MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. WH 7803 chromosome

Total Repeats: 47023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_009481	ATCA	2	8	187485	187492	50 %	25 %	0 %	25 %	148238505
4002	NC_009481	CCGAGA	2	12	187525	187536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238505
4003	NC_009481	GCCTG	2	10	187538	187547	0 %	20 %	40 %	40 %	148238505
4004	NC_009481	TGG	2	6	187651	187656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238505
4005	NC_009481	TCT	2	6	187693	187698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148238505
4006	NC_009481	GCC	2	6	187719	187724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238505
4007	NC_009481	GGA	2	6	187772	187777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238505
4008	NC_009481	TGG	2	6	187817	187822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238505
4009	NC_009481	CGG	2	6	187847	187852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238505
4010	NC_009481	GCA	2	6	187879	187884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238505
4011	NC_009481	AAG	3	9	187956	187964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148238505
4012	NC_009481	GAG	2	6	188022	188027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238505
4013	NC_009481	ACC	2	6	188028	188033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238505
4014	NC_009481	AGA	2	6	188062	188067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148238505
4015	NC_009481	GCG	2	6	188068	188073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238505
4016	NC_009481	TGG	2	6	188155	188160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238505
4017	NC_009481	GC	3	6	188171	188176	0 %	0 %	50 %	50 %	148238505
4018	NC_009481	TGG	2	6	188188	188193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238505
4019	NC_009481	GGC	2	6	188312	188317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238505
4020	NC_009481	GTG	2	6	188352	188357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238505
4021	NC_009481	CTG	2	6	188418	188423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238505
4022	NC_009481	CCTC	2	8	188485	188492	0 %	25 %	0 %	75 %	148238505
4023	NC_009481	ATC	2	6	188559	188564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148238505
4024	NC_009481	TGA	2	6	188623	188628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238505
4025	NC_009481	ACCA	2	8	188640	188647	50 %	0 %	0 %	50 %	148238505
4026	NC_009481	TGC	2	6	188707	188712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238505
4027	NC_009481	TGG	2	6	188731	188736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238505
4028	NC_009481	CT	3	6	188919	188924	0 %	50 %	0 %	50 %	148238506
4029	NC_009481	GCC	2	6	188967	188972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238506
4030	NC_009481	CTGGG	2	10	188978	188987	0 %	20 %	60 %	20 %	148238506
4031	NC_009481	G	6	6	189062	189067	0 %	0 %	100 %	0 %	148238506
4032	NC_009481	GCA	2	6	189077	189082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238506
4033	NC_009481	ATTC	2	8	189095	189102	25 %	50 %	0 %	25 %	148238506
4034	NC_009481	GGT	2	6	189104	189109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238506
4035	NC_009481	GGCC	2	8	189113	189120	0 %	0 %	50 %	50 %	148238506
4036	NC_009481	GAG	2	6	189177	189182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238506
4037	NC_009481	GGA	2	6	189233	189238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238506
4038	NC_009481	CGGC	2	8	189382	189389	0 %	0 %	50 %	50 %	148238506
4039	NC_009481	GATC	2	8	189464	189471	25 %	25 %	25 %	25 %	148238506
4040	NC_009481	TGC	2	6	189493	189498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238506
4041	NC_009481	CGG	2	6	189518	189523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238506
4042	NC_009481	GGC	2	6	189547	189552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238506
4043	NC_009481	CGC	2	6	189560	189565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238506
4044	NC_009481	GAACG	2	10	189584	189593	40 %	0 %	40 %	20 %	148238507
4045	NC_009481	GCC	3	9	189611	189619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238507
4046	NC_009481	GCC	3	9	189626	189634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238507
4047	NC_009481	GCG	2	6	189648	189653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238507
4048	NC_009481	AGC	2	6	189678	189683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238507
4049	NC_009481	CAC	2	6	189701	189706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238507
4050	NC_009481	TGC	2	6	189712	189717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238507
4051	NC_009481	CTC	2	6	189719	189724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148238507
4052	NC_009481	TTC	2	6	189789	189794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148238507
4053	NC_009481	CGG	2	6	189802	189807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238507
4054	NC_009481	TCG	2	6	189858	189863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238507
4055	NC_009481	GCG	2	6	189869	189874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238507
4056	NC_009481	TGC	2	6	189904	189909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238507
4057	NC_009481	TGC	2	6	190223	190228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238508
4058	NC_009481	CGC	2	6	190371	190376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238508
4059	NC_009481	TGG	2	6	190442	190447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238508
4060	NC_009481	GCGCC	2	10	190479	190488	0 %	0 %	40 %	60 %	148238508
4061	NC_009481	CTGG	2	8	190504	190511	0 %	25 %	50 %	25 %	148238508
4062	NC_009481	CGA	2	6	190533	190538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238508
4063	NC_009481	GGC	2	6	190545	190550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238508
4064	NC_009481	CGG	2	6	190608	190613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238508
4065	NC_009481	CAC	2	6	190617	190622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238508
4066	NC_009481	GGC	2	6	190645	190650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238508
4067	NC_009481	AAG	2	6	190717	190722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148238508
4068	NC_009481	TGG	3	9	190733	190741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238508
4069	NC_009481	TCGGC	2	10	190775	190784	0 %	20 %	40 %	40 %	148238508
4070	NC_009481	TGT	2	6	190838	190843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238508
4071	NC_009481	CAT	2	6	190986	190991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148238508
4072	NC_009481	CGG	2	6	190998	191003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238508
4073	NC_009481	GTG	2	6	191089	191094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238508
4074	NC_009481	GGA	2	6	191115	191120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238508
4075	NC_009481	GC	3	6	191163	191168	0 %	0 %	50 %	50 %	148238508
4076	NC_009481	CGC	3	9	191166	191174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238508
4077	NC_009481	TCC	2	6	191257	191262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148238509
4078	NC_009481	TGCTC	2	10	191318	191327	0 %	40 %	20 %	40 %	148238509
4079	NC_009481	CCG	2	6	191374	191379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238509
4080	NC_009481	ACG	2	6	191389	191394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238509
4081	NC_009481	GC	3	6	191427	191432	0 %	0 %	50 %	50 %	148238509
4082	NC_009481	GGC	2	6	191483	191488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238509
4083	NC_009481	TGG	2	6	191514	191519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238509
4084	NC_009481	GAT	2	6	191565	191570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238509
4085	NC_009481	CCA	2	6	191623	191628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238509
4086	NC_009481	TTG	2	6	191640	191645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238509
4087	NC_009481	CTG	2	6	191700	191705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238509
4088	NC_009481	GTGCAG	2	12	191754	191765	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148238509
4089	NC_009481	TCC	2	6	191807	191812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148238509
4090	NC_009481	GTG	2	6	191829	191834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238509
4091	NC_009481	GCC	2	6	191891	191896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238509
4092	NC_009481	GTGCAG	3	18	191913	191930	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148238509
4093	NC_009481	CCT	2	6	191984	191989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148238510
4094	NC_009481	TGC	2	6	192067	192072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238510
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4096	NC_009481	GATGG	2	10	192185	192194	20 %	20 %	60 %	0 %	148238510
4097	NC_009481	TGG	3	9	192192	192200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238510
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4100	NC_009481	CTC	2	6	192417	192422	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148238510
4101	NC_009481	CGC	2	6	192429	192434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238510
4102	NC_009481	ACG	2	6	192457	192462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238511
4103	NC_009481	TGG	2	6	192480	192485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238511
4104	NC_009481	CGGC	3	12	192526	192537	0 %	0 %	50 %	50 %	148238511
4105	NC_009481	GCC	2	6	192538	192543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238511
4106	NC_009481	GCT	2	6	192688	192693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238511
4107	NC_009481	CG	3	6	192706	192711	0 %	0 %	50 %	50 %	148238511
4108	NC_009481	GCC	2	6	192749	192754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238511
4109	NC_009481	AGGG	2	8	192768	192775	25 %	0 %	75 %	0 %	148238511
4110	NC_009481	CGC	2	6	192789	192794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238511
4111	NC_009481	TGC	2	6	192808	192813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238511
4112	NC_009481	CTG	2	6	192920	192925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238511
4113	NC_009481	GTG	2	6	193028	193033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238511
4114	NC_009481	GTT	2	6	193051	193056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238511
4115	NC_009481	CTG	2	6	193085	193090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238511
4116	NC_009481	GCGG	2	8	193102	193109	0 %	0 %	75 %	25 %	148238511
4117	NC_009481	GCT	2	6	193171	193176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238511
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4119	NC_009481	CAGGGG	2	12	193196	193207	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	148238511
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4121	NC_009481	GGC	2	6	193300	193305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238511
4122	NC_009481	CTG	2	6	193313	193318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238511
4123	NC_009481	CCG	2	6	193322	193327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238511
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4242	NC_009481	CGT	2	6	198179	198184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238517
4243	NC_009481	CTG	2	6	198216	198221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238517
4244	NC_009481	GCA	2	6	198242	198247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238517
4245	NC_009481	CCG	2	6	198251	198256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238517
4246	NC_009481	GGCC	2	8	198322	198329	0 %	0 %	50 %	50 %	148238518
4247	NC_009481	AAG	2	6	198354	198359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148238518
4248	NC_009481	CTG	2	6	198402	198407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238518
4249	NC_009481	GCA	2	6	198412	198417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238518
4250	NC_009481	ACCGC	2	10	198456	198465	20 %	0 %	20 %	60 %	148238518
4251	NC_009481	GCA	2	6	198535	198540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238518
4252	NC_009481	TCC	2	6	198677	198682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148238518
4253	NC_009481	G	6	6	198739	198744	0 %	0 %	100 %	0 %	148238518
4254	NC_009481	GCA	2	6	198761	198766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238518
4255	NC_009481	CTCA	2	8	198779	198786	25 %	25 %	0 %	50 %	148238518
4256	NC_009481	GCC	2	6	198809	198814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238518
4257	NC_009481	G	6	6	198895	198900	0 %	0 %	100 %	0 %	148238518
4258	NC_009481	CCA	2	6	198943	198948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238518
4259	NC_009481	GCC	2	6	198950	198955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238518
4260	NC_009481	GCCA	2	8	198963	198970	25 %	0 %	25 %	50 %	148238518
4261	NC_009481	CG	3	6	199019	199024	0 %	0 %	50 %	50 %	148238518
4262	NC_009481	GGC	2	6	199045	199050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238518
4263	NC_009481	CATCAG	2	12	199070	199081	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	148238518
4264	NC_009481	TGC	3	9	199089	199097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238518
4265	NC_009481	TGC	2	6	199101	199106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238518
4266	NC_009481	CGC	2	6	199141	199146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238518
4267	NC_009481	CAG	2	6	199154	199159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238518
4268	NC_009481	CGG	2	6	199211	199216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238518
4269	NC_009481	CAG	2	6	199223	199228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238518
4270	NC_009481	CGGC	2	8	199303	199310	0 %	0 %	50 %	50 %	148238518
4271	NC_009481	GGT	2	6	199358	199363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238518
4272	NC_009481	GGGC	2	8	199382	199389	0 %	0 %	75 %	25 %	148238518
4273	NC_009481	CTG	2	6	199610	199615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238519
4274	NC_009481	ATC	2	6	199659	199664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148238519
4275	NC_009481	GCC	2	6	199700	199705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238519
4276	NC_009481	TGC	2	6	199788	199793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238519
4277	NC_009481	CGG	2	6	199813	199818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238519
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4279	NC_009481	CTGG	2	8	199843	199850	0 %	25 %	50 %	25 %	148238519
4280	NC_009481	AGG	2	6	199863	199868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238519
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4282	NC_009481	TGC	4	12	199938	199949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238519
4283	NC_009481	CTG	2	6	199955	199960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238519
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4310	NC_009481	GCC	2	6	200742	200747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238519
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4331	NC_009481	GATCCC	2	12	201467	201478	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148238519
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4334	NC_009481	GGA	2	6	201556	201561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238519
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4338	NC_009481	TTTC	2	8	201679	201686	0 %	75 %	0 %	25 %	148238520
4339	NC_009481	CGG	2	6	201706	201711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238520
4340	NC_009481	TGCAGG	2	12	201774	201785	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148238520
4341	NC_009481	CAG	2	6	201857	201862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238520
4342	NC_009481	G	6	6	201913	201918	0 %	0 %	100 %	0 %	148238520
4343	NC_009481	TGCAGC	2	12	201933	201944	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148238520
4344	NC_009481	CCA	2	6	202018	202023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238520
4345	NC_009481	CAG	2	6	202088	202093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238520
4346	NC_009481	GCG	2	6	202104	202109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238520
4347	NC_009481	CG	3	6	202108	202113	0 %	0 %	50 %	50 %	148238520
4348	NC_009481	CTT	2	6	202127	202132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148238520
4349	NC_009481	CCT	3	9	202134	202142	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148238520
4350	NC_009481	CAT	2	6	202211	202216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148238521
4351	NC_009481	TCC	2	6	202227	202232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148238521
4352	NC_009481	CGC	2	6	202235	202240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238521
4353	NC_009481	GTG	2	6	202290	202295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238521
4354	NC_009481	GAT	2	6	202317	202322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238521
4355	NC_009481	CCGG	2	8	202330	202337	0 %	0 %	50 %	50 %	148238521
4356	NC_009481	AGG	2	6	202348	202353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238521
4357	NC_009481	GGC	2	6	202430	202435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238521
4358	NC_009481	TGC	2	6	202465	202470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238521
4359	NC_009481	GCCC	2	8	202477	202484	0 %	0 %	25 %	75 %	148238521
4360	NC_009481	ACC	2	6	202497	202502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238521
4361	NC_009481	TGT	2	6	202618	202623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238521
4362	NC_009481	GCT	2	6	202664	202669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238521
4363	NC_009481	CCG	2	6	202688	202693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238521
4364	NC_009481	GCA	2	6	202717	202722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238521
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4366	NC_009481	GCC	2	6	202748	202753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238521
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4393	NC_009481	TGC	2	6	203509	203514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238522
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4452	NC_009481	CCTGG	2	10	205926	205935	0 %	20 %	40 %	40 %	148238525
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4475	NC_009481	ACG	2	6	207128	207133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238526
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4479	NC_009481	GCG	2	6	207295	207300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238526
4480	NC_009481	GGCAC	2	10	207311	207320	20 %	0 %	40 %	40 %	148238526
4481	NC_009481	AGA	2	6	207372	207377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148238526
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4483	NC_009481	GC	3	6	207531	207536	0 %	0 %	50 %	50 %	148238526
4484	NC_009481	ACG	2	6	207548	207553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238526
4485	NC_009481	GCCG	2	8	207561	207568	0 %	0 %	50 %	50 %	148238526
4486	NC_009481	GCT	2	6	207688	207693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238526
4487	NC_009481	CTGG	2	8	207697	207704	0 %	25 %	50 %	25 %	148238526
4488	NC_009481	ACC	2	6	207814	207819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238527
4489	NC_009481	CTGA	2	8	207888	207895	25 %	25 %	25 %	25 %	148238527
4490	NC_009481	GTT	2	6	207936	207941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238527
4491	NC_009481	GAG	2	6	207951	207956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238527
4492	NC_009481	TTGGT	2	10	207973	207982	0 %	60 %	40 %	0 %	148238527
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4497	NC_009481	GTG	2	6	208170	208175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238527
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4499	NC_009481	CGT	2	6	208294	208299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238527
4500	NC_009481	GCAT	2	8	208303	208310	25 %	25 %	25 %	25 %	148238527

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