MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. WH 7803 chromosome

Total Repeats: 47023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_009481	GCCCC	2	10	141053	141062	0 %	0 %	20 %	80 %	148238464
3002	NC_009481	C	7	7	141059	141065	0 %	0 %	0 %	100 %	148238464
3003	NC_009481	GCG	2	6	141073	141078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238464
3004	NC_009481	TGA	2	6	141079	141084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238464
3005	NC_009481	CGT	2	6	141137	141142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238464
3006	NC_009481	TCA	2	6	141215	141220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148238464
3007	NC_009481	GAGC	2	8	141242	141249	25 %	0 %	50 %	25 %	148238464
3008	NC_009481	AGC	2	6	141288	141293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238464
3009	NC_009481	TC	3	6	141301	141306	0 %	50 %	0 %	50 %	148238464
3010	NC_009481	TTG	2	6	141386	141391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238464
3011	NC_009481	TGG	2	6	141499	141504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238464
3012	NC_009481	GC	3	6	141506	141511	0 %	0 %	50 %	50 %	148238464
3013	NC_009481	T	6	6	141569	141574	0 %	100 %	0 %	0 %	148238464
3014	NC_009481	TGG	2	6	141615	141620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238464
3015	NC_009481	TGC	2	6	141630	141635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238464
3016	NC_009481	TGC	2	6	141663	141668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238464
3017	NC_009481	CAG	2	6	141695	141700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238464
3018	NC_009481	ACC	2	6	141797	141802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238464
3019	NC_009481	ACA	2	6	141838	141843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148238464
3020	NC_009481	CT	3	6	141969	141974	0 %	50 %	0 %	50 %	148238464
3021	NC_009481	TGA	2	6	141996	142001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238464
3022	NC_009481	GT	3	6	142014	142019	0 %	50 %	50 %	0 %	148238464
3023	NC_009481	CTG	2	6	142023	142028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238464
3024	NC_009481	GTT	2	6	142040	142045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238464
3025	NC_009481	CT	3	6	142047	142052	0 %	50 %	0 %	50 %	148238464
3026	NC_009481	GCT	2	6	142106	142111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238464
3027	NC_009481	TGG	2	6	142140	142145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238464
3028	NC_009481	CGTT	2	8	142195	142202	0 %	50 %	25 %	25 %	148238464
3029	NC_009481	TCAT	2	8	142226	142233	25 %	50 %	0 %	25 %	148238464
3030	NC_009481	CTC	2	6	142267	142272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148238464
3031	NC_009481	ATT	2	6	142385	142390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148238464
3032	NC_009481	TGT	2	6	142480	142485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238464
3033	NC_009481	GAT	2	6	142508	142513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238464
3034	NC_009481	GTC	2	6	142553	142558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238464
3035	NC_009481	TTG	2	6	142650	142655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238464
3036	NC_009481	AGTGGC	2	12	142661	142672	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148238464
3037	NC_009481	CTT	2	6	142691	142696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148238464
3038	NC_009481	TGAT	2	8	142731	142738	25 %	50 %	25 %	0 %	148238464
3039	NC_009481	GAA	2	6	142868	142873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148238464
3040	NC_009481	GCC	2	6	142883	142888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238464
3041	NC_009481	TTGC	2	8	142893	142900	0 %	50 %	25 %	25 %	148238464
3042	NC_009481	G	6	6	142956	142961	0 %	0 %	100 %	0 %	148238464
3043	NC_009481	CTT	2	6	143027	143032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148238464
3044	NC_009481	CAA	2	6	143046	143051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148238464
3045	NC_009481	TTC	2	6	143123	143128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148238464
3046	NC_009481	CCA	2	6	143145	143150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238464
3047	NC_009481	TGA	2	6	143172	143177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238464
3048	NC_009481	TGG	2	6	143193	143198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238464
3049	NC_009481	AAG	2	6	143199	143204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148238464
3050	NC_009481	CAG	2	6	143258	143263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238464
3051	NC_009481	GTTT	2	8	143398	143405	0 %	75 %	25 %	0 %	148238465
3052	NC_009481	GACCA	2	10	143442	143451	40 %	0 %	20 %	40 %	148238465
3053	NC_009481	AGG	2	6	143491	143496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238465
3054	NC_009481	GTG	2	6	143517	143522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238465
3055	NC_009481	GTC	2	6	143602	143607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238465
3056	NC_009481	GCA	2	6	143674	143679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238465
3057	NC_009481	ACC	2	6	143708	143713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238465
3058	NC_009481	CAA	2	6	143796	143801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148238465
3059	NC_009481	ACTCG	2	10	143808	143817	20 %	20 %	20 %	40 %	148238465
3060	NC_009481	GAC	2	6	143859	143864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238465
3061	NC_009481	AAG	2	6	143962	143967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148238465
3062	NC_009481	TGC	2	6	143987	143992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238465
3063	NC_009481	ATT	2	6	144024	144029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148238465
3064	NC_009481	TTG	2	6	144046	144051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238465
3065	NC_009481	GCA	2	6	144344	144349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238465
3066	NC_009481	AGC	2	6	144379	144384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238465
3067	NC_009481	CAT	2	6	144476	144481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148238465
3068	NC_009481	AG	3	6	144558	144563	50 %	0 %	50 %	0 %	148238466
3069	NC_009481	TTTTCA	2	12	144626	144637	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	148238466
3070	NC_009481	CGG	2	6	144686	144691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238466
3071	NC_009481	CCAT	2	8	144722	144729	25 %	25 %	0 %	50 %	148238466
3072	NC_009481	GCT	2	6	144765	144770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238466
3073	NC_009481	GTG	2	6	144779	144784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238466
3074	NC_009481	TCCA	2	8	144826	144833	25 %	25 %	0 %	50 %	148238466
3075	NC_009481	CAG	2	6	144854	144859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238466
3076	NC_009481	GAGG	2	8	144887	144894	25 %	0 %	75 %	0 %	148238466
3077	NC_009481	GAT	2	6	144900	144905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238466
3078	NC_009481	CAG	2	6	145009	145014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238466
3079	NC_009481	CCTG	2	8	145048	145055	0 %	25 %	25 %	50 %	148238466
3080	NC_009481	GCT	2	6	145067	145072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238466
3081	NC_009481	CCAG	2	8	145199	145206	25 %	0 %	25 %	50 %	148238466
3082	NC_009481	TTG	2	6	145254	145259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238466
3083	NC_009481	AGG	2	6	145336	145341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238466
3084	NC_009481	CCT	2	6	145351	145356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148238466
3085	NC_009481	GCT	2	6	145360	145365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238466
3086	NC_009481	CTGA	2	8	145370	145377	25 %	25 %	25 %	25 %	148238466
3087	NC_009481	GAG	2	6	145389	145394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238466
3088	NC_009481	TTG	2	6	145491	145496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238466
3089	NC_009481	TGAT	2	8	145503	145510	25 %	50 %	25 %	0 %	148238466
3090	NC_009481	TCG	2	6	145546	145551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238466
3091	NC_009481	C	10	10	145639	145648	0 %	0 %	0 %	100 %	148238466
3092	NC_009481	GTG	2	6	145802	145807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238467
3093	NC_009481	CCG	2	6	145914	145919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238467
3094	NC_009481	CT	3	6	146109	146114	0 %	50 %	0 %	50 %	148238467
3095	NC_009481	TGG	2	6	146122	146127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238467
3096	NC_009481	TGT	2	6	146419	146424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238467
3097	NC_009481	CCA	2	6	146471	146476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238467
3098	NC_009481	ACA	2	6	146496	146501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148238467
3099	NC_009481	GGT	2	6	146504	146509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238467
3100	NC_009481	GGA	2	6	146512	146517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238467
3101	NC_009481	GCT	2	6	146521	146526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238467
3102	NC_009481	TGAT	2	8	146541	146548	25 %	50 %	25 %	0 %	148238467
3103	NC_009481	GC	4	8	146597	146604	0 %	0 %	50 %	50 %	148238467
3104	NC_009481	ACG	2	6	146679	146684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238467
3105	NC_009481	GTC	2	6	146752	146757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238467
3106	NC_009481	CAT	2	6	146816	146821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148238467
3107	NC_009481	TTGG	2	8	146860	146867	0 %	50 %	50 %	0 %	148238467
3108	NC_009481	GAGT	2	8	146879	146886	25 %	25 %	50 %	0 %	148238467
3109	NC_009481	TGG	2	6	146931	146936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238468
3110	NC_009481	AGC	2	6	147109	147114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238468
3111	NC_009481	A	6	6	147141	147146	100 %	0 %	0 %	0 %	148238468
3112	NC_009481	TGG	2	6	147506	147511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238468
3113	NC_009481	CTGC	2	8	147655	147662	0 %	25 %	25 %	50 %	148238468
3114	NC_009481	TGC	2	6	147667	147672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238468
3115	NC_009481	AGT	2	6	147738	147743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238468
3116	NC_009481	TCCA	2	8	147767	147774	25 %	25 %	0 %	50 %	148238469
3117	NC_009481	TGAGG	2	10	147889	147898	20 %	20 %	60 %	0 %	148238469
3118	NC_009481	T	6	6	147901	147906	0 %	100 %	0 %	0 %	148238469
3119	NC_009481	ATCGGC	2	12	147908	147919	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148238469
3120	NC_009481	GTT	2	6	148000	148005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238469
3121	NC_009481	ATCGC	2	10	148104	148113	20 %	20 %	20 %	40 %	148238469
3122	NC_009481	GCA	2	6	148206	148211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238469
3123	NC_009481	C	6	6	148293	148298	0 %	0 %	0 %	100 %	148238469
3124	NC_009481	AGT	2	6	148344	148349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238469
3125	NC_009481	TCG	2	6	148376	148381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238469
3126	NC_009481	GCC	2	6	148456	148461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238469
3127	NC_009481	TG	3	6	148466	148471	0 %	50 %	50 %	0 %	148238469
3128	NC_009481	TGA	2	6	148568	148573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238469
3129	NC_009481	CGA	2	6	148650	148655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238469
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3131	NC_009481	AGC	2	6	148716	148721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238469
3132	NC_009481	TCC	2	6	148811	148816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148238469
3133	NC_009481	AGA	2	6	148835	148840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148238469
3134	NC_009481	CAG	2	6	148891	148896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238469
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3142	NC_009481	CTG	3	9	149898	149906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238470
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3144	NC_009481	ATG	2	6	149997	150002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238470
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3146	NC_009481	CCT	2	6	150077	150082	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148238470
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3151	NC_009481	GCT	2	6	150299	150304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238470
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3153	NC_009481	CAG	2	6	150366	150371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238470
3154	NC_009481	GTT	2	6	150381	150386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238470
3155	NC_009481	GATC	2	8	150398	150405	25 %	25 %	25 %	25 %	148238470
3156	NC_009481	GTCC	2	8	150465	150472	0 %	25 %	25 %	50 %	148238470
3157	NC_009481	TCAGGA	2	12	150527	150538	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148238470
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3161	NC_009481	GCT	2	6	150939	150944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238471
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3231	NC_009481	TC	3	6	153568	153573	0 %	50 %	0 %	50 %	148238473
3232	NC_009481	TGC	2	6	153627	153632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238473
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3237	NC_009481	GCG	2	6	153885	153890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238474
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3240	NC_009481	T	6	6	154000	154005	0 %	100 %	0 %	0 %	148238474
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3242	NC_009481	TGG	2	6	154067	154072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238474
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3364	NC_009481	TGA	2	6	159654	159659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238477
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3444	NC_009481	GCT	2	6	163239	163244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238481
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3472	NC_009481	TGG	2	6	164498	164503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238482
3473	NC_009481	GGGCT	2	10	164525	164534	0 %	20 %	60 %	20 %	148238482
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3485	NC_009481	GT	3	6	165363	165368	0 %	50 %	50 %	0 %	148238483
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3488	NC_009481	GTG	2	6	165659	165664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238483
3489	NC_009481	TG	3	6	165663	165668	0 %	50 %	50 %	0 %	148238483
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