009481	ATCGC	2	10	148104	148113	20 %	20 %	20 %	40 %	148238469
104	NC_009481	GCCGC	2	10	151273	151282	0 %	0 %	40 %	60 %	148238471
105	NC_009481	CGACT	2	10	151583	151592	20 %	20 %	20 %	40 %	148238471
106	NC_009481	TCAGG	2	10	151697	151706	20 %	20 %	40 %	20 %	148238471
107	NC_009481	CTGAT	2	10	153704	153713	20 %	40 %	20 %	20 %	148238473
108	NC_009481	CTGCT	2	10	154012	154021	0 %	40 %	20 %	40 %	148238474
109	NC_009481	AGTGG	2	10	154358	154367	20 %	20 %	60 %	0 %	148238474
110	NC_009481	TGCCC	2	10	154464	154473	0 %	20 %	20 %	60 %	148238474
111	NC_009481	GAGCA	2	10	155053	155062	40 %	0 %	40 %	20 %	148238475
112	NC_009481	CGTTG	2	10	156394	156403	0 %	40 %	40 %	20 %	148238476
113	NC_009481	GCTGG	2	10	156612	156621	0 %	20 %	60 %	20 %	148238476
114	NC_009481	GCAGC	2	10	159145	159154	20 %	0 %	40 %	40 %	148238477
115	NC_009481	AGGCC	2	10	160378	160387	20 %	0 %	40 %	40 %	148238477
116	NC_009481	CGCAG	2	10	161784	161793	20 %	0 %	40 %	40 %	148238479
117	NC_009481	CGTGT	2	10	162428	162437	0 %	40 %	40 %	20 %	148238480
118	NC_009481	ATCGC	2	10	162489	162498	20 %	20 %	20 %	40 %	148238480
119	NC_009481	TGCGT	2	10	162954	162963	0 %	40 %	40 %	20 %	148238480
120	NC_009481	GCGCA	2	10	164209	164218	20 %	0 %	40 %	40 %	148238482
121	NC_009481	GGGCT	2	10	164525	164534	0 %	20 %	60 %	20 %	148238482
122	NC_009481	CGGCC	2	10	166864	166873	0 %	0 %	40 %	60 %	148238484
123	NC_009481	TCCAC	2	10	168028	168037	20 %	20 %	0 %	60 %	148238487
124	NC_009481	TCACC	2	10	169008	169017	20 %	20 %	0 %	60 %	148238488
125	NC_009481	GAAAT	2	10	171560	171569	60 %	20 %	20 %	0 %	148238490
126	NC_009481	AGGGC	2	10	174424	174433	20 %	0 %	60 %	20 %	148238492
127	NC_009481	GGGGC	2	10	176107	176116	0 %	0 %	80 %	20 %	148238492
128	NC_009481	GCTGG	2	10	177231	177240	0 %	20 %	60 %	20 %	148238493
129	NC_009481	GGTTG	2	10	177763	177772	0 %	40 %	60 %	0 %	148238494
130	NC_009481	GATGC	2	10	177804	177813	20 %	20 %	40 %	20 %	148238495
131	NC_009481	CCGTG	2	10	177959	177968	0 %	20 %	40 %	40 %	148238495
132	NC_009481	AAGGG	2	10	178105	178114	40 %	0 %	60 %	0 %	148238496
133	NC_009481	GCTCT	2	10	180514	180523	0 %	40 %	20 %	40 %	148238499
134	NC_009481	TCTGT	2	10	181919	181928	0 %	60 %	20 %	20 %	148238500
135	NC_009481	GCCCA	2	10	182325	182334	20 %	0 %	20 %	60 %	148238500
136	NC_009481	GGGCT	2	10	182834	182843	0 %	20 %	60 %	20 %	148238500
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138	NC_009481	GTGCT	2	10	185181	185190	0 %	40 %	40 %	20 %	148238502
139	NC_009481	GCCTG	2	10	187538	187547	0 %	20 %	40 %	40 %	148238505
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147	NC_009481	GCCGA	2	10	194309	194318	20 %	0 %	40 %	40 %	148238512
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247	NC_009481	CTCGA	2	10	333791	333800	20 %	20 %	20 %	40 %	148238644
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249	NC_009481	TGTCC	2	10	335852	335861	0 %	40 %	20 %	40 %	148238645
250	NC_009481	ATTCG	2	10	336878	336887	20 %	40 %	20 %	20 %	148238645
251	NC_009481	CCATG	2	10	337931	337940	20 %	20 %	20 %	40 %	148238647
252	NC_009481	CTGGC	2	10	338183	338192	0 %	20 %	40 %	40 %	148238647
253	NC_009481	AGTGC	2	10	339410	339419	20 %	20 %	40 %	20 %	148238647
254	NC_009481	AAGCA	2	10	340549	340558	60 %	0 %	20 %	20 %	148238648
255	NC_009481	TGGTT	2	10	341430	341439	0 %	60 %	40 %	0 %	148238651
256	NC_009481	GCCTC	2	10	344757	344766	0 %	20 %	20 %	60 %	148238656
257	NC_009481	GCGCA	2	10	345634	345643	20 %	0 %	40 %	40 %	148238657
258	NC_009481	CCAGG	2	10	348773	348782	20 %	0 %	40 %	40 %	148238662
259	NC_009481	TTGCG	2	10	348799	348808	0 %	40 %	40 %	20 %	148238662
260	NC_009481	CGCCC	2	10	350670	350679	0 %	0 %	20 %	80 %	148238663
261	NC_009481	TGTGG	2	10	350728	350737	0 %	40 %	60 %	0 %	148238663
262	NC_009481	AGCCG	2	10	352686	352695	20 %	0 %	40 %	40 %	148238665
263	NC_009481	GCTCA	2	10	354796	354805	20 %	20 %	20 %	40 %	148238667
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