MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. WH 7803 chromosome

Total Repeats: 47023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_009481	ACA	2	6	231305	231310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148238548
5002	NC_009481	GCA	2	6	231382	231387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238548
5003	NC_009481	TGG	2	6	231422	231427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238548
5004	NC_009481	GCC	2	6	231449	231454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238548
5005	NC_009481	G	6	6	231480	231485	0 %	0 %	100 %	0 %	148238548
5006	NC_009481	GCC	2	6	231490	231495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238548
5007	NC_009481	GGC	2	6	231498	231503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238548
5008	NC_009481	GTG	2	6	231535	231540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238548
5009	NC_009481	CGA	2	6	231567	231572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238548
5010	NC_009481	G	7	7	231588	231594	0 %	0 %	100 %	0 %	148238548
5011	NC_009481	G	6	6	231596	231601	0 %	0 %	100 %	0 %	148238548
5012	NC_009481	TGC	2	6	231647	231652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238548
5013	NC_009481	GTT	3	9	231657	231665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238548
5014	NC_009481	CCA	2	6	231686	231691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238548
5015	NC_009481	CCG	2	6	231693	231698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238548
5016	NC_009481	GAT	2	6	231736	231741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238548
5017	NC_009481	CCG	2	6	231759	231764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238548
5018	NC_009481	TGC	3	9	231866	231874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238548
5019	NC_009481	GCC	2	6	231904	231909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238548
5020	NC_009481	ACC	2	6	231949	231954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238548
5021	NC_009481	GTG	2	6	231958	231963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238548
5022	NC_009481	CTGG	2	8	232026	232033	0 %	25 %	50 %	25 %	148238548
5023	NC_009481	CAGC	2	8	232066	232073	25 %	0 %	25 %	50 %	148238548
5024	NC_009481	CAG	2	6	232129	232134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238549
5025	NC_009481	CAG	2	6	232170	232175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238549
5026	NC_009481	GCG	2	6	232205	232210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238549
5027	NC_009481	GTGA	2	8	232216	232223	25 %	25 %	50 %	0 %	148238549
5028	NC_009481	CGG	2	6	232296	232301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238549
5029	NC_009481	GTT	2	6	232311	232316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238549
5030	NC_009481	CGA	2	6	232338	232343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238549
5031	NC_009481	AGC	2	6	232379	232384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238549
5032	NC_009481	GCT	2	6	232419	232424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238549
5033	NC_009481	CGA	2	6	232425	232430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238549
5034	NC_009481	GTG	2	6	232436	232441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238549
5035	NC_009481	CG	3	6	232474	232479	0 %	0 %	50 %	50 %	148238549
5036	NC_009481	CGG	2	6	232565	232570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238549
5037	NC_009481	GGC	2	6	232573	232578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238549
5038	NC_009481	CAC	2	6	232638	232643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238549
5039	NC_009481	GCCGG	2	10	232753	232762	0 %	0 %	60 %	40 %	148238549
5040	NC_009481	TGG	2	6	232769	232774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238549
5041	NC_009481	CAC	2	6	232807	232812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238549
5042	NC_009481	GTG	2	6	232831	232836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238549
5043	NC_009481	C	7	7	232846	232852	0 %	0 %	0 %	100 %	148238549
5044	NC_009481	CAC	2	6	232941	232946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238549
5045	NC_009481	GCTGA	2	10	232965	232974	20 %	20 %	40 %	20 %	148238549
5046	NC_009481	GGC	2	6	233011	233016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238550
5047	NC_009481	GGGA	2	8	233074	233081	25 %	0 %	75 %	0 %	148238550
5048	NC_009481	CTGG	2	8	233104	233111	0 %	25 %	50 %	25 %	148238550
5049	NC_009481	GTT	2	6	233275	233280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238550
5050	NC_009481	CAG	2	6	233297	233302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238550
5051	NC_009481	GGC	2	6	233319	233324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238550
5052	NC_009481	GCA	2	6	233335	233340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238550
5053	NC_009481	GCAG	2	8	233494	233501	25 %	0 %	50 %	25 %	148238550
5054	NC_009481	CTC	2	6	233596	233601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148238550
5055	NC_009481	AGC	2	6	233691	233696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238550
5056	NC_009481	CCCG	2	8	233731	233738	0 %	0 %	25 %	75 %	148238550
5057	NC_009481	GGC	2	6	233747	233752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238550
5058	NC_009481	TGGCGC	2	12	233808	233819	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148238550
5059	NC_009481	CCA	2	6	233842	233847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238550
5060	NC_009481	GCC	2	6	233849	233854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238550
5061	NC_009481	GCT	2	6	233867	233872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238550
5062	NC_009481	GCG	2	6	234020	234025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238550
5063	NC_009481	CTG	2	6	234047	234052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238550
5064	NC_009481	CCG	2	6	234088	234093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238550
5065	NC_009481	GCA	2	6	234163	234168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238550
5066	NC_009481	CGA	3	9	234254	234262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238551
5067	NC_009481	GTT	2	6	234296	234301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238551
5068	NC_009481	TCGC	2	8	234344	234351	0 %	25 %	25 %	50 %	148238551
5069	NC_009481	GCT	2	6	234353	234358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238551
5070	NC_009481	GGC	2	6	234395	234400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238551
5071	NC_009481	GCT	3	9	234473	234481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238551
5072	NC_009481	AACC	2	8	234526	234533	50 %	0 %	0 %	50 %	148238551
5073	NC_009481	G	6	6	234606	234611	0 %	0 %	100 %	0 %	148238551
5074	NC_009481	CAC	2	6	234614	234619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238551
5075	NC_009481	CTG	2	6	234636	234641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238551
5076	NC_009481	CAC	2	6	234659	234664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238551
5077	NC_009481	CTGG	2	8	234716	234723	0 %	25 %	50 %	25 %	148238551
5078	NC_009481	GCG	2	6	234761	234766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238551
5079	NC_009481	G	6	6	234770	234775	0 %	0 %	100 %	0 %	148238551
5080	NC_009481	GAG	2	6	234819	234824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238551
5081	NC_009481	GGT	3	9	234863	234871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238551
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5083	NC_009481	TGT	2	6	234943	234948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238551
5084	NC_009481	CGC	2	6	234953	234958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238551
5085	NC_009481	GAG	2	6	234993	234998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238551
5086	NC_009481	CTGCGC	2	12	235021	235032	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	148238551
5087	NC_009481	CTGGTG	2	12	235080	235091	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	148238551
5088	NC_009481	GCT	2	6	235130	235135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238551
5089	NC_009481	G	6	6	235196	235201	0 %	0 %	100 %	0 %	148238551
5090	NC_009481	CTG	3	9	235212	235220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238551
5091	NC_009481	G	6	6	235240	235245	0 %	0 %	100 %	0 %	148238551
5092	NC_009481	GTG	2	6	235300	235305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238551
5093	NC_009481	TGG	2	6	235387	235392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238551
5094	NC_009481	CAC	2	6	235439	235444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238551
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5099	NC_009481	TGC	2	6	235708	235713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238552
5100	NC_009481	GGC	2	6	235739	235744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238552
5101	NC_009481	TCC	2	6	235807	235812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148238552
5102	NC_009481	GCA	2	6	235878	235883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238552
5103	NC_009481	TGC	2	6	235925	235930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238552
5104	NC_009481	GCA	2	6	235931	235936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238552
5105	NC_009481	GCT	2	6	235950	235955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238552
5106	NC_009481	TGCCC	2	10	235958	235967	0 %	20 %	20 %	60 %	148238552
5107	NC_009481	CGT	2	6	235985	235990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238552
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5109	NC_009481	ACG	2	6	236033	236038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238552
5110	NC_009481	TGC	2	6	236052	236057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238552
5111	NC_009481	GAG	2	6	236112	236117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238552
5112	NC_009481	CCA	2	6	236159	236164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238552
5113	NC_009481	GCC	2	6	236194	236199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238552
5114	NC_009481	CACCG	2	10	236265	236274	20 %	0 %	20 %	60 %	148238552
5115	NC_009481	CAG	2	6	236275	236280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238552
5116	NC_009481	ACC	3	9	236296	236304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238552
5117	NC_009481	AGC	2	6	236360	236365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238552
5118	NC_009481	CGCGGC	2	12	236393	236404	0 %	0 %	50 %	50 %	148238552
5119	NC_009481	GCA	2	6	236468	236473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238552
5120	NC_009481	CCT	2	6	236548	236553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148238552
5121	NC_009481	GGC	2	6	236588	236593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238552
5122	NC_009481	GCA	2	6	236603	236608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238552
5123	NC_009481	CAG	3	9	236613	236621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238552
5124	NC_009481	CA	3	6	236727	236732	50 %	0 %	0 %	50 %	148238552
5125	NC_009481	G	6	6	236831	236836	0 %	0 %	100 %	0 %	148238552
5126	NC_009481	CAGA	2	8	236880	236887	50 %	0 %	25 %	25 %	148238552
5127	NC_009481	GAT	2	6	237024	237029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238553
5128	NC_009481	GGC	2	6	237117	237122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238553
5129	NC_009481	CCT	2	6	237152	237157	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148238553
5130	NC_009481	CAT	2	6	237177	237182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148238553
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5132	NC_009481	GTGG	2	8	237249	237256	0 %	25 %	75 %	0 %	148238553
5133	NC_009481	GGC	2	6	237267	237272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238553
5134	NC_009481	CCA	2	6	237314	237319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238553
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5136	NC_009481	GTTGAG	2	12	237351	237362	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	148238553
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5140	NC_009481	GCT	2	6	237471	237476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238553
5141	NC_009481	CTT	2	6	237522	237527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148238553
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5145	NC_009481	TGCT	2	8	237805	237812	0 %	50 %	25 %	25 %	148238553
5146	NC_009481	GATGCC	2	12	237822	237833	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148238553
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5149	NC_009481	GCC	2	6	238101	238106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238553
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5152	NC_009481	CCA	2	6	238361	238366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238553
5153	NC_009481	CTGG	2	8	238401	238408	0 %	25 %	50 %	25 %	148238553
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5232	NC_009481	TTCCT	2	10	241827	241836	0 %	60 %	0 %	40 %	148238557
5233	NC_009481	CGA	2	6	241845	241850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238557
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5235	NC_009481	TGG	2	6	241922	241927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238557
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5237	NC_009481	GCT	2	6	242062	242067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238557
5238	NC_009481	CGCT	2	8	242165	242172	0 %	25 %	25 %	50 %	148238558
5239	NC_009481	GGT	2	6	242198	242203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238558
5240	NC_009481	TGC	2	6	242248	242253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238558
5241	NC_009481	CTG	2	6	242316	242321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238558
5242	NC_009481	GTGCT	2	10	242338	242347	0 %	40 %	40 %	20 %	148238558
5243	NC_009481	GGC	2	6	242402	242407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238558
5244	NC_009481	GC	4	8	242508	242515	0 %	0 %	50 %	50 %	148238558
5245	NC_009481	GCG	2	6	242558	242563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238558
5246	NC_009481	AGC	2	6	242568	242573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238558
5247	NC_009481	GAT	2	6	242649	242654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238558
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5249	NC_009481	AAC	2	6	242670	242675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148238558
5250	NC_009481	CCG	2	6	242698	242703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238558
5251	NC_009481	TG	3	6	242772	242777	0 %	50 %	50 %	0 %	148238558
5252	NC_009481	CAG	2	6	242783	242788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238558
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5254	NC_009481	TGC	2	6	242882	242887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238558
5255	NC_009481	ACCC	2	8	242912	242919	25 %	0 %	0 %	75 %	148238558
5256	NC_009481	TTG	2	6	242937	242942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238558
5257	NC_009481	GGC	2	6	242977	242982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238558
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5259	NC_009481	GCT	2	6	243054	243059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238558
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5261	NC_009481	TGC	2	6	243080	243085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238558
5262	NC_009481	GGT	2	6	243095	243100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238558
5263	NC_009481	CTGG	2	8	243112	243119	0 %	25 %	50 %	25 %	148238558
5264	NC_009481	GAAC	2	8	243237	243244	50 %	0 %	25 %	25 %	148238559
5265	NC_009481	CAC	2	6	243269	243274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238559
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5267	NC_009481	CTG	2	6	243337	243342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238559
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5270	NC_009481	TTGG	2	8	243477	243484	0 %	50 %	50 %	0 %	148238559
5271	NC_009481	GTT	2	6	243522	243527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238559
5272	NC_009481	TGC	2	6	243578	243583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238559
5273	NC_009481	CAG	2	6	243693	243698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238559
5274	NC_009481	TGC	2	6	243719	243724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238559
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5281	NC_009481	TG	3	6	244313	244318	0 %	50 %	50 %	0 %	148238559
5282	NC_009481	ACA	2	6	244361	244366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148238559
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5322	NC_009481	CGCA	2	8	246158	246165	25 %	0 %	25 %	50 %	148238560
5323	NC_009481	CTG	2	6	246197	246202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238560
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5331	NC_009481	ACG	2	6	246429	246434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238560
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5363	NC_009481	CGC	2	6	248289	248294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238561
5364	NC_009481	GC	3	6	248293	248298	0 %	0 %	50 %	50 %	148238561
5365	NC_009481	GATG	2	8	248395	248402	25 %	25 %	50 %	0 %	148238561
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5368	NC_009481	GGC	2	6	248461	248466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238562
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5483	NC_009481	CCA	2	6	253672	253677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238566
5484	NC_009481	CTTGCG	2	12	253688	253699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238566
5485	NC_009481	GGT	2	6	253853	253858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238566
5486	NC_009481	CAG	2	6	253919	253924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238566
5487	NC_009481	GC	3	6	253979	253984	0 %	0 %	50 %	50 %	148238566
5488	NC_009481	CAC	2	6	254150	254155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238566
5489	NC_009481	GCAGCC	2	12	254161	254172	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	148238566
5490	NC_009481	CTG	2	6	254232	254237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238566
5491	NC_009481	CGA	2	6	254296	254301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238566
5492	NC_009481	GCA	2	6	254305	254310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238566
5493	NC_009481	AGCG	2	8	254331	254338	25 %	0 %	50 %	25 %	148238566
5494	NC_009481	CCA	2	6	254425	254430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238566
5495	NC_009481	AAG	2	6	254493	254498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148238566
5496	NC_009481	CAG	2	6	254510	254515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238566
5497	NC_009481	CAG	2	6	254585	254590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238566
5498	NC_009481	AGC	2	6	254601	254606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238566
5499	NC_009481	GCC	2	6	254614	254619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238566
5500	NC_009481	GTG	2	6	254620	254625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238566

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