MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. WH 7803 chromosome

Total Repeats: 47023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009481	TGT	2	6	21649	21654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238354
502	NC_009481	TGC	2	6	21669	21674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238354
503	NC_009481	TGGTGA	2	12	21690	21701	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	148238354
504	NC_009481	GT	3	6	21723	21728	0 %	50 %	50 %	0 %	148238354
505	NC_009481	CCA	2	6	21744	21749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238354
506	NC_009481	CGT	2	6	21759	21764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238354
507	NC_009481	CGT	2	6	21795	21800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238354
508	NC_009481	GAG	2	6	21875	21880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238354
509	NC_009481	CGTGC	2	10	21926	21935	0 %	20 %	40 %	40 %	148238354
510	NC_009481	GAG	2	6	21949	21954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238354
511	NC_009481	TG	3	6	21992	21997	0 %	50 %	50 %	0 %	148238354
512	NC_009481	TGT	2	6	22018	22023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238354
513	NC_009481	TGC	2	6	22038	22043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238354
514	NC_009481	TGGTGA	2	12	22059	22070	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	148238354
515	NC_009481	GT	3	6	22092	22097	0 %	50 %	50 %	0 %	148238354
516	NC_009481	CCA	2	6	22113	22118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238354
517	NC_009481	CGT	2	6	22128	22133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238354
518	NC_009481	TGC	2	6	22140	22145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238354
519	NC_009481	GCT	2	6	22201	22206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238354
520	NC_009481	TTG	2	6	22249	22254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238354
521	NC_009481	ATC	2	6	22255	22260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148238354
522	NC_009481	CCA	2	6	22299	22304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238354
523	NC_009481	TGG	2	6	22398	22403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238354
524	NC_009481	CCT	2	6	22431	22436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148238354
525	NC_009481	ATCA	2	8	22492	22499	50 %	25 %	0 %	25 %	148238354
526	NC_009481	AAAGAG	2	12	22574	22585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148238354
527	NC_009481	CGC	2	6	22629	22634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238354
528	NC_009481	GAG	2	6	22681	22686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238354
529	NC_009481	GTC	2	6	22702	22707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238354
530	NC_009481	TGT	2	6	22730	22735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238354
531	NC_009481	CAT	2	6	22767	22772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148238354
532	NC_009481	GAGG	2	8	22813	22820	25 %	0 %	75 %	0 %	148238354
533	NC_009481	TGA	3	9	22872	22880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238354
534	NC_009481	AAAGAG	2	12	22988	22999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148238354
535	NC_009481	CGC	2	6	23043	23048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238354
536	NC_009481	GAG	2	6	23095	23100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238354
537	NC_009481	GTC	2	6	23116	23121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238354
538	NC_009481	TGT	2	6	23144	23149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238354
539	NC_009481	CAT	2	6	23181	23186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148238354
540	NC_009481	GAGG	2	8	23227	23234	25 %	0 %	75 %	0 %	148238354
541	NC_009481	TGA	3	9	23286	23294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238354
542	NC_009481	AAAGAG	2	12	23402	23413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148238354
543	NC_009481	CGC	2	6	23457	23462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238354
544	NC_009481	GAG	2	6	23509	23514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238354
545	NC_009481	GTC	2	6	23530	23535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238354
546	NC_009481	TGT	2	6	23558	23563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238354
547	NC_009481	CAT	2	6	23595	23600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148238354
548	NC_009481	CAG	2	6	24409	24414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238355
549	NC_009481	GCC	2	6	24430	24435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238355
550	NC_009481	CAC	3	9	24436	24444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238355
551	NC_009481	ATC	2	6	24446	24451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148238355
552	NC_009481	GCA	2	6	24588	24593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238355
553	NC_009481	CAG	2	6	24619	24624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238355
554	NC_009481	CG	3	6	24645	24650	0 %	0 %	50 %	50 %	148238355
555	NC_009481	ATG	2	6	24671	24676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238355
556	NC_009481	GTGA	2	8	24737	24744	25 %	25 %	50 %	0 %	148238355
557	NC_009481	GGCGGT	2	12	24766	24777	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	148238355
558	NC_009481	ATCA	2	8	24823	24830	50 %	25 %	0 %	25 %	148238355
559	NC_009481	CGG	2	6	24833	24838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238355
560	NC_009481	GTA	2	6	24853	24858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238355
561	NC_009481	CAG	2	6	24883	24888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238355
562	NC_009481	TGC	2	6	24907	24912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238355
563	NC_009481	GCA	2	6	24921	24926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238355
564	NC_009481	CCA	2	6	24939	24944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238355
565	NC_009481	CGC	2	6	25152	25157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238355
566	NC_009481	CCA	2	6	25173	25178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238355
567	NC_009481	CGG	2	6	25263	25268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238355
568	NC_009481	CTT	2	6	25276	25281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148238355
569	NC_009481	CTG	2	6	25297	25302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238355
570	NC_009481	CCA	2	6	25347	25352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238355
571	NC_009481	GAA	2	6	25428	25433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148238355
572	NC_009481	GGTTG	2	10	25483	25492	0 %	40 %	60 %	0 %	148238355
573	NC_009481	GATT	2	8	25504	25511	25 %	50 %	25 %	0 %	148238355
574	NC_009481	GTT	2	6	25536	25541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238355
575	NC_009481	T	6	6	25540	25545	0 %	100 %	0 %	0 %	148238355
576	NC_009481	CTT	2	6	25585	25590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148238355
577	NC_009481	TTTG	2	8	25868	25875	0 %	75 %	25 %	0 %	148238356
578	NC_009481	GT	3	6	25994	25999	0 %	50 %	50 %	0 %	148238356
579	NC_009481	CCGA	2	8	26025	26032	25 %	0 %	25 %	50 %	148238356
580	NC_009481	TGC	2	6	26051	26056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238356
581	NC_009481	GGC	2	6	26057	26062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238356
582	NC_009481	CCA	2	6	26084	26089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238356
583	NC_009481	TTG	2	6	26121	26126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238356
584	NC_009481	G	7	7	26130	26136	0 %	0 %	100 %	0 %	148238356
585	NC_009481	CCA	2	6	26144	26149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238356
586	NC_009481	CAG	2	6	26213	26218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238356
587	NC_009481	CCA	2	6	26261	26266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238356
588	NC_009481	GCT	2	6	26293	26298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238356
589	NC_009481	TGAT	2	8	26422	26429	25 %	50 %	25 %	0 %	148238356
590	NC_009481	CAG	2	6	26436	26441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238356
591	NC_009481	GTG	2	6	26452	26457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238356
592	NC_009481	CCA	3	9	26519	26527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238356
593	NC_009481	G	6	6	26529	26534	0 %	0 %	100 %	0 %	148238356
594	NC_009481	CAG	2	6	26541	26546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238356
595	NC_009481	TGC	2	6	26564	26569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238356
596	NC_009481	GCTG	2	8	26690	26697	0 %	25 %	50 %	25 %	148238356
597	NC_009481	TTG	2	6	26698	26703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238356
598	NC_009481	TCC	2	6	26734	26739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148238356
599	NC_009481	TCG	2	6	26749	26754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238356
600	NC_009481	CCGC	2	8	26824	26831	0 %	0 %	25 %	75 %	148238356
601	NC_009481	CCA	2	6	26834	26839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238356
602	NC_009481	ATC	2	6	26860	26865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148238356
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604	NC_009481	CCG	2	6	26980	26985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238357
605	NC_009481	TCC	2	6	27029	27034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148238357
606	NC_009481	GTG	2	6	27038	27043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238357
607	NC_009481	CAG	2	6	27076	27081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238357
608	NC_009481	GGT	2	6	27124	27129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238357
609	NC_009481	TTCA	2	8	27160	27167	25 %	50 %	0 %	25 %	148238357
610	NC_009481	GCA	2	6	27171	27176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238357
611	NC_009481	GAA	2	6	27262	27267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148238357
612	NC_009481	TCA	2	6	27291	27296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148238357
613	NC_009481	CTC	2	6	27313	27318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148238357
614	NC_009481	GGC	2	6	27339	27344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238357
615	NC_009481	CGC	2	6	27359	27364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238357
616	NC_009481	CGT	2	6	27456	27461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238357
617	NC_009481	TGCAA	2	10	27462	27471	40 %	20 %	20 %	20 %	148238357
618	NC_009481	GGT	2	6	27472	27477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238357
619	NC_009481	AGTG	2	8	27493	27500	25 %	25 %	50 %	0 %	148238357
620	NC_009481	AGC	2	6	27551	27556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238357
621	NC_009481	TC	3	6	27612	27617	0 %	50 %	0 %	50 %	148238357
622	NC_009481	CAG	2	6	27709	27714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238357
623	NC_009481	CAG	2	6	27862	27867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238357
624	NC_009481	GCA	2	6	27870	27875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238357
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626	NC_009481	GGCA	2	8	27899	27906	25 %	0 %	50 %	25 %	148238357
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