MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. WH 7803 chromosome

Total Repeats: 47023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_009481	TCA	3	9	115297	115305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148238447
2502	NC_009481	GTTG	2	8	115308	115315	0 %	50 %	50 %	0 %	148238447
2503	NC_009481	CAA	2	6	115319	115324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148238447
2504	NC_009481	GC	3	6	115375	115380	0 %	0 %	50 %	50 %	148238447
2505	NC_009481	GCTG	2	8	115452	115459	0 %	25 %	50 %	25 %	148238447
2506	NC_009481	GACG	2	8	115467	115474	25 %	0 %	50 %	25 %	148238447
2507	NC_009481	GCT	3	9	115528	115536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238447
2508	NC_009481	TGG	2	6	115607	115612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238447
2509	NC_009481	TTG	2	6	115642	115647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238447
2510	NC_009481	CGAT	2	8	115672	115679	25 %	25 %	25 %	25 %	148238447
2511	NC_009481	CGT	2	6	115703	115708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238447
2512	NC_009481	TTGG	2	8	115731	115738	0 %	50 %	50 %	0 %	148238447
2513	NC_009481	TCCG	2	8	115833	115840	0 %	25 %	25 %	50 %	148238447
2514	NC_009481	CAG	2	6	115869	115874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238447
2515	NC_009481	TCG	2	6	115879	115884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238447
2516	NC_009481	TTG	2	6	115915	115920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238447
2517	NC_009481	TCA	2	6	115966	115971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148238447
2518	NC_009481	CGT	2	6	116111	116116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238447
2519	NC_009481	CTT	2	6	116180	116185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148238447
2520	NC_009481	AAC	2	6	116368	116373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148238447
2521	NC_009481	GGC	2	6	116391	116396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238447
2522	NC_009481	TCG	2	6	116398	116403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238447
2523	NC_009481	TGC	2	6	116459	116464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238447
2524	NC_009481	CCA	2	6	116487	116492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238447
2525	NC_009481	ACC	2	6	116505	116510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238447
2526	NC_009481	GAT	2	6	116514	116519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238447
2527	NC_009481	GCT	2	6	116527	116532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238447
2528	NC_009481	CCA	2	6	116533	116538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238447
2529	NC_009481	CGT	2	6	116588	116593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238447
2530	NC_009481	TCG	2	6	116600	116605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238447
2531	NC_009481	ATGG	2	8	116656	116663	25 %	25 %	50 %	0 %	148238447
2532	NC_009481	ATT	2	6	116700	116705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148238447
2533	NC_009481	CGC	2	6	116807	116812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238447
2534	NC_009481	GC	3	6	116830	116835	0 %	0 %	50 %	50 %	148238447
2535	NC_009481	CAG	2	6	116900	116905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238447
2536	NC_009481	TGC	2	6	116927	116932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238447
2537	NC_009481	GCT	2	6	116943	116948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238447
2538	NC_009481	CAA	2	6	116990	116995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148238447
2539	NC_009481	AGCG	2	8	117021	117028	25 %	0 %	50 %	25 %	148238447
2540	NC_009481	TGG	2	6	117787	117792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238448
2541	NC_009481	TGC	2	6	117879	117884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238448
2542	NC_009481	TCG	2	6	117906	117911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238448
2543	NC_009481	CTT	2	6	118003	118008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148238448
2544	NC_009481	AGG	2	6	118017	118022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238448
2545	NC_009481	T	7	7	118072	118078	0 %	100 %	0 %	0 %	148238448
2546	NC_009481	ATT	2	6	118382	118387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148238449
2547	NC_009481	CTG	2	6	118408	118413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238449
2548	NC_009481	GCT	2	6	118489	118494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238449
2549	NC_009481	T	6	6	118515	118520	0 %	100 %	0 %	0 %	148238449
2550	NC_009481	CAGC	2	8	118592	118599	25 %	0 %	25 %	50 %	148238449
2551	NC_009481	CAT	2	6	118658	118663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148238449
2552	NC_009481	TCG	2	6	118675	118680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238449
2553	NC_009481	GCAG	2	8	118828	118835	25 %	0 %	50 %	25 %	148238449
2554	NC_009481	GGTGG	2	10	118848	118857	0 %	20 %	80 %	0 %	148238449
2555	NC_009481	TGG	2	6	118883	118888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238449
2556	NC_009481	TGG	2	6	118979	118984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238449
2557	NC_009481	CAG	2	6	119001	119006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238449
2558	NC_009481	GCT	2	6	119052	119057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238449
2559	NC_009481	AAGA	2	8	119061	119068	75 %	0 %	25 %	0 %	148238449
2560	NC_009481	CACCG	2	10	119081	119090	20 %	0 %	20 %	60 %	148238449
2561	NC_009481	GCT	2	6	119095	119100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238449
2562	NC_009481	GCA	2	6	119132	119137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238449
2563	NC_009481	C	6	6	119172	119177	0 %	0 %	0 %	100 %	148238449
2564	NC_009481	GCC	2	6	119188	119193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238449
2565	NC_009481	CAC	3	9	119196	119204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238449
2566	NC_009481	TCCA	2	8	119221	119228	25 %	25 %	0 %	50 %	148238449
2567	NC_009481	ATC	2	6	119244	119249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148238449
2568	NC_009481	AGG	2	6	119281	119286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238449
2569	NC_009481	C	6	6	119290	119295	0 %	0 %	0 %	100 %	148238449
2570	NC_009481	GC	3	6	119317	119322	0 %	0 %	50 %	50 %	148238449
2571	NC_009481	GCC	2	6	119361	119366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238449
2572	NC_009481	GAA	2	6	119373	119378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148238449
2573	NC_009481	CACC	2	8	119430	119437	25 %	0 %	0 %	75 %	148238450
2574	NC_009481	CCA	2	6	119496	119501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238450
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2577	NC_009481	GCTCG	2	10	119558	119567	0 %	20 %	40 %	40 %	148238450
2578	NC_009481	CAG	2	6	119592	119597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238450
2579	NC_009481	GTA	2	6	119602	119607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238450
2580	NC_009481	CAC	3	9	119623	119631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238450
2581	NC_009481	CTC	2	6	119659	119664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148238450
2582	NC_009481	GCC	2	6	119745	119750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238450
2583	NC_009481	ATC	2	6	119767	119772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148238450
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2585	NC_009481	GCA	2	6	119787	119792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238450
2586	NC_009481	GTC	2	6	119869	119874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238450
2587	NC_009481	CGC	2	6	119936	119941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238450
2588	NC_009481	GCA	2	6	120330	120335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238450
2589	NC_009481	GATC	2	8	120375	120382	25 %	25 %	25 %	25 %	148238450
2590	NC_009481	CTG	2	6	120398	120403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238450
2591	NC_009481	CAG	3	9	120442	120450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238450
2592	NC_009481	GC	3	6	120607	120612	0 %	0 %	50 %	50 %	148238451
2593	NC_009481	GCT	2	6	120630	120635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238451
2594	NC_009481	CAC	2	6	120780	120785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238451
2595	NC_009481	CGC	2	6	120789	120794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238451
2596	NC_009481	GTG	2	6	120880	120885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238451
2597	NC_009481	GCG	2	6	120910	120915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238451
2598	NC_009481	TGC	2	6	120953	120958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238451
2599	NC_009481	CAG	2	6	120961	120966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238451
2600	NC_009481	GCT	3	9	120975	120983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238451
2601	NC_009481	CCAG	2	8	121007	121014	25 %	0 %	25 %	50 %	148238451
2602	NC_009481	TGC	2	6	121083	121088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238451
2603	NC_009481	CAT	2	6	121090	121095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148238451
2604	NC_009481	AC	3	6	121108	121113	50 %	0 %	0 %	50 %	148238451
2605	NC_009481	GCTG	2	8	121128	121135	0 %	25 %	50 %	25 %	148238451
2606	NC_009481	GCC	2	6	121182	121187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238451
2607	NC_009481	CTG	2	6	121293	121298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238451
2608	NC_009481	GCTG	2	8	121300	121307	0 %	25 %	50 %	25 %	148238451
2609	NC_009481	CCA	2	6	121308	121313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238451
2610	NC_009481	TGC	2	6	121340	121345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238451
2611	NC_009481	GGGT	2	8	121354	121361	0 %	25 %	75 %	0 %	148238451
2612	NC_009481	TGG	2	6	121394	121399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238451
2613	NC_009481	CAG	2	6	121429	121434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238451
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2615	NC_009481	TGC	2	6	121475	121480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238451
2616	NC_009481	TCGA	2	8	121510	121517	25 %	25 %	25 %	25 %	148238451
2617	NC_009481	ACGC	2	8	121549	121556	25 %	0 %	25 %	50 %	148238451
2618	NC_009481	AGC	2	6	121577	121582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238451
2619	NC_009481	GCT	2	6	121677	121682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238451
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2621	NC_009481	GCG	2	6	121734	121739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238451
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2981	NC_009481	GGA	2	6	139826	139831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238463
2982	NC_009481	GATCA	2	10	139860	139869	40 %	20 %	20 %	20 %	148238463
2983	NC_009481	GCG	2	6	139986	139991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238463
2984	NC_009481	AGC	2	6	140128	140133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238463
2985	NC_009481	CAGTC	2	10	140178	140187	20 %	20 %	20 %	40 %	148238463
2986	NC_009481	AGC	2	6	140215	140220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238463
2987	NC_009481	ACC	2	6	140254	140259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238463
2988	NC_009481	AGT	2	6	140273	140278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238464
2989	NC_009481	CGA	2	6	140338	140343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238464
2990	NC_009481	GCA	2	6	140382	140387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238464
2991	NC_009481	GAT	2	6	140590	140595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238464
2992	NC_009481	GCA	2	6	140606	140611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238464
2993	NC_009481	AGC	2	6	140628	140633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238464
2994	NC_009481	GCTG	2	8	140648	140655	0 %	25 %	50 %	25 %	148238464
2995	NC_009481	GCA	2	6	140871	140876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238464
2996	NC_009481	CCG	2	6	140906	140911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238464
2997	NC_009481	TTC	2	6	140914	140919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148238464
2998	NC_009481	CCT	2	6	140926	140931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148238464
2999	NC_009481	CAG	2	6	140993	140998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238464
3000	NC_009481	GAT	2	6	141029	141034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238464

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