MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. WH 7803 chromosome

Total Repeats: 47023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009481	GCT	2	6	46384	46389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238382
1002	NC_009481	CAT	2	6	46494	46499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148238382
1003	NC_009481	CCA	2	6	46523	46528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238382
1004	NC_009481	TGG	2	6	46559	46564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238382
1005	NC_009481	GCT	2	6	46623	46628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238382
1006	NC_009481	CGC	2	6	46853	46858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238382
1007	NC_009481	TGA	2	6	46871	46876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238382
1008	NC_009481	GCC	2	6	46891	46896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238382
1009	NC_009481	GCT	2	6	46926	46931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238382
1010	NC_009481	CAGC	2	8	46941	46948	25 %	0 %	25 %	50 %	148238382
1011	NC_009481	CCA	2	6	46970	46975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238382
1012	NC_009481	ATC	2	6	47062	47067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148238382
1013	NC_009481	GTGG	2	8	47190	47197	0 %	25 %	75 %	0 %	148238383
1014	NC_009481	CGG	2	6	47198	47203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238383
1015	NC_009481	TGC	2	6	47211	47216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238383
1016	NC_009481	GCT	2	6	47278	47283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238383
1017	NC_009481	GGC	2	6	47304	47309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238383
1018	NC_009481	TG	3	6	47314	47319	0 %	50 %	50 %	0 %	148238383
1019	NC_009481	GT	3	6	47350	47355	0 %	50 %	50 %	0 %	148238383
1020	NC_009481	CTG	2	6	47409	47414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238383
1021	NC_009481	CGGGG	2	10	47451	47460	0 %	0 %	80 %	20 %	148238383
1022	NC_009481	CGGC	2	8	47550	47557	0 %	0 %	50 %	50 %	148238383
1023	NC_009481	GGT	2	6	47571	47576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238383
1024	NC_009481	CGC	2	6	47616	47621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238383
1025	NC_009481	TGGTG	2	10	47625	47634	0 %	40 %	60 %	0 %	148238383
1026	NC_009481	GGC	2	6	47750	47755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238383
1027	NC_009481	GCT	2	6	47853	47858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238383
1028	NC_009481	TGGC	2	8	47927	47934	0 %	25 %	50 %	25 %	148238383
1029	NC_009481	TGG	2	6	47984	47989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238383
1030	NC_009481	GCT	2	6	48040	48045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238383
1031	NC_009481	CTGG	2	8	48069	48076	0 %	25 %	50 %	25 %	148238383
1032	NC_009481	CGG	2	6	48125	48130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238383
1033	NC_009481	TGGGCG	2	12	48179	48190	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	148238383
1034	NC_009481	CT	3	6	48194	48199	0 %	50 %	0 %	50 %	148238383
1035	NC_009481	GTCAGC	2	12	48354	48365	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148238384
1036	NC_009481	GGT	2	6	48445	48450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238384
1037	NC_009481	CAC	2	6	48463	48468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238384
1038	NC_009481	GTG	2	6	48513	48518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238384
1039	NC_009481	TG	3	6	48552	48557	0 %	50 %	50 %	0 %	148238384
1040	NC_009481	GCA	2	6	48622	48627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238384
1041	NC_009481	GGT	2	6	48632	48637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238384
1042	NC_009481	GTG	2	6	48641	48646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238384
1043	NC_009481	GGC	2	6	48817	48822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238384
1044	NC_009481	GGT	2	6	48871	48876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238384
1045	NC_009481	GAT	2	6	48898	48903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238384
1046	NC_009481	CGG	2	6	48951	48956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238384
1047	NC_009481	TGC	2	6	49011	49016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238384
1048	NC_009481	CTC	2	6	49039	49044	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148238384
1049	NC_009481	AAG	2	6	49064	49069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148238384
1050	NC_009481	ATC	2	6	49250	49255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148238384
1051	NC_009481	GT	3	6	49272	49277	0 %	50 %	50 %	0 %	148238384
1052	NC_009481	GTC	2	6	49290	49295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238384
1053	NC_009481	CCA	2	6	49411	49416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238384
1054	NC_009481	GTGG	2	8	49421	49428	0 %	25 %	75 %	0 %	148238384
1055	NC_009481	TGG	2	6	49455	49460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238384
1056	NC_009481	TCGC	2	8	49504	49511	0 %	25 %	25 %	50 %	148238384
1057	NC_009481	GAG	2	6	49523	49528	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238384
1058	NC_009481	CTGC	2	8	49606	49613	0 %	25 %	25 %	50 %	148238384
1059	NC_009481	GGCA	2	8	49674	49681	25 %	0 %	50 %	25 %	148238384
1060	NC_009481	GTT	2	6	49690	49695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238384
1061	NC_009481	TGC	2	6	49752	49757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238384
1062	NC_009481	TG	3	6	49760	49765	0 %	50 %	50 %	0 %	148238384
1063	NC_009481	CGG	2	6	49785	49790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238384
1064	NC_009481	GGT	2	6	49867	49872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238384
1065	NC_009481	GCT	2	6	49988	49993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238385
1066	NC_009481	CAG	2	6	49997	50002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238385
1067	NC_009481	CGT	2	6	50018	50023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238385
1068	NC_009481	GCA	2	6	50026	50031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238385
1069	NC_009481	GGCA	2	8	50047	50054	25 %	0 %	50 %	25 %	148238385
1070	NC_009481	CAG	2	6	50153	50158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238385
1071	NC_009481	CTT	2	6	50195	50200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148238385
1072	NC_009481	GGA	2	6	50386	50391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238385
1073	NC_009481	GCG	2	6	50404	50409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238385
1074	NC_009481	ACC	2	6	50462	50467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238385
1075	NC_009481	TGG	2	6	50487	50492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238385
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1080	NC_009481	GAT	2	6	50744	50749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238386
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1082	NC_009481	CG	3	6	50785	50790	0 %	0 %	50 %	50 %	148238386
1083	NC_009481	GA	3	6	50797	50802	50 %	0 %	50 %	0 %	148238386
1084	NC_009481	GATCA	2	10	50810	50819	40 %	20 %	20 %	20 %	148238386
1085	NC_009481	AGGTGG	2	12	50853	50864	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	148238386
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1087	NC_009481	AGG	2	6	50922	50927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238386
1088	NC_009481	CAG	2	6	51042	51047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238387
1089	NC_009481	TGC	2	6	51055	51060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238387
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1091	NC_009481	TGG	2	6	51268	51273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238387
1092	NC_009481	GCT	2	6	51314	51319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238387
1093	NC_009481	GGC	2	6	51357	51362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238387
1094	NC_009481	TGC	2	6	51418	51423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238387
1095	NC_009481	GGC	2	6	51503	51508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238387
1096	NC_009481	AAG	2	6	51564	51569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148238387
1097	NC_009481	GATCG	2	10	51585	51594	20 %	20 %	40 %	20 %	148238387
1098	NC_009481	GGC	2	6	51611	51616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238387
1099	NC_009481	GCG	2	6	51634	51639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238387
1100	NC_009481	GGC	2	6	51645	51650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238387
1101	NC_009481	CCGT	2	8	51701	51708	0 %	25 %	25 %	50 %	148238387
1102	NC_009481	TCACCC	2	12	51727	51738	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	148238387
1103	NC_009481	TTGGCG	2	12	51831	51842	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	148238387
1104	NC_009481	CTT	2	6	51866	51871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148238387
1105	NC_009481	CAC	2	6	51884	51889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238387
1106	NC_009481	ACG	2	6	51901	51906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238387
1107	NC_009481	GAA	2	6	51923	51928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148238387
1108	NC_009481	GCA	2	6	51967	51972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238387
1109	NC_009481	CCG	2	6	52020	52025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238387
1110	NC_009481	CCA	2	6	52039	52044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238387
1111	NC_009481	CGG	2	6	52061	52066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238387
1112	NC_009481	TCT	2	6	52147	52152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148238387
1113	NC_009481	GCG	2	6	52194	52199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238387
1114	NC_009481	GGA	2	6	52244	52249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238387
1115	NC_009481	TGG	2	6	52261	52266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238387
1116	NC_009481	TGA	2	6	52268	52273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238387
1117	NC_009481	AAC	2	6	52313	52318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148238387
1118	NC_009481	GGA	2	6	52331	52336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238387
1119	NC_009481	GGT	2	6	52364	52369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238387
1120	NC_009481	TGGC	2	8	52421	52428	0 %	25 %	50 %	25 %	148238387
1121	NC_009481	CTGGA	2	10	52458	52467	20 %	20 %	40 %	20 %	148238387
1122	NC_009481	GGT	2	6	52541	52546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238387
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1124	NC_009481	CCA	2	6	52587	52592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238387
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1245	NC_009481	CCCA	2	8	58287	58294	25 %	0 %	0 %	75 %	148238396
1246	NC_009481	GCC	2	6	58310	58315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238396
1247	NC_009481	TCGC	2	8	58344	58351	0 %	25 %	25 %	50 %	148238396
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1497	NC_009481	CAC	2	6	70530	70535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238405
1498	NC_009481	CTGC	2	8	70536	70543	0 %	25 %	25 %	50 %	148238405
1499	NC_009481	GGC	2	6	70548	70553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238405
1500	NC_009481	GAT	2	6	70557	70562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238405

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