MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9 plasmid pSJH901

Total Repeats: 56

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009477	CG	3	6	2269	2274	0 %	0 %	50 %	50 %	148244143
2	NC_009477	AT	3	6	2306	2311	50 %	50 %	0 %	0 %	148244143
3	NC_009477	AT	3	6	2451	2456	50 %	50 %	0 %	0 %	148244143
4	NC_009477	AT	3	6	3163	3168	50 %	50 %	0 %	0 %	148244144
5	NC_009477	AT	3	6	3308	3313	50 %	50 %	0 %	0 %	148244144
6	NC_009477	CG	3	6	3345	3350	0 %	0 %	50 %	50 %	148244144
7	NC_009477	TA	3	6	3670	3675	50 %	50 %	0 %	0 %	148244144
8	NC_009477	TA	3	6	4310	4315	50 %	50 %	0 %	0 %	148244145
9	NC_009477	TA	3	6	4411	4416	50 %	50 %	0 %	0 %	148244145
10	NC_009477	AT	3	6	4558	4563	50 %	50 %	0 %	0 %	148244146
11	NC_009477	AT	3	6	5210	5215	50 %	50 %	0 %	0 %	148244146
12	NC_009477	AT	4	8	5593	5600	50 %	50 %	0 %	0 %	148244146
13	NC_009477	AT	4	8	5720	5727	50 %	50 %	0 %	0 %	148244146
14	NC_009477	AT	5	10	5992	6001	50 %	50 %	0 %	0 %	148244147
15	NC_009477	AT	3	6	6030	6035	50 %	50 %	0 %	0 %	148244147
16	NC_009477	AT	3	6	6713	6718	50 %	50 %	0 %	0 %	148244148
17	NC_009477	AT	3	6	6922	6927	50 %	50 %	0 %	0 %	148244148
18	NC_009477	TA	3	6	7019	7024	50 %	50 %	0 %	0 %	148244148
19	NC_009477	AT	3	6	7222	7227	50 %	50 %	0 %	0 %	148244148
20	NC_009477	AC	3	6	7527	7532	50 %	0 %	0 %	50 %	148244149
21	NC_009477	TA	3	6	7861	7866	50 %	50 %	0 %	0 %	148244149
22	NC_009477	CA	3	6	8049	8054	50 %	0 %	0 %	50 %	148244149
23	NC_009477	GA	3	6	8331	8336	50 %	0 %	50 %	0 %	148244149
24	NC_009477	AT	3	6	10861	10866	50 %	50 %	0 %	0 %	148244152
25	NC_009477	AT	3	6	11106	11111	50 %	50 %	0 %	0 %	148244152
26	NC_009477	AT	3	6	14473	14478	50 %	50 %	0 %	0 %	148244155
27	NC_009477	AT	3	6	14551	14556	50 %	50 %	0 %	0 %	148244155
28	NC_009477	CT	3	6	15140	15145	0 %	50 %	0 %	50 %	148244156
29	NC_009477	TA	3	6	15214	15219	50 %	50 %	0 %	0 %	148244156
30	NC_009477	AC	3	6	15282	15287	50 %	0 %	0 %	50 %	148244156
31	NC_009477	TA	3	6	15542	15547	50 %	50 %	0 %	0 %	148244157
32	NC_009477	CT	3	6	15808	15813	0 %	50 %	0 %	50 %	148244157
33	NC_009477	AT	3	6	17897	17902	50 %	50 %	0 %	0 %	148244158
34	NC_009477	AG	3	6	21185	21190	50 %	0 %	50 %	0 %	148244160
35	NC_009477	AT	3	6	21373	21378	50 %	50 %	0 %	0 %	148244160
36	NC_009477	AT	3	6	21983	21988	50 %	50 %	0 %	0 %	148244161
37	NC_009477	TA	3	6	22490	22495	50 %	50 %	0 %	0 %	148244161
38	NC_009477	AT	3	6	23494	23499	50 %	50 %	0 %	0 %	148244163
39	NC_009477	TA	3	6	23516	23521	50 %	50 %	0 %	0 %	148244163
40	NC_009477	AT	3	6	23616	23621	50 %	50 %	0 %	0 %	148244163
41	NC_009477	AT	3	6	23998	24003	50 %	50 %	0 %	0 %	148244163
42	NC_009477	TA	3	6	24265	24270	50 %	50 %	0 %	0 %	148244163
43	NC_009477	TA	3	6	24319	24324	50 %	50 %	0 %	0 %	148244163
44	NC_009477	TA	3	6	24489	24494	50 %	50 %	0 %	0 %	148244163
45	NC_009477	AT	3	6	24542	24547	50 %	50 %	0 %	0 %	148244163
46	NC_009477	AT	3	6	25341	25346	50 %	50 %	0 %	0 %	148244165
47	NC_009477	TA	3	6	25848	25853	50 %	50 %	0 %	0 %	148244165
48	NC_009477	TA	3	6	26157	26162	50 %	50 %	0 %	0 %	148244166
49	NC_009477	AT	3	6	26338	26343	50 %	50 %	0 %	0 %	148244166
50	NC_009477	AT	3	6	26632	26637	50 %	50 %	0 %	0 %	148244166
51	NC_009477	AT	3	6	26879	26884	50 %	50 %	0 %	0 %	148244166
52	NC_009477	TG	4	8	27577	27584	0 %	50 %	50 %	0 %	148244167
53	NC_009477	AC	3	6	27587	27592	50 %	0 %	0 %	50 %	148244167
54	NC_009477	AT	3	6	27991	27996	50 %	50 %	0 %	0 %	148244167
55	NC_009477	AT	3	6	28815	28820	50 %	50 %	0 %	0 %	148244167
56	NC_009477	TA	3	6	29562	29567	50 %	50 %	0 %	0 %	148244168

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.